Article de méthode

Silence de

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DOI :

10.3791/52849

12 août 2015

Dans cet article

Résumé

Le silençage génique par siRNA représente une stratégie expérimentale commode pour analyser les fonctions biologiques dépendantes de BRCA2 avec des implications immédiates pour mieux comprendre la biologie du cancer. Une méthode permettant de réduire efficacement au silence BRCA2, ainsi que la procédure expérimentale visant à détecter et à quantifier les changements dans l’expression de la protéine BRCA2 par immunotransfert dans des lignées cellulaires humaines, sont présentées.

Résumé

Silence de la protéine suppresseur de tumeur BRCA2 et sa détection par des analyses biochimiques classiques représentent un grand défi technique en raison de la grande taille de la protéine BRCA2 humain (environ 390 kDa). Nous rapportons modifications des protocoles standard de transfection et de réduire au silence immunoblotting siARN BRCA2 humain endogène et détecter la protéine BRCA2, respectivement, dans des lignées cellulaires epitheliales humaines. Les étapes clés comprennent une forte siRNA transfection ratio de réactif et de deux rondes subséquentes de transfection de siRNA dans la même expérience. L'utilisation de ces et d'autres modifications au protocole standard, nous réalisons systématiquement plus de 70% le silençage du gène BRCA2 humain tel que jugé par une analyse immunoblot avec des anticorps anti-BRCA2. En outre, la dénaturation des lysats de cellules à 55 ° C au lieu de la classique de 70 à 100 ° C et d'autres techniques d'optimisation de la procédure d'immuno-empreinte permet la détection de la protéine BRCA2 intact même when très faibles quantités de matière de départ sont disponibles ou lorsque les niveaux d'expression de protéine BRCA2 sont très faibles. Silençage efficace de BRCA2 dans les cellules humaines propose une stratégie utile pour perturber la fonction de BRCA2 dans les cellules avec BRCA2 intacte, y compris les cellules tumorales, à examiner de nouvelles voies moléculaires et les fonctions cellulaires qui peuvent être affectés par des mutations de BRCA2 pathogènes dans les tumeurs. Adaptation de ce protocole pour le silençage et l'analyse d'autres protéines «grands» comme BRCA2 efficace devrait être facilement réalisable.

Introduction

Le gène BRCA2 (BReast susceptibilité au cancer gène-2) code pour une protéine suppresseur de tumeur qui joue un rôle crucial dans la réparation des cassures double-brin par régulation de la fonction de l'enzyme recombinase Rad51 1. BRCA2 a également été impliquée dans la modulation de la transcription dans la cellule et le contrôle du cycle 2. Les mutations germinales dans le gène BRCA2 induisent un mode autosomique dominant la susceptibilité au cancer du sein et le cancer de l'ovaire chez les femmes et le cancer de la prostate chez les hommes, ainsi que la prédisposition à d'autres types de cancer 3,4. C....

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Protocole

1. Préparer des solutions siARN

  1. Remettre en suspension 5 nmol de brouillés (Ctrl) et 5 nmol de pastilles séchées BRCA2 siRNA dans 100 ul d'eau exempte de RNase (concentration finale de siRNA: 50 um). Ceci est le stock siRNA et doit être stocké à -20 ° C en 10 aliquotes.
  2. Prendre une aliquote de 10 pi de stock siRNA et ajouter 40 ul d'eau sans RNase pour obtenir la solution de travail 10 uM siRNA. Cette dilution doit être conservé à -20 ° C jusqu'à utilisation.
    NOTE: La solution de travail siRNA ne doivent pas subir de congélation / décongélation plus de 3 fois.

2. Ensemencement des ligné....

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Résultats

Avant de procéder à un dosage biologique / biochimique pour examiner l'effet de BRCA2 silence sur les fonctions des cellules, la première étape consiste à vérifier la spécificité de l'inactivation à l'aide d'un ARNsi crypté (non-ciblage siRNA) côte à côte avec BRCA2 siRNA (figure 1A ). Il est important d'effectuer un deuxième tour de transfection de siRNA avec un ratio élevé siRNA / transfection pour obtenir un rendement élevé de BRCA2 silencieux. En effet, effectue.......

