Les protocoles décrits ici mesurent détection de cellules T infectées par le GFP-tagged virus VIH-1 qui diffèrent seulement par leur capacité à exprimer Vpu, comme décrit dans notre récent rapport 18. Cependant, ces méthodes pourraient facilement être modifiés pour étudier détection de virus non marqués ainsi que les virus dépourvus d'autres gènes viraux qui pourraient moduler détection innée. Si les virus utilisés ne pas exprimer la GFP, le pourcentage de cellules cibles infectées doivent être déterminés par un autre moyen avant la co-culture, comme p24 (capside) coloration intracellulaire et cytométrie en flux ou par ELISA p24. Par ailleurs, ces protocoles peuvent être utilisés avec différentes cellules T cibles, y compris une variété de lignées cellulaires et des cellules primaires disponibles.
Les méthodes décrites dans ce manuscrit ont un certain nombre d'avantages par rapport aux premières méthodes utilisées pour étudier le VIH-1 de détection. Tout d'abord, il a été établi par un certain nombre de groupes que acellulaire VIH-1 pdes articles sont des inducteurs pauvres de type I IFN 2,13,14. En outre, les premières études comptaient sur les méthodes basées sur ELISA IFNa âgés de quantifier la quantité de type I IFN produit. Une limitation de cette technique de détection est que la plupart des kits ELISA IFNa âgés seule mesure un type d'IFNa, tout en donnant sur les autres types de IFNa et IFNß. L'utilisation des lignées de cellules rapporteurs décrits surmonte cette limitation que la concentration de toutes les formes bioactives de IFN humains de type I peut être mesurée à la fois. La technique est très sensible, moins cher que la nouvelle génération de kit ELISA IFN et pour de nombreux donateurs de grandes quantités d'IFN de type I peuvent être facilement détectés. Néanmoins, ce protocole peut être facilement adapté pour une utilisation avec d'autres type I IFN méthodes de lecture tels que ELISA.
Les étapes critiques: Il est important que la qualité de tous les composants cellulaires (deux cibles et effecteurs) être étroitement contrôlée. Contamination potentielle, même lorsque asympmatique, doit être surveillée et contrôlée. Comme nous l'avons mentionné précédemment, antibiotiques contrôlé contamination bactérienne asymptomatique, et potentiellement d'autres pathogènes intracellulaires tels que les mycoplasmes, peut générer des réponses immunitaires similaires à ceux observés après infection VIH-1, à savoir la production d'IFN de type I. En outre, tous les réactifs doivent être libres de LPS ou d'autres endotoxines potentiels. De même, le suivi des CMSP et pDC est également important car les échantillons humains peuvent souvent être amorcés par des infections en cours sous-jacents, qui peuvent affecter la détection normale. Nous vous recommandons de toujours, y compris les contrôles négatifs proposées, telles l'absence de cellules cibles ainsi que les co-cultures avec des cellules pseudo-infectées. La viabilité des cellules infectées est également important pour une détection correcte pDC depuis l'IFN de type I ne se produit après co-culture avec des cellules apoptotiques 2,14.
Une limitation importante de la technique est la nécessité pour les cellules primaires fraîchement isolées. Cette procédure n'a pas ététesté en utilisant CMSP ou pDCs qui ont été soit préalablement congelés ou maintenues en culture. L'isolement des PBMC est de main-d'oeuvre et ces cellules ont une durée de vie très limitée. En outre, des protocoles standards pour la protection contre les agents pathogènes transmissibles par le sang devraient être utilisées tout en travaillant avec du sang humain. Il ya souvent plusieurs sources de variabilité associées au travail impliquant des cellules humaines fraîchement isolées. Parmi eux se trouvent les différentes procédures mises en œuvre pour isoler ces cellules, et la variabilité hérité rencontrées du donneur à donneur. Bien qu'il soit impossible d'éviter la variabilité entre les bailleurs de fonds, l'utilisation des contrôles positifs proposées, telles que la mesure réponse à des agonistes connus de TLR7 et TLR9 voies, serait de fournir un contrôle interne important pour ces expériences. Nous avons observé qu'une réponse robuste à des agonistes TLR9 de la voie pourrait être corrélée avec une réponse pDC en bonne santé, tandis qu'une voie TLR7 sensibles est nécessaire pour une bonne réponse contre le VIH-1 3.
Basé sur les observations faites par les États-Unis et d'autres 2, l'enrichissement des PDC à partir de PBMC est souvent pas nécessaire. Toutefois, si le protocole expérimental l'exige (par exemple dans le contexte où l'épuisement des marqueurs spécifiques de la surface est nécessaire pDC) sélection négative est préférable à une sélection positive, les cellules restent libres de l'anticorps après le processus de sélection. PDCs isolés apoptose rapide dans la culture. Pour les expériences qui ont besoin de ces cellules à cultiver pendant une période de temps prolongée, les milieux de culture peuvent être complétés avec de l'IL-3. Cette cytokine induit pDC prolifération et l'apoptose inhibe leur 16. Cependant, l'IL-3 utilisation doit être étroitement contrôlé car il peut conduire à la maturation des pDC ou la différenciation.
La méthode décrite ici combine cible du VIH-1 des cellules infectées avec CMSP ou pDCs fraîchement isolés afin de recréer les étapes initiales impliqués pendant la détection innée. Cette méthode sera sans doute utile de Explore événements immunitaires innées précoces associés à l'infection à VIH. Bien que les protocoles associés visent à mesurer l'IFN de type I, ils pourraient facilement être modifiés pour mesurer d'autres molécules bioactives libérées de pDC lors de la reconnaissance des cellules infectées. Celles-ci peuvent inclure: l'IFN de type III (IFN-λ), cytokines pro-inflammatoires (telles que le TNF-α et IL-6) et le chimiokines CXCL10, CCL4, CCL5 et 17.