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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Les forces mécaniques sont importantes pour contrôler la migration cellulaire. Ce protocole démontre l'utilisation d'hydrogels élastiques qui peuvent être déformés à l'aide d'une micropipette en verre et d'un micromanipulateur pour stimuler les cellules avec un gradient de rigidité local pour provoquer des changements dans la structure cellulaire et la migration.
Durotaxis est le processus par lequel les cellules détectent et réagissent aux gradients de tension. Afin d'étudier ce processus in vitro, la rigidité du substrat sous-jacent à une cellule doit être manipulée. Tandis que les hydrogels avec la rigidité graduée et les essais à long terme de migration se sont avérés utiles dans des études de durotaxis, les réponses immédiates et aigues aux changements locaux dans la tension de substrat permettent l'étude focalisée des mouvements individuels de cellules et des événements subcellulaires de signalisation. Pour tester à répétition la capacité des cellules à détecter et à répondre à la rigidité sous-jacente du substrat, une méthode modifiée pour l'application de gradients aigus de tension accrue aux cellules individuelles cultivées sur des hydrogels déformables est utilisée qui permet de temps réel manipulation de la force et de la direction des gradients de rigidité transmis aux cellules en question. En outre, en affinant les détails et les paramètres de l'analyse, tels que la forme et les dimensions de la micropipette ou la position relative, le placement et la direction du gradient appliqué, l'analyse peut être optimisée pour l'étude de tout mécaniquement type et système de cellules sensibles. Ces paramètres peuvent être modifiés pour modifier de manière fiable le stimulus appliqué et élargir la fonctionnalité et la polyvalence de l'analyse. Cette méthode permet l'examen du mouvement durotactic à long terme aussi bien que des changements plus immédiats dans la signalisation cellulaire et la dynamique morphologique en réponse à la rigidité changeante.
Au cours des dernières décennies, l'importance des propriétés mécaniques de l'environnement d'une cellule a acquis une reconnaissance croissante en biologie cellulaire. Différents tissus et matrices extracellulaires ont des rigidités relatives différentes et, comme les cellules migrent dans tout le corps, ils naviguent dans ces changements, en utilisant ces propriétés mécaniques pour les guider1,2,3 , 4 ( en plus) , 5 Annonces , 6 Annonces , 7. Les cellules utilisent la rigidité d'un tissu donné pour éclairer leur comportement motile pendant des processus tels que le développement, la guérison des plaies et les métastes cancéreuses. Cependant, les mécanismes moléculaires qui permettent la sensation et la réponse à ces entrées mécaniques restent largement inconnus1,2,3,4,5, 6 Annonces , 7.
Afin d'étudier les mécanismes par lesquels les cellules réagissent aux indices environnementaux physiques, la rigidité ou la rigidité du substrat sous-jacent aux cellules adhérentes doit être manipulée. En 2000, Chun-Min Lo, Yu-Li Wang et ses collègues ont mis au point un essai8 par lequel la réponse motile d'une cellule individuelle aux indices mécaniques changeants pouvait être directement testée en étirant la matrice extracellulaire déformable (ECM) enduite de polyacrylamide hydrogels sur lesquels les cellules ont été plaquées. Les cellules présentent une préférence significative pour la migration vers des substrats plus rigides, un phénomène qu'elles ont surnommé « durotaxis ».
Depuis le rapport original de 2000, de nombreuses autres techniques ont été utilisées pour l'étude du durotaxis. Des gradients de rigidité raide ont été fabriqués en jetant des gels sur des caractéristiques rigides telles que les perles de polystyrène9 ou les poteaux de polymère rigide s'il en est à10 ou en polymérisant le substrat sur les bords d'un verrecouvre 11 pour créer des step-boundaries ». Alternativement, les hydrogels avec des gradients de rigidité moins profonds mais fixes ont été fabriqués par une variété de méthodes telles que des gradients de crosslinker créés par des dispositifs microfluidiques12,13 ou côte à côte gouttelettes de solution hydrogel de rigidité différente8, ou hydrogels avec crosslinker photoréactive traité avec une exposition à la lumière UV graduée pour créer un gradient de rigidité linéaire14,15. Ces techniques ont été utilisées à grand effet pour étudier le mouvement cellulaire durotactic en masse au fil du temps. Cependant, généralement ces caractéristiques sont fabriquées à l'avance du placage cellulaire et leurs propriétés restent cohérentes au cours de l'expérience, en s'appuyant sur le mouvement aléatoire des cellules pour l'échantillonnage des gradients mécaniques. Aucune de ces techniques ne sont propices à l'observation de changements rapides dans le comportement cellulaire en réponse à un stimulus mécanique aigu.