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Discussion

Parce que les mutations de la lignée germinale de la sonde du gène BRCA2 à un risque accru de plusieurs types de cancer, notamment le cancer femelle et mâle du sein, du cancer de l'ovaire, le cancer de la prostate, le cancer du pancréas et le mélanome 3,4, un certain nombre d'études ont été entreprises pour comprendre la fonction biologique de la protéine BRCA2. La plupart de ces études sont d'origine génétique basée principalement en raison de difficultés techniques dans l'analyse d&.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Ce travail a été soutenu par les subventions FIRB-Merit RBNE08YFN3_005 et RBNE08HWLZ_012, et le ministère italien de l’Économie et des Finances au CNR pour le projet « FaReBio di Qualità ».

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
BRCA2 siRNADharmaconL-003462-00SMARTpool : ON-TARGETplus BRCA2 siRNA
Ctrl siRNADharmacon  ; D-001810-10-05de lipofectamine non ciblée ON-TARGETplus
  ;Life Technologies13778075Réactif de transfection
OPTI-MEM I Sérum réduit Medium LifeTechnologies31985-070Milieu pour procédure de transfection
NuPAGE Tris-Acétate 3-8 % 1,5 mm Gel préfabriquéLife TechnologiesEA0378Gel pour électrophorèse des protéines
NuPAGE LDS Tampon d’échantillons  ;Life TechnologiesNP0007Réactif pour électrophorèse protéique
NuPAGE Agent réducteur d’échantillon (10x)Life TechnologiesNP0004Réactif pour électrophorèse protéique
NuPAGE AntioxidantLife TechnologiesNP0005Réactif pour électrophorèse protéique
HiMark Étalon protéique pré-coloréLife TechnologiesLC5699Marqueur précoloré pour gel électrophorèse
XCell SureLoc Mini-Cell  ; SystemLife TechnologiesEI0002Équipement pour l’électrophorèse/transfert de protéines
NuPAGE Tris-Acétate SDS Running BufferLife TechnologiesLA0041Réactif pour Western blot
membrane PVDFMilliporeIPVH00010Réactif pour Western blot
NuPAGE Transfer BufferLife TechnologiesNP0006-1Réactif pour Western blot
BRCA2 H-300 Anticorps polyclonal de lapinSanta Cruz Biotechnologysc-8326dilution 1:300
Anticorps monoclonal bêta-tubulineSigma AldrichT4026-100ULdilution 1:1 000
Lait écrémé en poudreSigma Aldrich70166Réactif pour transfert Western
Tween-20Sigma AldrichP1379Réactif pour transfert Western
Substrat chimiluminescent SuperSignal West Pico/FemtoPierce Thermo Scientific34080/34096Système de chimiluminescence
Cellules PNT1ASIGMA Aldrich (pour ECACC)95012614PNT1A humain, épithélium normal de la prostate immortalisé avec des cellules Nthy SV40
SIGMA Aldrich (pour ECACC)90011609Nthy-ori 3-1 Cell Line Cellules épithéliales folliculaires thyroïdiennes humaines
Prolifération cellulaire Kit I (MTT)Roche11465007001Kit pour les tests de prolifération cellulaire
Réactif d’ARNiMAX

Références

  1. Thorslund, T., West, S. C. BRCA2: a universal recombinase regulator. Oncogene. 26, 7720-7730 (2007).
  2. Yoshida, K., Miki, Y. Role of BRCA1 and BRCA2 as regulators of DNA repair, transcription, and cell cycle in response to DNA damage. Cancer Sci. 95<....

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Mots-clés

Silen age de BRCA2transfection d siARNWestern blotd tection prot iquepr paration de lysat cellulaireprot ines de poids mol culaire levanalyse des suppresseurs de tumeursefficacit du knockdown g niqueoptimisation de l immunoblotratio de transfection d siARN

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