La coloration immunohistochimique et le séquençage du gène de l’ARN ribosomique 16S (gène de l’ARNr 16S) ont été effectués afin de découvrir et de distinguer les bactéries dans les tissus ovariens cancéreux et non cancéreux in situ. Les différences de composition et de fonctionnement des bactéries ont été prédites à l’aide de BugBase et de Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States (PICRUSt).
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Article de méthode
Caractérisation et prédiction fonctionnelle des bactéries dans les tissus ovariens
* These authors contributed equally
Dans cet article
Résumé
Résumé
La théorie d’un appareil reproducteur supérieur féminin « stérile » a rencontré une opposition croissante en raison des progrès de la détection bactérienne. Cependant, la question de savoir si les ovaires contiennent des bactéries n’a pas encore été confirmée. Ici, une expérience pour détecter les bactéries dans les tissus ovariens a été introduite. Nous avons choisi des patientes atteintes d’un cancer de l’ovaire dans le groupe cancer et des patientes non cancéreuses dans le groupe témoin. Le séquençage du gène de l’ARNr 16S a été utilisé pour différencier les bactéries dans les tissus ovariens des groupes cancéreux et témoins. De plus, nous avons prédit la composition fonctionnelle des bactéries identifiées en utilisant BugBase et PICRUSt. Cette méthode peut également être utilisée dans d’autres viscères et tissus, car il a été prouvé que de nombreux organes hébergent des bactéries ces dernières années. La présence de bactéries dans les viscères et les tissus peut aider les scientifiques à évaluer les tissus cancéreux et normaux et peut aider au traitement du cancer.
Introduction
Récemment, un nombre croissant d’articles ont été publiés qui prouvent l’existence de bactéries dans les viscères abdominaux solides, tels que le rein, la rate, le foie et l’ovaire1,2. Geller et al. ont trouvé des bactéries dans les tumeurs pancréatiques, et ces bactéries étaient résistantes à la gemcitabine, un médicament chimiothérapeutique2. S. Manfredo Vieira et al. ont conclu qu’Enterococcus gallinarum était portable aux ganglions lymphatiques, au foie et à la rate, et qu’il pouvait conduire à l’auto-immunité3.
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Protocole
Cette étude a été approuvée par le Comité d’éthique médicale institutionnelle du premier hôpital affilié de l’Université Xi’an Jiaotong (No. XJTUIAF2018LSK-139). Le consentement éclairé a été obtenu de tous les patients inscrits.
1. Critères d’entrée dans le groupe cancéreux et le groupe témoin
- Pour le groupe du cancer, recrutez des patientes qui reçoivent principalement un diagnostic de cancer de l’ovaire, et après la laparotomie, il est prouvé qu’elles ont un cancer de l’ovaire séreux par des résultats pathologiques.
- Pour le groupe témoin, recruter des patientes qui reçoivent principalement un diagnost....
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Résultats
Patient
Au total, 16 patients qualifiés ont été inclus dans l’étude. Le groupe témoin comprenait 10 femmes ayant reçu un diagnostic de tumeur utérine bénigne (parmi elles, 3 patientes ont reçu un diagnostic de myome utérin et 7 patientes ont reçu un diagnostic d’adénomyose utérine). Pendant ce temps, le groupe de cancer comprenait 6 femmes ayant reçu un diagnostic de cancer de l’ovaire séreux (parmi elles, 2 patientes ont reçu un diagnostic de stade II et 2 d’entre elles ont reçu un diagnostic de stad.......
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Discussion
Le cancer de l’ovaire a une influence notable sur la fertilité des femmes25. La plupart des patientes atteintes d’un cancer de l’ovaire sont diagnostiquées à un stade avancé et le taux de survie à 5 ans est inférieur à 30%18. La confirmation de la bactérie dans les viscères solides abdominaux, y compris le foie, le pancréas et la rate, a été publiée. L’existence de bactéries dans l’appareil reproducteur féminin supérieur se produit parce que le col de l’utérus n’est pas fer.......
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Déclarations de divulgation
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Remerciements
Ce travail a été soutenu par le prix de recherche clinique du premier hôpital affilié de l’Université Xi’an Jiaotong, en Chine (XJTU1AF-2018-017, XJTU1AF-CRF-2019-002), le grand projet de recherche fondamentale en sciences naturelles du département provincial des sciences et de la technologie du Shaanxi (2018JM7073, 2017ZDJC-11), le projet de recherche et de développement clé du département provincial des sciences et de la technologie du Shaanxi (2017ZDXM-SF-068, 2019QYPY-138), le projet provincial d’innovation technologique collaborative du Shaanxi (2 017XT-026, 2018XT-002) et le projet de recherche médicale du Plan d’orientation pour le développement social de Xi’an....
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Matériaux
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| 2200 TapeStation Software | Agilgent États-Unis | ||
| AmpliSeq pour la préparation de la bibliothèque Illumina, les index et les accessoires | Illumina | ||
| Image-pro plus 7 | Media Cybernetics | ||
| Leica ASP 300S | Leica Biosystems Division de Leica Microsystems | ||
| Leica EG 1150 | Leica Biosystems Division de Leica Microsystems | ||
| Leica RM2235 | Leica Biosystems Division de Leica Microsystems | ||
| LPS Core Anticorps monoclonal, clone WN1 222-5 | Hycult Biotech | ||
| Mag-Bind RxnPure Plus billes magnétiques | Omega Biotek | M1386-00 | |
| Mag-Bind Universal Pathogen 96 Kit | Omega Biotek | M4029-01 | |
| MiSeq | Illumina | SY-410-1003 | |
| Base de données Silva | Institut Max Planck de microbiologie marine et Université | ||
| , le système d’ADNdb QuantiFluor | Promega | E2670 | |
| Trimmomatic | Bjö ; rn Usadel | ||
| ZytoChem Plus (HRP) Kit Anti-Lapin (DAB) | Systèmes Zytomed | HRP008DAB-RB |
Références
- Manfredo Vieira, S., et al. Translocation of a gut pathobiont drives autoimmunity in mice and humans. Science. 359 (6380), 1156-1161 (2018).
- Geller, L. T., et al. Potential role of intratumor bacteria in mediating tumor resistanc....
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Réimpressions et autorisations
