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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Le but de ce protocole est d'isoler les micronavires de plusieurs régions du système nerveux central des vertébrés lissencephalic et gyrencephalic.
L'isolement des microvaisseaux du système nerveux central (SNC) est généralement effectué en combinant le tissu cortical de plusieurs animaux, le plus souvent des rongeurs. Cette approche limite l'interrogation des propriétés de la barrière hémato-encéphalique (BBB) au cortex et ne permet pas de comparaison individuelle. Ce projet se concentre sur le développement d'une méthode d'isolement qui permet la comparaison de l'unité neurovasculaire (NVU) à partir de plusieurs régions du SNC : cortex, cervelet, lobe optique, hypothalamus, pituitaire, tronc cérébral et moelle épinière. En outre, ce protocole, initialement développé pour les échantillons de murine, a été adapté avec succès pour une utilisation sur les tissus du SNC à partir de petites et grandes espèces de vertébrés à partir de laquelle nous sommes également en mesure d'isoler les micronavires de la matière blanche de l'hémisphère cérébral. Cette méthode, lorsqu'elle est jumelée à l'immunolabeling, permet la quantitation de l'expression des protéines et la comparaison statistique entre les individus, le type de tissu ou le traitement. Nous avons prouvé cette applicabilité en évaluant des changements dans l'expression de protéine pendant l'encéphalomyélite autoimmune expérimentale (EAE), un modèle murine d'une maladie neuroinflammatoire, sclérose en plaques. En outre, les micronavires isolés par cette méthode pourraient être utilisés pour des applications en aval comme qPCR, RNA-seq, et Western blot, entre autres. Même s'il ne s'agit pas de la première tentative d'isoler les micronavires du SNC sans l'utilisation d'ultracentrifugation ou de dissociation enzymatique, il est unique dans son aptitude à la comparaison des individus isolés et de plusieurs régions du SNC. Par conséquent, il permet d'enquêter sur une gamme de différences qui pourraient autrement rester obscures : parties du SNC (cortex, cervelet, lobe optique, tronc cérébral, hypothalamus, pituitaire et moelle épinière), type tissu du SNC (matière grise ou blanche), individus, groupes de traitement expérimental et des espèces.
Notre cerveau est l'organe le plus important de notre corps. Pour cette raison, garder l'homéostasie du cerveau en dépit de facteurs externes qui peuvent déclencher une déviation de la normalité est une priorité. Selon certains chercheurs, il y a environ 400 à 500 millions d'années1, les animaux vertébrés ont développé ce que nous connaissons aujourd'hui comme la barrière hémato-encéphalique (BBB)2,3. Cette « clôture » protectrice exerce la plus grande influence sur l'homéostasie et les fonctions du système nerveux central (SNC) en régulant étroitement le transport des ions, des molécules et des cellules entre le sang et le parenchyme du SNC. Lorsque le BBB est perturbé, le cerveau devient sensible à l'exposition toxique, l'infection et l'inflammation. Par conséquent, le dysfonctionnement de BBB est associé à beaucoup, sinon tous, désordres neurologiques et neurodevelopmental4,5,6.
La fonction sophistiquée du BBB est attribuée à la microvasculature unique du SNC conforme par l'unité neurovasculaire (NVU)2,3. Les cellules endothéliales hautement spécialisées, les péricytes et les pieds d'extrémité astrocytiques sont les composants cellulaires du NVU2,3. La matrice extracellulaire générée par ces cellules est également essentielle à la physiologie NVU et BBB2,3. Bien que les composants cellulaires et moléculaires essentiels de la NVU soient conservés chez les vertébrés, l'hétérogénéité est signalée chez les ordres et les espèces7,8. Cependant, les limitations techniques entravent notre capacité à considérer pleinement ces différences dans la neurobiologie, la recherche biomédicale ou translationnelle.
Pour cette raison, nous avons élargi une méthode d'isolement micronavire spécifique à la région du SNC pour la rendre applicable à de nombreuses espèces des cinq groupes de vertébrés : poissons, amphibiens, reptiles, oiseaux et mammifères. Le protocole est décrit pour une utilisation sur les vertébrés de petite-lissencéphale et de grande gyrencéphalie, y compris les espèces avec la pertinence translationnelle9. En outre, nous incluons d'autres régions du SNC non étudiées auparavant dans ce contexte, mais pertinentes à la neurophysiologie et avec des implications cliniques énormes : l'hypothalamus, l'hypotuitaire et la matière blanche. Enfin, nous avons testé la capacité de cette méthode d'isolement comme un outil fiable pour identifier les changements dans l'expression des protéines le long de la NVU et / ou BBB9,10,11. Comme preuve de concept, nous avons montré comment déterminer les changements dans l'expression VCAM-1 et JAM-B pendant EAE utilisant la méthode d'isolement suivie de l'immunofluorescence.
Toutes les procédures de la présente étude sont conformes aux lignes directrices fixées par l'Université de Californie (UC), le Davis Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC). Les soins aux animaux de l'UC Davis sont réglementés par plusieurs ressources indépendantes et sont entièrement accrédités par l'Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International (AAALAC) depuis 1966. Les tissus porcins du SNC ont été obtenus auprès du Département des sciences animales de l'UCD, Laboratoire des sciences de la viande. Les tissus de CNS des macaques de rhesus ont été obtenus du département de pathologie de centre national de primate de la Californie (NIH P51OD011107). Aucune anesthésie, euthanasie, ou autopsie n'a été exécutée par le personnel de laboratoire sur des porcs et des macaques. Par conséquent, il n'y a pas de recommandations particulières à ce sujet.
