Toutes les expériences animales ont été effectuées conformément aux lignes directrices pour le soin et l’utilisation des animaux de laboratoire et ont été approuvées par les autorités responsables (Regierung von Oberbayern, Munich, Allemagne et Stanford Institutional Animal Care et utiliser Comité, Stanford, CA, é.-u.). Une liste de tous les plasmides de clonage (étapes 1 à 4) est fournie dans une table supplémentaire S1.
1. clonage d’un transgène pour l’Expression des gènes constitutifs
- Concevoir des amorces pour le transgène amplification13,14.
- Ajouter des sites de restriction pour PacI (TTAATTAA) à l’extrémité 5' de l’amorce vers l’avant. Ajouter des sites de restriction pour AscI (GGCGCGCC) ou FseI (GGCCGGCC) à l’extrémité 5' de l’amorce de marche arrière.
- Amplifier le transgène par PCR à l’aide de conditions optimisées pour le transgène désiré14. Purifier à l’aide d’un kit de purification ADN disponible dans le commerce.
Remarque : Recuit temps dépend des amorces conçues à l’étape 1.1., allongement temps dépend de la longueur de la construction. Par exemple, pour une construction de 1 000 bp longueur utilisation 60 s de temps de l’élongation.
- Digérer transgene et vecteur d’expression de gène constitutif15 nucléases de restriction respectifs (Voir l’étape 1.2) et un tampon dans un volume total de 50 µL à 37 ° C pendant la nuit. Par exemple, digérer construct avec 5 unités PacI et 5 unités FseI le cas échéant (voir étape 1.2).
- Gel de purifier vecteur digérée et insérer à l’aide d’un kit d’extraction gel commercial selon les instructions du fabricant. Effectuer une ligature standard de 100 ng du vecteur et de 100 à 1 000 ng de l’insert à l’aide de 400 U T4 ligase à 14 ° C pendant 16 h. chaleur inactiver à 65 ° C pendant 10 min.
- Transformer des bactéries compétentes en utilisant une chaleur-choc-protocole standard16.
- Plaque sur la gélose plaques contenant 100 ampicilline de µg/mL. Incuber à 30 ° C pendant 24 h.
- Prélever des colonies unique, purifier l’ADN de plasmide utilisant un kit de miniprep commerciale selon les instructions du fabricant et vérifier la séquence de séquençage Sanger17 (amorce de séquençage : 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Utilisation positive de colonies pour maxi échelle d’amplification d’ADN plasmidique et purifient à l’aide d’un plasmide exempte d’endotoxine préparation kit18 selon les instructions du fabricant.
- Construction est prête pour l’injection, donc passez à l’étape 5.
2. le clonage d’un transgène pour l’Expression des gènes inductibles
- Concevoir des amorces pour le transgène amplification13,14.
- Ajouter des sites de restriction pour SacI (GAGCTC), SpeI (ACTAGT) ou KpnI (GGTACC) à l’extrémité 5' de l’amorce vers l’avant. Ajouter des sites de restriction pour NotI (GCGGCCGC) ou XhoI (CTCGAG) à l’extrémité 5' de l’amorce de marche arrière.
- Amplifier le transgène par PCR à l’aide de conditions optimisées pour le transgène désiré14. Purifier à l’aide d’une trousse commerciale de purification ADN.
- Digérer le transgène purifié et 4 µg du vecteur d’entrée (pEN_TTmcs-vecteur, voir Table des matières)19 séparément avec les nucléases de restriction appropriée (Voir l’étape 2.2) et un tampon dans un volume total de 50 µL à 37 ° C pendant la nuit.
- Gel de purifier vecteur digérée et insérer à l’aide d’un kit d’extraction gel commercial selon les instructions du fabricant. Effectuer une ligature standard avec 100 ng du vecteur et de 100 à 1 000 ng de l’insert à l’aide de 400 U T4 ligase à 14 ° C pendant 16 h. chaleur inactiver à 65 ° C pendant 10 min.
- Transformer des bactéries compétentes en utilisant une chaleur-choc-protocole standard16.
- Plaque sur la gélose plaques contenant gentamicine 15 µg/mL. Incuber à 37 ° C pendant 16 h.
- Prélever des colonies unique, purifier l’ADN plasmidique et vérifier les insérer par séquençage de17 à l’aide de l’apprêt avant de pCEP : 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
NOTE : PCR sur des colonies individuelles peut être effectuée sans purification préalable avec amorces pCEP avant et pCEP inverser (AGA AAG CTG GGT LTC GAT ATC TCG 3' 5'). Cette étape peut utile pour la présélection des colonies positives.
- Passez à l’étape 4.
3. clonage d’un miR-shARN de gènes inductibles par précipitation
- Concevoir des oligonucléotides de miR-shARN selon la pSLIK clonage Protocole19. Recuire et purifier les oligonucléotides et diluer à 01:20 dans ddH2O.
- Digest 3 µg du vecteur d’entrée avec 5 U BfuAI à 50 ° C pendant 3 h, puis inactiver la réaction à 65 ° C pendant 20 min.
