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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
L’échocardiographie est couramment utilisée pour caractériser et quantifier de manière non invasive les changements de la structure et de la fonction cardiaques. Nous décrivons un algorithme ultrason-basé de formation image qui offre une mesure de substitution augmentée de la microstructure myocardique et peut être exécuté utilisant le logiciel d’analyse d’image en libre accès.
L’échocardiographie est une modalité largement accessible de formation image qui est généralement employée pour caractériser et quantifier non envahissantement des changements de structure et de fonction cardiaques. Les évaluations ultrasoniques du tissu cardiaque peuvent inclure des analyses de l’intensité du signal de rétrodiffusion dans une région d’intérêt donnée. Les techniques précédemment établies se sont appuyées principalement sur la valeur intégrée ou moyenne des intensités de signal de rétrodiffusion, qui peuvent être sensibles à la variabilité des données aliasées à partir de faibles fréquences d’images et de retards de temps pour les algorithmes basés sur la variation cyclique. Ci-dessus, nous décrivons un algorithme ultrason-basé d’imagerie qui s’étend des méthodes précédentes, peut être appliqué à une trame d’image simple et tient compte de la distribution complète des valeurs d’intensité de signal dérivées d’un échantillon myocardique donné. Lorsqu’il est appliqué à des données d’imagerie représentatives de souris et d’humains, l’algorithme fait la distinction entre les sujets avec et sans exposition à une résistance chronique après charge. L’algorithme offre une mesure de substitution améliorée de la microstructure myocardique et peut être effectué à l’aide d’un logiciel d’analyse d’image en libre accès.
L’échocardiographie est une modalité largement accessible de formation image qui est généralement employée pour caractériser et quantifier non envahissantement des changements de structure et de fonction cardiaques. Les évaluations par ultrasons du tissu cardiaque peuvent inclure des analyses de l’intensité du signal de rétrodiffusion dans une région d’intérêt donnée à un seul moment dans le temps, ainsi qu’au cours du cycle cardiaque. Des études antérieures ont suggéré que les mesures de l’intensité sonore du signal puissent identifier la présence sous-jacente du désarroi myocardique de fibres, viable contre le tissu myocardique non viable, et de la fibrose interstitielle1-3. Nous nous référons à la « microstructure » myocardique comme l’architecture tissulaire qui peut être caractérisée, utilisant l’analyse échographique, au-delà des mesures linéaires de la taille brute et de la morphologie. En conséquence, des analyses de l’intensité du signal échographique ont été utilisées pour évaluer les altérations microstructurales du tissu myocardique dans le cadre de la cardiomyopathie hypertrophique et dilaté4,5,de la coronaropathie chronique6,7et de la cardiopathie hypertensive8,9. Cependant, les techniques précédemment établies se sont principalement appuyées sur la valeur intégrée ou moyenne des intensités de signal de rétrodiffusion, qui peuvent être sensibles à la variabilité du bruit aléatoire5,des données aliasées à partir de faibles fréquences d’images10et des délais pour les algorithmes basés sur la variation cyclique11.
Ici, nous décrivons la méthode d’utilisation d’un algorithme d’analyse d’image basé sur ultrasons qui s’étend des méthodes précédentes; cet algorithme se concentre sur une seule trame diastolique finale pour l’analyse d’image et tient compte de la distribution complète des valeurs d’intensité du signal dérivées d’un échantillon myocardique donné. En utilisant le péricarde comme référence dans le cadre12,13,l’algorithme quantifie de manière reproductible la variation des distributions d’intensité du signal échographique et offre une mesure de substitution améliorée de la microstructure myocardique. Dans un protocole étape par étape, nous décrivons les méthodes de préparation des images à utiliser, d’échantillonnage des régions d’intérêt et de traitement des données dans des régions d’intérêt sélectionnées. Nous montrons également des résultats représentatifs de l’application de l’algorithme à des images échocardiographiques acquises auprès de souris et d’humains avec une exposition variable au stress après charge sur le ventricule gauche.
1. Préparation des images pour les analyses
2. Échantillonnage du retour sur investissement
3. Analyse et traitement des données
4. Quantification de la variabilité cyclique
L’analyse de l’intensité du signal est effectuée en 4 étapes principales(Figure 1),y compris: 1) la sélection et le formatage de l’image, 2) le retour sur investissement et les zones de référence de l’échantillonnage, 3) l’application de l’algorithme et 4) le traitement des valeurs finales pour produire des rapports d’intensité myocardique / péricardique. La sélection et la taille du retour sur investissement sont normalisées pour limiter la variabilité inter-utilisateurs et intra-utilisateur (Figure 2). Le positionnement de chaque ROI est également normalisé par rapport aux structures anatomiques de chaque sujet pour limiter la variabilité intersubjecte et intrasubjecte.
En tant que mesure de la densité myocardique, l’algorithme devrait révéler des changements dans l’intensité du signal tout au long du cycle cardiaque, correspondant à l’augmentation prévue de la densité myocardique dans la systole par rapport à la diastole. Comme le montre la figure 3,des valeurs centiles plus élevées de l’intensité du signal accentuent la variabilité cyclique chez les souris avec et sans 7 semaines d’exposition à la résistance après charge(c.-à-d. une souris qui a subi une constriction aortique ascendante par rapport à une souris témoin de véhicule qui a subi une chirurgie simulée).
