1. Arenavirus Rescue transfection
Notre système de sauvetage a été basée sur l'utilisation des deux II plasmides d'expression de la protéine de polymérase codant pour la nucléoprotéine (NP) et dépendante de l'ARN-ARN-polymérase (L), les facteurs agissant en trans virales nécessaires à la réplication d'ARN et de l'expression des gènes du génome de l'arénavirus 7, 19, et des plasmides capables de diriger la synthèse intracellulaire, par l'intermédiaire du cellulaire d'ARN polymérase I (pol-I), de la S et L espèces d'ARN antigénomique 7. Dans nos études, nous utilisons l'expression pCAGGS de protéines plasmide, qui utilise le promoteur β-actine de poulet et polyadenylanation des séquences de signaux (PA), et la pol-I humain plasmide, qui utilise la polymérase I humaine séquences promoteur et terminateur murins (Figure 2) . Le S et L segments d'ARN sont clonées dans le plasmide HPOL-I dans une orientation anti-génomique pour permettre la génération de segments d'ARN génomique lors de la transcription par HPOL-I. Pour le sauvetage de wild-type VCML recombinant (rLCMV) et franc # 1 (rCandid n ° 1) le pCAGGS NP et L de chaque virus ont été co-transfectées avec leur pol-I humain respective S et L segments d'ARN (Figure 3). Génération de VCML recombinant trisegmented (r3LCMV) et franc # 1 (r3Candid n ° 1) a suivi un protocole similaire, mais le segment S a été scindé en deux plasmides S pol-I différents, chacun codant pour un gène rapporteur distinctif: dans l'un, la lecture NP ouvert cadre (ORF) a été remplacé par la protéine (GFP) fluorescente verte de journaliste (HPOL-I S GFP / GP) et, dans l'autre, le précurseur de la glycoprotéine virale (GPC) ORF est remplacé par le Gaussia luciférase (Gluc) du gène rapporteur (HPOL-I S NP / Gluc). Une représentation schématique du protocole est illustré à la figure 4. La transfection et le protocole d'infection a été établi pour 6 puits de plaques chauffantes.
- OptiMEM-Lipofectamine 2000 (LPF2000) mélange: Préparer 250 pi de milieu OptiMEM et, selonsur la délivrance de virus, de 10 à 12 pg de LPF2000 (1 pg / pl) par transfection (tableau 1). Un ratio de 2,5 pg LPF2000 par pg d'ADN est recommandée. Incuber pendant 5-10 min à température ambiante. Pendant ce temps, préparer le mélange de transfection plasmidique dans un tube à centrifuger séparé (étape 1.2).
- Mélange de transfection d'ADN plasmidique: Préparer le cocktail de transfection plasmidique dans un tube de centrifugation en utilisant les quantités recommandées pour chaque sauvetage de virus (voir tableau 1). Porter le volume final de 50 pi avec OptiMEM.
- Mélange de plasmides OptiMEM-LPF2000-ADN: Ajouter 250 pi de la LPF2000 OptiMEM mélange (étape 1.1) dans le mélange de transfection d'ADN plasmidique (étape 1.2). Incuber ce mélange pendant 20 - 30 minutes à température ambiante. Pendant ce temps préparer et compter 1 x 10 6 cellules Vero par réaction de la transfection. Les cellules Vero sont transfectées en suspension.
- Préparation des cellules Vero: Vero cells sont cultivées dans des boîtes de 100 mm. Avant de commencer, mettre le PBS 1x, DMEM 10% FBS 1% des médias PS, et le mélange trypsine-EDTA à 37 ° C.
- Laver les cellules deux fois avec 5 ml de PBS 1x.
- Trypsiniser cellules avec 1 ml de trypsine-EDTA et attendre jusqu'à ce que les cellules détachement (environ 5 min). Doux écoutes peut-être nécessaire de détacher complètement les cellules de la vaisselle.
- Soigneusement, remettre en suspension les cellules dans 10 ml de DMEM 10% FBS 1% PS dans un tube à centrifuger de 15 ml.
- Centrifuger les cellules pendant 5 min à 1000 rpm dans une centrifugeuse.
- Resuspendre les cellules dans 10 ml de DMEM 10% de FBS 1% PS et compter les cellules à l'aide d'un hémocytomètre, et ajuster la concentration de 1 x 10 6 cellules / ml. Il a été observé que 0.5 - 1 x 10 6 cellules Vero par transfection a produit les meilleurs résultats.