Remarque : Si vous souhaitez la co-expression de la protéine fluorescente verte (GFP), utilisation pEN_TTGmiRc19 comme vecteur d’entrée, sinon utilisez pEN_TTmiRc219.
- Gel de purifier digérée vecteur comme au point 2.5. Effectuer une ligature standard de 100 ng du vecteur et 1 µL de purifié et dilué shARN oligonucléotides (étape 3.1) à l’aide de 400 U T4 ligase à température ambiante pendant 1 h. chaleur inactiver à 65 ° C pendant 10 min.
- Transformer des bactéries compétentes en utilisant une chaleur-choc-protocole standard16.
- Plaque sur la gélose plaques contenant gentamicine 15 µg/mL. Incuber à 37 ° C pendant 16 h.
- Prélever des colonies unique, purifier l’ADN plasmidique et vérifier les insérer par Sanger séquençage17 (amorce de séquençage : 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Passez à l’étape 4.
4. recombinaison de clonage pour produire des Clones de prêt-à-Injection
- Mix 150 ng du vecteur d’entrée (de l’étape 2 ou 3) et 150 ng de pTC TET-vecteur20.
- Ajoute un volume total de 8 µL de tampon TE (pH = 8).
- Transférer le mélange enzymatique clonase LR II (voir Table des matières) à la glace, incuber pendant 2 min. Vortex deux fois.
- Ajouter 2 µL de mélange enzymatique de LR-clonase II dans la réaction et incuber à 25 ° C pendant 1 h.
- Arrêter la réaction en ajoutant 1 µL de protéinase K-solution. Incuber à 37 ° C pendant 10 min.
- Transformer Stbl3 bactéries compétentes avec 2 µL de recombinaison clonage mélangent à l’aide d’une norme de chaleur-choc-protocole16.
- Plaque sur la gélose plaques contenant 100 ampicilline de µg/mL. Incuber à 30 ° C pendant 24 h.
- Prélever des colonies unique, purifier l’ADN de plasmide utilisant un plasmide exempte d’endotoxine préparation kit18 selon les instructions du fabricant et vérifier l’intégrité de vecteur par Sanger séquençage17 (amorce de séquençage 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Construction est prête pour injection, passez à l’étape 5.
5. préparation de Solution pour Injection dans la veine queue hydrodynamique
NOTE : Préparation des constructions pour l’expression des gènes inductibles et constitutive sont décrits à l’étape 1, 2, 3 et 4.
- Préparer la solution saline 0,9 % stérile pour injection (font pas usage PBS). Utiliser le volume correspondant à environ 10 % du poids de la souris. Exemple : pour une souris pesant 20 g, préparer 2 mL de solution.
- Préparer les vecteurs d’injection qui ont été purifiés à l’aide d’un plasmide exempte d’endotoxine purification kit18 (Voir l’étape 1.8 ou 4.8, respectivement).
- Ajouter 10 µg ou 15 µg d’endotoxine libres dormant vector construction (de l’étape 1, utilisez 10 µg, d’après l’étape 4 utilisation 15 µg, respectivement) et 1 µg d’endotoxine-free pc-HSB521 / mL de sérum physiologique stérile.
- Solution de boutique pendant 4 h à 4 ° C. Ne pas congeler.
6. effectuer l’Injection dans la veine queue hydrodynamique
- Utiliser une drisse pour injection dans la veine queue (commerciale ou préparée à partir d’un tube de 50 mL conique avec trous pour respirer et pour la queue). Remplissez le fond du tube avec papier de soie.
- Pour injection, utilisez souris d’environ 8 – 10 semaines d’âge avec des poids de 20 à 25 g.
- Peser la souris avant l’injection et de préparer le volume d’injection selon le poids corporel (correspondant à 10 % du poids corporel, reportez-vous à l’étape 5.1). Préparer une stérile 3 mL-seringue avec une aiguille à 27 G à injection et remplissez-le avec le volume requis.
- Placez la souris sur la drisse. Ajuster la quantité de papier de soie (Voir l’étape 6.1) de laisser seulement un minimum d’espace pour le mouvement mais assez d’espace pour respirer.
- Veiller à ce que la souris est respirer régulièrement.
- Chaud la queue en utilisant une lampe infrarouge pour 30 à 60 s. soigneusement attentif aux signes de surchauffe.
- Nettoyer la queue avec un tampon imbibé d’alcool.
- Insérez l’aiguille presque horizontalement dans l’un des deux nervures latérales arrière près de la base de la queue.
NOTE : S’il est placé avec succès, une petite quantité de sang peut couler dans le cône de l’aiguille. Il n’est pas recommandé d’aspirer activement comme n’importe quel mouvement supplémentaire de l’aiguille peut entraîner son déplacement et/ou des blessures de la veine.
- Injecter le volume total dans la veine caudale dans 8-10 s.
- Retirez immédiatement la souris de la drisse. Compresser les injection enroulé pendant au moins 30 s ou jusqu'à ce que tout saignement disparaisse.
