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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
L’analyse ex vivo décrite dans cette étude à l’aide d’extraits d’homogénéisation intestinale et de taches d’immunofluorescence représente une nouvelle méthode pour examiner la morphogenèse hyphale de Candida albicans dans le tractus gastro-intestinal. Cette méthode peut être utilisée pour étudier les signaux environnementaux régulant la transition morphogenétique dans l’intestin.
Candida albicans morphogenèse hyphale dans le tractus gastro-intestinal (GI) est étroitement contrôlée par divers signaux environnementaux, et joue un rôle important dans la diffusion et la pathogénie de cet agent pathogène fongique opportuniste. Cependant, les méthodes pour visualiser l’hyphe fongique dans le tractus gastro-intestinal in vivo sont difficiles, ce qui limite la compréhension des signaux environnementaux dans le contrôle de ce processus de morphogenèse. Le protocole décrit ici démontre une nouvelle méthode ex vivo pour la visualisation de la morphogenèse hyphale dans les extraits d’homogénéisation intestinale. À l’aide d’un essai ex vivo, cette étude démontre que le contenu cécal des souris traitées aux antibiotiques, mais pas des souris témoins non traitées, favorise la morphogenèse hyphale de C. albicans dans la teneur en intestin. En outre, l’ajout de groupes spécifiques de métabolites intestinaux au contenu cécal des souris traitées aux antibiotiques régule différemment la morphogenèse hyphale ex vivo. Pris ensemble, ce protocole représente une nouvelle méthode pour identifier et étudier les signaux environnementaux qui contrôlent la morphogenèse hyphale de C. albicans dans le tractus gastro-intestinal.
Candida albicans est un pathogène fongique opportuniste et polymorphe qui est normalement proportionnel, mais qui peut subir un changement morphologique en une forme virulente capable de causer des infections potentiellement mortelles chez les personnes immunocompromisées1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13. C. albicans est l’une des principales causes d’infections nosocomiales systémiques, avec un taux de mortalité de 40\u201260%, même avec un traitement antifongique2,14,15. Bien que C. albicans réside dans différents créneaux d’accueil, y compris le systèmereproducteur féminin 16,17, la cavité buccale des personnes en bonne santé18 et le tractus gastro-intestinal (GI)19,20, la majorité des infections systémiques proviennent du tractus gastro-intestinal et en outre, la source de l’infection systémique est souvent confirmée pour être letractus gastro-intestinal 21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34. La pathogénie de C. albicans dans le tractus gastro-intestinal est influencée par un large éventail de facteurs; cependant, une caractéristique majeure nécessaire à la virulence est la transition d’une morphologie des cellules de levure en une morphologie virulente des cellules hyphaliques35,36,37,38,39,40,41,42,43,44. C. albicans attachement et la diffusion du tractus gastro-intestinal pendant l’infection est fortement associée à sa capacité à passer d’une levure proportionnelle à hyphe virulente, permettant aux champignons de causer des maladies invasives44,45,46,47,48,49,50,51,52,53.
Une variété de facteurs dans l’intestin, y compris n-acétylglucosamine, réguler la formation d’hyphal par C. albicans. Par conséquent, il est crucial de réduire l’écart dans la connaissance concernant la morphogenèse hyphale de cet agent pathogène fongique dans letractus gastro-intestinal 54,55,56. Des preuves récentes indiquent que divers métabolites intestinaux contrôlent différemment la morphogenèse hyphale de C. albicans in vitro57,58,59,60. Cependant, les contraintes techniques présentent des problèmes lorsqu’on tente d’étudier la formation d’hyphes de C. albicans dans des échantillons intestinaux in vivo, en particulier la coloration des cellules de levure et d’hyphes et l’analyse quantitative du développement hyphal. Pour comprendre la morphogenèse hyphale de C. albicans dans le tractus gastro-intestinal, une méthode ex vivo a été développée à l’aide d’extraits solubles de contenu intestinal homogénéisé de souris pour étudier l’effet des métabolites sur la morphogenèse hyphale fongique. Utilisant des échantillons d’intestin de souris résistantes et sensibles à l’infection par l’IG de C. albicans, cette méthode aidera à identifier et à étudier l’effet des métabolites, des antibiotiques et des xénobiotiques sur la morphogenèse hyphale fongique dans le tractus gastro-intestinal.
