Nous décrivons ici une approche protéomique unicellulaires Evaluer immunitaire phénotypique et fonctionnelle (induction de cytokines intracellulaires) des altérations dans les échantillons de sang périphérique, analysés par cytométrie en masse.
Article de méthode
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Ruxolitinib | Santa Cruz | SC-364729A | Stock Conc : 10 mM ; Conc final : 5 &mu ; M |
| R848 | Invivogen | tlrl-r848-5 | Stock Conc : 1 &mu ; g/&mu ; L; Conc final : 1 &mu ; g/mL |
| LPS-EK | Invivogen | tlrl-eklps | Stock Conc : 1 &mu ; g/&mu ; L; Concentration finale : 0,1 &mu ; g/mL |
| Stérile PBS | Lonza | 17-516F | |
| Tampon Lyse/Fix BD | biosciences | 558049 | Stock Conc : 5X ; Conc final : 1X (dilué dans ddH2O) |
| BD Phosflow perm/wash buffer I | BD biosciences | 557885 | Stock Conc : 10X ; Teneur finale : 1:10 (dilué dans ddH2O) |
| RPMI | Gibco | 21870-076 | |
| Azoture de sodium (NaN3) | Sigma-Aldrich | S-8032 | Teneur en stock : >99,9 %; Processeur final : 0,0002 |
| Inhibiteur de transport de protéines (PTI) | eBiosciences | 00-4980-93 | Processeur : 500X ; Conc final : 1X |
| Intercalateur d’ADN | Fluidigm | 201192B | Stock Conc : 500 &mu ; M; Concentration finale : 0,1 &mu ; |
| Média de coloration des cellules M (CSM) | PBS + 0,5 % BSA, 0,02 % NaN3 | ||
| MaxPar Barcode Perm Buffer | Fluidigm | 201057 | Stock Conc : 10X ; Conc final : 1X |
| 20-plex Barcode Set | Fluidigm | S0014 | Stock Conc : n/a ; Conc final : n/a |
| EQ TM< / sup> Perles d’étalonnage à quatre éléments | Fluidigm | 201078 | Stock Conc : 10X ; Cône final : 1X |
| 16 % sans MeOH Solution de formaldéhyde | Thermo | 28908 | Processeur : 16 % (p/v) ; Cône final : 1,6 % (p/v) |
| Tubes stériles en polystyrène à fond rond | VWR | 60818-496 | Processeur : n/a ; Commande finale : n/a |
| Tubes en grappe de polypropylène | Light Labs | A-9001 | Référence stock : n/a ; Conc final : n/a |
| Helios CyTOF instrument | Fluidigm | Helios | Toutes les solutions à utiliser dans l’analyse CyTOF doivent être exemptes de contamination métallique. ddH2O est utilisé dans la préparation de toutes les solutions doivent avoir une résistivité d’au moins 18,0 M&Omega ;. cm. ddH2O et toutes les solutions auto-préparées doivent être stockées dans des bouteilles neuves en plastique ou en verre qui n’ont jamais été autoclavées. |
| Name | Company | Numéro de catalogue | Comments |
| Anticorps utilisés pour la cytométrie de masse | |||
| Marqueurs de surface | |||
| CD1c | Biolegend | L161 | Masse : 161 |
| CD3 | BD | UCHT1 | Masse : 144 |
| CD4 | Biolegend | SK3 | Masse : 174 |
| CD7 | BD | M-T701 | Masse : 149 |
| CD8 | Biolegend | SK1 | Masse : 142 |
| CD11b | Fluidigm | ICRF44 | Masse : 209 |
| CD11c | BD | B-ly6 | Masse : 152 |
| CD15 | BD | HI98 | Masse : 115 |
| CD14 | Biolegend | M5E2 | Masse : 154 |
| CD16 | eBioscience/Thermo | B73.1 | Masse : 165 |
| CD19 | Santa Cruz | SJ25C1 | Masse : 163 |
| CD21 | Biolegend | Bu32 | Masse : 141 |
| CD27 | BD | L128 | Masse : 155 |
| CD38 | Fluidigm | HIT2 | Masse : 172 |
| CD45 total | Biolegend | HI30 | Masse : 89 |
| CD45RA | Biolegend | HI100 | Masse : 153 |
| CD56 | Miltenyi | REA196 | Masse : 168 |
| CD66 | BD | B1.1/CD66 | Masse : 113 |
| CD86 | Fluidigm | IT2.2 | Masse : 150 |
| CD123 | Fluidigm | 6H6 | Masse : 143 |
| CD278/ICOS | Biolegend | C398.4A | Masse : 156 |
| CD179/PD1 | Biolegend | EH12.2H7 | Masse : 162 |
| IgD | Biolegend | IA6-2 | Masse : 146 |
| IgM | Biolegend | MHM-88 | Masse : 151 |
| CXCR5 | BD | RF8B2 | Masse : 173 |
| HLADR | Biolegend | L243 | Masse : 167 |
| Cytokines | |||
| IL-1&alpha ; | Biolegend | 364-3B3-14 | Masse : 147 |
| IL-1&beta ; | Biolegend ; | H1b-98 | Masse : 169 |
| IL-1RA | Santa Cruz | AS17 | Masse : 157 |
| IL-6 | Biolegend | MQ2-13A5 | Masse : 164 |
| IL-8 | BD | E8N1 | Masse : 160 |
| IL-12/IL-23p40 | Biolegend ; | C8.6 | Masse : 171 |
| IL-17A | Biolegend ; | BL168 | Masse : 148 |
| IL23p19 | eBioscience/Thermo | 23dcdp | Masse : 176 |
| MIP1&beta ; | BD | D21-1351 | Masse : 158 |
| MCP1 | BD | 5D3-F7 | Masse : 170 |
| IFN&alpha ; | Miltenyi ; | LT27:295 | Masse : 175 |
| IFN&gamma ; | Biolégende | 4S. B3 | Masse : 165 |
| PTEN | BD | A2B1 | Masse : 159 |
| TNF&alpha ; | Biolegend | Mab11 | Masse : 166 |
| Note : Si le fabricant est indiqué comme Fluidigm, cet anticorps a été acheté auprès de Fluidigm avec du métal préconjugué. Si le fabricant est indiqué comme autre que Fluidigm, cet anticorps a été auto-conjugué à l’aide de l’étiquetage multi-métaux MaxPar. Kit (Fluidigm Cat : 201300) selon le protocole du fabricant. |
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