REMARQUE : Cette méthode a été validée pour plusieurs espèces, mais le protocole fourni correspond plus directement aux tissus de souris et de porcin. Les détails relatifs au lobe optique ne s'appliquent pas lors de l'utilisation de spécimens de mammifères. Tous les matériaux biodangereux doivent être manipulés dans une installation de biosécurité appropriée (BSL). Tous les matériaux extrêmement toxiques doivent être manipulés sous une hotte de fumée. Tous les déchets médicaux biodangereux et les déchets extrêmement toxiques doivent être éliminés correctement.
1. Préparation
2. Dissection tissulaire du SNC à partir d'un petit spécimen de vertébré lissencéphalique
REMARQUE: L'article démontre l'application du protocole sur un C57BL6/J, 10 semaines, 25 g, souris mâle.
3. Dissection tissulaire du SNC d'un grand spécimen de vertébré gyncéphalique
REMARQUE : Ce protocole utilise des tissus porcins du SNC obtenus d'un abattoir. Par conséquent, aucune anesthésie, euthanasie, ou autopsie n'est décrite ou montrée ici.
4. Homogénéisation des tissus du SNC
REMARQUE : Il est plus efficace quand deux investigateurs s'engagent dans le processus d'homogénéisation : un disséquant les méninges sous le stéréoscope et l'autre homogénéisant les tissus hachés. De cette façon, les tissus sont rapidement retournés au seau à glace et gardés au froid.
5. Purification des micronavires
6. Elution et filtration de micronavires
7. Immunostaining
REMARQUE : La coloration de l'hématoxylin et de l'éosine (H et E) a été réalisée sur des spécimens de reptiles, d'amphibiens et de poissons comme preuve de concept de la faisabilité du protocole. Par conséquent, il n'y a aucune recommandation pour l'immunolabeling pour ces spécimens.
Les microvessels isolés du SNC murine ont montré tous les composants cellulaires intrinsèques de l'unité neurovasculaire2,3. Utilisation de la molécule d'adhérence des cellules endothéliales plaquettaires-1 (PECAM, également connue sous le nom de CD31) ou de l'isolectin IB4 (une glycoprotéine qui lie la cellule endothéliale glycocalyx) pour les cellules endothéliales, Le facteur de croissance dérivé des plaquettes (PDGFTRD) ou antigène neuronal-glial 2 (NG2) pour les péritéytes et l'aquaporine-4 (AQP4) pour les pieds d'extrémité astrocytiques(figure 3A,B) démontre que ces composants intrinsèques sont présents dans les micronavires isolés. Les régions du SNC visibles comprennent les microvaisseaux corticaux (figure 3B),le cervelet (figure 3C), l'hypotuitaire (figure 3D),l'hypothalamus (figure 3E),le tronc cérébral (figure 3F), et la moelle épinière (figure 3G). Tous ont montré l'expression de ces marqueurs canoniques.
De même, les micronavires ont montré l'expression de la protéine de jonction adhérente VE-cadherin (Figure 4A,C), protéines de jonction serrées claudin-5 et zonula occludens-1 (CLDN5 et ZO-1, Figure 4A,D), protéine de jonction tricellulaire angulin-1 (Figure 4A,E) et marqueurs apicobasal C-X-C motif chemokine ligand 12 et gamma-glutamyltransferase 1 (CXCL12 et GGT1, Figure 4A,F). Ces résultats sont pertinents parce que ces protéines sont des indicateurs des propriétés pivots BBB-spécifiques9,12,13,14. Une présence limitée d'astrocytes, d'oligodendrocytes et de neurones exprimant des protéines acide fibrillaires gliales (GFAP, Figure 4B,C,G),des protéines spécifiques à l'oligodendrocyte (OSP, Figure 4B,G),et neurofilament-moyen (NFM, Figure 4B,H),respectivement, démontre que les micronavires isolés présentaient des traces négligeables de cellules non neurovasculaires non neurovasculaires non neurovasculaires non indésirables. De plus, la majorité des micronavires étaient dépourvus de l'expression de l'actine musculaire lisse (SMA, Figure 5B,C). Ceci est pertinent parce que l'AMS est un marqueur pour les cellules musculaires lisses associées aux artérioles et aux œilles(figure 5A),ce qui indique que ce protocole d'isolement cible sélectivement les micronavires de petit calibre15.
Les micronavires obtenus à partir d'autres petits vertébrés lissencéphaliques partagent certaines caractéristiques morphologiques, comme on le voit chez les poissons (grenouille et lézard non montré) et les micronavires aviaires. Cela donne à penser que cette méthode est utile pour caractériser davantage les différences dans les VUN entre les espèces (figure 6). De plus, les micronavires aviaires du SNC(figure 6H-N)présentaient une réactivité croisée avec bon nombre des anticorps développés pour l'homme et la souris. Cela encourage l'étude plus approfondie des spécimens aviaires pour des études biologiques et biomédicales de BBB. Nous avons observé des résultats similaires lorsque nous avons isolé des micronavires de porcs et de macaques, deux espèces gyncéphaliques (figure 7). Seuls les marqueurs canoniques NVU dans les micronavires porcins sont montrés. En plus des régions susmentionnées du SNC, nous avons pu isoler les micronavires de la matière blanche périventriculaire(figure 7B). Ceci est pertinent parce que la matière blanche est impliquée dans des conditions neuroinflammatoires (par exemple, la sclérose en plaques16,17,18).
