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Helicobacter pylori est une bactérie de forme hélicoïdale à Gram négatif qui colonise la niche gastrique humaine de la moitié de la population humaine1,2. H. pylori est la principale cause de cancer gastrique, la deuxième cause de décès liés au cancer dans le monde3. L’un des facteurs de virulence qui a été associé à un risque accru de maladie gastrique est l’îlot de pathogénicité Cag, une région de 40 kb dans le chromosome de H. pylori qui code pour un système de sécrétion de type IV et la molécule effectrice apparentée, CagA4,5. Le Cag-T4SS est responsable de la translocation du CagA et du peptidoglycane dans les cellules épithéliales de l’hôte5,6. L’activité du Cag-T4SS entraîne de nombreux changements dans la biologie de la cellule hôte, notamment la régulation à la hausse de l’expression des cytokines, l’activation des voies pro-inflammatoires, le remodelage du cytosquelette et l’induction de réseaux de signalisation cellulaire oncogénique5-8. Le Cag-T4SS est une machine macromoléculaire composée de composants de sous-assemblage couvrant la membrane interne et externe et s’étendant de la cellule à l’espace extracellulaire. La partie extracellulaire du Cag-T4SS est appelée « pilus »5. De nombreuses études ont démontré que les pili Cag-T4SS se forment à l’interface hôte-pathogène9,10. Cependant, les caractéristiques environnementales qui régulent la biogenèse de cet organite important restent largement obscures. Récemment, nous avons rapporté que les conditions de faible disponibilité du fer augmentaient l’activité de Cag-T4SS et la biogenèse du pilu. Nous présentons ici un protocole optimisé pour cultiver H. pylori dans des conditions variables de disponibilité du fer avant la co-culture avec des cellules épithéliales gastriques humaines. De plus, nous présentons le protocole complet pour la visualisation du phénotype hyper-pilié présenté dans des conditions de restriction en fer par des analyses de microscopie électronique à balayage à haute résolution.