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Notre protocole fournit une méthode rapide, reproductible et fiable pour générer des monocouches IEC 2D primaires directes. L’une des principales différences dans notre protocole par rapport aux protocoles précédemment publiés pour générer des monocouches épithéliales du côlon est que nous ne coupons pas le côlon en petits morceaux pour libérer les cryptes. Au lieu de cela, nous avons adapté un protocole pour séparer l’épithélium intestinal du mésenchyme13 par une combinaison de forces chimiques et mécaniques pour libérer des cryptes dans une préparation extrêmement propre , (Figure 2), fournissant au chercheur un matériau idéal pour générer des cultures primaires. Notre méthode d’isolation peut également être utilisée pour générer des entéroïdes et des coloïdes 3D. Il est important de faire un comptage de cryptes chaque fois qu’une expérience est effectuée pour normaliser le nombre de cryptes qui sont plaquées. Des variables telles que la turgescence de la saucisse du côlon, la vitesse d’isolement, l’expertise de l’utilisateur peuvent affecter le nombre de cryptes isolées. La concentration de crypte de placage suggérée mentionnée dans le protocole est un point de départ, mais chaque utilisateur pour tenir compte des variables pilotées par l’utilisateur doit l’optimiser. Nous avons utilisé cette technique avec des souris WT mâles et femelles allant de 8 à 20 semaines et nous n’avons pas vu de différences majeures dans la survie cellulaire, en théorie les cryptes isolées de souris plus jeunes ont de meilleures chances de survivre. Les cryptes sont plaquées en excès car seul un petit pourcentage d’entre elles se fixent à la surface et survivent. Un équilibre où il y a assez de cryptes pour avoir une confluence de 50% un jour après le placage mais pas trop de cryptes où les cryptes mourantes auront un effet cytotoxique est l’objectif. Les supports LWRN doivent être soigneusement enlevés 24 heures après le placage pour éliminer les cryptes et les débris morts, cela doit être fait avec soin pour éviter de détacher les cellules qui poussent déjà comme une monocouche.
Après le retrait initial du support LWRN, l’utilisateur doit décider si les conditions expérimentales nécessitent des monocouches IEC primaires qui restent plus proches des cellules souches et ajoutent des milieux LWRN frais ou si la différenciation de la monocouche est souhaitée, remplacez-le par un support de différenciation. Le seul facteur le plus important dans ce protocole est d’assurer l’intégrité des deux points pendant le processus d’isolement. En cas de rupture, la saucisse peut être raccourcie pour éliminer la zone endommagée. Avant de mettre la saucisse dans de l’EDTA, assurez-vous que les nœuds sont aussi serrés que possible. Si la saucisse est dégonflée après l’incubation de l’EDTA, le protocole peut être poursuivi avec peu ou pas d’effet sur le rendement global de la crypte. Si la seringue à répétition n’est pas disponible, une pointe de micropipette régulière fixée à une seringue ordinaire peut également être utilisée pour le processus de gonflage et de déflation. De plus, si aucune solution de récupération cellulaire n’est disponible, les étapes d’inflation et de déflation peuvent être effectuées dans l’EDTA (intestin grêle 2mM, côlon 50 mM), mais cette substitution n’est pas recommandée. Si la confluence n’est pas nécessaire, les cryptes peuvent se développer dans des plaques recouvertes uniquement de collagène et même dans des plaques non enduits. N’utilisez que des plaques non revêtues, il n’y a pas d’autre option, mais les cellules ne se développeront pas en bonne santé comme elles le feraient dans les plaques recouvertes de collagène. En ce qui concerne la santé et la stabilité de la culture, les monocouches plaquées en plastique sont saines pendant 4 à 5 jours tandis que les monocouches plaquées dans des puits de transbordement peuvent être transportées jusqu’à 8 jours.
L’une des principales limitations de cette méthode est le support cellulaire requis pour cultiver les monocouches épithéliales du côlon. Les cellules LWRN sont disponibles chez ATCC, mais la génération de médias conditionnés par LWRN nécessite beaucoup de travail et nécessite l’accès à un spectromètre fluorescent pour déterminer l’activité Wnt. Les milieux de différenciation nécessitent un certain nombre de réactifs qui sont ajoutés frais avant utilisation, ce qui en fait un processus fastidieux. Enfin, la plupart de ces réactifs sont coûteux et faciles à brûler à un rythme rapide. Si un laboratoire souhaite établir cette technique sans culture cellulaire primaire intestinale préalable, il est fortement recommandé de trouver un collaborateur /collège avec de l’expérience et de former l’un de leurs membres.
L’entretien de la culture 3D pourrait être coûteux en raison du coût de la matrice membranaire du sous-sol moyenne et des volumes élevés de milieux conditionnés nécessaires pour les cultures organoïdes, mais il a l’avantage d’utiliser un nombre réduit de souris et les structures générées peuvent être transmises plusieurs fois. Les entéroïdes (dérivés de l’intestin grêle) sont relativement faciles à isoler et à maintenir tandis que les coloïdes sont plus délicats, se développent à un rythme plus lent et ont une capacité de passage plus limitée. La génération de monocouche à partir de coloïdes 3D nécessite une quantité disproportionnée de structures 3D, ce qui rend ce genre d’expériences long et coûteux. Au contraire, la préparation monocouche directe du côlon épithélial est rapide et est un moyen rapide d’obtenir les résultats. Une préparation du côlon peut générer une zone confluente de 75cm2 (10 à 15 mL de milieux conditionnés, remplace une fois) 2 à 3 jours après le placage (cette zone nécessiterait 144 puits de coloïdes 3D, ce qui signifie près de 6 ml de Matrigel et plus de 250 mL de milieux conditionnés). La consommation plus faible de milieux, l’entretien à faible coût de la culture cellulaire et la capacité d’effectuer des tests fonctionnels et un traitement rapide en aval sont de grands avantages des monocouches épithéliales du côlon.
Ce protocole est un outil précieux dans l’étude de la biologie intestinale de cellules épithéliales dans des domaines tels que la cellule-adhérence, la polarité, et la différentiation. Il donne l’avantage de générer des cultures cellulaires primaires à partir de souris génétiquement modifiées (knock-out, surexprimant, reporters). Les monocouches épithéliales intestinales primaires permettent un accès facile aux surfaces apicales et basolatérales (lorsqu’elles sont plaquées sur des puits trans), ce qui permet l’étude de la perméabilité, de la barrière et de la migration transépithéliale de différents types de cellules. Enfin, ce modèle peut être utile dans différents domaines tels que les interactions hôte-pathogène, les dommages épithéliaux et la réparation et la découverte de médicaments.