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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dans ce travail, nous décrivons les protocoles afin d’étudier le rôle des vésicules extracellulaires (EVs) libéré par les érythrocytes de Plasmodium falciparum infectés. En particulier, nous nous concentrons sur les interactions des véhicules électriques avec des cellules endothéliales.
Le paludisme est une maladie mortelle causée par les parasites Plasmodium , à P. falciparum est le plus répandu sur le continent africain et le responsable de la plupart des décès liés au paludisme dans le monde. Plusieurs facteurs, notamment la fixation du parasite dans les tissus, dysfonction vasculaire et les réponses inflammatoires influencent l’évolution de la maladie chez les personnes infectées par le paludisme. P. falciparum-globules rouges infectés (iRBCs) libérer de petites vésicules extracellulaires (EVs) contenant différentes sortes de molécules de cargaison qui médient pathogenèse et cellulaire communication entre l’hôte et de parasites. SVE est efficacement absorbés par les cellules dans lesquelles ils modulent leur fonction. Nous discutons des stratégies pour aborder le rôle des véhicules électriques dans les interactions parasite-hôte. Tout d’abord, nous décrivons une méthode simple pour l’étiquetage et l’internalisation de l’EV de suivi par les cellules endothéliales, à l’aide d’un colorant de linker cellule verte. Deuxièmement, nous rapportons une façon simple de mesurer la perméabilité à travers une monocouche de cellules endothéliales en utilisant un dextran fluorescent étiqueté. Enfin, nous montrons comment enquêter sur le rôle des petites molécules d’ARN non codants en fonction des cellules endothéliales.
Selon l’Organisation mondiale de la santé, il y a 212 millions de nouveaux cas de paludisme dans le monde en 2015 et environ 429 000 personnes sont mortes, principalement des enfants moins de cinq ans d’âge1. Les mécanismes conduisant à une maladie grave, qui est souvent associée à une dysfonction vasculaire, restent mal définis2. Plasmodium- iRBCs sécrètent des sphères petit bi-lipides membranaires appelées vésicules extracellulaires (EVs). On sait que ces véhicules électriques sont susceptibles d’être pertinents pour le processus d’infection et de la réponse immunitaire de hôte à l’infection ; Cependant, on connaît la fonction exacte de ces petites vésicules au cours de l' infection de paludisme3. Il est possible qu’ils jouent deux rôles importants : d’une part, ils pourraient contribuer à la pathogenèse en activant des macrophages4,5; et d’autre part, ils pourraient agir comme médiateur communication cellulaire entre les parasites et entre les parasites et hôte6,7. En fait, parasites peuvent transférer des protéines ou des acides nucléiques entre eux via EVs. Par exemple, Trypanosoma brucei rhodesiense EVs peut transférer le facteur de virulence Serum Resistance-Associated (SRA) et peut également cibler les autres T. brucei et hôte érythrocytes8. En outre, à P. falciparum- iRBCs communiquer entre eux par le transfert d’acides nucléiques dans les véhicules électriques. Cela permet les parasites d’optimiser et de synchroniser sa croissance. En fait, les EVs pourraient être le principal régulateur de la conversion gamétocyte et donc contribuer à la régulation de la transmission Etape7.
