Ce protocole décrit en détail une méthode pour reconstituer les protéines de liaison chorophyll a / b in vitro. Cette technique permet le pliage de ces complexes pigment-protéine in vitro à partir de l'apoprotéine, qui peut être obtenu par surexpression dans un système hétérologue et des pigments extraits de plantes ou d'algues. Après reconstitution, le complexe pigment-protéine repliée est purifié de l'excès de pigments et l'apoprotéine plié en deux étapes. La première étape (figure 1 AB) est basée sur la présence d'un marqueur His à l'extrémité C-terminale de la protéine, ce qui permet l'élimination d'une grande partie des pigments non liés. La deuxième étape de purification utilise la centrifugation en gradient de densité de saccharose, (figure 2) où la protéine dépliée migre généralement plus lente que la bande verte contenant la protéine reconstituée. Le but de la reconstitution in vitro est d'obtenir des complexes avec le même bonliens que les natifs. Pour illustrer ce résultat, les propriétés spectroscopiques d'un complexe in vivo lumière récolte est comparé avec le même complexe LHC reconstitué in vitro 13,20,21. Le spectre d'absorption de la SLL dans le domaine visible (350 nm et 750 nm) dépend de la composition de pigment de complexe, ainsi que sur l'environnement du pigment (qui comprend la protéine) et il est par conséquent un outil sensible pour contrôler la qualité de la reconstitution. Sur la figure 3, le spectre d'absorption de CP24, une chlorophylle a / b protéine d'Arabidopsis thaliana, reconstitué in vitro de liaison, est comparé avec le spectre de la même complexe purifié à partir de 21 Arabidopsis thylakoïdes. Dans les spectres, il est possible de reconnaître la Qy et la transition de Soret (Chl a des pics à 671/439 nm) et b (Chl pics à 649/466 nm). Les complexes natifs et reconstituées montrent identique absoLes spectres de rption, indiquant une composition de pigment pratiquement identique et leur organisation. La spectroscopie de fluorescence peut être utilisée pour évaluer la qualité du complexe reconstitué. Les spectres d'émission de fluorescence est mesurée lors de l'excitation à différentes longueurs d'onde, qui excitent préférentiellement différents pigments: Chl a à 440 nm, Chl b à 475 nm, et Xanthophylles à 500 nm. Dans un complexe protéine-de pigment correctement repliée, Chl b et xanthophylles transfèrent leur énergie d'excitation principalement de Chl un espace de quelques picosecondes, et la fluorescence provenant d'un système en équilibre thermique résultant en un pic unique avec la même forme et les maxima de tous les trois excitation les longueurs d'onde (figure 4A-B). La présence de Chl b non coordonné à la protéine peut être reconnu par un pic ou épaulement supplémentaire autour de 650 nm à 475 nm d'excitation (Figure 4C). La présence de libre Chl mène une placeà l'émission supplémentaire autour de 675 nm, ce qui est principalement présente sur 440 nm excitation. Les spectres d'émission de fluorescence à 475 nm d'excitation à la fois reconstitué et les complexes CP24 natifs (figure 4D) correspond à un seul pic à 681 nm, ce qui indique que complexe reconstitué est correctement repliée. Une confirmation supplémentaire que le complexe pigment-protéine est correctement reconstitué vient de dichroïsme circulaire (CD) des mesures. Le signal de CD dans la région visible dépend des interactions excitoniques entre pigments et il est donc très sensible à même de petits changements dans l'organisation des chromophores 22. Figure 5 montre les spectres CD reconstituée et natif CP24, avec les pics typiques d'empreintes digitales au 681 nm, 650 nm et 481 nm. En conclusion, la grande similitude entre les propriétés spectroscopiques de maternelle et le CP24 reconstitué confirme que complexes, les rendements de la procédure de reconstitution de type natif suita Blé pour l'étude in vitro des protéines collecteurs de lumière.

Figure 1: Représentation de la purification des protéines LHC recombinantes avec un marqueur His en utilisant une colonne de nickel. (A) Au cours de la purification, marquée par His protéines, composé de deux complexes reconstitués (hexagonaux vert) et les protéines non reconstitué / agrégé (orange hexagone) sont liés à la surface de la Ni-Sepharose (point bleu), tandis que les pigments non liés (petites taches de couleur) traversent. (B) Lorsque la colonne est lavée avec le tampon d'élution contenant de l'imidazole, les protéines reconstituées et un-reconstituée sont collectées dans le flux à travers.
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Figure 2 gradient de saccharose de LHCII reconstitué après purification par colonne de nickel. Reconstitués Les complexes sont séparés du pigment libre par le gradient de densité. La bande vert foncé représente LHCII reconstitué et le fond vert pâle est composée de pigments libres.

Figure 3 Spectres d'absorption de protéines reconstitué CP24 (rCP24, ligne rouge) et celui d'origine (nCP24, ligne noire) isolé d'Arabidopsis thaliana. Dans les deux spectres, il est possible de reconnaître la Qy et la transition Soret de Chl a (pointes à 671/439 nm) et Chl b (pics à 649/466 nm). Ce chiffre a été modifié depuis Passarini et al. 2014 21.
Figure 4 de spectres d'émission de fluorescence. L'spectres d'émission de fluorescence du complexe reconstitué CP24 de type sauvage
(A) et normalisées par rapport à la valeur maximale
(B) indiquant un transfert d'énergie efficace de Chl et
b Xanthophyls à
un CHL.
(C) Fluorescence spectres d'émission de CP24 reconstitué (rCP24) et le complexe natif (nCP24) isolé
d'Arabidopsis thaliana. Les spectres sont normalisés au maximum du pic
(D). S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure. 
Figure 5 dichroïsme circulaire Spectra. Reconstitué CP24 (rCP24, ligne rouge) et le natif complexe (nCP24, ligne noire) isolé d'Arabidopsis thaliana montre spectres très semblables.

