Ce protocole décrit l'infection de la peau de la souche de souris consanguine couramment utilisée C57BL/6 par Malassezia spp. Adapter ce protocole à d'autres souches de souris ayant un bagage génétique différent (p. ex. Balb/c) ou à une souris génétiquement modifiée. les souches peuvent avoir besoin d'ajustement de la dose d'infection, du point de temps de l'analyse, etc. Pour assurer la reproductibilité, les groupes de souris doivent toujours être du même âge et du même sexe. La source des souris doit rester stable, car même de légers changements dans le contexte génétique et des différences dans le microbiote, qui existent entre les fournisseurs et peuvent exister même entre les différentes unités d'une seule installation de reproduction, peuvent avoir un impact imprévisible sur le cours de l'infection. Lors de la mise en place du modèle d'infection de Malassezia décrit dans ce protocole, il est conseillé d'effectuer une étude pilote pour surveiller attentivement le cours de l'infection, y compris l'étendue de la colonisation, la cinétique du dégagement fongique et le degré de inflammation et pathologie qui pourraient être induites (p. ex., si la peau de l'oreille est perturbée par la barrière avant l'infection) afin de déterminer les conditions optimales d'analyse.
Afin d'assurer la reproductibilité et de détecter de manière fiable les différences entre les groupes expérimentaux, le nombre d'animaux utilisés par groupe doit être calculé sur la base de l'analyse statistique. La taille de l'échantillon est calculée en fonction de la taille de l'effet, du taux d'erreur et de la puissance, qui tiennent compte des variations biologiques et expérimentales (p. ex., en raison de la variation du système immunitaire). Pour des raisons éthiques, évitez d'utiliser un nombre inutilement élevé d'animaux. En ce qui concerne l'infection cutanée Malassezia, le traitement d'une seule oreille avec le champignon et l'utilisation de l'autre oreille comme un contrôle au sein de la même souris, n'est pas conseillé parce que les souris peuvent propager le champignon aux deux oreilles lors du toilettage. Cependant, l'utilisation d'une demi-oreille pour différentes sorties méthodologiques telles que la détermination de la charge fongique, l'isolement des cellules immunitaires ou l'analyse histologique est souvent suffisant et entraîne une réduction significative du nombre d'animaux utilisés pour les expériences.
18 espèces différentes de Malassezia ont été décrites à ce jour. Les variations inter-espèces et intraspécifiques au sein du genre Malassezia peuvent affecter l'interaction avec l'hôte, comme nous l'avons également appris d'études sur d'autres champignons pathogènes humains13. Différentes espèces et souches de Malassezia diffèrent par leur origine (p. ex., M. pachydermatis est l'espèce la plus fréquente isolée des animaux, tandis que M. restricta, M. globosa et M. sympodialis sont les plus membres éminents du microbiome de peau fongique chez l'homme avec la distribution variable de ces espèces entre différentes zones de peau). Certaines espèces ont été associées au commensalisme, tandis que d'autres sont considérées comme plus pathogènes, bien que les preuves détaillées restent relativement faibles. Fait important, certaines espèces et souches sont intrinsèquement plus difficiles à cultiver que d'autres. Ainsi, la décision de l'espèce/souche à utiliser pour l'infection doit être fondée sur la question de la recherche.
L'infection expérimentale de la peau murine avec certains organismes microbiens tels que Candida albicans ou Staphylococcus aureus nécessitent la perturbation de la barrière épidermique avant l'infection, par exemple, avec du papier de sable14, 15,16. En revanche, le modèle de l'infection de Malassezia décrit ici est également efficace avec et sans perturbation de barrière7. Le degré d'inflammation induit par le champignon est massivement amélioré si la peau est dépouillée avant l'infection7. Par conséquent, si la peau doit être manipulée avant l'application de Malassezia dépend de la question de recherche. Divers modèles d'inflammation chronique et aigue de la peau (p. ex., modèles d'hypersensibilité de type retardé (DTH) et d'hypersensibilité au contact (SCH)) et de modèles d'insuffisance de barrière qui peuvent être d'intérêt pour étudier la contribution de la levure commensal aux pathologies cutanées.