Afin d'observer les réponses cellulaires aux changements aigus dans l'environnement mécanique, les essais de durotaxis à cellule unique offrent plusieurs avantages. Dans ces essais, les cellules individuelles sont donnés un stimulus mécanique aigu en tirant le substrat sous-jacent loin de la cellule avec une micropipette en verre, introduisant de ce fait un gradient directionnel de tension de cellule-matrice. Les changements dans le comportement motile, tels que la vitesse ou la direction de la migration, sont ensuite observés par microscopie de contraste de phase de cellule vivante. Cette approche facilite l'observation directe des relations de cause à effet entre les stimuli mécaniques et la migration cellulaire, car elle permet une manipulation rapide et itérative de la direction et de l'ampleur du gradient de tension et l'évaluation des réponses cellulaires en temps réel. En outre, cette méthode peut également être utilisée pour stimuler mécaniquement les cellules exprimant des protéines fluorescentes de fusion ou des biocapteurs pour visualiser les changements dans la quantité, l'activité ou la localisation subcellulaire des protéines soupçonnées d'être impliquées dans la mécanoceles et durotaxis.
Cette technique a été utilisée par des groupes qui étudient la durotaxique8,16 et est décrite ici comme il a été adapté par le laboratoire Howe pour étudier le comportement durotactic des cellules cancéreuses ovariennes SKOV-3 et les mécanismes moléculaires qui sous-durotaxis17. En outre, une méthode modifiée est décrite pour la fabrication d'hydrogels avec une seule couche uniforme de microsphères fluorescentes près de la surface de la culture cellulaire; cela facilite la visualisation et l'optimisation des gradients de tension générés par micropipette et peut permettre l'évaluation de la contractilité cellulaire par microscopie de force de traction.
1. Fabrication d'hydrogels de polyacrylamide déformables avec microsphères fluorescentes intégrées
REMARQUE: Les instructions décrivent la polymérisation d'un hydrogel de 25 kPa d'un diamètre de 22 m et d'une épaisseur d'environ 66 m. Chacun ou tous ces paramètres peuvent être modifiés et les directions à cet égard peuvent être trouvées dans le tableau 1 et dans les notes17.
2. Cellules de placage
3. Préparation de micropipette en verre : traction et forge de pipette
4. Positionnement du micromanipulateur et de la micropipette
5. Calibrating le micromanipulateur et la génération de force
6. Conduite de l'assay durotaxis
7. Détermination de la réponse migratoire durotactique
En préparant des micropipettes (figure 1) et en normalisant la génération de force des tractions (figure 2 et figure 3) comme décrit ci-dessus, des conditions durotactiques optimales ont été identifiées pour plusieurs lignées cellulaires. À l'aide de cette technique, telle qu'elle est décrite à la figure 4, les cellules cancéreuses ovariennes SKOV-317 et les fibroblastes embryonnaires de rat Ref52 (figure 5) se dirigent vers une rigidité accrue des gradients appliqués par une micropipette en verre. En plus de durotaxis, cette méthode peut être utilisée pour étudier les événements de signalisation dynamique à l'aide de biocapteurs et de marqueurs fluorescents. Par exemple, la structure et la signalisation dans les structures d'adhérence focale peuvent être observées sur la stimulation durotactic. Le capteur de tension de Vinculin (VinTS) est un biocapteur basé sur fret qui localise aux adhérences focales, permettant l'observation fluorescente de la dynamique focale d'adhérence et la mesure des changements de tension dans ces structures19. Ref52 cellules exprimant transitoirement VinTS sur 125 kPa gels polyacrylamide montrent la formation d'adhérences focales dans le sens de l'étirement au cours de la période de 40 min (Figure 6A). L'analyse20 du FRET révèle que la vinculane localisée aux adhérences focales subit un changement immédiat de tension lorsqu'elle est présentée avec une stimulation durotacticale aigue (Figure 6B) élargissant l'utilité de cet analyse à l'observation de la sous-cellulaire en réponse à la stimulation durotactic.