Nous voulions savoir si cette méthode pouvait être utilisée comme un outil fiable pour déterminer les changements dans l'expression des protéines. Sachant que VCAM-1 et JAM-B ont été impliqués dans le processus neuro-inflammatoire à la moelle épinière pendant EAE, nous avons décidé de quantifier l'expression de ces protéines aux stades de pointe et chroniques des souris EAE et faux-témoins (10 souris C57BL/6J de la semaine)9,10,11. Pour ce faire, nous avons mesuré l'unité arbitraire d'intensité (AUI) le long du diamètre des micronavires. Ensuite, à l'aide d'un seuil de 20 AUI pour le DAPI, nous avons calculé la zone sous la courbe (AUC) pour VE-cadherin, VCAM-1 et JAM-B pour 50 micronavires par région du SNC(figure 8A,B). Enfin, nous avons effectué l'ANOVA bidirectionnel suivi de l'essai post-hoc de Sidak pour déterminer la signification statistique des changements dans l'expression des protéines.
Comme prévu, nous avons observé une augmentation du VCAM-1 et du JAM-B le long des micronavires de la moelle épinière au plus fort de l'EAE(figure 8D,E). Cependant, nous avons observé des changements dans d'autres régions du SNC qui n'avaient pas été signalés auparavant pour l'EAE. Le VCAM-1 a augmenté de manière significative dans les microvessels pituitaires et a diminué dans les microvessels d'hypothalamus et de tronc cérébral. Il y a eu des changements au cours de l'EAE chronique dans tous les tissus du SNC (figure 8D). LE JAM-B a augmenté de façon significative dans les micronavires hypothalamus et pituitaires pendant l'EAE chronique (figure 8E). Fait intéressant, nous avons observé des changements dans ve-cadherin le long des micronavires isolés de l'hypothalamus et du tronc cérébral pendant le pic de l'EAE, le cervelet pendant l'EAE chronique(figure 8C), et une diminution de la largeur des micronavires pituitaires pendant le pic et l'EAE chronique. Dans l'ensemble, ces données suggèrent que cette méthode d'isolement des micronavires est un outil utile pour caractériser les changements dans les modèles régionaux d'expression des protéines pendant la santé et la maladie.

Figure 1 : Dissection efficace de moelle épinière sans laminectomy. La dissection de la moelle épinière à partir de petits spécimens de vertébrés (jusqu'à 100 g) est effectuée plus rapidement et plus efficacement en rinçant le cordon dans une direction caudale à rostrale dans tout le foramen vertébral. À l'aide de ciseaux disséquants, la tête est enlevée par l'articulation de l'atlas et la colonne vertébrale est découpée par la hanche (A). Tous les organes de remaing sont enlevés, ne laissant que la colonne vertébrale (B). La moelle épinière dans le foramen vertébral lombaire apparaît comme un très petit cercle blanc (diamètre de 1 mm) par rapport à la largeur du cordon cervical (B, flèches jaunes). Garder une ouverture étroite au foramen vertébral lombaire facilite un gradient de pression de la colonne lombaire à la colonne cervicale lors de la rinçage avec une aiguille de 18 G et 10 cc seringue chargée de 1x PBS (C et D). Une fois rincée, la moelle épinière(D, flèche jaune) est presque totalement dépourvue du sac dural, et seule la pia doit être enlevée sous la portée de dissection. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Outil de dissection de pique à double volet et porte-filtre modifié. Cet outil de dissection de 11 cm de long (A) a deux points très pointus, presque horizontalement opposés, 2 mm de bout en bout (B). En appliquant une légère pression vers le bas et en tordant légèrement dans le sens des aiguilles d'une montre (C), les points s'intègrent horizontalement dans les méninges afin qu'ils puissent être soulevés vers le haut. Ceci est particulièrement utile lors de l'enlèvement des méninges du cervelet, car il permet l'accès dans la profondeur des folia cerebelli. Il est également très utile lors de l'élimination des méninges du tissu cortical, en particulier gyrencéphale. Dans ce cas, la pia est fortement intégrée avec la vascularisation de haut calibre qui compromettra la pureté de l'isolement de microsevessel. De même, il facilite l'élimination du plexus choroïde, qui est la source la plus semblable de contamination. Les supports de filtre de 47 mm, 25 mm et 13 mm de diamètre ont été coupés au laser pour enlever le connecteur d'intérieur (D) du compartiment supérieur (E), mais garder le composant de tamis (G). Cette modification a permis l'assemblage d'une unité de filtre (I,J) en plaçant le filet de filtre en nylon de 20 m sur le tamis et la partie inférieure (G,H), la sécurisation du filet en place lors de la vissement de la partie supérieure (E). Seul le porte-filtre de 25 mm est affiché. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3 : Microvessels isolés de plusieurs régions du SNC ont exprimé des marqueurs d'unité neurovasculaire canonique. (A) À l'aide de l'immunolabeling et de la microscopie confocale, les composants cellulaires intrinsèques du NVU sont utilisés pour identifier les micronavires murines C57BL/6J de C57BL/6J adultes (8 à 14 semaines). Comme on le voit sur l'image de fusion pour les micronavires corticaux (B), au-dessus des images confocales individuelles pour le marqueur cellulaire endothélial CD31 (blanc), marqueur périgraphique PDGFR (rouge), et astrocytic end-feet marqueur AQP4 (vert) tous ces composants cellulaires sont conservés. Notez que la relation intime entre les cellules endothéliales et les péritéytes les font apparaître magenta sur l'image fusionnée, tandis que les pieds d'extrémité astrocytiques semblent avoir un halo qui les entoure (B). Le même modèle d'expression est observé pour le cervelet (C), pituitaire (D), hypothalamus (E), tronc cérébral (F), et la moelle épinière (G, DAPI, tache nucléaire - bleu; barre d'échelle de 10 m). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 4 : Les micronavires exprimaient des protéines associées à des propriétés propres à BBB. Les cellules endothéliales de l'unité neurovasculaire (NVU) sont également décrites par les protéines associées à leurs propriétés intrinsèques de barrière (A). Comme on le voit dans la figure, les cellules endothéliales ont des jonctions faites de VE-cadherin, CLDN5, ZO-1 (A, jaune), et angulin-1 (A, sarcelle). Ils présentent également une polarité apicobasale à plusieurs protéines, y compris GGT-1 et CXCL12 (A, vert et rouge). Les neurones, les oligodendrocytes et les corps à cellules astrocytes peuvent être inclus dans les microvaisseaux isolés, bien qu'ils ne soient pas intrinsèques au NVU (B). Ceux-ci sont identifiables par l'expression de NFM (rouge), OSP (cyan), et GFAP (vert lime), respectivement (B). Conformément à ceux-ci, nos micronavires isolés ont exprimé des adhérences protéine VE-cadherin (C, rouge), protéines de jonction serrées CLDN5 et ZO-1(D, rouge et vert, respectivement, fusion - jaune), protéine de jonction tricellulaire LSR (E, vert), et marqueurs apicobasal CXCL12 et GGT1 (F, rouge et vert, respectivement). Ils ont également montré des quantités limitées de GFAP (A, vert, G,blanc), OSP (G, vert), et NFM (H, rouge), suggérant une rétention négligeable des cellules unitaires non neurovasculaires (DAPI, tache nucléaire - bleu; barre d'échelle de 10 m). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 5 : La plupart des micronavires isolés n'expriment pas l'AMS. L'unité neurovasculaire présente une transition sophistiquée de l'artériole-capillary-venule (A). L'expression anulaire de l'ASM identifie clairement l'artériole, et comme il devient l'expression capillaire, 'SMA (B, rouge) l'expression diminue, exposant le marqueur mural NG2 (B, vert). Nous avons mesuré le diamètre des navires 'SMA' et 'SMA' (parenthèses blanches, n '20), afin de les distinguer comme des artérioles ou des capillaires (DAPI, tache nucléaire, bleu, barre d'échelle de 10 m). L'analyse non appariée du diamètre des navires de l'AMA et de la SMA a montré une signification statistique élevée (C, SMAMD - rouge, rouge/vert, 'p 'lt; 0.0001). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 6 : Isolement réussi des micronavires du SNC par ceux d'autres espèces lissencephalic. Le SNC a été récolté à partir d'une grenouille pêchée à l'état sauvage (8,2 cm), d'un lézard (12,7 cm), d'une truite arc-en-ciel élevée en réservoir (2 ans, 35,6 cm) et d'un pigeon élevé à la volière (9 mois, 300 g). Les micronavires de la grenouille, du poisson et du lézard ont été tachés par h et E (seuls les micro-navires de la truite sont montrés, barre d'échelle de 20 m). Les micronavires de pigeon ont été immunolabeled. Nous avons pu identifier les micronavires sur toutes les régions comme indiqué sur les contours du poisson et du pigeon CNS : cortex (A et H), lobe optique (B et I), cervelet (C et J), pituitaire (D et L), hypothalamus (E et K), tronc cérébral (F et M), et moelle épinière (G et N). En outre, nous avons pu identifier les cellules endothéliales avec l'isolectin IB4 (blanc), les pieds d'extrémité astrocytiques avec AQP4 (vert), et les neurones adjacents avec NFM (rouge) des micronavires isolés du pigeon (DAPI, tache nucléaire - bleu, barre d'échelle ' 10 'm). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 7 : Isolement des micronavires du SNC par les espèces gyncéphaliques. Le cerveau et la moelle épinière ont été disséqués à partir d'un porc élevé à la ferme (6 mois, 120 kg) pour l'isolement des micronavires et l'immunoétiquetage. Nous avons pu identifier les micronavires étiquetés positivement pour ib4 (blanc), PDGFR (rouge) et AQP4 (vert) sur toutes les régions du CNS porcin : cortex (A), matière blanche périventriculaire (B), cervelet (C), pituitaire (D), hypothalamus (E), tronc cérébral (F), et moelle épinière (G, DAPI, tache nucléaire, bleu). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 8 : Exemple d'autre application de l'isolement des micronavires du SNC. L'expression de JAB-B et vCAM-1 a été quantifiée pour les micronavires eAE murines. Des unités arbitraires d'intensité (AUI) ont été mesurées pour le cortex, le cervelet, l'hypothalamus, l'hypotuitaire, le tronc cérébral, et la moelle épinière des souris aux stades de pointe et chroniques de l'EAE, avec le faux comme contrôle (n - 4). Pour chaque région du SNC, douze micronavires ont été évalués par souris pour déterminer l'AUI par fluorochrome et le diamètre du micronavire (A). Les supports blancs montrent des exemples de l'outil de mesure du logiciel de microscope confocal utilisé pour déterminer l'AUI pour VCAM-1 (blanc), VE-cadherin (vert), JAM-B (rouge) et DAPI (bleu, barre d'échelle de 10 m). Ensuite, l'AUI résultant a été tracée contre le diamètre des microns (B) pour calculer la zone sous la courbe (AUC) pour chaque protéine immunolabeled comme estimation de l'expression de protéine. L'AUC moyen par groupe a ensuite été analysé par ANOVA bidirectionnelle, suivi du test post hoc de Sidak, pour un total de 48 micronavires par région du SNC. À l'exception des microvaisseaux pituitaires, nous n'avons observé aucune différence majeure entre le diamètre des micronavires associé à l'état de la maladie (C, insert), mais une diminution significative de l'expression VE-cadhérine de l'hypothalamus et du tronc cérébral chez les souris EAE (C). Une analyse statistique similaire a montré une augmentation significative pour VCAM-1 (D) et JAM-B (E) à la moelle épinière, compatible avec le statut neuroinflammatoire pendant le pic de l'EAE. Intéressant, nous avons également observé des changements pour VCAM-1 à l'hypothalamus, pituitaire, et le tronc cérébral. Ces résultats font l'objet d'une enquête (barres et points noirs, faux, barres rouges et points, pic EAE, barres et points de saumon, EAE chronique, 0,05, @p lt;0,01, #p-lt;0,001, et 0,0001). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
| MV-1 | 10 mM HEPES |
| dans 1x la solution de sel équilibrée de Hank (HBSS) avec calcium et magnésium | |
| MV-2 (en) | 18% 70 kDa poids moléculaire (MW) dextran |
| en 10 mM HEPES/HBSS (MV-1) | |
| MV-2 (en) | 20% 70 kDa MW dextran |
| en 10 mM HEPES/HBSS (MV-1) | |
| MV-3 (en) | 1% d'albumine de sérum bovin (BSA) |
| en 10 mM HEPES/HBSS (MV-1) | |
| Fixateur | 4% de paraformaldéhyde (PFA) |
| en 1x phosphate tamponné salin (PBS) pH 7.4 | |
| Tampon de lavage | 1x PBS pH 7,4 |
| Perméabilisation et blocage du tampon | 10% BSA |
| 0,25% de surfactant nonionic | |
| en 1x PBS pH 7.4 | |
| Diluant d'anticorps | 5% BSA |
| 0,25% de surfactant nonionic | |
| en 1x PBS pH 7.4 |
Tableau 1 : Solutions utilisées dans le protocole.
| Étape (s) | Action |
| 4.1 et 4.1.1 | Mince dans la solution MV-1 avec une lame à bord unique |
| 4,2 à 4,2,2 | Homogérisez dans la solution MV-1 à l'aide d'un pilon Potter-ELVJ PTFE ou microtube |
| 5.1 | Tourner à 2 000 x g, 4 oC, 10 min |
| 5.1.1 à 5.1.1.2 | Resuspendre le granule dans la solution MV-2 |
| 5.2 | Tourner à 4 400 x g, 4 oC, 15 min |
| 5,3 à 5,5 | Resuspendre la pastille avec 1 ml de solution MV-3 |
| 6,2 à 6,4,1 | Éluter sur un tube conique de 50 ml à travers une passoire cellulaire et rincer avec la solution MV-3 |
| 6.5, 6.5.1, 6.6 et 6.7 | Filtrer avec un filet en nylon de 20 m sur le support de filtre modifié |
| 6.8 | Chargez le filet de nylon dans le bécher de 50 ml avec 10 ml de solution MV-3 et secouez pendant 30 s |
| 6,9 à 6,10 | Décant dans un tube conique de 15 ml et tourner à 2 000 x g, 4 oC, 5 min |
| 6.10 | Resuspendre dans 1 ml de solution MV-3 |
| 6.10.1 | Transférer dans un microtube de 1,7 ml et tourner à 20 000 x g,4 oC, 5 min |
| 7,1 à 7,3 | Resuspendre en 1x PBS et charger dans les toboggans de puits |
Tableau 2 : Mise en page pour l'isolement des petits micronavires vertébrés. Ce graphique est une version abrégée du protocole lors de l'utilisation d'un spécimen lissencephalic.
