La comparaison entre deux groupes distincts ou plus, tels que la santé et la maladie, est nécessaire pour déterminer l’état cellulaire. Les mitochondries sont au cœur de la santé cellulaire en raison de leur rôle à la fois dans le métabolisme cellulaire et la production d’énergie, ainsi que dans le contrôle de l’apoptose. Par conséquent, l’évaluation directe des mitochondries isolées et la perturbation mitochondriale offrent la possibilité de déterminer si une (dys)fonction spécifique aux organites se produit. Les méthodes décrites dans ce protocole comprennent l’isolement de mitochondries intactes et fonctionnelles à partir de cellules cultivées HEK et de foie et de moelle épinière de souris, mais peuvent être facilement adaptées pour être utilisées avec d’autres cellules cultivées ou tissus animaux. La fonction mitochondriale évaluée par TMRE et l’utilisation de découpleurs et d’inhibiteurs mitochondriaux courants en conjonction avec un lecteur de plaques fluorescentes permettent à ce protocole non seulement d’être polyvalent et accessible à la plupart des laboratoires de recherche, mais aussi d’offrir un débit élevé.