Figure 1. Diagrammes de micropipettes typiques tirées (A) et forgées (B). (A) Les micropipettes sont tirées à l'aide d'un protocole en deux étapes pour atteindre un cône de 1 mm à 10 m sur 2 mm. (B) Les micropipettes sont ensuite chargées dans la microforge et leurs pointes sont pliées, fermées et raccourcies de sorte que les 250 derniers m de la la micropipette est pliée à un angle de 35 degrés et s'effiloche de 30 m à une pointe arrondie qui mesure 15 m. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2. Amélioration du champ de perles après revêtement d'éthanol par rapport à la méthode traditionnelle utilisant la poly-L-lysine. Champs représentatifs de perles d'hydrogel provenant des méthodes de revêtement de couverture d'évaporation de poly-L-L-lysine et d'éthanol (EtOH) utilisant des perles fluorescentes jaune-vert, rouge et rouge foncé. Barre d'échelle : 25 m. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3. Carte de génération de force pour un étirement durotactic d'exemple. (A) Position des microsphères fluorescentes avant et après (vert et rouge pseudo-colorés, respectivement) déformant l'hydrogel avec une micropipette (située au-delà du bord droit du panneau). Barre d'échelle : 25 m. Les vecteurs de déplacement (B) et la carte thermique de déplacement (C) entre les champs de perles nulles et tirés générés par les plugins de microscopie de traction force dans ImageJ mettent en évidence le gradient de la déviation de perles et de la souche hydrogel. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 4. Schéma tique de l'assay durotaxis et détermination de l'angle de déviation. (A) Une cellule est observée pendant au moins 30 min pour déterminer sa trajectoire d'origine. (B) La micropipette est positionnée orthogonalement sur la trajectoire de la cellule, à 50 m du bord cellulaire. L'hydrogel est engagé par la micropipette de telle sorte que le déplacement de la micropipette exercera une force sur la surface de l'hydrogel. (C) La micropipette est tirée à 20 m supplémentaires de la cellule, orthogonale à la trajectoire de la cellule qui crée un gradient de tension local aigu (dénoté en bleu) qui augmente vers la micropipette. (D) La cellule est observée au fil du temps pendant qu'elle navigue le gradient appliqué. (E) Dans ImageJ ou un programme d'analyse d'images, la trajectoire originale (ligne pointillée) est marquée par une ligne tracée au milieu de la cellule à travers le centre du bord d'avant dans la première image. La trajectoire finale (ligne solide) est marquée par une ligne tracée après que la cellule est autorisée à naviguer dans le gradient de tension appliqué. L'angle entre ces deux lignes vers le stimulus est appelé « angle de virage », marqué ici par . S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 5. Les fibroblastes embryonnaires de rat se déplacent vers des régions de rigidité accrue de substrat dans le durotaxis. Cours de temps montrant le mouvement durotactic d'une cellule Ref52 10 min avant la traction (panneau 1), 1 min avant la traction (panneau 2), au moment de la traction (panneau 3), et 1 h après traction (panneau 4). La flèche indique la direction de l'étirement. Barre d'échelle : 50 m. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 6. Localisation et activité des protéines pendant la stimulation durotactic à l'aide de marqueurs fluorescents ou de biocapteurs. Les cellules Ref52 exprimant transitoirement le capteur de tension de Vinculin (VinTS)19 migrant sur 125 gels polyacrylamide de kPa sont présentées avec la stimulation durotactic aigu. (A) Après stimulation, de nouvelles adhérences focales se forment dans le sens de l'étirement lorsque les cellules se réorientent le long du gradient de rigidité. Pendant deux périodes de 10 minutes, à partir de 20 minutes avant la stimulation mécanique et 21 min après stimulation, la morphologie cellulaire (en haut) et la formation d'adhérence focale (en bas) ont été surveillées. La couleur rouge indique le premier point de temps dans la période de temps et la couleur verte indique le point de temps 10 min plus tard. Les nouvelles adhérences focales formées au cours de la période de 10 minutes sont indiquées en vert. Avant la stimulation, de nouvelles adhérences focales se forment dans le sens du voyage. Après stimulation, de nouvelles adhérences focales se forment dans le sens de l'étirement. La flèche indique la direction de l'étirement. Les pointes de flèche indiquent les zones avec des adhérences focales formées au cours de cette période de 10 min. Barre d'échelle : 25 m. (B) L'analyse fret de la fluorescence de VinTS indique un changement de tension dans les adhérences focales proximales à l'étirement durotactic. Le contour de la membrane cellulaire avant et après l'étirement accentue la déformation de la cellule lors de la stimulation. Arrowheads indiquent des exemples d'adhérences focales éprouvant des changements dans le rapport FRET sur l'étirement. Barre d'échelle : 10 m. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
| Rigidité d'hydrogel désirée | 3 kPa | 25 kPa | 125 kPa |
| 7,5% Acrylamide | 100 l | 100 l | 160 l |
| 0,5% Bis-Acrylamide | 10 l | 100 l | 100 l |
| ddH2O | 287 l | 197 l | 137 l |
Tableau 1. Solutions de gel d'acrylamide.