| Étape (s) | Solution | Action | Ctx | Cbl | Opter | BST (en) | Sc | Hyp | Fosse |
| 4.1 | MV-1 | Émincer sur le plat | 100 mm x 20 mm Petri plat, 1 ml | n/a | |||||
| 4.2.1 et 4.2.2 | MV-1 | Homogénéiser | 5 mL, 10 ml Potter-Elvehjem au pilon | 1 ml, micropille | |||||
| 5.1.1.1 et 5.1.1.2 | MV-2 (en) | Remettre | 5 ml de 5 ml, 18 % Dextran | 1 mL, 20% dextran | |||||
| 5.5 et 6.4.1 | MV-3 (en) | Remettre | 1 ml à 10-15 mL | 1 mL | |||||
| 6.2 et 6.4.1 | MV-3 (en) | Taille de strainer | 100 m | 70 m | 100 m | 70 m | 100 m | ||
| Rincer | 5 mL | ||||||||
| 6.5, 6.5.1 et 6.7 | MV-3 (en) | Taille du filtre, rinçament | Filtre de 25 mm, 10 ml | 13 mm, 5 ml | |||||
| 6.8 | MV-3 (en) | Secouer sur le bécher | 10 ml | ||||||
| 6.10 | MV-3 (en) | Remettre | 1 mL | ||||||
| 7.2 | 1x PBS | Remettre | 1,5 à 2,0 ml | 0,5 à 1,0 ml | 0,1 à 0,2 ml | ||||
| 7.3 | 1x PBS | Charge par puits | 200 l | 100 l | 25 à 50 l | ||||
| CTX - cortex, CBL - cervelet, BST - tronc cérébral, OPT - lobe optique (non présent chez les mammifères), HYP , hypothalamus, PIT , pituitaire, SC et moelle épinière. Les volumes recommandés sont pour les tissus entiers provenant d'animaux dont la taille varie de 20 g (jeune souris) à 800 g (rat adulte). |
Tableau 3 : Volume/taille recommandé. Ce contour a le volume recommandé de solutions pour l'utilisation d'un petit spécimen de vertébrés allant de 20 à 800 g, ou plus précisément, la souris de 25 g montrée sur la vidéo. L'ajustement final des volumes nécessaires doit être déterminé par le chercheur en fonction de la quantité spécifique de tissu humide obtenue après la dissection. La pratique et le dépannage sont fortement recommandés. CTX - cortex, CBL - cervelet, BST - tronc cérébral, OPT - lobe optique (non présent chez les mammifères), HYP , hypothalamus, PIT , pituitaire, SC et moelle épinière.
| Étape (s) | Action |
| 4.1 et 4.1.2 | Mince dans MV-1 avec une lame à bord unique |
| 4.3 à 4.3.4 | Homogérisez dans la solution MV-1 à l'aide d'un broyeur Potter-Elvehjem avec un pilon PTFE |
| 5.1 | Tourner à 2 000 x g, 4 oC, 10 min |
| 5.1.2 à 5.1.2.2 | Resuspendre le granule dans la solution MV-2 |
| 5.2 | Tourner à 4 400 x g, 4 oC, 15 min |
| 5,3 à 5,5 | Resuspendre la pastille avec 1 ml de solution MV-3 |
| 6,2 à 6,4 et 6,4,2 | Éluter sur un tube conique de 50 ml à travers une passoire cellulaire et rincer avec la solution MV-3 |
| 6.5, 6.5.2, 6.6 et 6.7 | Filtrer avec un filet en nylon de 20 m sur le support de filtre modifié |
| 6.8 | Chargez le filet en nylon dans un bécher de 50 ml avec 30 ml de solution MV-3, et secouez pendant 30 s |
| 6,9 et 6,10 | Décant dans un tube conique de 50 ml et tourner à 2 000 x g,4 oC, 5 min |
| 6.10 | Resuspendre dans 1 ml de solution MV-3 |
| 6.10.2 | Transférer dans un microtube de 5 ml et tourner à 2 000 x g,4 oC, 5 min |
| 7,1 à 7,3 | Resuspendre en 1x PBS et charger dans les toboggans de puits |
Tableau 4 : Mise en page pour l'isolement des grands micronavires vertébrés. Ce graphique est une version abrégée du protocole lors de l'utilisation d'un spécimen gyrencéphalique.
| Étape (s) | Soution (Soution) | Action | Ctx | Cbl | Wm | BST (en) | Sc | Hyp | Fosse |
| 4.1 | MV-1 | Émincer sur le plat | 3 à 5 ml | 1 mL | |||||
| 4.3 à 4.3.4 | MV-1 | Homogénéiser | 20 à 30 ml, 55 ml Potter-Elvehjem avec pilon et agitateur de tête | 5 mL, 10 ml Potter-Elvehjem au pilon | |||||
| 5.1.2 à 5.1.2.2 | MV-2 (en) | Remettre | 20 mL, 20% dextran | 5 ml à 5 ml, 20% dextran | |||||
| 5.5, 6.4 et 6.4.2 | MV-3 (en) | Remettre | 1 ml à 20 ml | 1 ml à 10 ml | |||||
| 6.2 et 6.4.2 | MV-3 (en) | Taille de strainer | 100 m | 70 m | 100 m | 70 m | 100 m | ||
| Rincer | 10 ml | ||||||||
| 6.5, 6.5.2 et 6.7 | MV-3 (en) | Taille du filtre, rinçament | Filtre de 47 mm, 10 ml | 25 mm, 10 ml | |||||
| 6.8 | MV-3 (en) | Secouer sur le bécher | 30 ml | ||||||
| 6.10 et 6.10.2 | MV-3 (en) | Remettre | 1 ml à 4 ml | ||||||
| 7.2 | 1x PBS | Remettre | 2,0 à 4,0 ml | 1,0 à 2,0 ml | |||||
| 7.3 | 1x PBS | Charge par puits | 200 l | 100 l | |||||
| CTX - cortex, CBL - cervelet, WM - matière blanche, BST - tronc cérébral, HYP - hypothalamus, PIT - pituitaire, SC - moelle épinière. Les volumes recommandés sont pour les échantillons de 45 cm3 pour cTX, CBL, BST et SC HYP et PIT entiers. |
Tableau 5 : Volume/taille recommandé. Ce contour a le volume recommandé de solutions pour l'utilisation d'un grand spécimen de vertébrés. Plus précisément, il s'applique aux biopsies tissulaires du SNC de 45 cm3 pour le cortex, le cervelet, la matière blanche, le tronc cérébral, la moelle épinière, et l'hypothalamus et l'hypotuite entiers, comme le montre la vidéo. L'ajustement final des volumes nécessaires doit être déterminé par le chercheur en fonction de la quantité spécifique de tissu humide obtenue après la dissection. La pratique et le dépannage sont fortement recommandés. CTX - cortex, CBL - cervelet, WM - matière blanche, BST - tronc cérébral, HYP - hypothalamus, PIT - pituitaire, SC - moelle épinière.
