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Research Article
Elizabeth M. Gibbs1,2, Rachelle H. Crosbie-Watson1,2,3,4
1Department of Integrative Biology and Physiology,University of California, 2Center for Duchenne Muscular Dystrophy,University of California, 3Department of Neurology,David Geffen School of Medicine, University of California, 4Molecular Biology Institute,University of California
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ce protocole décrit un système flexible et peu onéreuse pour mesurer ambulation de souris en un dosage de l’activité de plein champ. Nous montrons qu’un test de marche de 6 minutes basé sur ce système détecte une diminution des mouvements volontaires chez la souris mdx et distingue précisément amélioration à un sauvetage d’un muscle spécifique de ces animaux.
Mesurer les résultats fonctionnels dans le traitement de la dystrophie musculaire est un aspect essentiel des essais précliniques. L’évaluation de l’ambulation volontaire dans des modèles murins est un test non invasif et reproductible de l’activité qui est directement analogues aux mesures du patiente ambulation tel que le test de marche de 6 minutes et scores de mobilité. Beaucoup de méthodes communes pour tester la souris ambulation vitesse et la distance sont basées sur le test de plein champ, où la libre circulation de l’animal dans une arène est mesurée au fil du temps. Un inconvénient majeur de cette approche est que les logiciels commerciaux et équipements pour le suivi de mouvement haute résolution est coûteux et peut nécessiter le transfert de souris à des établissements spécialisés pour les tests. Nous décrivons ici un système peu coûteux et axée sur la vidéo pour mesurer ambulation de souris qui utilise des logiciels libres et open source. Utilisant ce protocole, nous démontrons qu’ambulation volontaire dans le modèle de souris mdx de la dystrophine null pour la dystrophie musculaire de Duchenne (DMD) est diminuée par rapport à l’activité souris sauvage. Dans mdx , souris exprimant le transgène utrophine, ces déficits d’activité ne sont pas respectées et la distance totale parcourue est indiscernable de la souris de type sauvage. Cette méthode est efficace pour mesurer les variations ambulation volontaire associé à une pathologie dystrophique et fournit une plate-forme polyvalente qui peut être facilement adaptée aux paramètres de recherche diversifié.
Des mesures fiables et reproductibles des fonctions musculaires sont essentiels pour évaluer l’efficacité des thérapies potentielles de DMD. DMD est un trouble génétique causé par des mutations dans le gène de la dystrophine, conduisant à une faiblesse musculaire progressive, perte de déambulation et éventuelle insuffisance cardiorespiratoire. Le modèle animal plus largement utilisé de DMD est la souris mdx de la dystrophine null. Une batterie de tests fonctionnels sont apparus comme des tests de routine pour évaluer la progression de la maladie chez la souris mdx , ainsi que dans des modèles animaux similaires d’autres dystrophies musculaires et myopathies. Couramment utilisés en vivo essais comprennent des mesures de la force de préhension des membres antérieurs, fil pour accrocher des temps, rotarod maximum, temps d’épuisement au cours du suivi d’activité en cours d’exécution et moteur tapis roulant. Il y a eu un effort considérable dans le domaine de normaliser ces tests, dans le but de réduire la variabilité entre les études précliniques et accroître le potentiel translationnel des agents thérapeutiques testés dans la souris1,2.
Un volet important des essais précliniques est la mesure des mouvements volontaires, un paramètre qui est fréquemment altéré dans les modèles murins de la dystrophie musculaire. Ceci est généralement testé par des études basées sur le contrôle de l’activité de plein champ et peut évaluer horizontal (à pied) ou des mouvements verticaux (élevage) sur un parcours de quelques minutes ou heures2,3,4. Un certain nombre d’études ont montré des mouvements volontaires pour être modifiée chez les souris mdx , notamment après l’exercice, et ces mesures ont démontré d’être sensible à la progression de la maladie et de traitement drogue. Une des limites principales dans l’exécution de ces tests est le besoin d’équipement spécialisé et coûteux. Ici, une méthode peu coûteux qui suit ambulation de souris à l’aide des ressources disponibles est présentée.
La distance de marche de 6 minutes est une mesure couramment utilisée comme un outil d’évaluation clinique chez les personnes atteintes de la dystrophie musculaire de Duchenne5,6. Modifications de cette mesure ont été utilisées pour évaluer les résultats dans des modèles animaux de Duchenne, y compris de souris mdx 7 et de chiens golden retriever de Duchenne (GRMD)8. Dans cette étude, nous enregistrons le mouvement volontaire de plein champ dans les 6 minutes immédiatement après une faute d’exercice doux. Distance de marche a ensuite été calculé à l’aide de logiciel open source libre pour mesurer le mouvement horizontal au fil du temps.
Le principal avantage de cette méthode est que les animaux peut être testés dans une variété de configurations sans avoir besoin d’équipement spécialisé ou coût élevé des logiciels commerciaux pour l’analyse. Un aspect important de cette analyse est qu’elle peut être réalisée dans un environnement de laboratoire de base sans avoir besoin de déplacer ou de transférer la souris hors du vivarium à un laboratoire spécialisé central. Le protocole de suivi vidéo décrit ici est bien adapté à l’évaluation de déambulation au cours de périodes relativement peu de temps et peut détecter des différences d’activité entre souris sauvage et mdx , ainsi que révèlent une amélioration fonctionnelle dans une opération de sauvetage modèle de DMD.
