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Article de méthode

Approche génétique de l'avant pour découvrir les gènes de résistance au stress chez la souris - un écran haute-débit dans les cellules ES

7.2K vues

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DOI :

10.3791/53062

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11 novembre 2015

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Dans cet article

Résumé

La résistance au stress est l'une des caractéristiques de longévité et est connu pour être génétiquement régie. Ici, nous avons développé une méthode à haut débit impartiale pour le dépistage de mutations qui confèrent la résistance au stress dans des cellules ES avec laquelle de développer des modèles de souris pour les études de longévité.

Résumé

Les criblages génétiques pilotés par phénotype chez la souris sont une technique puissante pour découvrir les fonctions des gènes, mais sont souvent entravés par des coûts extrêmement élevés, ce qui limite considérablement son potentiel. Nous décrivons ici l’utilisation de cellules souches embryonnaires (SE) de souris comme cellules de substitution pour dépister un phénotype d’intérêt, puis d’introduire ces cellules dans un embryon hôte pour se développer en une souris vivante porteuse du phénotype. Cette méthode fournit (1) une plate-forme rentable et à haut débit pour le criblage génétique dans les cellules de mammifères ; (2) un moyen rapide d’identifier les gènes mutés et de vérifier la causalité ; et (3) un raccourci pour développer des mutants de souris directement à partir de ces cellules ES sélectionnées pour des études sur des animaux entiers. Nous avons démontré l’utilisation du paraquat (PQ) pour sélectionner des mutants résistants et identifier les mutations qui confèrent une résistance au stress oxydatif. D’autres facteurs de stress ou composés cytotoxiques peuvent également être utilisés pour dépister les mutants résistants afin de découvrir de nouveaux déterminants génétiques d’une variété de résistance au stress cellulaire.

Introduction

Longévité a une relation intime avec la résistance au stress. En général, les espèces à long terme démontrent souvent une résistance accrue vers de multiples facteurs de stress, tels que le peroxyde d'hydrogène, le paraquat (PQ), UV, de la chaleur, et des métaux lourds 1,2. En revanche, la sensibilité accrue au stress a tendance à prédire la durée de vie réduite et / ou un phénotype de la maladie plus sujette. La voie de balayage anti-oxydant a longtemps été supposé jouer un rôle important pour conférer une résistance au stress à l'animal. Cependant, à quelques exceptions près, les études d'une variété d'animaux transgéniques à des manipula....

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Protocole

1. Gene-piégé cellules ES Bibliothèque Construction Utilisation piggyBac Transposon

  1. Préparer les fibroblastes embryonnaires de souris primaire (PMEF) que les mangeoires pour la culture de cellules ES
    1. Décongelez un flacon de mitomycine C-inactivé PMEF (5,0 x 10 6) dans un bain d'eau à 37 ° C. Transférer les cellules dans 5 ml de milieu de cellules ES (DMEM contenant 15% de FBS, 1 000 unités / ml de facteurs inhibiteurs leucémiques, 100 uM d'acides aminés non essentiels, 2 mM de glutamine, 55 pM de 2-mercaptoéthanol, et 25 unités / ml de pénicilline / streptomycine ), et centrifuger à 100 g pendant 5 min.
    2. Aspire....

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Résultats

Dans une expérience typique de mutagenèse, la transfection se compose d'un total de 3 x 10 7 cellules ES avec PB-UPA et MPB transposase. Le nombre de cellules ES gènes piégés engendrés dans deux expériences indépendantes sont résumés dans le tableau 1. L'efficacité de piégeage de gènes est d'environ 0,04%. Les bibliothèques combinées de piégeage de gènes mutants contiennent 22.400 indépendants, soit environ une couverture complète de génome de la souris (23.000 gè.......