Non seulement EVs réglementent les parasites, ils véhiculent aussi des interactions hôte-parasite. Nous avons récemment découvert que EVs d’iRBCs contiennent des dérivés hôte le microARN (miARN ; petites espèces d’ARN dans la fourchette de 21 à 25 nucléotides9) qui était absorbés par les cellules endothéliales humaines. Les miARN du serveur virtuel Exchange forme un complexe avec Ago2 stable (membre de la RNA-induced silencing complex), qui, une fois livré à des cellules réceptrices, est capable de plus précisément faire taire l’expression des gènes et qui affectent les propriétés barrières des cellules10. Protocoles standards ont été développés pour étudier la fonction du SVE. Nous décrivons ici tout d’abord un protocole qui permet le marquage fluorescent de EVs pour enquêter sur leur absorption par les cellules réceptrices. En outre, en utilisant un microscope confocal, il est possible de suivre le sort de l’EV à l’intérieur de la cellule. Plusieurs colorants fluorescents peuvent être utilisés pour suivre les EVs. Le colorant réactif-amine, 5-(and-6)-carboxyfluorescéine diacétate Succinimidyl Ester (CFSE) et fluorescentes de calcéine-AM deviennent une fois à l’intérieur des vésicules. Nous préférons utiliser le label amphiphiles, PKH, parce qu’il donne un signal plus lumineux et plus uniform. Cette approche fournit des informations importantes pour comprendre les interactions entre les véhicules électriques et de cellules réceptrices. Tandis que dans certains cas, EVs se lient à la surface des cellules, des vésicules sont rapidement absorbés. Après absorption, EVs livrent leur cargaison aux cellules, dans lequel ils exercent leurs fonctions de réglementation.
Nous décrivons ici un protocole visant à mesurer la fonction barrière de la cellules endothéliales in vitro en quantifiant le transfert d’un dextran fluorescent à travers une couche cellulaire. Traceurs plus sensibles peuvent être utilisées comme marqueurs radioactifs. Toutefois, dont ils ont besoin de précautions spéciales pour utilisation. Autres tests existent pour mesurer la fonction de barrière en vitro telles que la résistance électrique transendothéliale (TEER), qui mesure l’intégrité de la jonction serrée. Enfin les visualisation ZO-1, une protéine de jonction serrée, par immunofluorescence permet d’évaluer de l’intégrité de la jonction serrée comme bien10. EVs étant des entités complexes et hétérogènes contenant plusieurs cargaisons avec caractéristiques réglementaires potentielles, il est utile de surexprimer un ARN spécifique pour étudier ses effets sur la cellule receveuse. Par conséquent, nous définissons également un protocole qui vise à produire des lignées cellulaires stables exprimant la miRNA d’intérêt10.
Globules rouges humains ont été extraites du sang de donneurs sains, conformément aux directives de Swissethics (swissethics.ch).
NOTE : Cultures de parasite P. falciparum (3 7) et de la production de EV ont été décrites précédemment dans sebastien, et al. 11 parce que P. falciparum est un pathogène humain, consulter la réglementation locale pour la manutention. Les cultures doivent être conservés stérile tout le temps.
1. fluorescence étiquetage des véhicules électriques
Remarque : La procédure suivante prend avantage de la technologie d’étiquetage de manière stable incorporer un colorant fluorescent vert (PKH67) avec des grandes queues aliphatiques dans la région de lipides de la membrane de l’EV. La réaction est effectuée dans une coloration volume contenant une concentration finale de 20 µM de PKH67 final de 200 µL. Effectuez toutes les opérations à température ambiante (20-25 ° C)
2. visualiser l’absorption du SVE par microscopie confocale
Remarque : Le protocole suivant décrit le suivi de l’internalisation EV par les cellules endothéliales cultivées sur des lamelles de verre. Les cellules endothéliales sont les cellules de la moelle osseuse endothéliales humaines semi immortalisés comme décrit dans12.
3. endothélial perméabilité
Remarque : La perméabilité cellulaire endothéliale est évaluée en mesurant le transfert de la rhodamine B isothiocyanate-dextran (moyenne MW 70 000) à travers la couche de cellules endothéliales. Dextran fournit un excellent outil pour étudier la perméabilité vasculaire.
4. déterminer la sensibilité de la puromycine
Remarque : Avant transduction les lignées cellulaires avec lentivirus, il est important de déterminer la courbe de tuer d’un médicament sélectionné pour cette ligne de la cellule particulière. Pour déterminer le montant minimal de la concentration du médicament nécessaire pour tuer toutes les cellules, réaliser une expérience de réponse de dose en utilisant des doses supplémentaires du médicament sélectionné. Parce que chaque ligne de cellules de mammifère a une sensibilité différente, avant expérimentation, déterminer la concentration optimale de l’antibiotique en développant le titrage de courbe de tuer tel que décrit ci-après.