Les méthodes décrites ici ont été approuvées par le Comité de l’urbanisme à l’Université de Californie, Los Angeles et d’institutionnels animalier. Sauvage (C57BL/6J) et souris mdx (C57Bl/10ScSn fond) ont été achetées à une source commerciale. MDX: souris utrophine-Tg étaient un cadeau de James Ervasti, avec la permission de Kay Davies et se sont maintenus sur le fond de mdx . Ambulation analyses ont été effectuées sur des souris mâles à l’âge de 6 mois. Souris ont été maintenues dans le Vivarium de Sciences de la vie de Terasaki directives établies par l’animalier institutionnel et le Comité de l’urbanisme à l’Université de Californie, la Los Angeles (autorisation #2000-029-43) et l’approbation de ces études a été accordée par le UCLA Animal Welfare Assurance (agrément n° A3196-01).
1. préparation de la chambre
2. exercer de pré collecte de données et de protocole
3. video analyse
4. analyse des données

Les variations du dosage plein champ ont démontré être une méthode efficace pour vérifier la progression de la maladie dans les modèles de la dystrophie musculaire. Ici, nous démontrons une vidéo polyvalente suivi la méthode d’analyse de mouvement de la souris à deux dimensions à l’aide d’appareil de contrôle facilement accessibles et logiciels open source (Figure 1 a–B). Conformément aux résultats signalés dans des épreuves similaires, nous montrons que les souris mdx contesté avec un protocole d’exercice immédiatement avant les essais montrent significativement moindre mouvement volontaire dans une tâche de plein champ 6 minutes que les souris de type sauvage (Figure 1 , Figure 2). Après le léger effort d’un défi de force de préhension, souris mdx généralement rester immobile pendant les premières minutes du protocole ambulation, avec une augmentation modeste de mouvement par minute 4 à 5 (Figure 3 a). Lorsque vous testez des animaux sauvage et mdx sans une contestation de l’exercice, nous avons ne détecté aucune différence dans la distance totale parcourue (Figure 2).
Cela est compatible avec les rapports des autres groupes semblables essais de mouvement, en regardant avec levées mdx ne montrant aucune différence ou légères diminutions par rapport aux souris de type sauvage. Nous avons évalué en outre des souris transgéniques exprimant des niveaux élevés d’utrophine afin de tester la sensibilité de notre essai (mdx: utr-tg, ligne de Fiona)11,12. Le mdx: utr-tg est un modèle robuste sauvetage du phénotype mdx avec peu de fonctionnalités dystrophiques. Après l’exercice, souris mdx exprimant l’utrophine étaient impossibles à distinguer de type sauvage, sans qu’aucune différence significative dans la distance totale parcourue (Figure 3 b) ou à tout le temps cumulatif des points mesurés (Figure 3 a).
Suivi vidéo repose sur la variabilité de l’image à image, mesurée par un observateur manuel marquant ou par détection d’un logiciel automatisé. Logiciel gratuit et open source d’analyse de mouvement permet une détection semi automatisée des mouvements des animaux, dans lequel mouvements non détectées ou surestimées peuvent être manuellement corrigées comme la trace de l’activité est générée. Pour réduire au minimum le traitement des données dans ce test, nous avons sous-échantillonnées les vidéos originales de l’enregistré 30 i/s à 15 images/s. Pour déterminer l’effet de la diminution du taux d’échantillonnage, nous avons mesuré le total distance parcourue de 1 min de vidéo taux plein cadre et ensuite comparé les mesures de distances dérivés sous-échantillonnées versions de l’ensemble de données (Figure 4 a). Nous avons constaté que la réduction de la cadence de la moitié (décimation par 2) a diminué la distance mesurée de 5,0 % et réduire la fréquence d’images aussi faible que 7,5 fps retenus près de 90 % de la distance d’origine calculée (89,2 % de la distance à 30fps vidéo). La précision de la distance mesurée a chuté fortement après ce point, bien qu’encore fortement décimé les ensembles de données encore d’approximation de la voie de l’animal (Figure 4 b). Ces observations soulignent l’importance de considérer la cadence et en évaluant l’activité animale de traitement du signal et démontrent que haute résolution spatiale peut être conservée dans les données vidéo sous-échantillonnées.