- Placez la souris dans une cage séparée. Une fois que la souris a récupéré de la procédure (environ 30 à 60 min), transférer la souris vers sa cage originale. Vérifier sur la souris régulièrement pour les prochaines 24 heures.
Remarque : Un sédatif léger de la souris est régulièrement observé jusqu'à 2 h après l’injection.
- Avant de procéder à davantage d’expériences (p. ex., étape 7), attendez 10 à 15 jours pour le dédouanement des vecteurs non intégrées.
7. induction de CreER transfectée avec le tamoxifène
ATTENTION : Tamoxifène est-il dangereux, peut être cancéreux ou endommager la fertilité. Veuillez vous reporter à la fiche de données de sécurité.
- Plan des injections intrapéritonéales de tamoxifène sur trois jours consécutifs.
- Jour 1, dissoudre 10 mg de tamoxifène dans l’éthanol 40 µL. Incuber à 55 ° C pendant 10 min. Vortex plusieurs fois jusqu'à ce que le tamoxifène a dissous.
- Ajouter l’huile de maïs 960 µL. Incuber 5 min à 55 ° C. Vortex plusieurs fois pour obtenir une solution claire.
- Préparer la solution dans une seringue de 1 mL insuline avec une aiguille de 27 G.
- Scruff la souris en saisissant le cou de la souris délicatement avec le pouce et la deuxième, la queue entre la base de la main et le quatrième et cinquième doigt de fixation.
- Injecter par voie intrapéritonéale 0,1 mL (= 1 mg de tamoxifène) de la solution dans le quadrant inférieur gauche de l’abdomen.
- Répéter les injections deux et trois jours.
8. induction de tétracycline-dépendant du gène ou de shARN Expression
ATTENTION : La Doxycycline peut être nocif. Veuillez vous reporter à la fiche de données de sécurité.
Remarque : Selon le type et la durée de l’expérience, doxycycline peut être fourni en eau potable (étape 8.1) ou chow (étape 8.2)
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Pour des expériences de courte durée (< 10 jours) administrer la doxycycline par l’eau potable en utilisant le protocole suivant.
- Dissoudre 5 g de saccharose dans 100 mL d’eau du robinet. Autoclave.
- Dissoudre 100 mg de doxycycline-hyclate dans 5 mL de solution de saccharose (point 8.1.1) dans un tube conique de 15 mL.
- À l’aide d’une seringue de 10 mL, filtre stérile, la solution à travers un filtre à 0,2 µm. Ajoutez à la solution de saccharose préparée à l’étape 8.1.1.
- Fournir une solution de sucrose-doxycycline comme l’eau potable à la souris. Vérifier tous les jours et les remplacer quand la solution devient trouble indiquant la pullulation microbienne (remplacer la solution claire après trois jours au plus tard).
- Pour les expériences à long terme (> 10 jours) ou expériences sensibles aux changements métaboliques, utiliser la doxycycline-chow commerciale (p. ex., Doxycycline Hyclate Chow 0,625 g/kg) pour éviter la déshydratation et/ou les changements induits par le saccharose dans le foie des animaux traités.
9. préparation du foie de souris pour l’analyse par immunomarquage
ATTENTION : Paraformaldéhyde peut être nocif. Veuillez vous reporter à la fiche de données de sécurité.
Remarque : Le validant quand les souris seront analysées dépend de l’expérience. Il est recommandé d’analyser le tissu hépatique après pas moins de trois jours de traitement doxycycline pour assurer suffisamment induction de l’expression de transgènes ou shARN.
- Préparez une seringue de 1 mL avec une aiguille de 27 G avec 1 mL de solution à 4 % paraformaldéhyde (PFA).
- Euthanasier la souris par une méthode appropriée selon un protocole approuvé animale.
Remarque : Les lignes directrices pour les méthodes d’euthanasie appropriées peuvent varier selon l’établissement.
- À l’aide de ciseaux de dissection et pince anatomique, ouvrez avec précaution la cavité abdominale avec une laparotomie médiane pour exposer le foie. Déplacer l’intestin grêle vers la droite pour exposer la veine porte et la veine cave inférieure (VCI).
- Insérer l’aiguille de la seringue préparée (voir étape 9.1) dans la VCI et couper la veine porte. Injecter 1 mL de PFA lentement dans la VCI pour perfuse le tissu hépatique et supprimer auto-fluorescent culots globulaires (souhaitables si immunofluorescence sera effectué).
- Retirez le foie. Rincer à l’eau et transfert à 5 – 10 mL de solution PFA de 4 %.
- Pour les sections de paraffine, fix tissu pour 36 – 48 h. tissu est prêt pour déshydratation et enrobage de paraffine.
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Pour les coupes congelées, Difficulté tissu chez 4 % PFA pendant 1 h.
- Pour cryoprotection, transférer à une solution de 10 % de saccharose. Incuber 60 min.
- Transfert à la solution de sucrose à 20 %. Incuber 60 min.
- Transfert à la solution de sucrose à 30 %. Incuber les 12 et 16 h. Embed en enrobage composé pour coupes congelées et congeler à-20 ° C.