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Discussion

L’analyse génétique directe permet une interrogation impartiale du génome à la recherche de gènes responsables d’un phénotype spécifique. Cette méthode est très puissante pour découvrir de nouvelles fonctions génétiques. Il a été largement utilisé chez les organismes inférieurs, mais pas chez les mammifères, tels que la souris, principalement en raison du coût extrêmement élevé associé à l’infrastructure et à la logistique que cela impliquerait. Ici, nous avons déplacé le processus de criblage génétique vers la platef.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Nous tenons à remercier le Wellcome Trust Sanger Institute pour les dons de piggyBac transposon et piggyBac transposase. Ce travail a été soutenu par la bourse Butcher du Colorado et le NIH R01 AG041801 (W.S.C).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Vector
PB-UPA
mPBase
mPBasePuro
Tissue Culture
500 ml Filtres StericupEMD MilliporeSCGPU05RE
250 mlFiltres EMD MilliporeSCGPU02RE
50 ml Steriflip-GVEMD MilliporeSE1M179M6
KO DMEMLife Technologies10829-018
DMEMSigma-AldrichD6429
FBSTissue Culture Biologicals104
FBS inactivé par la chaleurSigma-AldrichF4135-500
LIFEMD MilliporeESG1107
Acides aminés non essentiels Life Technologies11140-050
GlutaMAXLife Technologies35050-061
Pen/StrepLife Technologies15140148
&beta ;-MercaptoethanolLife Technologies21985-023
Dichlorure de méthyl viologène ( Paraquat)Sigma-Aldrich856177
Dimethyl Sulfoxide Hybri-MAXSigma-AldrichD2650
EmbryoMAX 0.1 % gélatineEMD MilliporeES006B
DPBS/ModifiedHyCloneSH30028.02
0.25 % Trypsine-EDTALife Technologies25200-056
T25 FlaconCorning353108
Fiole T75Corning353135
plaqueCorning
150 mm 430599Corning96
puits, plaqueCorning3585
96 puits, plaque à fond en U 96 puitsCorning3799
plaque 24 puitsCorning3526
Réservoir de 50 ml  ;Corning4870
Tubes de 15 mlVWR International, LLC82050-276
Fibroblastes embryonnaires primaires de sourisEMD MilliporePMEF-NL
DR4 Fibroblastes embryonnaires de sourisApplied StemCellASF-1001
Mitomycine CFisher BioReagents  ;
Geneticin (G418)Life Technologies11811-023
DoxycyclineFisher BioReagents  ;
CryotubesThermo Scientific377267
Centrifugeuse  ;Centrifugeuse Eppendorf5702
TC10 Compteur de cellulesBio-Rad
Lames de comptage (pour TC10)Bio-Rad1450011
Electroporation
Gene Pulser XcellBio-Rad1652611
Gene Pulser Cuvettes (4  ; mm gap)Bio-Rad1652088
Molecular Biology
Thermal CyclerEppendorfMastercylcer ep Gradient  ; S
Puregene Core kit BQiagen158745
Topo-TA Kit de clonageLife Technologies  ;450030
Kit de synthèse d’ADNc haute capacitéApplied Biosystems4368814
NaClFisher BioReagents  ;BP358-212
100 % éthanolDecon Laboratories, Inc.2716
Double Processed Tissue Culture WaterSigma-AldrichW3500
Sau3A1New England BioLabsR0169L
T4 DNA LigaseNew England BioLabsM0202T
EcoRVNew England BioLabsR3195S
96-well Lysis Buffer (Ramires-Solis et al. 1992)
Trizma BaseSigma-AldrichT1503
Acide chlorhydriqueFisher BioReagents  ;A144-212
EDTASigma-AldrichE5134
N-Lauroylsarcosine sel sodiqueSigma-AldrichL5777
Proteinase-KFisher BioReagents  ;BP1700
Electrophorèse
Mini-Sub Cell GTBio-Rad170-4469EDU
LE Agarose  ;GeneMateE3120500
bromure d’éthidium  ;Fisher BioReagents  ;BP1302
100 BP Échelle d’ADNNew England BioLabsN3231S
Échelle d’ADN 1 KbNew England BioLabsN3232S
Échelle d’ADN 2-logNew England BioLabsN3200L
100 mm 353003 plaque , , , BP25312BP26531

Références

  1. Johnson, T. E., et al. Longevity genes in the nematode Caenorhabditis elegans also mediate increased resistance to stress and prevent disease. J Inherit Metab Dis. 25, 197-206 (2002).
  2. Murakami, S., Salmon, A., Miller, R. A. M....

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Réimpressions et autorisations

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