Figure 1 : représentation ouvrir des traces de champ de distance de marche de 6 minutes. (A) mise en place de chambre d’enregistrement d’activité utilisée dans cette étude. Compteur de poignée a été utilisé pour exercice avant le défi d’analyser, puis déambulation libre a été enregistrée sur la plate-forme de plein champ. (B) image Composite de 6 min de vidéo d’enregistrement avec l’analyse de traçage dans le logiciel de suivi de mouvement. (C) superposition de deux traces représentatives (WT, gris, n = 1 ; mdx, rouge, n = 1). S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Effet de l’exercice sur la déambulation de mdx . distance de marche de 6 minutes ont été enregistrés à 6 mois d’âge avec ou sans exercice antérieur (non exercés mdx n = 5, WT n = 4 ; exercé mdx n = 5, WT n = 5). Aucune différence significative n’a été observée entre les versions WT et mdx lors de levées, mais une différence significative a été observée chez les souris exercés avant les tests (pas d’exercice : WT 1077.0± 106,4 cm, mdx 971.0 ± 36,16 cm ; post-exercice : WT 770.2 ± 30,75 cm, mdx 127,8 ± 36,16 cm). Données représentent ± SEM. statistiques calculées à l’aide de deux voies ANOVA suivie de Tukey signifie test de comparaison multiple (*p < 0,05, **p < 0,01, *** p < 0,001 et ***p < 0,0001). S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Expression transgénique d’utrophine améliore la déambulation chez les souris mdx . distance de marche de 6 minutes ont été enregistrés à 6 mois d’âge à l’aide d’une chambre de l’activité de plein champ (WT, n = 5, mdx n = 5, mdx: utr-Tg n = 4). (A) distance cumulée parcourue par minute. Aucune différence significative n’a été détecté entre WT et mdx: utr-tg à tout moment. Statistiques calculées utilisation bidirectionnelle ANOVA suivie de Tukey du test de comparaison multiple (*p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,001 et ***p < 0,0001). (B) Total libre champ distance parcourue pendant 6 min (WT 770.2 ± 30,75 cm, ± mdx 127,8 cm 36,16, mdx: utr-Tg 701,3 ± 33,54 cm). Données représentent ± SEM. statistiques calculées à l’aide d’ANOVA à suivie de Tukey signifie test de comparaison multiple (*p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,001 et ***p < 0,0001).S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : effet de la fréquence d’échantillonnage sur ambulation suivi. Chez une souris sauvage, 1 min de distance de marche a été enregistré et suivis à l’aide de mouvement dépistant le logiciel à une fréquence (30,0 fps, 1 819 nombre total de trames). La position de deux dimensions de la souris dans chaque image a été déterminée, et ces données sont ensuite décimées afin de simuler le repérage en vidéo de taux de trame inférieure (30, 22,5, 20, 15, 10, 7,5, 6, 3, 1,5 et 0,75 fps). Distance totale (A), calculée à partir des coordonnées dans chaque ensemble de données sous-échantillonnées. Lignes pointillées montrent des valeurs au sein de 5 % de la distance calculée à partir du full frame rate vidéo. Données dans cette étude proviennent de vidéo décimée à 15 images/s (flèche rouge). (B) des superpositions de traces en comparant plein cadre taux retraçant avec 1,5 images/s (voir ci-dessus) et 15 images/s (ci-dessous). S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Ce protocole décrit un système flexible et peu onéreuse pour mesurer ambulation de souris en un dosage de l’activité de plein champ. Nous montrons qu’un test de marche de 6 minutes basé sur ce système détecte une diminution des mouvements volontaires chez la souris mdx et distingue précisément amélioration à un sauvetage d’un muscle spécifique de ces animaux.
Ce travail a été soutenu par des subventions de la National Institutes of Health [R01 AR048179 et R01 HL126204 R.C.W, AR059033 T32 et F32 AR069469to E.M.G] et la Muscular Dystrophy Association USA [274143 et 416364 à R.C.W.].
| Caméra vidéo | Apple Inc. | ME553LL/A | Pour l’enregistrement de vidéos d’ambulation, iPhone 5S Plus (ou équivalent) |
| Logiciel Kinovea (version 0.8.15) | Association Kinovea Logiciel | d’analyse vidéo open source. Téléchargement gratuit, compatible PC (Version 0.8.15, www.kinovea.org) | |
| iMovie (version 10.0.6) | Apple Inc. | Tout logiciel similaire peut être utilisé pour réduire la fréquence d’images vidéo (en option) | |
| Poubelle ronde noire Roughneck 32 gallons (chambre à champ ouvert) | Rubbermaid | # 1778013 | Tout système de chambre à champ ouvert peut être adapté pour l’enregistrement. Cette étude utilise une chambre d’enregistrement construite à partir d’un plateau sur une plate-forme, au fond d’une grande poubelle. |
| Plateau en plastique blanc Avant 15 « L x 10 » P x 1,45 « H (chambre à champ ouvert) | US Acrylic, LLC | Tout système de chambre à champ ouvert peut être adapté pour l’enregistrement. Cette étude utilise une chambre d’enregistrement construite à partir d’un plateau sur une plate-forme, au fond d’une grande poubelle. | |
| C57BL/6J | Jackson Laboratory | #000664 | Souris mâles de 6 mois |
| C57BL/10ScSn-Dmd/J (mdx) | Jackson Laboratory | #001801 | Souris mâles de 6 mois |
| mdx : utrophine-Tg (fiona) | Don de James Ervasti, avec la permission de Kay Davies | Souris mâles de 6 mois |