5. transduction des cellules endothéliales avec vecteur Lentiviral
Nous décrivons ici les protocoles afin d’étudier les interactions des véhicules électriques avec les cellules hôtes. L’absorption du SVE fluorescent étiquetés est surveillée par microscopie confocale (Figure 1). Les cellules endothéliales relever efficacement EVs, cependant le temps d’incubation avec EVs peut être optimisé afin de suivre l’absorption. Pour une meilleure localisation des véhicules électriques à l’intérieur des cellules, tache actine avec la phalloïdine. Ensuite, nous utilisons une membrane de filtre au sommet de laquelle se développe une monocouche de cellules endothéliales. La rhodamine B isothiocyanate-dextran est appliqué sur la chambre supérieure de la membrane du filtre, et puis la perméabilité de la monocouche endothéliale est mesurée en surveillant le transfert de la dextrane fluorescent dans le bas du réservoir (Figure 2 a). En règle générale, la perméabilité des cellules endothéliales est affectée lors de l’incubation avec un nombre croissant d’EVs (Figure 2 b). Il est important de cultiver les cellules pendant plusieurs jours pour s’assurer qu’ils formeront une monocouche, autrement que le colorant se diffusera rapidement à travers les puits. Il est important de noter que même sans traitement, le dextran diffusera lentement par le biais de la monocouche cellulaire.
MicroARN sont des éléments clés du SVE et après transfert vers les cellules réceptrices, ils régulent l’expression de gène. Afin d’étudier plus précisément le rôle des miARN, c’est très utile pour eux surexpriment dans la ligne de la cellule receveuse. Ici, nous décrivons comment transduce miARN dans les cellules endothéliales. La première étape consiste à déterminer la concentration de puromycine qui tue les cellules endothéliales afin de sélectionner les cellules stablement transduits (Figure 4 a). Enfin, le niveau d’expression de la miARN peut être contrôlé et validé par qPCR (Figure 4 b).

Figure 1 : EVs sont absorbés par les cellules endothéliales. Purifiée EVs ont été marqués en vert avec PKH67 et incubé pendant 4 h avec une monocouche de cellules endothéliales. Les cellules endothéliales non traitées sont utilisées comme contrôle négatif. Après avoir lavé une vaste pour supprimer EVs non liés, les cellules ont été colorées avec la phalloïdine de colorer d’actine (rouge) et Hoechst 33342 pour colorer le noyau (en bleu). Les cellules ont été observés en microscopie confocale. Des images ont été prises à l’aide d’un microscope confocal laser et un objectif à huile 63 x 1.3 NA. Hoechst 33342 est excitée à 405 nm et dont les émissions recueillies au 450-470 nm (bleu) ; PKH67 est excitée à 488 nm, émissions recueillies à 505-530 nm (vert) ; et la phalloïdine-594 est excitée à 543 nm, émissions recueillies à 620 nm. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : effet d’absorption de l’EV sur la barrière endothéliale. Schéma (A) de la diffusion de dextran rhodamine marquée : les cellules endothéliales sont cultivés au confluent sur le dessus d’une membrane filtrante, le dextran fluorescent est appliqué à la chambre supérieure et se diffuse dans le temps à travers la membrane. L’effet des véhicules électriques sur la perméabilité est évalué après l’ajout du SVE à la chambre supérieure en mesurant le taux de diffusion de la dextrane à la chambre basse. (B) une augmentation de la quantité d’EVs sont incubées avec des cellules endothéliales. Le transfert de dextran rhodamine marqués à travers une membrane trans-bien au fil du temps permet des mesures de perméabilité. Perméabilité à travers la couche endothéliale augmente significativement après 2 h d’incubation avec 50 à 100 µg/mL d’EVs. Les données représentent la moyenne (± s.e.m.) de 3 expériences. