Article de méthode

Extraction, purification et profilage des gangliosides

DOI :

10.3791/62385

12 mars 2021

* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

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Les gangliosides sont des glycosphingolipides porteurs d’acide sialique qui sont particulièrement abondants dans le cerveau. Leur nature amphipathique nécessite des techniques d’extraction et de purification organiques/aqueuses pour assurer une récupération optimale et des analyses précises. Cet article fournit des aperçus de l’extraction, de la purification et de l’analyse par chromatographie sur couche mince à l’échelle analytique et préparative.

Résumé

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Les gangliosides sont des glycosphingolipides qui contiennent un ou plusieurs résidus d’acide sialique. Ils se trouvent sur toutes les cellules et tissus des vertébrés, mais sont particulièrement abondants dans le cerveau. Exprimés principalement sur la feuillet externe des membranes plasmiques des cellules, ils modulent les activités des protéines de surface cellulaire par association latérale, agissent comme récepteurs dans les interactions cellule-cellule et sont des cibles pour les agents pathogènes et les toxines. La dérégulation génétique de la biosynthèse des gangliosides chez l’homme entraîne de graves troubles congénitaux du système nerveux. En raison de leur nature amphipathique, l’extraction, la purification et l’analyse des gangliosides nécessitent des techniques qui ont été optimisées par de nombreux chercheurs au cours des 80 années qui ont suivi leur découverte. Nous décrivons ici des méthodes au niveau du banc pour l’extraction, la purification et les analyses qualitatives et quantitatives préliminaires des principaux gangliosides de tissus et de cellules qui peuvent être complétées en quelques heures. Nous décrivons également des méthodes d’isolement et de purification à plus grande échelle des principales espèces de gangliosides du cerveau. Ensemble, ces méthodes fournissent un accès à l’échelle analytique et préparative à cette classe de molécules bioactives.

Introduction

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Les gangliosides sont définis comme des glycosphingolipides portant un ou plusieurs résidus d’acide sialique1. Ils sont exprimés principalement à la surface de la cellule avec leur fraction lipidique céramide hydrophobe intégrée dans la feuillet externe de la membrane plasmique et leurs glycanes hydrophiles s’étendant dans l’espace extracellulaire2. Bien que largement distribués dans les cellules et les tissus des vertébrés, ils sont particulièrement abondants dans le cerveau des vertébrés3, où ils ont été découverts et nommés pour la première fois4.

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Protocole

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Le prélèvement de tissus a été effectué dans les conditions autorisées par le Comité de soins et d’utilisation des animaux de Johns Hopkins.

1. Extraction de gangliosides à petite échelle et purification partielle

ATTENTION : Utilisez une ventilation appropriée lorsque vous travaillez avec des solvants volatils et toxiques. Évitez le plastique partout; les solvants extraient les composants chimiques de nombreux plastiques qui interfèrent avec les analyses ultérieures. Le polytétrafluoroéthylène (PTFE) est une exception; Des fermetures revêtues de PTFE doivent être utilisées pour boucher les flacons de stockage en v....

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Résultats

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Les méthodes décrites à la rubrique 1 (petite échelle) fournissent des gangliosides en quantité et en pureté suffisantes pour la détermination qualitative et quantitative des principaux gangliosides cérébraux. La récupération du cerveau de la souris est d’environ 1 μmol de ganglioside par g de poids humide du cerveau (1 nmol / μL) lorsqu’il est préparé comme décrit. La résolution TLC de 1 μL (1 nmol) à l’aide de la section 3 fournit suffisamment de matériel pour la détection du résorcinol et résout tous les principaux ga.......

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Discussion

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Les méthodes d’extraction et d’isolement des gangliosides à petite et à grande échelle décrites ici ne sont pas uniques - il existe de nombreuses approches différentes d’extraction et de purification par solvant qui donnent d’excellents résultats12. Les méthodes rapportées ici pour la purification à petite échelle du cerveau, de Fredman et Svennerholm13, ont été montrées pour optimiser la récupération et se sont avérées robustes et simples pendant de nombreuses années dans .......

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Déclarations de divulgation

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Les auteurs ne revendiquent aucun intérêt concurrent.

Remerciements

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Ce travail a été soutenu par la subvention U01CA241953 du Fonds commun des National Institutes of Health (NIH) pour la glycoscience. MJP a été soutenu par le programme d’interface chimie-biologie de Johns Hopkins (T32GM080189).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Cerveau de bovin, dépouilléPelFreez57105-1
Étalons de gangliosideMatreyaGM1, 1061 ; GD1a, 1062 ; GD1b, 1501 ; GT1b, 1063
Flacon en verre avec bouchon doublé de PTFEFisher Scientific02-911-739
Flacon centrifuge en verreFisher Scientific05-586B
Tubes de culture en verre, 16 x 125 mmVWR60825-430pour la collecte des fractions HPLC
Entonnoir séparateur en verre (2 L)Pyrex6400-2L
Seringue d’injection - Hamilton 1750 étanche au gaz 500 & micro ; lHamilton81265
p-Anisaldéhyde, 98 %Sigma-Aldrich  ; A88107
Homogénéisateur Potter-ElvhjemFisher Scientific08-414-14AChoisissez l’option de volume appropriée
Reprosil 100 NH2 10µ ; m 5x4mmColonnes de garde Analytics-ShopAAVRS1N-100540-5
Reprospher 100 NH2, 5 &mu ; m, 250 mm x 20 mm Colonne HPLCAnalytics-Shopemballé sur mesureautres tailles disponibles
ResorcinolSigma-Aldrich30752-1
Évaporateur rotatifBuchiR-300
Boucle d’échantillonnage pour modèle 7725 Injecteur (5 ml)Sigma-Aldrich57632
Sep-Pak tC18 Cartidges Vac 35 cc (10 g)WatersWAT043350
Sep-Pak tC18 Plus Cartouche courte, 400 mgWatersWAT036810
Seringue Spotting - Hamilton 701N 10 µ ; lHamilton80300
Tubes à essai à paroi épaisse de 13 mm de diamètre avec bouchons doublés de PFTE FisherScientific14-933A
Flacons filetés de 2 ml avec bouchons doublés de PFTEFisher Scientific14-955-323Pour le stockage des gangliosides
Plaques TLC, HPTLC Gel de silice 60 F254 MultiformatFisher ScientificM1056350001L’imprégnation par fluorescence (F254) stabilise le sorbant pulvérisateur
réactifs TLCFisher Scientific05-723-26A
Chambre de coulée TLC pour plaques de 10 x 10 cmCamag22.5155
Waring 1 litre en acier inoxydable résistant aux explosions BlenderWaringE8520
de de surface

Références

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  1. Schnaar, R. L. The Biology of Gangliosides. Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry. 76, 113-148 (2019).
  2. DeMarco, M. L., Woods, R. J. Atomic-resolution conformational analysis of....

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Mots-clés

Ganglioside PurificationGanglioside ProfilingThin Layer ChromatographySolid Phase ExtractionBrain GangliosidesLipid StainingSaponification MethodHPLC ResolutionMass Spectrometric Analysis

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