L’analyse d’un seul cadre diastolique final(figure 4)a également permis de noter des différences significatives pour les souris et les sujets humains exposés à un stress chronique après charge (cas) par rapport à leurs homologues représentatifs (témoins). La plage et l’ampleur de l’intensité du signal diffèrent d’un cas à l’autre et d’un contrôle à l’autre. Comme on le voit dans les analyses de la variabilité cyclique, 80e par rapport aux valeurs du 50e centile dans chaque distribution de l’intensité du signal suggèrent une plus grande différence relative dans l’intensité du signal entre les cas et les témoins.
L’algorithme présenté ici fournit une sortie sous la forme de rapports myocardiques/péricardiques d’intensité du signal, où les valeurs péricardiques servent de référent dans la trame(Figure 5). Le rapport myocardique-à-péricardique d’intensité de signal a été déterminé basé sur l’analyse de simple-trame des images acquises des commandes représentatives et des cas de l’effort d’afterload. Concordant avec les résultats ci-dessus, le rapport myocardique-à-péricardique des valeurs d’intensité de signal de 80e centile offre la plus grande capacité de différencier entre les contrôles et les cas. Les différences attendues dans la microstructure myocardique, d’après les résultats de notre analyse d’images, étaient compatibles avec les résultats de l’histologie des tissus myocardiques chez les souris témoins et les souris cas 7 semaines suivant une chirurgie par feinte ou par bande aortique, respectivement(figure 6).

Figure 1. Processus de flux de travail pour une image individuelle. Le processus comprend quatre étapes principales qui peuvent être répétées lors de la comparaison des sujets ou lors de la quantification de la variabilité cyclique.
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Figure 2. Technique d’échantillonnage de la région d’intérêt (ROI). L’algorithme d’analyse d’image est normalisé pour une application chez la souris(A)et chez l’homme(B). Des sélections myocardiques et péricardiques pour des images représentatives de souris et d’homme, respectivement, sont montrées.
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Figure 3. Variation de l’intensité du signal échographique tout au long du cycle cardiaque. L’algorithme a été appliqué à une région myocardique d’intérêt sur des images consécutives de DICOM acquises à partir d’une souris témoin représentative(A)et d’une souris à bandes aortiques(B). La fréquence d’images était de 212 pour les deux images. Pour ces images, la variabilité cyclique a été évaluée à l’aide de 3 points de coupe :20 e centile (losange),50 e centile (carré) et 80e centile (triangle). La variabilité cyclique relative est plus élevée pour les valeurs du80 e centile que pour les valeurs de point de coupure inférieures. Cliquez ici pour agrandir l’image.

Figure 4. Les distributions d’intensité du signal sont indiquées à partir de l’analyse à trame unique d’images représentatives de souris et d’humains. Les histogrammes montrent des distributions de l’intensité du signal dérivées du myocarde d’une souris témoin à 7 semaines après la chirurgie simulée(A),une souris à bandes aortiques à 7 semaines après la chirurgie(B),un humain normot lumineux(C)et un humain hyperténieur(D). Les lignes verticales bleues indiquent les valeursdu 20 e centile, du50 e centile et du80 e centile. Les distributions de l’intensité du signal sont décalées vers la droite, et sont plus grandes dans la gamme, pour les sujets avec le stress chronique d’après charge(c.-à-d. aortique-banded comparé à la souris de contrôle, et hypertendus comparé à l’humain normotensive).
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Figure 5. Données représentatives produites par l’algorithme d’analyse d’image. (A) montre les données d’une souris à feinte (témoin) par rapport à la souris à bandes aortiques (cas) à 7 semaines. (B) montre les données d’un humain avec une pression artérielle normale (contrôle) par rapport à un humain avec l’hypertension chronique (cas). Le rapport myocardique-à-péricardique d’intensité de signal a été déterminé utilisant 3 méthodes analytiques dans l’algorithme : rapport des valeurs de 20e centile ; rapport des valeurs du50 e centile; et rapport des valeurs du80 e centile. La plus grande différence entre les contrôles et les cas est démontrée en utilisant des rapports des valeurs du 80e centile de l’intensité du signal.
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Figure 6. Différences dans l’histologie myocardique de tissu entre les souris avec et sans exposition au stress d’afterload. Les sections tachées trichromes du ventricule gauche du représentant Masson sont montrées pour une souris qui a subi une chirurgie simulée(A: contrôle) et une souris qui a subi une bande aortique(B: cas) à 7 semaines après la chirurgie. Les sections montrent la présence du dépôt substantiel de collagène et de la fibrose interstitielle dans le cas comparé au contrôle. Les barres d’échelle représentent 50 μm.
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Aucun conflit d’intérêts déclaré.
L’échocardiographie est couramment utilisée pour caractériser et quantifier de manière non invasive les changements de la structure et de la fonction cardiaques. Nous décrivons un algorithme ultrason-basé de formation image qui offre une mesure de substitution augmentée de la microstructure myocardique et peut être exécuté utilisant le logiciel d’analyse d’image en libre accès.
Nous sommes reconnaissants des ressources fournies par le Laboratoire central de physiologie cardiovasculaire de la Harvard Medical School/Brigham and Women’s Hospital. Ce travail a été soutenu en partie par le financement des national institutes de la santé subventions HL088533, HL071775, HL093148 et HL099073 (RL). MB a reçu une bourse postdoctorale de l’American Heart Association. KU est récipiendaire d’une bourse postdoctorale affiliée aux fondateurs de l’American Heart Association. SC a été soutenu par un prix de la Fondation Ellison.
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