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Research Article
Maruti Nandan Rai1, Sapan Borah1, Gaurav Bairwa*1, Sriram Balusu*1,2, Neelima Gorityala1, Rupinder Kaur1
1Laboratory of Fungal Pathogenesis,Centre for DNA Fingerprinting and Diagnostics, Andhra Pradesh, India, 2Current location: VIB Department for Molecular Biomedical Research, UGent,Fiers-Schell-Van Montagu Building, Technologiepark 927, B-9052 Ghent (Zwijnaarde), Belgium
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Le présent article décrit un protocole pour établir un système de modèle de culture cellulaire in vitro pour étudier l'interaction d'un champignon pathogène intracellulaire facultatif humain Candida glabrata avec les macrophages humains qui sera un outil utile pour faire progresser notre connaissance des mécanismes de virulence des champignons.
Un système modèle de culture cellulaire, si un synoptique proche des conditions d'environnement de l'hôte, peut servir comme une alternative peu coûteuse, facilement manipulable et reproductible pour des systèmes de modèles animaux pour l'étude d'une étape spécifique de l'infection par le pathogène microbien. Une lignée cellulaire monocytaire humaine THP-1 qui, lors du traitement de l'ester de phorbol, se différencie en macrophages, a déjà été utilisé pour étudier les stratégies de virulence de nombreux pathogènes intracellulaires, y compris Mycobacterium tuberculosis. Ici, nous discutons d'un protocole d'adopter un modèle in vitro de culture cellulaire dans système à l'aide de macrophages THP-1 pour délimiter l'interaction d'un agent pathogène opportuniste humain de la levure Candida glabrata avec des cellules phagocytaires de l'hôte. Ce système de modèle est simple, rapide, prête à écrans mutantes à haut débit, et ne nécessite pas de matériel sophistiqué. Un THP-1 expérience d'infection des macrophages typique prend environ 24 heures avec un 24-48 heures supplémentaires pour permettre intracellulaire récupérélevure de se développer sur un milieu riche pour colony forming analyse de la viabilité à base de parts. Comme d'autres systèmes modèles in vitro dans une éventuelle limitation de cette approche est la difficulté d'extrapoler les résultats obtenus à un circuit de cellule immunitaire très complexe existant dans l'hôte humain. Cependant, malgré cela, le protocole actuel est très utile pour élucider les stratégies d'un agent pathogène fongique peut employer pour échapper / contrecarrer réponse antimicrobienne et survivre, s'adapter, et de proliférer dans l'environnement pauvre en nutriments des cellules immunitaires de l'hôte.
Espèces de Candida sont la principale cause des infections fongiques invasives potentiellement mortelles chez les patients immunodéprimés 1. Candida glabrata, un pathogène nosocomial émergents, est la deuxième ou troisième plus fréquemment isolés espèces de Candida chez des patients de l'unité de soins intensifs en fonction de la situation géographique 1-3. Phylogénétiquement, C. glabrata, une levure bourgeonnante haploïde, est plus étroitement liée aux Saccharomyces non pathogène modèle cerevisiae que de pathogène Candida spp., y compris C. albicans 4. Conformément à cela, C. glabrata manque quelques traits de virulence fongiques clés, y compris l'accouplement, l'activité protéolytique sécrétée et la plasticité morphologique 4-5.
Bien que C. glabrata ne fait pas hyphes, il peut survivre et se répliquer dans les macrophages murins et humains 6-8 suggérant qu'il a développé des mécanismes de pathogenèse uniques. Peu d'informations sont disponibles sur les stratégies que C. glabrata emploie pour survivre environnement macrophages intracellulaire pauvres en éléments nutritifs et de contrer oxydation et réponses de l'hôte non oxydants montés par les cellules immunitaires de l'hôte 5. Un système de modèle de macrophage pertinente est une condition préalable pour délimiter l'interaction de C. glabrata avec des cellules phagocytaires de l'hôte par des approches génomiques et protéomiques fonctionnels. Les cellules mononucléées du sang (PBMC) et des macrophages dérivés de la moelle osseuse (BMDMs) d'origine humaine et murine, respectivement, ont précédemment été utilisées pour étudier l'interaction de C. glabrata avec des cellules immunitaires de l'hôte 7,9. Cependant, la difficulté à obtenir les CMSP et BMDMs, leur durée de vie limitée et variation intrinsèque entre les différents bailleurs de fonds de mammifères limitent l'utilisation de ces cellules des systèmes modèles comme polyvalents.
