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L’ischémie-reperfusion (IRA) du rein représente l’un des principaux facteurs de risque de développement de l’insuffisance rénale aiguë (IRA)1. L’IRA joue un rôle important dans le pronostic des patients, mais des traitements spécifiques et des biomarqueurs diagnostiques précoces n’ont pas été établis.
Les microARN (miARN) sont des ARN courts et non codants avec environ 18 à 25 bases. Les miARN sont stables dans les fluides corporels et leurs séquences sont très conservées chez les animaux2. Les miARN régulent l’expression de plusieurs protéines à travers des milliers de cibles, influençant ainsi diverses voies de signalisation 2,3,4,5,6,7,8. Ces dernières années, il a été rapporté que les miARN sont impliqués dans divers états pathologiques et sont des biomarqueurs efficaces pour le diagnostic précoce de plusieurs maladies.
L’objectif global de ce protocole est de purifier et de détecter avec succès les miARN dans les reins d’un modèle murin d’IRA induit par l’IRI. Ce modèle IRI est un modèle largement utilisé de l’IRA et de la fibrose rénale. Les avantages du modèle IRI incluent la possibilité de confirmer visuellement si l’ischémie-reperfusion a été réalisée et de déterminer le moment exact de l’apparition de l’IRA. Cependant, une durée de clamp suffisamment longue pour causer des lésions tubulaires larges est associée à un taux de mortalité élevé, tandis qu’une courte durée de clamp ne provoque pas de dommages tubulaires, ce qui entraîne une grande variation dans la progression des dommages tubulaires dans ce modèle expérimental. Par rapport au modèle de clampage bilatéral, le tissu de néphrectomie droit prélevé dans le modèle IRI rénal unilatéral agit comme un contrôle et assure l’insuffisance rénale.
L’échantillon de rein est écrasé à l’aide d’un homogénéisateur en verre, dans lequel les protéines et les acides nucléiques sont séparés, et l’ADN et l’ARN sont séparés9. L’ARN total, y compris les miARN, est purifié à partir de l’échantillon de rein à l’aide d’une colonnede spin 9 à base de membrane de silice. Par la suite, la synthèse de l’ADNc (transcription inverse) est réalisée à partir de l’ARN total à l’aide de la poly(A) polymérase et des amorces oligo-dT10. Enfin, l’expression du miARN est déterminée par qRT-PCR à l’aide d’un colorant intercalateur10. La qRT-PCR peut quantifier plus précisément l’expression des gènes par rapport à la PCR des volumes d’amplification aux extrémités. La qRT-PCR mesure des concentrations élevées et se caractérise par une large plage dynamique, ce qui permet une quantification précise qui dépend du nombre de cycles. Des études antérieures ont rapporté que des processus simples pouvaient être utilisés pour purifier et détecter efficacement les miARN dans les tissus 8,9,10. Les méthodes décrites dans ce protocole pour la synthèse de l’ADNc (transcription inverse) et la détection de l’expression des miARN par qRT-PCR à l’aide d’un colorant intercalateur ont été signalées comme présentant une précision et une sensibilité élevées10.
De plus, ce protocole est simple et permet d’obtenir des résultats cohérents entre les laboratoires. Par conséquent, ce protocole est utile dans les études qui nécessitent une détection très précise et sensible des miARN dans les reins d’IRA de souris.