Les auteurs n'ont rien à révéler.
Le but de ce protocole est d'isoler les micronavires de plusieurs régions du système nerveux central des vertébrés lissencephalic et gyrencephalic.
Le Dr Cruz-Orengo a reçu le soutien de l'Université de Californie, Davis, School of Veterinary Medicine Start Up Funds.
| 10X PBS | ThermoFisher | BP39920 | Utilisé pour le blocage et le diluant d’anticorps. |
| 20 % PFA | Microscopie électronique Sciences | 15713-S | Utilisé comme fixateur (4 % PFA) |
| 70 000 MW Dextran | Millipore Sigma | 9004-54-0 | Utilisé pour la solution MV-2 |
| Adson Forceps | Fine Science Tools (FST) | 11006-12 | Utilisé pour l’ablation des muscles et de la peau |
| Adson Forceps, qualité étudiante | FST | 91106-12 | Identique que ci-dessus mais moins cher |
| Sérum bovin albumine (BSA) | Millipore Sigma | A7906-100G | Utilisé pour la solution MV-3, le blocage et le diluant d’anticorps |
| Corning 100 &mu ; m Crépine à cellules | Millipore Sigma | CLS431752-50EA | |
| Corning 70 &mu ; m Filtre à cellules | Millipore Sigma | CLS431751-50EA | |
| Corning Deskwork pointes à faible liaison | Millipore Sigma | CLS4151 | Identique que ci-dessous mais moins cher. |
| Cultrex Poly-D-Lysine | R& D | 3439-100-01 | Utilisé pour le revêtement en glissement |
| Donkey anti-Goat IgG-ALEXA 555 | Thermo | A21432 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Âne anti-souris IgG-ALEXA 488 | Thermo | A21202 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Âne anti-Lapin IgG-ALEXA 488 | Thermo | A21206 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Âne anti-Lapin IgG-ALEXA 647 | Thermo | A31573 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Âne anti-Rat IgG-DyLight 650 | Thermo | SA5-10029 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Pic à tissu à double broche | FST | 18067-11 | Utilisé pour l’ablation des méninges et du plexus choroïde |
| Dumont #3c Forceps | FST | 11231-20 | Utilisé pour la manipulation de tissus du SNC plus délicates et/ou plus petites (comme l’hypophyse) |
| Dumont #7 Forceps | FST | 11274-20 | Utilisé pour la dissection et la manipulation du syndrome du SNC |
| Dumont #7 Forceps, étudiant | FST | 91197-00 | Identique à ci-dessus mais |
| moins cher ep Dualfilter T.I.P.S. LoRetention Tips | Eppendorf | 22493008 | de meilleure qualité que les tips ci-dessus (plus cher). |
| Pince Graefe extra fine, dentelée | FST | 11151-10 | Utilisée pour l’ablation des os |
| Ciseaux fins, tranchants | FST | 14060-09 | Utilisée pour l’ablation du sac dural du porc et du macaque |
| Pilon en verre 1,5 mL Microcentrifuge Tube Broyeur de tissus Homogénéisateur, paquet de 10 | Chang Bioscience Inc. (eBay) | GP1.5_10 | Utilisé pour l’hypothale et l’hypophyse des petits vétébrés. |
| Anti-CXCL12 de chèvre, | PeproTech | 500-P87BGBT | biotinyléUtilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Dilution recommandée : 1:20. |
| Chèvre anti-JAM-B | R& D | AF1074 | Utilisé comme anticorps primaire pour évaluer la neuroinflammation. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Chèvre anti-souris IgG-ALEXA 488 | Thermo | A11001 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Anti-souris chèvre IgG-ALEXA 555 | Thermo | A21424 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Chèvre anti-PDGFR&beta ; | R& D | AF1042 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Chèvre anti-Lapin IgG-ALEXA 555 | Thermo | A21249 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Chèvre anti-Lapin IgG-DyLight 488 | Thermo | 35552 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Anti-Rat de chèvre IgG-DyLight 650 | Thermo | SA5-10021 | Utilisé comme anticorps secondaire. Dilution recommandée de 1:200. |
| Pince Graefe, pointe incurvée, 1X2 dents | FST | 11054-10 | Utilisation pour le maintien et l’agitation des filets filtrants en nylon |
| HBSS, 1X tampon avec calcium et magnésium | Corning | 21-022-CM | Utilisé pour la solution MV-1 |
| HEPES, tampon liquide 1M | Corning | 25-060-CI | Utilisé pour la solution MV-1 |
| Isolectine GS-IB4-Biotin-XX | ThermoFisher Scientific (Thermo) | I21414 | Glycoprotéine isolée de la légumineuse Griffonia simplicifolia qui se lie aux résidus D-galactosyle de la cellule endothéliale glycocalysx. Utilisé pour les microvaisseaux du SNC aviaire et porcin. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Ciseaux LaGrange, dentelés | FST | 14173-12 | Utilisé pour la dissection du crâne et la laminectomie (sauf porc et macaque) |
| Lame Millicell EZ unité 8 puits Millipore | Sigma | PEZGS0816 | |