Ici, nous décrivons une méthode pour l'établissement d'un système in vitro pour étudier la intracellulcomportement ar de C. glabrata cellules dans les macrophages issus de la lignée cellulaire monocytaire humaine THP-1. L'objectif global de ce protocole était d'adopter un système de modèle de culture cellulaire simple, peu coûteux, rapide et reproductible qui peut être facilement manipulé pour étudier différents aspects du pathogène interaction hôte-fongique.
Cellules THP-1 ont déjà été utilisées pour déchiffrer la réponse immunitaire de l'hôte contre une large gamme d'agents pathogènes, notamment des bactéries, des virus et des champignons 10-12. Cellules monocytaires THP-1 sont faciles à entretenir et peuvent être différenciées, par traitement de l'ester de phorbol, de macrophages qui imitent les macrophages dérivés de monocytes humains et des macrophages expriment des marqueurs appropriés 13. Les principaux avantages de THP-1 système de modèle de macrophage sont la facilité d'usage et l'absence d'exigence d'un équipement sophistiqué.
Le protocole présenté ici est facilement adaptable pour étudier l'interaction d'autres agents pathogènes fongiques humains avec host cellules immunitaires. La procédure de courant peut également être utilisée pour identifier des facteurs de virulence de l'agent pathogène d'intérêt en utilisant des écrans de mutants à haut débit. Cette preuve de concept a été illustré par l'utilisation réussie de THP-1 système de modèle de culture pour identifier un ensemble de 56 gènes qui sont nécessaires pour la survie de C. glabrata dans les macrophages humains 8.
Il est recommandé d'effectuer C. glabrata expériences d'infection dans un laboratoire avec un niveau de biosécurité de confinement 2 (BSL-2).
Une. Préparation de THP-1 macrophages monocouche
2. C. Préparation d' glabrata & #160; suspension cellulaire
C. glabrata souche sauvage Bg2 sera utilisé pour infecter les macrophages THP-1. C. glabrata cellules sont cultivées en routine en milieu YPD liquide (extrait de levure (1%)-peptone (2%), de dextrose (2%)) moyenne. Milieu YPD solide est préparé en ajoutant 2% de gélose avant l'autoclavage milieu.
3. L'infection des macrophages THP-1 avec C. Cellules glabrata
4. Mesure de la phagocytose taux intracellulaire et Réplication via Colony Forming Unit Test
5. Surveillance de la réplication intracellulaire confocale Laser microscopie à balayage
Analyse infection de PMA-traités macrophages THP-1 avec C. les cellules de type sauvage glabrata (wt) ont révélé que les cellules wt ont été phagocytés par des macrophages à un taux de 55-65% au bout de 2 h co-incubation. En outre, C. glabrata cellules étaient capables de résister à mort par les macrophages THP-1 et ont subi une moyenne de 5 - à 7 fois plus dans UFC après 24 heures de co-culture avec des macrophages THP-1 8. La réplication intracellulaire de cellules de type sauvage, transformées avec le plasmide exprimant la GFP, dans les cellules THP-1 macrophages a également été vérifiée par microscopie à fluorescence confocale, dans lequel le nombre de cellules de levure intracellulaires par THP-1 macrophage est passé de un ou deux à sept à douze sur une période de 24 h (figure 1).

La figure 1. Une image confocale de formaldéhyde fixe, GFP-étiquetée C. glabrata infectés macrophages THP-1 présentant la réplication intracellulaire de cellules THP-1 héberger 1-2 et 5-8 levure à 2 h et 24 h, respectivement. noyaux sont colorés au DAPI. Bar = 10 um.

Figure 2. Représentation schématique de la C. écran de la bibliothèque mutant glabrata pour les profils de survie modifiés dans THP-1 macrophages par mutagenèse de signature-tagged cercles verts sur les membranes hybridées (STM) approche. Rouge et dénotent réduits et la représentation élevée des balises, respectivement, dans des échantillons de sortie par rapport à des échantillons d'entrée.
Les auteurs déclarent qu'ils n'ont aucun intérêt financier concurrents.
Le présent article décrit un protocole pour établir un système de modèle de culture cellulaire in vitro pour étudier l'interaction d'un champignon pathogène intracellulaire facultatif humain Candida glabrata avec les macrophages humains qui sera un outil utile pour faire progresser notre connaissance des mécanismes de virulence des champignons.
