Ce protocole décrit un procédé pour mesurer l'oxydation des substrats spécifiques radiomarqués chez les adultes de Drosophila melanogaster. Cette technique est simple, quantitative, reproductible et sensible, et il vient compléter les méthodes existantes qui mesurent la production totale de CO 2 et O 2 consommation , car il peut être utilisé pour identifier l'élément nutritif (s) est oxydé pour la production d'ATP.
Mesure du CO 2 libérée par l'oxydation de substrats radiomarqués spécifiques en utilisant la méthode décrite ici est complémentaire des techniques qui mesurent la production totale de CO 2. CO Total 2 production (V CO2) permet d' estimer le taux métabolique et, si le montant total O 2 Consommation (V O2) est connu, le taux métabolique peut être calculé et la source de combustible pour l' oxydation peut être estimée sur la base du ratio d'échange respiratoire (V CO2 / V O2 = RER). Quandles hydrates de carbone sont le substrat exclusif, RER = 1, mais lorsque les acides gras sont la source exclusive, RER = 0,7, grâce à la stoechiométrie des réactions de glucose et de l'oxydation des lipides. En l'absence d'équipements pour mesurer la consommation d'oxygène chez la drosophile 14, la source de combustible oxydant ne peut être identifié. Cependant, par l' étiquetage vole avec des quantités infimes d'un substrat radioactif ou d'une autre et les taux de mesure de radiomarqué production de CO 2, on peut tirer des conclusions quant à la capacité des mouches pour oxyder un substrat donné à différents moments au cours d' un stimulus ou sur les effets d'une étant donné la mutation sur l'oxydation du carburant.
Il y a un certain nombre d'étapes critiques dans ce protocole. Tout d'abord, il faut prendre soin lors de l'utilisation des matières radioactives pour éviter les déversements et la contamination des zones de recherche. Deuxièmement, lorsque anesthésier les mouches pendant les étapes 2.1 et 3.4, l'expérimentateur doit travailler rapidement pour éviter les effets de CO 2 prolongéel'exposition sur le métabolisme et le comportement. Un groupe de 20 mouches peut être anesthésiée et transféré dans un nouveau flacon ou dans une nacelle de braguette en 20 secondes ou moins. Lorsqu'ils sont transférés d'un appareil d'anesthésie à un flacon alimentaire, le flacon doit être posé sur le côté pour empêcher les mouches anesthésiées de se coincer sur la surface des aliments. Quand les mouches sont des aliments radiomarqué nourris au cours de plusieurs jours comme dans l'étape 2.2, l'expérimentateur devrait assurer que la nourriture ne se dessèche pas que les mouches sont sensibles à la déshydratation.
L'état nourri ou à jeun avant l'étiquetage, le choix de l'étiquette, la longueur du temps d'étiquetage, la longueur de temps dans la nacelle à la mouche, et la méthode de l'anesthésie sont des paramètres qui peuvent être soumis au dépannage et à la modification lors de l'utilisation de cette technique. Tout d'abord, les mouches soumis à des périodes d'étiquetage courtes (2 - 3 hr) ne sont pas susceptibles de consommer des quantités importantes de nourriture radiomarqué moins soumis à une période de jeûne préalable. D'autre part, le choix du marqueur cune incidence sur les conclusions que l'on peut tirer sur les phénotypes métaboliques. Par exemple, la production de CO 2 radiomarqué à partir de D- [1- 14C] -glucose peut refléter l' oxydation par le cycle de l' acide citrique ou du phosphate pentose, alors que la production de CO 2 radiomarqué à partir D- [6- 14C] -glucose reflète l' oxydation à travers le cycle de l' acide citrique seul 12,15,16. Nourrir les mouches avec un traceur radiomarqué pour un acide aminé essentiel 17,18 serait une bonne stratégie pour évaluer l' oxydation des acides aminés dérivés de protéines. Enfin, les périodes longues de marquage avec du glucose radiomarqué soulèvent également la possibilité d'incorporation de ce précurseur dans d' autres classes de molécules telles que les triglycérides 19 et des acides aminés tels que l' alanine, qui interconvertit facilement avec du pyruvate. Elle peut être évaluée en mesurant la radioactivité incorporée dans les différentes classes de molécules 6. rad En effet, des cohortes distinctes de mouches peuvent être nourrissubstrats iolabeled de la même manière et ensuite utilisé pour des expériences mouche pod ou la mesure de radiomarqueur qui sont stockées et reste en glycogène et de triglycérides dans nourris et jeûné conditions 6, par exemple. Une autre stratégie consiste à utiliser de courtes périodes d'étiquetage qui sont susceptibles de révéler l'oxydation des nutriments alimentaires radiomarqués eux-mêmes et non pas des formes de stockage de ces nutriments. Troisièmement, il est également possible que deux groupes de mouches pourraient avoir des taux identiques de 14 production de CO 2 sur une période de temps donnée, mais des vitesses très différentes au départ. Par conséquent, faire varier la quantité de temps qui vole passer dans la nacelle de mouche peut être un paramètre important de modifier l'évaluation de la variation phénotypique. Enfin, ce protocole prévoit l'utilisation d'une courte période de CO 2 anesthésie lors de la mise mouches dans l'appareil mouche pod. Il est possible que les CO 2 anesthésie peuvent affecter la fonction métabolique au cours de l'expérience mouche pod. Un suppléant approche est d'utiliser l' anesthésie d'azote qui ne modifie pas le taux métabolique 20.
Comme avec toute technique qui mesure un système aussi complexe que l'oxydation du carburant et le taux métabolique, le procédé décrit ici a des limites. Tout d' abord, il est possible que les mouches dans les différents groupes pourraient consommer différentes quantités de nourriture radiomarqué et ne serait donc entrer dans la phase de collecte de CO 2 de l'essai avec différentes quantités de départ de substrat. Ceci peut être contrôlé par une certaine mesure en effectuant l'expérience avec de grandes tailles d'échantillon et en alimentant les mouches en masse. Pour les périodes d'étiquetage courtes, les mouches avec les tripes de couleur bleue similaires auront consommé radiomarqueur et peuvent être reportés à la partie de chasse de l'expérience. La quantité de radiomarqueur restant dans un groupe de mouches peut également être mesurée à la fin de l'expérience et des cohortes distinctes de mouches après la fin de l'alimentation et de la période de chasse initiale. Deuxièmement, les niveaux d'activité entregroupes de mouches dans les gousses de mouches peuvent différer. Cela devra être déterminée expérimentalement et pris en compte lors de l'interprétation des données. Troisièmement, cette technique ne permet pas de mesurer la production totale de CO 2, seule la production d'un nutriment alimentaire spécifique ou la forme (s) de stockage de ce nutriment. Ce protocole ne remplace pas pour mais est complémentaire aux mesures de VCO 2 , car il fournit des informations différentes et complémentaires.
La méthode décrite ici mesures exhalé, CO 2 radiomarqué qui est un produit de l'oxydation des quantités infimes de substrats métaboliques spécifiques. En faisant varier l'étiquette utilisée - glucose, acides gras ou acides aminés - on peut concevoir des expériences de plus en plus sophistiqués pour évaluer les contributions des différents substrats du métabolisme dans différentes conditions physiologiques telles que la famine et sur différents fonds génétiques. Les applications futures de cette technique comprennent la mesure de METABOLIm dans les stades larvaires et pupes de développement, deux étapes du cycle de vie de Drosophila qui sont caractérisées par des extrêmes de stockage des éléments nutritifs et la ventilation, respectivement.