Figure 6 Spectres d'absorption de CP29 type sauvage (CP29_WT) et muté CP29 (CP29_A2). La ligne verte montre les différences entre les deux parcelles.
| Tous les tampons peuvent être stockés à 4 ° C. | | |
| Composants | Concentration finale | Notes complémentaires |
| Rectification tampon | Sorbitol | 0,4 M | |
| Tricine | 0,1 M | pH 7,8 |
| NaCl | 10 mM | |
| MgCl2 | 5 mM | |
| Poudre de lait | 0,5% p / v | |
| Le tampon de lavage | Sorbitol | 50 mM | |
| 5 mM | pH 7,8 |
| EDTA | 10 mM | pH 8 |
| Lysis Buffer | Tris | 50 mM | pH 8 |
| Saccharose | 2,5% p / v | |
| EDTA | 1 mM | pH 8 |
| tampon de détergent | NaCl | 200 mM de NaCl | |
| L'acide désoxycholique | 1% p / v | |
| 1% p / v | |
| Tris | 20 mM | pH 7,5 |
| EDTA | 2 mM | pH 8 |
| bêta-mercaptoéthanol | 10 mM | |
| Triton tampon | Triton X-100 | 0,5% p / v | |
| Tris | 20 mM | pH 7,5 |
| bêta-mercaptoéthanol | 1 mM | |
| Tampon TE | Tris | 50 mM | pH 8 |
| EDTA | 1 mM | pH 8 |
| Reconstitution Buffer | HEPES | 200 mM | |
| Saccharose | 5% p / v | |
| Lithiumdodecylsulfate (LDS) | 4% p / v | |
| Benzamidine | 2 mM | |
| Aminocaproïque | 10 mM | |
| OG tampon | Octylglucoside | 1% p / v | |
| 12,5% en poids / volume | |
| NaCl | 0,2 M | |
| HEPES | 20 mM | |
| Imidazole | 10 mM | |
| OG Rincer tampon | n-dodécyl-bêta-D-maltoside (DM-β) | 0,06% p / v | |
| HEPES | 40 mM | pH 7,5-9 |
| NaCl | 0,2 M | |
| Tampon d'élution | Imidazole | 0,5 M | |
| 0,06% p / v | |
| HEPES | 40 mM | pH 8 |
| NaCl | 0,2 M | |
| Solution de saccharose | Saccharose | 20% p / v | |
| n-dodécyl-bêta-D-maltoside (DM-β) | 0,06% p / v | |
| HEPES | 0,01 M | pH 7,6 |
| Acétone 80% tamponné avec du carbonate de sodium | Acétone | 80% v / v | |
| Carbonate de sodium | 1 M | |
| Ethanol 96% tamponné avec du carbonate de sodium | L'éthanol | 96% v / v | |
| Carbonate de sodium | 1 M | |
px; "> Saccharose n-dodécyl-bêta-D-maltoside (DM-β)
Tableau 1 Liste des tampons et des solutions utilisées dans ce protocole.
rCP26 | Chla a / b mélange | Chla | Chl a | Chl b | Neo | Alto | Luth | Chl tot | Chl / Car |
| nCP26 | - | 2,2 ± 0,05 | 6.2 | 2.8 | 0,61 | 0,38 | 1.02 | 9 | 4,5 ± 0,1 |
| rCP26 | 8 | 2,71 ± 0,05 | 6,57 | 2.43 | 0,72 | 0,32 | 0,97 | 3,9 ± 0,04 |
| rCP26 | 5.5 | 2,25 ± 0,05 | 6.23 | 2,77 | 0,77 | 0,3 | 0,96 | 9 | 4,0 ± 0,1 |
| rCP26 | 3 | 2,08 ± 0,04 | 6,08 | 2,92 | 0,76 | 0,3 | 1,04 | 9 | 4,1 ± 0,1 |
| rCP26 | 1 | 1,7 ± 0,05 | 5.7 | 3.3 | 0,7 | 0,3 | 0,9 | 9 | 4,3 ± 0,05 |
| rCP26 | 0,3 | 1,11 ± 0,04 | 4.7 | 4.28 | 0,7 | 0,3 | 0,9 | 9 | 4,2 ± 0,2 |
| 0,05 | 0,23 ± 0,01 | 1.4 | 5.6 | 0,58 | 0,24 | 1.11 | 7 | 3,1 ± 0,06 |
| rCP26 | <0,01 | 0,11 ± 0,01 | 0,7 | | 0,64 | 0,3 | 1,08 | 7 | 3,06 ± 0,06 |
"> 9 pt; largeur: 48pt "width =" 64 ">
Tableau 2 teneur en pigment de CP26 natif complexe par rapport à reconstituées complexes protéine-pigment avec différents Chl a / b Ratios 39.