Nous présentons ici les méthodes d’étude haut débit d’une série de la mexicaine agassizii comportements et coloration vitale d’un système de mécanosensoriels. Ces méthodes utilisent des scripts logiciel libre et sur mesure, fournissant une méthode pratique et rentable pour l’étude des comportements.
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Article de méthode
Suivi comportemental et l’imagerie de Neuromast des Mexicains Agassizii
Dans cet article
Résumé
Résumé
Les animaux cavernicoles ont développé une série de traits morphologiques et comportementales pour s’adapter à leur environnement perpétuellement sombre et nourriture sont rares. Parmi ces traits de caractère, comportement alimentaire est l’une des fenêtres utiles dans les avantages fonctionnels de l’évolution du trait comportemental. Présentées ici sont mises à jour des méthodes pour analyser le comportement de l’attraction de vibration (VAB : un comportement adaptatif) et d’imagerie de mechanosensors associé de grotte adaptés tetra, Astyanax mexicanus. En outre, les méthodes sont présentées pour le haut débit suivi d’une série de comportements agassizii supplémentaires incluant hyperactivité et sommeil-perte. Agassizii montre également la sociabilité, de comportements répétitifs et d’anxiété plus élevée. Par conséquent, agassizii service comme modèle animal pour les comportements ont évolué. Ces méthodes utilisent des scripts de logiciel libre et sur mesure qui peuvent être appliquées à d’autres types de comportement. Ces méthodes offrent des solutions de rechange pratiques et économiques pour le logiciel de suivi disponible dans le commerce.
Introduction
Le tétra aveugle, Astyanax mexicanus (Teleostei : Characidae), est unique parmi les poissons pour avoir deux formes alternatives radicalement distinctes - un morphing voyant, surface vivant et un morphing aveugle, cavernicoles, composé de plusieurs distincts les populations1. Bien que différents dans la morphologie et de physiologie, ils sont toujours interfertiles2,3. Ces formes interfertiles semblent avoir évolué rapidement (~ 20 000 ans)4, qui en fait un système de modèle idéal pour l’étude de l’adaptation rapide. Agassizii est connus pour avoir une s....
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Protocole
Toutes les procédures sont effectuées suivant les directives décrites dans les « Principes of Laboratory Animal Care » (publication de l’Institut National de la santé n° 85-23, révisé 1985) et l’approuvé par l’Université d’Hawaï à Manoa animalier institutionnel et l’utilisation Comité animaux protocole no 17-2560-3.
1. test de comportement (VAB) attraction vibration (≤ 10 min pour tout enregistrement de procédure)
Remarque : Utilisez une caméra infrarouge sensible ou construire une caméra infrarouge en modifiant une webcam USB. Pour modifier une webcam USB, consultez la description détaillée présentée par le labora....
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Résultats
Les résultats présentés ici sont des exemples représentatifs de ce qui peut être acquis avec les méthodes présentées. Donc, les résultats peuvent dévier légèrement de celles présentées ici pour poulsoni et poissons de surface selon les conditions expérimentales.
Comportement de l’attraction de vibration
On trouvera les résultats représentatifs pour VAB.......
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Discussion
Ces méthodes présentées sont facile d’accès, mais peuvent être compliqués à réaliser en raison de la nature de ses origines de freeware. Par conséquent, il est fortement recommandé d’effectuer l’essais essais et analyses avant toute expérimentation réelle.
Le taux de génération de données peut être rapid une fois que le cadre analytique et expérimental sont établis. Une fois établi, il est possible des deux poissons Records en 7 min pour le dosage de VAB, 30 en 24h pour le dosage de l’activité.......
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Déclarations de divulgation
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Remerciements
Nous remercions tous les membres du laboratoire Yoshizawa dont N. Cetraro, N. Simon, C. Valdez, C. Macapac, J. Choi, L. Lu, J. Nguyen, S. Podhorzer, H. Hernandes, J. Fong, J. Kato et I. Lord pour soins de poissons sur les poissons expérimentaux utilisés dans ce manuscrit. Nous remercions également les membres de laboratoire A. Keene, dont P. Masek pour former mon montage caméra CCD IR. Enfin, nous tenons à remercier l’école Media Lab - collège des Sciences sociales - des Communications à l’Université d’Hawaï Manoa pour leur inestimable aide à faire de la vidéo, surtout B. Smith, J. Lam et S. White. Ce travail a été soutenu par Hawaiian Community Foundation (16CON-7891....
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Matériaux
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| 4-Di-1-ASP (4-(4-(diméthylaminostyryl)-1-iodure de méthylpyridinium) | MilliporeSigma | D3418 | |
| 880 nm longueur d’onde lumière noire Advanced | Illumination | BL41192-880 | |
| avfs | freeware | Version 1.0.0.6 | http://turtlewar.org/avfs/ |
| Avisynth | freeware | Version 2.6.0 | http://avisynth.nl/index.php/Main_Page |
| Cygwin | freeware Version 2.11.0 | https://www.cygwin.com/ | |
| Chambre de dosage cylindrique (plat en verre Pyrex 325 ml) | Corning | 3140-100 | 10 cm de diamètre 5 cm de haut |
| Ethovision XT | Noldus Informations ; Technologie, Wageningen, Pays-Bas | Version 14 | https://www.noldus.com/animal-behavior-research/products/ethovision-xt |
| Fish Aquarium Cylindre Soft Sponge Stone Filtre à eau, Noir | Jardin (à travers Amazon.com) | NA | Filtre éponge pour système d’enregistrement du sommeil/hyperactivité |
| Grade A Oeufs de saumure | Crevettes de saumure direct | BSEA16Z | |
| ImageJ | freeware | Version 1.52e | https://imagej.nih.gov/ij/ |
| macro 1.8/12.5-75mm Objectif zoom à monture C | Toyo | NA | Se fixe à la webcam USB à l’aide de la monture c, qui est imprimée dans une imprimante 3D |
| Régulateur neutre | Seachem | NA | |
| Plastique moulé optique Filtre passe-long IR | Edmund optics | 43-948 | Coupé en un petit morceau pour s’adapter au CCD de la webcam USB |
| pfmap | freeware | Build 178 | http://pismotec.com/download/ (à " Télécharger l’archive" lien en bas) |
| Reef Crystals Reef Salt | Instant Ocean | RC15-10 | |
| SwisTrack | freeware | Version 4 | https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack |
| USB webcam (LifeCam Studio 1080p HD Webcam) | Microsoft | Q2F-00013 | Cut 2-2.5 cm de l’avant |
| WinAutomation | freeware | Version 8 | https://www.winautomation.com/ (free stand-alone application pour cette procédure) |
| Système d’exploitation Windows | Microsoft | 7, 8 ou 10 | https://www.microsoft.com/en-us/windows |
| x264vfw | freeware | NA | https://sourceforge.net/projects/x264vfw/ |
Références
- Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. , Elsevier Inc. Amsterdam. (2015).
- Mitchell, R. W., Russell, W. H., Elliott, W. R.
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Réimpressions et autorisations