Ce travail a été soutenu par Innovative jeune biologiste Prix BT/BI/12/040/2005 et BT/PR13289/BRB/10/745/2009 subvention du Département de biotechnologie, gouvernement de l'Inde et les ressources de base de Centre pour empreintes génétiques et diagnostics, Hyderabad. MRN et GB sont les bénéficiaires de bourses de recherche junior et senior du Conseil de recherche scientifique et industrielle vers la poursuite d'un diplôme de l'Université de Manipal de doctorat. SB est le récipiendaire du Junior et Senior Research Fellowship du Département de biotechnologie vers la poursuite d'un diplôme de l'Université de Manipal de doctorat.
| THP-1 | American Type Culture Collection | TIB 202 | Lignée cellulaire de leucémie monocytaire aiguë humaine |
| RPMI-1640 | Hyclone | SH30096.01 | Pour maintenir les cellules THP-1 |
| Phorbol 12-myristate 13-acétate | Sigma-Aldrich | P 8139 | Attention : Dangereux |
| YPD  ; | BD-Difco | 242710 | Pour la culture de cellules Candida glabrata |
| Formaldéhyde | Sigma-Aldrich | F8775 | Pour la fixation des macrophages THP-1 C. glabrata infectés par |
| phosphate Tampon salin tamponné au phosphate (PBS) | Tampon (137 mM NaCl, 10 mM Phosphate, 2,7 mM KCl,  ; pH 7,4) pour lavages Citrate salin-sodique | ||
| (SSC)  ; | Tampon (3 M NaCl, 0,3 M de citrate de sodium pour une concentration de 20x) pour lavages Tampon | ||
| de | préhybridation | Tampon (50 % formamide, 5x Denhardt' s, 5x SSC, 1 % SDS) pour l’hybridation | |
| Support de montage VECTASHIELD | Vector Labs | H-1200 | Pour le montage de lames pour la microscopie confocale |
| 32P labellisé &alpha ;-dCTP | JONAKI-BARC | LCP-102 | Pour le radiomarquage des étiquettes de signature |
| Boîtes de culture tissulaire de 100 mm | Corning | 430167 | Pour la culture de cellules THP-1 |
| Plaque de culture tissulaire à 24 puits | Corning | 3527 | Réalisation d’études sur l’infection C. glabrata dans les macrophages THP-1 |
| Lame de verre traitée par culture tissulaire à 4 chambres | BD Falcon REF354104 | Pour imager les macrophages THP-1 infectés par C. glabrata | |
| Hemocytomètre | Rohem Inde | Pour le dénombrement des cellules | |
| Microcentrifugeuse de table | Beckman Coulter | Microfuge 18 | Pour la rotation de cellules dans des microtubes |
| Centrifugeuse de table | Remi | R-8C | Pour la rotation de cellules dans des tubes de 15 ml |
| Spectrophotomètre | Amersham Biosciences | Ultraspec 10 | Pour surveiller l’absorbance des cellules de levure |
| Incubateur à plaques | Labtech | Réfrigéré | Pour cultiver des cellules C. glabrata |
| Incubateur Agitateur | Nouveau-Brunswick | Innova 43 | Pour cultiver des cellules C. glabrata |
| Enveloppe d’eau CO2 incubateur | Thermo Electron Corporation | Forma series 2 | Pour cultiver des cellules THP-1 |
| Microscope confocal | Carl Ziess | Ziess LSM 510 meta | Pour observer les macrophages THP-1 C. glabrata infectés par |
| Microscope composé | Olympus | CKX 41 | Pour observer les macrophages C. glabrata et THP-1 |
| Machine PCR | BioRad | DNAEngine | Pour amplifier des marqueurs uniques à partir de l’entrée et de la sortie de l’ADN génomique |
| Four d’hybridation | Labnet | Problot 12S | Pour l’hybridation  ; |
| PhosphorImager | Fujifilm | FLA-9000 | Pour le balayage de membranes hybrides |
| Thermomixeur | Eppendorf | Thermomixer Confort | Pour la dénaturation de marqueurs de signature radiomarqués |
| Unité de documentation sur gel Alphainnontech | Alphaimager | Pour visualiser l’ADN coloré au bromure d’éthidium dans les gels d’agarose |