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Article de méthode

Une plate-forme robotique pour haut débit protoplastes Isolement et Transformation

14K vues

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DOI :

10.3791/54300

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27 septembre 2016

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Dans cet article

Résumé

Une méthode à haut débit automatisée, la production de tabac en protoplastes et la transformation est décrite. Le système robotisé permet l'expression du gène massivement parallèle et de découverte dans le système modèle BY-2 qui devrait être traduisible aux cultures non-modèle.

Résumé

Au cours de la dernière décennie, il y a eu une résurgence de l'utilisation des protoplastes végétaux qui vont des espèces modèles pour recadrer les espèces, pour l'analyse des voies de signalisation de la transduction, les réseaux de régulation transcriptionnelle, l'expression des gènes, génome d'édition, et la neutralisation des gènes. En outre, des progrès significatifs ont été réalisés dans la régénération des plantes à partir de protoplastes, qui a généré encore plus d'intérêt dans l'utilisation de ces systèmes pour la génomique végétale. Dans ce travail, un protocole a été mis au point pour l'automatisation de l'isolement de protoplastes et la transformation de 2 (PAR-2) la culture du tabac en suspension un «Bright Yellow» en utilisant une plate-forme robotique. Les procédures de transformation ont été validés à l'aide d'une protéine fluorescente orange (OFP) gène rapporteur (pporRFP) sous le contrôle du promoteur de chou-virus de la mosaïque 35S (35S). OFP expression dans des protoplastes a été confirmée par microscopie à épifluorescence. Les analyses comprenaient également des méthodes d'efficacité de production protoplastes utilisant propidium iodure. Enfin, les enzymes de qualité alimentaire à faible coût ont été utilisés pour la procédure d'isolement de protoplastes, de contourner la nécessité d'enzymes de laboratoire de qualité qui sont un coût prohibitif en haut débit automatisé isolement et l'analyse protoplastes. Basé sur le protocole mis au point dans ce travail, la procédure complète de l'isolement de protoplastes à la transformation peut être réalisée en moins de 4 heures, sans aucune intervention de l'opérateur. Alors que le protocole mis au point dans ce travail a été validé avec la culture cellulaire BY-2, les procédures et les méthodes doivent être traduisible à tout système de culture en suspension végétale / protoplastes, ce qui devrait permettre une accélération de la recherche en génomique des cultures.

Introduction

Ces dernières années , il y a eu une impulsion significative placé sur la conception des cultures transgéniques pour surmonter diverses maladies 1, conférer une résistance aux herbicides 2, confère la sécheresse 3,4 et la tolérance au sel 5, prévenir herbivory 6, augmenter le rendement de la biomasse 7, et de diminuer la paroi cellulaire récalcitrante 8. Cette tendance a été favorisée par le développement de nouveaux outils moléculaires pour générer des plantes transgéniques, y compris le génome d'édition en utilisant CRISPR et TALENs 9 et silençage génique par ARNdb 10,<....

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Protocole

1. Mise en place de la suspension des cultures cellulaires

  1. Préparer liquide par 2 supports en y ajoutant 4,43 g Linsmaier & Skoog basal, 30 g de saccharose, 200 mg de KH 2 PO 4 et 200 pg d'acide 2,4-dichlorophénoxyacétique (2,4-D) à 900 ml d' eau distillée l'eau et le pH à 5,8 avec 0,1 M KOH. Après ajustement du pH, ajuster le volume final à 1000 ml avec de l'eau distillée et autoclave. Les médias peuvent être stockés jusqu'à 2 semaines à 4 ° C.
  2. Inoculer un flacon de 250 ml Erlenmeyer avec 100 ml de liquide BY-2 médias et une seule pièce de PAR-2 ​​cals (> 1 cm de diamètre) cultivés sur milieu solide PAR-....

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Résultats

Dans la présente étude, le taux de doublement de BY-2 a varié de 14 à 18 h dépendant de la température à laquelle les cultures ont été incubées, en accord avec les rapports précédents, d'une longueur moyenne de 15 heures du cycle cellulaire. Avec ce taux de doublement, 1: 100 à partir inoculum a été utilisé pour initier des cultures, ce qui conduit à des cultures avec un volume cellulaire tassé (CVP) de 50% en 5-7 jours. Dans le protocole actuel, dans lequel les cultures ont été cult.......

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Discussion

Le protocole décrit ci-dessus a été validé avec succès pour l'isolement de protoplastes, l'énumération et la transformation du tabac en utilisant une culture de cellules en suspension BY-2; Toutefois, le protocole pourrait facilement être étendu à toute culture de suspension de la plante. À l' heure actuelle, l' isolement de protoplastes et la transformation ont été réalisés dans de nombreuses plantes, notamment le maïs (Zea mays) 10, la carotte (Daucus carota) 32,.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs déclarent qu'ils ont aucun intérêt financier en compétition.

Remerciements

Cette recherche a été soutenue par l’Agence des projets de recherche avancée - Énergie (ARPA-E) N° de prix DE-AR0000313.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Orbitor RS Déménageur de microplaquesThermo Scientific
Bravo Liquid HandlerAgilent
Synergy H1 Lecteur multimodeBioTek
MultiFlo FX Distributeur multimodeBioTek
TeleshakeInheco3800048
CPAC Ultraflat Heater/coolerInheco
Logiciel d’automatisation VworksLogiciel Agilentutilisé pour contrôler et écrire des protocoles pour Agilent Bravo
Logiciel MomentumThermo ScientificLogiciel de planification des tâches pour le contrôle Orbiter RS
Liquid Handling Control 2.17 LogicielBiotekLogiciel utilisé pour contrôler et écrire des protocoles pour le
microscope inversé MultiFlo FX IX81Olympus
Zyla 3-Tap Caméra microscopeAndor
ET-CY3/TRITC Filter SetChroma Technology Corp49004
Rohament CLAB Enzymes flacon d’échantilloncellulase à faible coût
Rohapect UFAB Enzymes flacon d’échantillonpectinase à faible coût
Rohapect 10LAB Enzymesflacon d’échantillonpectinase/arabinase à bas prix
Linsmaier & Skoog Basal MediumPhytotechnology LaboratoriesL689
Acide 2,4-dichlorophénoxyacétiquePhytotechnology LaboratoriesD295
propidium iodureSigma AldrichP4170
Poly(éthylène glycol) 4000Sigma Aldrich95904-250G-FAnciennement Fluka PEG
Propidium IodideFisher Scientific25535-16-4Acros Organics
CaCl2Sigma AldrichC7902-1KG
Acétate de sodiumFisher ScientificBP333-500
MannitolSigma AldrichM1902-1KG
SaccharoseFisher ScientificS5-3
KH2PO4Fisher ScientificAC424205000
KOHSigma AldrichP1767
Gelzan CMSigma AldrichG1910-250G
Plaque 6 puitsThermo Scientific103184
96 puits 1,2 ml Plaque de puits profondThermo ScientificAB-0564
Plaque inférieure optique 96 puitsThermo Scientific165305
Finntip 1000 Pointesde pipette à large diamètreThermo Scientific9405 163
NaClFisher ScientificBP358-10
KClSigma AldrichP4504-1KG
MESFisher ScientificAC17259-5000
MgCl2Fisher ScientificM33-500
7000190

Références

  1. Atkinson, H. J., Lilley, C. J., Urwin, P. E. Strategies for transgenic nematode control in developed and developing world crops. Curr. Opin. Biotech. 23 (2), 251-256 (2012).
  2. Duke, S. O. Perspectives on transgenic, ....

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Réimpressions et autorisations

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