Nématodes fournissent un système puissant pour comprendre la neurobiologie et le comportement avec C. elegans étant jusqu'à présent le principal outil. Cependant, de nombreuses espèces de nématodes dont P. comportements d'affichage pacificus, qui sont absents ou varient en complexité de l'organisme modèle C. elegans et donc soulèvent des questions fascinantes sur l'évolution et la régulation de ces comportements. Un tel comportement supplémentaire trouvé dans de nombreuses autres espèces de nématodes dont P. pacificus est la capacité de compléter leur alimentation bactérienne en se livrant à l' alimentation prédatrice 1, 20. Nous avons donc mis au point et décrit un protocole détaillé pour la caractérisation facile et rapide de ces comportements prédateurs précédemment non analysés dans les nématodes.
Tout d'abord, nous avons fourni des procédés pour cribler des variations dans l'appareil d'alimentation dans la bouche des nématodes. L'identification du type de bouche correcte est un élément essentiel premier sTep pour les essais de prédation avec succès que, au moins dans le genre Pristionchus seuls animaux eurystomatous sont capables de l' alimentation prédatrice. Il est préférable d'identifier la bouche se transforme avec le protocole «bouche de phénotypage rapide» décrit dans le protocole 1.2 que cette méthode est beaucoup moins invasive et donc il est moins probable que les comportements prédateurs peuvent être perturbés. Toutefois, il est recommandé de commencer par se familiariser avec les différentes structures de la bouche par l'identification avec les animaux anesthésiés sur coussinets d'agar (protocole 1.1).
Après identification de la morph bouche souhaitée, nous avons décrit deux essais pour quantifier l'alimentation prédatrice. Ce sont, à haut débit "essai de cadavre» rapide (protocole 3) et un plus de temps, mais l'analyse comportementale plus approfondie par le "test de morsure" (protocole 2). Ces deux protocoles sont très souples permettant de nombreuses modifications afin d'optimiser les dosages en fonction des experimenexigences de fonds. Pour les essais de morsure en utilisant P. prédateurs pacificus sur C. elegans proie, observations d'interactions comportementales prédateurs pour une fenêtre de temps de 10 min est suffisante pour quantifier une quantité importante de morsures ainsi que d'autres événements d'alimentation. Pour les "tests de cadavre» à nouveau en utilisant P. prédateurs pacificus sur C. elegans proie, 5 prédateurs pendant 2 heures a produit nombre de cadavres facilement quantifiables et cohérents permettant l' analyse comportementale rapide. Toutefois, il convient de noter les différentes espèces de mouvement des nématodes prédateurs à des vitesses différentes, manger à des rythmes différents et généralement démontrer une grande diversité d'autres comportements 1. En outre, les différentes espèces de proies peuvent également être consommés à des taux différents pour des raisons similaires. Il est donc recommandé d'optimiser les analyses basées sur les espèces de nématodes testés à la fois comme les prédateurs et les proies, et aussi pour toutes les différences dans les conditions environnementales. Pendant les deux "morsure" et "corpse "des essais, il est essentiel que les deux proies et les prédateurs sont en bonne santé, comme stressés ou prédateurs blessés ne seront pas tuer efficacement. En outre, des plaques d'essai fraîches sont essentielles en tant que plaques âgées peuvent devenir séché qui affecte négativement la santé des nématodes menant à un faux des essais. On espère également que les futures itérations de ces essais prédateurs seront en mesure de tirer parti des progrès récents dans la technologie afin d'automatiser une grande partie de l'analyse comme cela a été accompli pour enquêter sur de nombreux comportements observés chez C. elegans 21, 22. Actuellement les problèmes sont susceptibles de survenir chez les nématodes tels que P. pacificus comme ils apparaissent beaucoup plus sensibles au contact, ce qui rend l' isolement et l' immobilisation dans des chambres microfluidiques susceptibles de mettre fin à l' alimentation prédatrice. Surmonter cela peut se révéler difficile , mais faciliterait les nématodes individuels à cribler pour subtile prédateur comportements.
Enfin, nous avons également fourni des méthodes for examiner l'appareil nématode d'alimentation lui-même faciliter les comparaisons entre les modes d'alimentation prédateurs et bactériennes en quantifiant les dents et pharyngée pompage cinétique en utilisant une caméra à grande vitesse (protocole 4). La quantification des taux de pompage du pharynx en C. elegans a été utilisé pour surveiller l' alimentation pendant de nombreuses années 23, cependant, C. elegans est dépourvu de toute forme de bouche denticle et manque aussi des comportements prédateurs. En combinant la quantification de pompage pharyngé avec celle de l'activité de la dent, toute innervation des dents spécifiques à la prédation peut également être observée. En raison de l'agrandissement nécessaire pour observer le mouvement des dents les animaux se déplacent souvent en dehors du plan focal, il est donc généralement possible d'observer la dent pour de courtes fenêtres de temps. En outre, à la différence C. elegans, le pharynx de P. pacificus ne continue pas pomper, mais plutôt se livre à des périodes de pompage et d' alimentation. Par conséquent, pour précise pharyngée pumtaux de ping alors que l'alimentation à déterminer, il est important d'enregistrer 15 secondes de l'alimentation continue.
Ces méthodes présentées ici constituent donc le premier cadre d'enquêter sur les comportements prédateurs dans les systèmes de nématodes. De plus, ils peuvent également être adaptable pour une utilisation dans les enquêtes sur d' autres interactions au sein de l'écosystème de nématodes , y compris l'influence des organismes plus écologiquement pertinents sur la prédation , y compris les micro - organismes, les champignons et les acariens . Ainsi, ils fournissent un moyen de disséquer la façon dont ces comportements prédateurs sont réglementés, la façon dont ils peuvent avoir évolué et aussi leur importance écologique.