- Mélanger LPF2000/DNA et cellules: Après 20 - 30 min chambre d'incubation de la température (étape 1.3), ajouter 1 ml de cellules Vero (1 x 10 6) (étape 1.4)le mélange de plasmides OptiMEM-LPF2000-ADN et incuber pendant 5 min à température ambiante.
- Seed LPF2000/DNA-cell mélange dans 6 puits des plaques: Ajouter le mélange d'ADN LPF2000-Vero (étape 1.5) dans les puits de la plaque de 6 puits. Secouer doucement le-bien-plaque 6 et laisser incuber la transfection de la nuit dans l'incubateur à 37 ° C et 5% de CO 2.
- Changer le milieu de transfection: Environ 16 à 24 h post-transfection, retirez le support de transfection, ajouter 2 ml de milieu d'infection et incuber les cellules transfectées pour un 48 heures supplémentaires.
- passage Cellulaire: Après 48 heures d'incubation dans un milieu d'infection, retirer le surnageant de culture tissulaire (TCS) et faire passer les cellules transfectées dans un plat 100 mm. Le TCS contient rarement virus infectieux parce que les cellules transfectées ont besoin d'incubation supplémentaire pour générer des particules virales. Pour le passage de la cellule:
- Laver les cellules deux fois avec 2 ml de PBS 1x.
- Trypsiniser cellules w vec 0,5 ml de trypsine-EDTA et attendre jusqu'à ce que les cellules se détachent.
- Reprendre les cellules dans 1 ml de DMEM 10% FBS 1% PS dans un tube de 1,5 ml.
- Centrifuger les cellules pendant 5 min à 5000 rpm, 4 ° C dans une microcentrifugeuse.
- A mélanger soigneusement les cellules dans 1 ml de milieu d'infection et de transférer les cellules à un plat 100 mm. Amener au volume total de la plaque, avec des milieux infectieuses, à 8 ml, un volume suffisant pour empêcher le séchage des cellules ainsi que pour la concentration du virus.
- Secouer doucement le plat 100 mm et continuer l'incubation de cellules Vero dans l'incubateur à 37 ° C et 5% de CO 2 pendant 72 heures.
- Collection de TCS: Après 72 heures d'incubation, de recueillir le TCS dans un tube à centrifuger de 15 ml. Éliminer les débris cellulaires par centrifugation pendant 5 min à 2500 tpm dans une centrifugeuse. Arénavirus infectieuses se trouve dans le TCS, donc enlever des débris culot cellulaire et stocker le TCS à -80 ° C.
Le "> 2. Confirmation de recombinant Rescue Arenavirus
La détection d'un sauvetage réussi de rLCMV et rCandid n ° 1 est réalisée par une unité de formation de mise au point (FFU) de test d'immunofluorescence (IFA). Pour le sauvetage de virus de type sauvage, nous utilisons des anticorps spécifiques pour le NP virale. Le r3LCMV et r3Candid # 1 codent deux gènes rapporteurs (GFP et Gluc), permettant ainsi la détection et la titration virale sans nécessité d'anticorps par microscopie à fluorescence (GFP) et / ou de luminescence (Gluc).
- Confirmez type sauvage sauvetage arénavirus recombinant: Le jour avant le titrage, laver les cellules Vero deux fois avec PBS, trypsiniser et préparer des plaques à 96 puits pour atteindre 80 - 90% de confluence le lendemain (4 x 10 4 cellules / puits). Secouer doucement les plaques à la main pour obtenir une répartition uniforme des cellules. Culture des cellules, la nuit, dans les 37 ° C incubateur avec 5% de CO 2. Vérifiez les cellules sous le microscope pour confirmer une monocouche, avant de procéder à l'infection:
- Série diluer (10 dilutions) le virus contenant TCS récupéré à partir des cellules transfectées dans le plat 100 mm (étape 1.10) en OptiMEM.
- Retirez le support à partir des cellules Vero ensemencées, laver deux fois avec 50 pi de PBS 1x et infecter les cellules avec 50 pl du virus dilué en série (étape 2.1). Infecter les cellules pendant 1,5 heure à 37 ° C et 5% de CO 2.
- Après l'infection, enlever l'inoculum de virus, ajouter 100 ul de milieu d'infection / puits et incuber les cellules pendant 16 à 18 h. Viral réinfection peut se produire après 18 heures d'incubation, ce qui pourrait entraîner une surestimation des titres viraux.
