Deux méthodes basées sur la biotinylation, conçues pour déterminer l'expression de la surface cellulaire et la vitesse endocytaire des protéines exprimées à la membrane plasmatique, sont présentées dans ce rapport.
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Article de méthode
Deux méthodes basées sur la biotinylation, conçues pour déterminer l'expression de la surface cellulaire et la vitesse endocytaire des protéines exprimées à la membrane plasmatique, sont présentées dans ce rapport.
Les protéines de surface cellulaire font appel à un large éventail de fonctions. Dans de nombreux cas, leur activité est régulée par des processus endocytaires qui modulent leurs niveaux à la membrane plasmique. Ici, nous présentons des protocoles détaillés pour 2 méthodes qui facilitent l'étude de tels procédés, tous deux basés sur le principe de la biotinylation des protéines de surface cellulaire. Le premier est conçu pour permettre la détermination semi-quantitative des niveaux relatifs d'une protéine particulière à la surface de la cellule. Dans celui-ci, les résidus de lysine des protéines de la membrane plasmique des cellules sont d'abord marqués avec un fragment de biotine. Une fois que les cellules sont lysées, ces protéines peuvent ensuite être précipitées spécifiquement par l'utilisation de streptavidine immobilisée par agarose en exploitant l'affinité naturelle de cette dernière pour la biotine. Les protéines isolées de cette manière peuvent ensuite être analysées par une méthode standard de Western Blot. La deuxième méthode fournit un moyen de déterminer le taux endocytique d'une particuleAr cellule cible sur une période de temps. Les protéines de surface cellulaire sont d'abord modifiées avec un dérivé de biotine contenant une liaison dissulfure clivable. Les cellules sont ensuite décalées vers des conditions de culture normales, ce qui provoque l'absorption endocytaire d'une proportion de protéines biotinylées. Ensuite, les liaisons disulfure de groupes de biotine non internalisés sont réduites en utilisant l'agent réducteur imperméable à la membrane, le glutathion. Grâce à cette approche, les protéines endocytesées peuvent donc être isolées et quantifiées avec un haut degré de spécificité.
Les protéines à la surface de la cellule jouent une variété de rôles essentiels au maintien de la fonction cellulaire. Dans de nombreux cas, leur activité dépend ou est modulée par des processus endocytaires qui les séquestrent temporairement dans des sites intracellulaires ou qui les dirigent vers des voies de dégradation 1 , 2 , 3 , 4 , 5 . Ici, nous mettons en évidence 2 approches basées sur la biotinylation conçues pour permettre à l'utilisateur d'étiqueter et d'isoler spécifiquement les pr....
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1. Détermination de l'expression relative des protéines de surface cellulaire dans les Astrocytes par Biotinylation
NOTE: Ici, nous illustrons l'application de cette technique de biotinylation à l'étude des effets de la molécule de molécule de matrice extracellulaire sur la localisation de la surface cellulaire du canal perméable à l'eau aquaporin-4 (AQP4). Les matériaux spécialisés requis pour ce dosage comprennent la sulfo-NHS-LC-biotine et la résine streptavidine-agarose (voir le tableau des matériaux ).
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Utilisation de la biotinylation de la surface cellulaire pour évaluer l'expression de la membrane plasmatique de l'AQP4 dans les astrocytes
Les cultures d'astrocytes traitées à la laminine et les cellules témoins non traitées ont été soumises à une biotinylation de surface cellulaire en utilisant les méthodes décrites. Les protéines biotinylées ont été précipitées avec de la streptavidine conjuguée à de l'agarose, puis séparées par SDS-PAGE. Les fr.......
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Modifications:
Comme ces méthodes ont été conçues pour être utilisées avec des cellules adhérentes, nous avons spécifié l'utilisation de PBS contenant 100 mg / L de MgCl 2 ∙ 6H 2 O et
100 mg / L de CaCl2 (CM-PBS) pour les étapes de lavage et comme base de certains tampons afin de s'assurer que les cellules restent attachées à la surface de culture et que les jonctions cellule-cellule ne sont pas perturbées. Cependant, les protocoles peuve.......
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Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêt.
Ce projet a été soutenu par l'Institut canadien de recherche en santé PG # 20R47867.
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Chlorure d’ammonium (NH4Cl) | Fisher Scientific | A661-500 | |
| Albumine sérique bovine (BSA) | Sigma-Aldrich | A9647-50 | |
| Bleu de bromophénol | Bio-Rad | #1610404 | |
| cOmplete cocktail inhibiteur de protéase | Sigma-Aldrich | 11697498001 | |
| Ethylenediaminetétraacétate disodique dihydraté ( EDTA) | Bio-Rad | #1610729 | |
| Dithiothreitol (DTT) | Bio-Rad | #1610611 | |
| Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 11960-044 | |
| EZ-Link Sulfo-NHS-LC-Biotine | Thermo Fisher Scientific | #21335 | |
| EZ-Link Sulfo-NHS-SS-Biotine | Thermo Fisher Scientific | #21331 | |
| Sérum fœtal bovin (FBS) | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 16000-044 | |
| Glycérol | Fisher Scientific | BP229-1 | |
| Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 ; | |
| Iodoacétamide | Bio-Rad | #163-2109 | |
| Laminine d’Engelbreth-Holm-Swarm sarcome murin membrane basale | Sigma-Aldrich | L2020 | Dégel sur glace. |
| L-glutamine | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 25030-081 | |
| Anticorps monoclonal anti-&bêta ;-actine de souris (AC-15) | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| Anticorps monoclonal anti-&bêta ;-dystroglycane de souris (43DAG1/8D5) | Leica Biosystems | B-DG-CE | |
| Pénicilline/streptomycine | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 15140-122 | |
| Peroxydase AffiniPure Donkey anti-Souris IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 715-035-150 | |
| Peroxydase AffiniPure Goat anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 111-035-045 | |
| Solution saline tamponnée au phosphate (PBS) | Gibco/Thermo Fisher Scientific | 10010-023 | |
| Glutathion réduit | Sigma-Aldrich | G6529 | |
| Chlorure de sodium (NaCl) | Fisher Scientific | S271-500 | |
| Dodécylsulfate de sodium (SDS) | Sigma-Aldrich | 862010 ; | |
| Hydroxyde de sodium (NaOH) | Fisher Scientific | S318-100 | |
| Résine d’agarose streptavidine | Thermo Fisher Scientific | #20347 | |
| Anticorps polyclonal anti-AQP4 de lapin | Alomone | AQP-004 | |
| Base Tris (base Trizma) | Fisher Scientific | BP152-1 | |
| Tris-HCl | Fisher Scientific | BP153-1 | |
| Triton X-100 | Fisher Scientific | BP151-500 |
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