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : titrage de puromycine. La solution mère de puromycine (10 mg/mL) est diluée dans RPMI 1640 additionné de sérum de veau 10 % inactivés par la chaleur (56 ° C, 30 min) foetale, pyruvate de sodium 1 mM, 2 mM de glutamine, 100 U/mL de pénicilline/streptomycine. Un total de 15 µL est ajouté à 10 mL de milieu dans le tube A. Puis 7,5 mL de la solution de A tube est mélangé à 2,5 mL de RPMI au tube B. Enfin, 100 µL de la dilution sont ajoutés à 100 µL de cellules pour donner une concentration finale de 7,5 µL/mL, la 5,62 µL/mL et ainsi de suite. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : génération de cellules endothéliales surexprimant miR451a. (A) Détermination de la courbe de l’assassinat de puromycine sur les cellules endothéliales. Les cellules endothéliales sont incubées avec la puromycine à doses croissantes. La viabilité a été mesurée par le test de MTS après 72 h. Les données représentent la moyenne (± s.e.m.) d’une expérience représentative. (B) RNAs dérivée de cellules endothéliales surexprimant miR451a ou un contrôle négatif ont été récoltés et la transcription de miR451a a été quantifiée par PCR en temps réel. résultats de qPCR sont normalisées par la méthode 2-Ct U6 comme un gène de la gouvernante et exprimées en moyenne (± s.e.m.) (n = 3 expériences). S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Dans ce travail, nous décrivons les protocoles afin d’étudier le rôle des vésicules extracellulaires (EVs) libéré par les érythrocytes de Plasmodium falciparum infectés. En particulier, nous nous concentrons sur les interactions des véhicules électriques avec des cellules endothéliales.
Cette étude a été financée en partie par la Fondation Novartis medical - recherche biologique (à PYM), la Gottfried et Julia Bangerter-Rhyner-Stiftung (à MW et PYM) et le bassin de recherche de l’Université de Fribourg (à PYM). Subventions supplémentaires comprennent les bourses d’Excellence gouvernement suisse pour étudiants étrangers (à KAB et SM). Nous remercions Isabelle Fellay et Solange Kharoubi Hess pour le support technique.
| PKH67 Mini Kit de liaison de cellules fluorescentes vertes | Sigma-Aldrich | MINI67-1KT | |
| Diluant C | Sigma-Aldrich | G8278 | |
| poly-L-lysine | Sigma-Aldrich | P8920 | |
| PBS | ThermoFisher - Gibco | 10010023 | |
| Phalloidin CF594 | Biotium | #00045 | |
| Hoechst 33342 | ThermoFisher | H3570 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | ThermoFisher | P36934 | |
| Rhodamine B isothiocyanate&ndash ; Dextran | ThermoFisher | R9379-250MG | |
| Insert avec membrane PET transparent Falcon  ; pour la plaque 24 puits | Falcon | 353095 | |
| Croissance des cellules endothéliales  ; Medium MV | Promocell | C-22020 | |
| Dichlorhydrate de puromycine | Sigma-Aldrich | P9620-10ML | |
| MTS Kit de dosage colorimétrique de prolifération cellulaire | Biovision | K300-500 | |
| bromure d’hexadiméthrine | Sigma-Aldrich | 107689-10G | |
| MISSION  ; MicroARN Lenti, humain has-miR-451a | Sigma-Aldrich | HLMIR0583 | |
| MISSION MicroARN Lenti, ath-miR416, contrôle négatif 1 particules de transduction | Sigma-Aldrich | NCLMIR001 | |
| MISSION  ; MicroARN Lenti, humain | Sigma-Aldrich | NCLMIR0001 | |
| Leica TCS SP5 | Leica Microsystems | ||
| miRNeasy mini Kit | Qiagen | 217004 | |
| TaqMan MicroRNA Reverse Transcription Kit 1000 réactions | ThermoFisher | 4366597 | |
| has-mir-451a  ; RT/750 PCR rxns | ThermoFisher | 001141 | |
| U6 snRNA | ThermoFisher | 001973 | |
| TaqMan Universal Master Mix II, avec UNG | ThermoFisher | 4440038 | |
| StepOnePlus Système de PCR en temps réel | ThermoFisher | 4376600 |