Les lymphocytes T sont essentiels pour beaucoup de processus immunologiques, y compris la détection et élimination des cellules infectées par le virus, empêchant l’auto-immunité, aidant à la production de B-cellule et cellule-plasma des anticorps et détecter et éliminer les cellules cancéreuses. Le développement de peptide/MHC classe I tétramère coloration spécifique de l’antigène des cellules T CD81 et le récent développement de MHC classe II tétramère dégorgement des lymphocytes T CD4 des cellules2 par cytométrie en flux a révolutionné notre capacité à étudier et comprendre le immunobiologie des cellules T. Bien qu’extrêmement utiles pour déterminer la quantité et le phénotype des cellules T spécifiques de l’antigène, cytométrie de flux ne permet pas la détection de la localisation spatiale des lymphocytes T spécifiques de l’antigène à d’autres cellules et structures dans les tissus et actuel techniques de ventilation pour extraire les cellules T nécessaires pour la cytométrie en flux ont une efficacité limitée dans les tissus non lymphoïdes3.
Nous et autres avons mis au point des méthodes à l’aide de chargement peptide MHC classe I et classe tétramère II ou multimères réactifs pour colorer les cellules CD8 et CD4 T antigène-spécifiques en tissus4,5,6,7, 8 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13. IST ces méthodes permettent la détermination de l’emplacement, l’abondance et le phénotype des cellules CD8 et CD4 T antigène-spécifiques des tissus et fournir un moyen de détecter ces cellules par rapport à d’autres structures dans les tissus et cellules. Notre groupe a largement utilisé MHC-j’ai tétramère coloration afin d’étudier le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) - et le virus de l’immunodéficience simienne (vis) - des cellules T CD8 spécifiques dans les tissus lymphoïdes, génitales et rectales à acquérir une compréhension de l’immunopathogenèse du VIH et SIV et de définir les corrélats des stratégies de vaccination réussie14,15,16,17. En outre, nous avons également développé une technique qui combine IST avec hybridation in situ (ISH) pour localiser et quantifier les cellules T CD8 spécifiques du virus et les cellules infectées par le virus dans les tissus et pour déterminer les niveaux d’effecteur-cible en vivo 18 , 19.
Nous décrivons ici un protocole utilisant chargés en peptide MHC-j’ai tétramères pour colorer les cellules CD8 T antigène-spécifiques dans les sections de tissu frais, de contre-colorant tissus par IHC et de quantifier les cellules avec des phénotypes spécifiques dans des compartiments de tissus spécifiques. Ces procédures sont les mêmes comme étaient utilisés dans notre publication récente par Li et al., dans lequel nous avons déterminé l’emplacement, l’abondance et le phénotype des cellules T spécifiques SIV dans les tissus lymphoïdes au cours de l’infection chronique par le SIV dans macaques20.
Pour cette procédure, tissus frais sont sectionnés et incubés durant une nuit avec chargement peptide MHC-j’ai tétramères conjugués à des molécules de thiocyanate de fluorescéine (FITC). Elles sont ensuite fixées à la paraformaldéhyde. Après avoir résolu le tissu, le signal provenant des tétramères de MHC est amplifié à l’aide d’anticorps de lapin anti-FITC et incubées avec les anticorps d’IgG anti-lapin fluorescent étiquetés, qui encore amplifient le signal des tétramères liés. IHC est utilisé en conjonction avec IST pour caractériser les cellules T spécifiques de l’antigène et les cellules environnantes. Anticorps qui reconnaissent des épitopes sur la surface des cellules ou dans l’espace extracellulaire sont inclus lors de l’incubation primaire avec les tétramères. Anticorps qui reconnaissent des épitopes intracellulaires exigent la perméabilité de la paroi cellulaire avant la coloration. Les coupes de tissus colorés sont imagés à l’aide d’un microscope confocal et analysées à l’aide de logiciels confocale. Cellules marquées sont quantifiés à l’aide de logiciels de microscopie confocale ou ImageJ. Le protocole décrit peut être utilisé pour colorer essentiellement n’importe quelle cellule CD8 T antigène-spécifiques dans n’importe quel tissu pour laquelle MHC-j’ai tétramères sont disponibles.