| Souris anti-CLDN5 | Thermo | 35-2500 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Souris anti-GGT1 | Abcam | ab55138 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Souris anti-humaine CD31 | R& D | BBA7 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC des primates. Concentration recommandée : 16,5 &mu ; g/mL. |
| Thermo | RMO-270 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. | |
| Souris anti-&alpha ;SMA | Thermo | MA5-11547 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Dilution recommandée de 1:200. |
| Filet filtrant en nylon, rouleau | Millipore Sigma | NY6000010 | Disques de filet filtrant découpés au laser à 13 mm de diamètre. Utilisé pour les petits hypothales et hypophysaires vétérés. |
| Filets filtrants en nylon, 25 mm | Millipore Sigma | NY2002500 | Utilisé sur la plupart des tissus du SNC des petits vertébrés, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. Utilisé pour l’hypothalamus et l’hypophyse du macaque et du porc. |
| Filets filtrants en nylon, 47 mm | Millipore Sigma | NY2004700 | Utilisé pour les tissus du SNC des macaques et des porcs, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. |
| Réactif anti-décoloration ProLong Gold avec DAPI | ThermoFisher | P36935 | Utilisé pour les lames de lamelles. |
| Lapin anti-AQP4 | Millipore Sigma | A5971 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Dilution recommandée de 1:200. |
| Lapin anti-LSR | Millipore Sigma | SAB2107967 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Lapin anti-NG2 | Millipore Sigma | AB5320 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Dilution recommandée de 1:200. |
| Lapin anti-OSP | Abcam | ab53041 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 1 &mu ; g/mL. |
| Lapin anti-VE-Cadhérine | Abcam | ab33168 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Lapin anti-ZO-1 | Thermo | 61-7300 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Rat anti-CD31 | Becton Dickinson | BD 550274 | Utilisé comme anticorps primaire pour les microvaisseaux murins du SNC. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Anti-GFAP pour rat | Thermo | 13-0300 | Utilisé comme anticorps primaire sur les microvaisseaux du SNC à partir de tous les échantillons. Dilution recommandée de 1:200. |
| Rat anti-VCAM-1 | Becton Dickinson | BD 553329 | Utilisé comme anticorps primaire pour évaluer la neuroinflammation. Concentration recommandée : 5 &mu ; g/mL. |
| Solution de Ringer stérile, Frog | Aldon Corporation | IS5066 | Utilisé pour l’anesthésie amfibienne |
| Streptavidin-ALEXA 555 | Thermo | S32355 | Utilisé comme anticorps secondaire pour marquer les anticorps primaires biotinylés. Dilution recommandée de 1:500. |
| Streptavidin-ALEXA 647 | Thermo | S32357 | Utilisé comme anticorps secondaire pour marquer les anticorps primaires biotinylés. Dilution recommandée de 1:500. |
| Ciseaux chirurgicaux, tranchants | FST | 14002-12 | Utilisés pour l’ablation des muscles et de la peau |
| Ciseaux chirurgicaux, tranchants-émoussés | FST | 14001-16 | Utilisés pour la décapitation (sauf porc et macaque) |
| Porte-filtre Swinnex, 13 mm | Millipore Sigma | SX0001300 | Modifié par découpe laser. Utilisé pour les petits hypothales et hypophysaires vétérés. |
| Porte-filtre Swinnex, 25 mm | Millipore Sigma | SX0002500 | Modifié par découpe laser. Utilisé sur la plupart des tissus du SNC des petits vertébrés, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. Utilisé pour l’hypothalamus et l’hypophyse du macaque et du porc. |
| Porte-filtre Swinnex, 47 mm | Millipore Sigma | SX0004700 | Modifié par découpe laser. Utilisé pour les tissus du SNC du macaque et du porc, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. |
| Triton X-100 | ThermoFisher | 50-165-7277 | Utilisé pour le blocage et le diluant d’anticorps. |
| Wheaton 120 Vac Overhead Sutterrer | VWR (Fournisseur DWK Life Sciences) | 62400-904 (DWK #903475) | Utilisé pour les tissus du SNC du macaque et du porc avec un broyeur de tissus de 55 ml, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. |
| Broyeur de tissus Wheaton Potter-Elvehjem avec pilon en PTFE, 10 mL | VWR (Fournisseur DWK Life Sciences) | 14231-384 (DWK #357979) | Utilisé sur la plupart des tissus du SNC des petits vertébrés, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. Utilisé pour l’hypothalamus et l’hypophyse du macaque et du porc. |
| Broyeur de tissus Wheaton Potter-Elvehjem avec pilon en PTFE, 55 mL | VWR (Fournisseur DWK Life Sciences) | 14231-372 (DWK #357994) | Utilisé pour les tissus du SNC du macaque et du porc, à l’exception de l’hypothalamus et de l’hypophyse. |