- A 16 - 18 heures après l'infection, retirer le TCS de chaque puits et fixer les cellules avec 4% de formaldéhyde diluée dans du PBS 1X, pendant 15 min à température ambiante.
- Ensuite, retirez la solution de fixation et perméabiliser les cellules avec 0,1% de Triton X-100 dilué dans du PBS 1X, pendant 10 min à température ambiante.
- Aspirer la solution de perméabilisation, puis laver les cellules 3 fois wie 1x PBS.
- Bloquer les cellules avec du sérum albumine bovine à 2,5% (BSA) dans du PBS 1X (solution de blocage) pendant 1 heure à température ambiante. Alternativement, les cellules peuvent être bloquées pendant une nuit à 4 ° C et a continué avec incubation d'anticorps le lendemain.
- Pendant ce temps préparer l'anticorps primaire. Diluer les anticorps primaires # 1 spécifiques LCMV-et franc dans une solution de blocage, puis centrifuger l'anticorps / solution de blocage pendant 15 min à 3500 rpm. L'anti-LCMV NP clone d'anticorps monoclonal 1.1.3 (01:30 dilution) 16 et l'anticorps anti-NP JUNV monoclonal SA02-BG12 de ressources BEI (dilution 1:500) peut être utilisé pour la détection de rLCMV et rCandid n ° 1 , respectivement.
- Après une heure d'incubation 1, aspirer la solution de blocage et ajouter 50 ul de l'anticorps primaire dans les cellules et incuber pendant 1 heure à 37 ° C.
- A cette époque, diluer l'anticorps secondaire dans une solution de blocage, puis centrifuger le / la solution de blocage d'anticorps pendant 15 min à 3500 rpm. Le polyIgG anti-souris anticorps secondaire clonale de lapin FITC pour la détection des anticorps monoclonaux primaires a été utilisé pour obtenir des images observées sur la figure 5.
- Après 1 heure d'incubation, aspirer l'anticorps primaire, laver 3 fois avec PBS 1x, et ajouter l'anticorps secondaire pendant 30 min à 37 ° C.
- Après 30 minutes d'incubation, aspirer l'anticorps secondaire et laver 3 fois avec PBS 1x. Les cellules sont maintenant prêts à être observé par microscopie de fluorescence à la fois déterminer le succès du sauvetage et de titrage viral en comptant le centre de formation d'unités par ml (FFU / ml).
- r3LCMV et r3Candid n ° 1 de sauvetage viral: Depuis ces virus expriment deux gènes rapporteurs, leur sauvetages peut être contrôlée par microscopie à fluorescence pour détecter l'expression GFP ou expression Gluc en TCS. Rescue peut aussi être confirmé par l'expression de Gluc en TCS. Pour titrer les virus trisegmented, nous suivons les étapes 2.1 à 2.1.4, mais les cellules n'ont pas besoin de be fixé pour déterminer une opération de sauvetage réussie virale en raison de l'expression de la GFP. Le titrage du virus sera déterminée en comptant le FFU / ml. Pour déterminer sauvetage viral réussie par l'expression Gluc, expression Gluc du TCS peut être mesurée à l'aide d'un kit de dosage Gluc (Biolux kit de dosage de luciférase Gaussia, New England Biolabs). À cette fin:
- Ajouter 100 ul de TCS dans une plaque blanche à 96 puits (plaques de microtitration à fond plat, Fisher Scientific).
- Mettre en place le luminomètre (LumiCount, Packard Biosciences).
- Ajouter 50 - 100 ul solution de dosage Gluc (tel que recommandé par le fabricant) pour chaque échantillon et de mesurer l'expression du gène rapporteur Gluc avec le luminomètre. Comme témoin négatif, expression Gluc du TCS contre les virus de type sauvage cellules infectées a été mesurée.
3. Passage de tissu surnageants de culture
Sauvetage virale dépend de l'efficacité de la transfection. Des cellules Vero ont été montrésd'avoir des efficacités de transfection plus faibles que d'autres lignées cellulaires 14. Si les titres de virus dans le TCS sont faibles, infecter des cellules Vero frais à une multiplicité d'infection (MOI) de 0,01 (LCMV) ou 0.1 (Candid n ° 1) pendant 72 heures pour amplifier le virus.