Tous les protocoles animaux ont été approuvés par le Midwestern University Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) tel que décritavant 57. Le Comité institutionnel de soins et d’utilisation des animaux de l’Université du Midwest a approuvé cette étude en vertu du Protocole IACUC de l’UTW #2894. Les politiques de soins aux animaux de l’UTW suivent la Politique du Service de santé publique (SSP) sur les soins et l’utilisation des animaux de laboratoire et les politiques énoncées dans la Loi sur le bien-être des animaux (AWA).
1. Les souris étudient le protocole standard
2. Préparation des plaques d’agar extrait-peptone-dextrose (YPD) de levure
3. Préparation ex vivo pour l’essai hyphal de morphogenèse
4. Ajout exogène de métabolites aux extraits homogénéisés d’intestin pour l’essai hyphal de morphogenèse
5. Essai de morphogenèse de C. albicans (immunostaining et imagerie)
Ces résultats ainsi que les résultats antérieurs du laboratoire Thangamani60 indiquent que lorsque C. albicans est cultivé ex vivo dans des extraits d’homogénéisation intestinale prélevés dans l’estomac, les intestins grêles et les gros intestins de souris témoins non traitées et traitées aux antibiotiques, C. albicans se développe généralement avec une morphologie de levure (figure 1B). Cependant, lorsqu’il est cultivé dans l’extrait cécal à partir de souris traitées aux antibiotiques, C. albicans subit facilement la morphogenèse, ce qui entraîne des échantillons contenant des formes de levure et d’hyphes (Figure 1B); cela ne se produit pas chez les souris témoins. Ceci soutient des résultats précédents, qui ont montré une augmentation significative des formes d’hyphe dans les échantillons cultivés dans les extraits cecal antibiotiques-traités, mais pas dans n’importe quels autres extraits antibiotique-traitésd’intestin 60. Ces résultats suggèrent que le traitement antibiotique provoque des changements dans l’environnement cécal, qui induisent la morphogenèse hyphale de C. albicans. En outre, la localisation spécifique de ce phénotype remarqué seulement dans le cecum suggère également que ces conditions hyphae-promotion peuvent ne pas nécessairement présenter dans tout le tractus gastro-intestinal, mais sont plutôt limitées à des segments spécifiques du tractus gastro-intestinal en fonction de la disponibilité des nutriments, métabolites et autres molécules inconnues.
Puisque l’extrait cécal des souris antibiotiques-traitées favorise la morphogenèse de C. albicans57,58,59,60,nous avons examiné si l’addition exogène d’un groupe choisi de métabolites d’intestin (identifiés des études in vitro précédentes) à la teneur cecal des souris cef-traitées affectera la morphogenèse de C. albicans ex vivo. Des travaux antérieurs effectués par le laboratoire Thangamani ont caractérisé le profil métabolomique de l’homogénéité à teneur cécale extraite de souris non traitées et traitées aux antibiotiques, révélant des changements significatifs dans l’abondance de divers métabolites à la suite d’un traitement antibiotique, en particulier une diminution de l’abondance des acides biliaires secondaires et une abondanceaccrue de glucides 60. En outre, cette étude a identifié que les acides biliaires secondaires et les acides carboxyliques inhibent le développement d’hyphe, tandis que les hydrates de carbone comprenant le glucose, favorisent la morphogenèse hyphal de C. albicans in vitro60. Les résultats indiquent que l’ajout d’un pool de métabolites inhibiteurs de l’intestin contenant de l’acide désoxycholique (DCA, 0,5 mg/mL), de l’acide lithocholic (LCA, 0,1 mg/mL), acide palmitique (0,1 mg/mL), acide p-tolylacetic (0,1 mg/mL), acide sébacique (0,5 mg/mL), 2 l’acide méthylbutyrique (0,5 mg/mL) et l’acide lactique (5 mg/mL) à l’homogénéité cécale des souris traitées au cef ont complètement inhibé la morphogenèse hyphale ex vivo. D’autre part, l’addition exogène du glucose (1 mg/mL) à l’homogénéate cecal des souris cef-traitées a montré un ex vivo massif de développement hyphal (figure 2B). Collectivement, ces résultats indiquent que l’addition des métabolites d’intestin de nouveau à l’homogénéate cecal des souris cef-traitées régule différentiellement la morphogenèse de C. albicans, confirmant ainsi des résultats in vitro précédents. Ces résultats indiquent que les métabolites intestinaux jouent un rôle essentiel dans la morphogenèse hyphale de C. albicans et la compréhension des cibles génétiques et des voies de signalisation modulées par ces métabolites aidera au développement de nouvelles approches thérapeutiques pour prévenir et traiter les infections à C. albicans.

