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Article de méthode

In Vivo Alkaline Comet Assay et Enzyme modifiée Alkaline Comet Assay pour mesurer Breaks brin d' ADN et l' ADN oxydative dommages de foie de rat

15.3K vues

DOI :

10.3791/53833

4 mai 2016

Dans cet article

Résumé

Le test des comètes alcalines mesure les cassures de brins d’ADN dans les cellules eucaryotes. En ajoutant une étape de digestion de l’endonucléase III ou de la 8-oxoguanine-DNA-N-glycosylase humaine, le test peut détecter efficacement les dommages oxydatifs à l’ADN. Nous décrivons les méthodes d’utilisation de ces tests pour détecter les dommages à l’ADN dans le foie du rat.

Résumé

Des dommages à l’ADN non réparés peuvent entraîner une instabilité génétique, ce qui peut à son tour favoriser le développement du cancer. Par conséquent, l’identification des agents potentiellement dommageables de l’ADN est importante pour protéger la santé publique. Le test in vivo sur les comètes alcalines, qui détecte les dommages à l’ADN sous forme de ruptures de brins, est particulièrement pertinent pour évaluer les dangers génotoxiques des xénobiotiques, car ses réponses reflètent l’absorption, la distribution tissulaire, le métabolisme et l’excrétion in vivo (ADME) des produits chimiques, ainsi que le processus de réparation de l’ADN. Comparé à d’autres tests in vivo sur les dommages à l’ADN, le test est rapide, sensible, visuel et peu coûteux, et, en convertissant les dommages oxydatifs à l’ADN en cassures de brins à l’aide d’enzymes de réparation spécifiques, le test peut mesurer les dommages oxydatifs à l’ADN de manière efficace et relativement exempte d’artefacts. La mesure des dommages à l’ADN avec le test de la comète peut être effectuée à l’aide de plans d’étude toxicologique aigus et subchroniques, et en intégrant le test de la comète à d’autres évaluations toxicologiques, le test répond aux exigences de bien-être animal en utilisant au maximum les ressources animales. Un autre avantage majeur des tests est qu’ils ne nécessitent qu’une petite quantité de cellules et que les cellules n’ont pas besoin d’être dérivées de populations cellulaires en prolifération. Les tests peuvent également être effectués avec une variété d’échantillons humains obtenus auprès de personnes cliniquement ou professionnellement exposées.

Introduction

Le test des comètes alcalines mesure les ruptures d'ADN au niveau d'une seule cellule. Les suspensions de cellules individuelles sont noyées dans agarose sur une lame de microscope et les cellules ont été lysées pour former nucléoïdes, qui contiennent des boucles surenroulées de l'ADN. Electrophorèse à pH> 13 résultats dans la perte de surenroulement dans des boucles d'ADN contenant la rupture des brins, les brins d'ADN libérés migrent vers l'anode, la création de structures de comète qui peuvent être observées par microscopie à fluorescence. ADN Fragmenté migre de la «tête» de la comète dans la «queue» en fonction de la taille du fragment, et....

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Protocole

Éthique déclaration: procédures impliquant des animaux ont été approuvés par le Comité institutionnel des animaux soin et l'utilisation (IACUC) au Centre FDA / national pour la recherche toxicologique.

NOTE: La conception de l' étude décrite ici est basée sur le protocole développé par le Centre japonais pour la validation des méthodes alternatives (JaCVAM) pour leur validation de l'essai in vivo rongeur alcaline de la comète 18, et en outre modifié en fonction des recommandations du guide de l' OCDE TG489 19 .

1. Préparation

  1. préparation de diapositives....

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Résultats

Le test des comètes alcalines in vivo a été réalisée conjointement avec le test des comètes enzyme modifiée pour mesurer les dommages de l' ADN direct et oxydatif dans le foie des rats traités avec de l' acétate de cyprotérone (CPA) 5. CPA est un médicament hormonal synthétique qui provoque des tumeurs du foie de rat d'une manière spécifique du sexe, avec cinq fois plus fortes doses nécessaires pour induire des tumeurs du foie chez les rats mâles par rappo.......

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Discussion

Ce protocole décrit la mesure concurrente de dommages à l'ADN et à l'oxydation directe dans le foie de rat au niveau de la cellule unique. Le protocole général est applicable à tout tissu à partir duquel les cellules ou les noyaux individuels peuvent être isolés avec un minimum de lésions de l' ADN induites par le traitement ( à savoir, des lésions de l' ADN induites et non par l'agent d'essai, mais la manipulation et le traitement des tissus d'origine animale). Dans notre recherche,.......

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Déclarations de divulgation

Aucun des auteurs n’a d’intérêts concurrents ou conflictuels. Les informations contenues dans ces documents ne constituent pas une diffusion formelle d’informations par la FDA et ne représentent pas la position ou la politique de l’agence.

Remerciements

Ce travail a été soutenu par la Food and Drug Administration des États-Unis. Nous tenons à souligner la publication originale de l’étude CPA par Elsevier B.V. : Ding W, Bishop ME, Peace MG, Davis KJ, White GA, Lyn-Cook LE, Manjanatha MG. Analyse dose-réponse spécifique au sexe de la génotoxicité chez les rats F344 traités à l’acétate de cyprotérone. Recherche sur les mutations 774 : 1-7, 2014 (PMID : 25440904)

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Lamelles (n° 1, 24 x 50 mm)Fisher12-544-14
Lames de microscopeFisher12-550-123
Diméthylsulfoxyde (DMSO)  ;Fisher67-68-5
EDTA, DisodiumFisherBP120-1
Solution saline tamponnée au phosphateFisherICN1860454
1x Solution saline équilibrée Hanks (HBSS) (Ca2+, Mg2+ free)HyCloneSH30588.02
HEPESFisherBP310-1
Agarose à bas point de fusion ( LMP)Lonza50081NuSieve GTG Agarose
à fusion normale (NMA)  ;FisherBP1356-100
Bandelettes en papier pour tester le pH (pH 7,5-14)FisherM95873
Chlorure de potassiumFisher7447-40-7
Hydroxyde de potassiumFisher1310-58-3
Étiquettes pour lames (0,94 x 0,5 po)FisherNC9822036
Chlorure de sodium (NaCl)  ;Fisher7647-14-5
Hydroxyde de sodium (NaOH)  ;Fisher1310-73-2
SYBR&trade ; Or  ;InvitrogenS11494
Triton X-100  ;Fisher9002-93-1
Base Trizma  ;Fisher77-86-1
Tubes à centrifuger microcentrifugation de 2,0 mlFisher05-402-6
Crépine à cellules (40 µ ; m)Fisher22363547
Endonuclease III (Nth)  ;New England BiolabsM0268SDilution 1:1 000
hOGG1  ;New England BiolabsM0241SDilution 1:1 000

Références

  1. Collins, A. R. The comet assay for DNA damage and repair: principles, applications, and limitations. Mol Biotechnol. 26 (3), 249-261 (2004).
  2. Olive, P. L., Banath, J. P., Durand, R. E. Heterogeneity in radiati....

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Réimpressions et autorisations

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