Ce test de vert malachite avec pT a été utilisé pour mesurer l’activité de PP2Ac parce qu’il est plus facile à réaliser que la méthode classique, qui utilise des substrats marqués P 32. Un autre avantage de ce test sur des essais radioactifs est que radio-isotopes présentent certains risques et peuvent être coûteux, surtout 32de molécules marquées P qui ai courte demi-vie, qui limite le nombre d’essais, on peut effectuer avant réactifs n’expirent. À l’aide de vert de malachite, plutôt que la radioactivité élimine également le besoin de disposer de 32P déchets. Tests de vert de malachite sont également très sensibles lors de la mesure de l’activité des sérine/thréonine phosphatases par rapport à un autre Dosage colorimétrique qui utilise le substrat p-nitrophénylphosphate (pNPP), qui est non sélectif car il peut être déphosphorylé par un grand nombre d’enzymes32.
Kits de vert de malachite commercial pour mesurer l’activité PP2A existent depuis longtemps et ont déjà été utilisées dans le laboratoire. Toutefois, lorsque vous effectuez plusieurs essais de vert de malachite, ces trousses est devenu prohibitifs. En outre, des kits commerciaux pour activité PP2A sont stables seulement pendant un an, tout en ayant des réactifs disponibles en poudre forme et avec bon rangement, fournissent des éléments d’analyse disponibles qui sont structurellement stables pendant de longues périodes de temps.
Avant de tester bSyn et gSyn, asynchrone a été utilisé comme témoin positif pour stimuler l’activité PP2Ac et pour déterminer la quantité de PP2Ac requis pour les tests et aussi pour confirmer que les données qui en résulte restent sur l’échelle de la courbe d’étalonnage (150-2400 pmol de PO4 ). Il est à noter que si asynchrone stimule PP2Ac trop fortement, si la réaction est généralement linéaire, données seront éteint échelle et produits chimiques dans la solution MGT précipitent, rendant impossible de mesurer les quantités exactes sorti libre-PO4 avec une plaque lecteur.
Étant donné qu’asynchrone contribue à PP2Ac activité in vivo et in vitro12,19,21,,du23au25et que tous les synucleins ont une forte homologie avec, il avait été l’hypothèse que tous les membres de la famille synucléine sont susceptibles de stimuler PP2Ac en essais libres sur des cellules. En utilisant le dosage colorimétrique décrit ici, on a constaté qu’en effet, tous les trois synucleins recombinantes (asynchrone, bSyn, gSyn) stimulée PP2Ac activité, ce qui soulève la possibilité que tous les trois synucleins peut exercer des fonctions similaires dans le système nerveux. Cependant, le cerveau de la maladie de Parkinson ou la démence à corps de Lewy cas ont moins d’activité PP2Ac dans les tissus contenant hautement agrégées asynchrone23. Tissus de souris nourrissait Lewy présentent aussi des corps-comme pathologie réduit PP2Ac activité25. Cela, et les nouvelles données à la Figure 3 , ainsi que des données préalables du asynchrone knockout souris12, suggèrent fortement que ni bSyn ni gSyn peut généralement compenser la perte d’asynchrone soluble dans le cerveau, ou, subsidiairement, que ces homologues synucléine ne peuvent pas associer à PP2Ac aussi forte qu’asynchrone comme illustré (Figure 3). L’Atlas du cerveau Allen montre co-localisation des tous les trois synucléine ARNm dans plusieurs régions du cerveau, et bien que les souris knock-out synucléine triple ont été généré9,33, PP2Ac activité n’a pas été évaluée dans ce modèle. Fait intéressant, asynchrone qui est phosphorylé sur Ser129 par Polo-like kinase 2, est moins en mesure d’activer PP2Ac12, mais montré ici pour bSyn suggèrent que la phosphorylation de bSyn est peu probable à l’impact de l’activité PP2Ac, car très peu bSyn est descendu avec PP2Ac dans le cerveau de souris (Figure 3). Pris ensemble, les données suggèrent que PP2Ac endogènes modulateurs de l’activité, comme asynchrone, susceptibles de contribuent au bien-être et à la maladie.
Le protocole décrit ici est une technique simple mais puissante pour déterminer la capacité des PP2Ac à déphosphorylent un substrat phosphopeptide en réponse à divers traitements. Par exemple, cette même méthode peut être utilisée pour tester les autres activateurs de PP2Ac, tels que les céramides ainsi que de nouveaux traitements potentiels34, ou pour évaluer l’impact des inhibiteurs de la PP2Ac in vitro. Il est également important de souligner que des tests similaires peuvent mesurer l’activité de PP2Ac qui a été isolé par 1 6 immunoprécipitation des extraits de cellules ou de tissus de l’organisme, tel que déjà décrits par les auteurs12,19, 25. avenir applications pour le dosage de vert de malachite existent au-delà de mesure de l’activité PP2Ac, comme l’activité ATP peut aussi être déterminée à l’aide d’un tel test.
Remarque, une courbe d’étalonnage doit être générée à chaque fois pour chaque dosage PP2Ac indépendant. Il est obligatoire de s’assurer que tous les réactifs utilisés sont phosphate libre, comme les phosphates gratuits artificiellement augmentent le signal de fond et produisent des résultats erronés. Le jour du test, il est essentiel de préparer la solution MGT assez frais pour tous les échantillons à doser. En outre, MGT est seulement bon le jour où il est fait et a tendance à précipiter après quelques heures. PP2Ac acheté auprès d’un fournisseur doit être aliquoté et stockés congelés peu de temps après sa réception pour empêcher le gel-dégel qui réduisent son activité. Comme autres phosphatases peuvent déphosphorylent le substrat pT (p. ex. PP1 et PP535), lors de l’analyse des extraits cellulaires ou tissulaires dans lequel PP2Ac n’a pas été isolé par immunoprécipitation, les échantillons doivent être passés sur colonnes pour éliminer les phosphates gratuits et des inhibiteurs spécifiques des phosphatases doivent être utilisés pour confirmer la spécificité de la phosphatase, comme précédemment décrit18.