Les auteurs n'ont rien à révéler.
Les forces mécaniques sont importantes pour contrôler la migration cellulaire. Ce protocole démontre l'utilisation d'hydrogels élastiques qui peuvent être déformés à l'aide d'une micropipette en verre et d'un micromanipulateur pour stimuler les cellules avec un gradient de rigidité local pour provoquer des changements dans la structure cellulaire et la migration.
aucun.
| Acrylamide 40 %  ; | Diagnostic national | EC-810 | |
| Persulfate d’ammonium  ; | Fisher | BP179-25 | |
| BD20A Générateur haute fréquence | Electro Technic Products | 12011A | 115 V -  ; Baguette corona portable |
| Bind Silane (y-méthacryloxypropyltriméthoxysilane) ( | Sigma Aldrich | M6514 | |
| Bis-acrylamide 2 %  ; | National Diagnostic | EC-820 | |
| Capillaires en verre borosilicaté | World Precision Instruments | 1B100-4 | |
| Branson 2510 Nettoyeur à ultrasons | Bransonic | 40 kHz fréquence | |
| Manipulateur grossier | Narshige | MC35A | |
| DMEM | Corning | 10-013-CV | |
| DMEM sans rouge phénol | Sigma Aldrich | D5030 | |
| Extracteur de micropipette en verre à deux étages | Narshige | PC-10 | |
| Facteur de croissance épidermique | Peprotech | AF-100-15 | |
| Éthanol | Pharmco-aaper | 111000200 | |
| Sérum de veau fœtal (qualifié One Shot) | Gibco | A31606-02 | |
| Fibronectine  ; | EMD Millipore | FC010 | |
| Fluosphères Carboxylate 0,2 um  ; | Invitrogen | F8810, F8807, F8811 | |
| Fugene 6 | Roche | 1815091 | 1.5 &mu ; g ADN / 6 &mu ; L fugene 6 par boîte de 35 mm |
| Glacial Acide acétique | Fisher Chemical | A38SI-212 | |
| Plat à fond en verre | CellVis | D60-60-1.5-N | |
| Lambeau en verre | Microscopie électronique Sciences | 72224-01 | 22 mm, #1.5 |
| HCl JT | Baker | 9535-03 | |
| Hellmanex III  ; Concentré de nettoyage spécial | Sigma Aldrich | Z805939 | Utilisé à 2 % dans ddH2O pour le nettoyage des lamelles HEPES |
| poudre | Sigma Aldrich | H3375 | Make 50mM HEPES buffer, pH 8.5 |
| Intelli-Ray 400 Shuttered UV Flood Light | Uviton International | UV0338 | |
| Isopropanol | Fisher Chemical | A417-4 | |
| Microforge | Narshige | MF900 | |
| Micromanipulateur | Narshige | MHW3 | |
| Huile minérale | Sigma Aldrich | M5904 | |
| Nanopure Life Science Système UV/UF | Barnstead | D11931 | ddH2O |
| Nikon Eclipse Ti | Nikon | ||
| OptiMEM | Invitrogen | 31985062 | |
| Parafilm M | Bemis Company, Inc | PM-992 | |
| PBS | 139 mM NaCl, 2,5 mM KCl, 28,6 mM Na2HPO4, 1,6 mM KH2PO4, pH 7,4 | ||
| Facteur de croissance dérivé des plaquettes-BB (PDGF-BB) | Sigma Aldrich | P4056 | |
| Ref52 | Lignée cellulaire de fibroblastes embryonnaires de rat ; Culture en DMEM + 10 % FBS | ||
| Ringer’s Buffer | 134 mM NaCl, 5,4 mM KCl, 1 mM MgSO4, 2,4 mM CaCl2, 20 mM HEPES, 5 mM D-Glucose, pH 7,4 | ||
| SKOV-3 | American Type Culture Collection | Culture en DMEM + 10 % FBS | |
| Sulfo-SANPAH  ; | Covachem |   ; 12414-1 | |
| Nettoyeur plasma de table | Harrick Plasma | PDC-32G | |
| TEMED  ; | Sigma Aldrich | T9281-50 |