Figure 1 : Analyse ex vivo pour déterminer l’effet du traitement de cefoperazone sur la morphogenèse hyphale de C. albicans dans le contenu intestinal. (A) Schéma de protocole. (B) Le contenu intestinal traité aux antibiotiques (panneaux supérieurs) et non traité (panneaux du bas) a été prélevé sur l’estomac, les intestins grêles, les ccums et les gros intestins des souris C57BL/6J. Le contenu intestinal inoculé avec C. albicans SC5314 a été incubé à 37 °C pendant 4\u20125 h et taché d’anticorps C. albicans. Les cellules ont été imaged au grossissement de 40x. Des images représentatives sont affichées ici. S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Ajout exogène de métabolites intestinaux au contenu cécal des souris traitées au cef sur la formation hyphe de C. albicans ex vivo. (A) Schéma de protocole. (B) Piscine inhibitrice de métabolites intestinaux contenant du DCA (0,5 mg/mL), du LCA (0,1 mg/mL), de l’acide palmitique (0,1 mg/mL), de l’acide p-tolylacétique (0,1 mg/mL), de l’acide sébacique (0,5 mg/mL); L’acide 2-méthylbutyrique (0.5 mg/mL), et l’acide lactique (5 mg/mL) ou le glucose (1 mg/mL) ont été ajoutés de nouveau à la teneur en cecal des souris cef-traitées, mélangées complètement et incubées à 37 °C pendant 15 min pour effectuer l’essai ex vivo hyphae. Le contenu cécal inoculé avec C. albicans SC5314 a été incubé à 37 °C pendant 4\u20125 h et taché d’anticorps C. albicans. Les cellules ont été imaged au grossissement de 40x. Des images représentatives sont affichées ici. S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Les auteurs n’ont pas d’intérêts financiers concurrents ou d’autres conflits d’intérêts.
L’analyse ex vivo décrite dans cette étude à l’aide d’extraits d’homogénéisation intestinale et de taches d’immunofluorescence représente une nouvelle méthode pour examiner la morphogenèse hyphale de Candida albicans dans le tractus gastro-intestinal. Cette méthode peut être utilisée pour étudier les signaux environnementaux régulant la transition morphogenétique dans l’intestin.
Les auteurs reconnaissent les ressources et le soutien du centre de recherche cellulaire et moléculaire de base de l’Université du Midwest.
| 1 - 10 et micro ; L Pointes de pipette | Fisher Scientific | 02-707-454 | Misc |
| 100 - 1000 µ ; L pointes de pipette | Fisher Scientific | 02-707-400 | Misc |
| 20 - 200 & micro ; L Pointes de pipette | Fisher Scientific | 02-707-451 | |
| Divers Acide 2-méthylbutyrique | Sigma | 193070-25G | composé inhibiteur d’hyphe |
| 488 chèvre anti-lapin IgG | Invitrogen (Fisher) | A11008 | IF Coloration secondaire ab |
| Agar | Fisher | BP1423-500 | YPD Gélose |
| Microscope d’imagerie automatisé | Keyence | BZX700 | |
| Candida Albicans Anticorps | Invitrogen (Fisher) | PA1-27158 | IF Coloration primaire ab |
| céfoperazone | Cayman | 16113 | antibiotique |
| acide désoxycholique | Sigma | 30960 | composé inhibiteur d’hyphes |
| D-Glucose | Fisher | D16-500 | pince à composé favorisant l’hyphe |
| Fisher | 08-885 | ||
| acide lactique | Alfa Aesar | AAAL13242-06 | composé inhibiteur d’hyphe |
| acide lithoholique | Sigma | L6250-10G | composé inhibiteur d’hyphe |
| acide palmitique | Sigma | P5585-10G | composé inhibiteur d’hyphe |
| Paraformaldéhyde | Alfa Aesar | A11313 | IF Fixateur de coloration |
| Saline tamponnée au phosphate (PBS), 10x | Alfa Aesar | J62692 | Composant PBS |
| Acide p-tolylacétique | SCBT | sc-257959 | Composé inhibiteur d’hyphe |
| Acide sébacique | Sigma | 283258-250G | Composé inhibiteur d’hyphe |
| Ciseaux à bout pointu | Fisher | 28301 | |
| Eau stérile Milli-Q | N/A | N/A | |
| Divers YPD Bouillon | BD Biosciences | 242810 | Composant de gélose YPD |