Les souris consanguines maintenues dans des conditions spécifiques exemptes d'agents pathogènes (SPF) ne sont pas (à notre connaissance) naturellement colonisées avec Malassezia. Par conséquent, l'application expérimentale de Malassezia à la peau de l'oreille de la souris représente une exposition primaire au champignon qui induit une réponse aigue chez l'hôte, qui à son tour conduit à un dégagement fongique dans les 1 - 2 semaines7. Alors que le modèle décrit dans ce protocole ne reflète donc que partiellement la situation chez les humains immunocompétents ou d'autres organismes hôtes qui sont colonisés en permanence avec Malassezia, l'infection expérimentale permet une fenêtre ample de l'occasion d'étudier l'immunité antifongique et les mécanismes cellulaires et moléculaires qui sous-tendent cette réponse. Il permet également d'étudier les variations dans la réponse à différentes espèces et souches de Malassezia dans différentes conditions expérimentales (par exemple, avec et sans perturbation de barrière de la peau).
L'étude de Malassezia - interactions hôtes ont été limitées dans le passé à des expériences in vitro avec des types de cellules isolées dans les cultures (par exemple, les lignées cellulaires de kératinocytes, PBMCs). Bien que ces études aient mis en lumière les déterminants fongiques et hôtes qui façonnent l'interaction entre Malassezia et l'hôte17, elles ne permettent pas d'acquérir une compréhension complète du champignon - l'interaction hôte dans le complexe l'environnement de la peau, qui implique de multiples types de cellules qui sont en communication constante, tels que les kératinocytes, les fibroblastes et les cellules immunitaires résident esparent des tissus, mais aussi les populations de leucocytes qui n'infiltrent le tissu qu'à la rencontre microbienne de la Peau. Ce réseau multicellulaire ne peut pas être entièrement reproduit dans les modèles in vitro, même avec la plupart des systèmes organoïdes avancés. Ainsi, l'infection expérimentale des souris représente toujours l'étalon-or dans la recherche sur l'immunologie et les maladies infectieuses, et la disponibilité du modèle décrit ici représente une percée dans le domaine de la recherche Malassezia. Fait important, ce modèle repose sur l'application épicutanée de Malassezia sur la peau de l'oreille de souris par ailleurs non perturbée, et il n'implique pas l'inoculation du champignon par injection dans le tissu, par exemple, sous-cutanée ou par voie intrapéritone, comme des études antérieures ont rapporté18, qui sont tous deux plus éloignés de la situation dans les hôtes naturellement colonisés.
La possibilité de combiner le modèle de l'infection de Malassezia décrit dans ce protocole avec d'autres modèles de souris disponibles augmente considérablement la portée et la flexibilité de l'application. Ces derniers comprennent divers modèles de troubles spécifiques de la peau, tels que le modèle de carence en barrière qui imite les caractéristiques importantes de la dermatite atopique, une maladie associée à La Malassezia chez les humains et les chiens. En outre, l'infection épicutanée de la peau par Malassezia peut facilement être appliquée à des souris présentant des défauts génétiques dans les gènes hôtes d'intérêt, ou à des souris dans lesquelles un type cellulaire d'intérêt est génétiquement supprimé ou peut être épuisé par la pharmacologie (par exemple, par des moyens de l'administration de la toxine de diphtérie dans les souris récepteurs de la diphtérie). Ces modèles représentent un outil inévitable pour disséquer la réponse de l'hôte aux microbes commensal et pathogènes, y compris Malassezia, et pour évaluer le rôle de ces gènes et le type de cellule dans l'interaction champignon-hôte. Les analyses de l'interaction peau Malassezia-hôtepeuvent être étendues bien au-delà de ce qui est décrit dans ce protocole. Il s'agit notamment d'analyses par histologie (p. ex., pour déterminer le degré de pathologie cutanée ou l'épaississement épidermique induit par le champignon), par l'immunohistochimie ou la coloration immunofluorescente des sections tissulaires à l'aide d'anticorps dirigés contre le type cellulaire. marqueurs spécifiques ou d'autres molécules d'intérêt. Il peut également impliquer l'isolement des cellules (par exemple, les sous-ensembles de loucoocytes infiltrants de tissu ou de tissu-infiltrant) du tissu cutané infecté pour étudier la polarisation, la régulation, et la dynamique de la réponse immunitaire à Malassezia en profondeur.