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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
La β-oxydation des acides gras est une voie métabolique essentielle responsable de la génération d’énergie dans de nombreux types de cellules, y compris les hépatocytes. Ici, nous décrivons une méthode pour mesurer l’oxydation β des acides gras dans des hépatocytes primaires fraîchement isolés en utilisant de l’acide palmitique marqué 14C.
La β-oxydation des acides gras est une voie métabolique clé pour répondre aux besoins énergétiques du foie et fournir des substrats et des cofacteurs pour des processus supplémentaires, tels que la cétogenèse et la gluconéogenèse, qui sont essentiels pour maintenir l’homéostasie du glucose dans tout le corps et soutenir la fonction extra-hépatique des organes à jeun. La β-oxydation des acides gras se produit dans les mitochondries et les peroxysomes et est régulée par de multiples mécanismes, y compris l’absorption et l’activation des acides gras, les niveaux d’expression enzymatique et la disponibilité de cofacteurs tels que la coenzyme A et le NAD +. Dans les essais qui mesurent la β-oxydation des acides gras dans les homogénats hépatiques, la lyse cellulaire et l’ajout commun de niveaux supraphysiologiques de cofacteurs masquent les effets de ces mécanismes de régulation. De plus, l’intégrité des organites dans les homogénats est difficile à contrôler et peut varier considérablement d’une préparation à l’autre. La mesure de la β-oxydation des acides gras dans des hépatocytes primaires intacts surmonte les pièges ci-dessus. Ce protocole décrit une méthode de mesure de la β-oxydation des acides gras dans une suspension d’hépatocytes primaires de souris fraîchement isolés incubés avec de l’acide palmitique marqué 14C. En évitant les heures à les jours de culture, cette méthode a l’avantage de mieux préserver les niveaux d’expression des protéines et l’activité de la voie métabolique du foie d’origine, y compris l’activation de l’β-oxydation des acides gras observée dans les hépatocytes isolés de souris à jeun par rapport aux souris nourries.
La β-oxydation des acides gras est un processus essentiel dans le métabolisme des lipides, fournissant une voie catabolique pour équilibrer la synthèse des acides gras et l’apport de l’alimentation. Ce processus génère de l’énergie pour plusieurs organes, y compris le muscle cardiaque, le cortex rénal et le foie à jeun, et utilise les acides gras obtenus à partir de l’alimentation, la lipolyse du tissu adipeux et les réserves internes de triglycérides 1,2.
L’oxydation des acides gras par la voie β-oxydation entraîne le raccourcissement séquentiel de la chaîne acylique grasse par deux carbones à la fois, libérés sous forme d’acétyl-CoA, et ce processus se produit à la fois dans les mitochondries et les peroxysomes. Alors que la plupart des acides gras ne subissent qu’une β-oxydation, certains sont oxydés à différents carbones avant d’entrer dans cette voie. Par exemple, les acides gras substitués au 3-méthyle, tels que l’acide phytanique, subissent l’élimination d’un carbone par α-oxydation dans les peroxysomes avant d’entrer dans la voie de β-oxydation. De même, certains acides gras sont d’abord convertis en acides gras dicarboxyliques par oxydation du groupe méthyle terminal (ω-oxydation) dans le réticulum endoplasmique avant d’être préférentiellement oxydés dans les peroxysomes par β-oxydation3.
Quel que soit l’organite spécifique, un acide gras doit d’abord être converti en un thioester de coenzyme A (CoA), ou acyl-CoA, pour être oxydé par la voie de β-oxydation. β-oxydation des acyl-CoA à longue chaîne dans la matrice mitochondriale nécessite la navette carnitine pour leur translocation, où la carnitine palmitoyltransférase 1 (CPT1) catalyse la conversion des acyl-CoAs en acylcarnitines et est l’enzyme limitant le taux dans ce processus4. Une fois transloqués dans la matrice mitochondriale, les acyl-CoAs sont reformés et servent de substrats à la machinerie mitochondriale β-oxydation. À jeun, l’acétyl-CoA produit par β-oxydation dans les mitochondries hépatiques est principalement canalisé vers la cétogenèse. Les peroxysomes servent de site principal pour la β-oxydation des acides gras à très longue chaîne, à chaîne ramifiée et dicarboxyliques. Les peroxysomes n’ont pas besoin de la navette carnitine pour importer des substrats d’acides gras, mais importent plutôt les acyl-CoA correspondants par l’activité des transporteurs de cassettes de liaison à l’ATP (ABC) ABCD1-35. Dans les peroxysomes, les acyl-CoAs sont ensuite oxydés par un ensemble dédié d’enzymes, distinctes de la machinerie mitochondriale d’β-oxydation des acides gras. Les mitochondries et les peroxysomes nécessitent également un apport de NAD+ et de CoA libre pour oxyder les chaînes acyles grasses. Il a été démontré que les niveaux de CoA dans le foie augmentent en réponse au jeûne, ce qui favorise l’augmentation du taux d’oxydation des acides gras qui se produit dans cet état6. De plus, l’augmentation de la dégradation du CoA dans les peroxysomes entraîne une diminution sélective de l’oxydation des acides gras peroxysomaux7. Par conséquent, le processus d’oxydation des acides gras dans la cellule est régulé par les niveaux d’expression et les activités des enzymes impliquées dans l’activation, le transport et l’oxydation des acides gras, ainsi que par les concentrations de cofacteurs et d’autres métabolites dans plusieurs compartiments subcellulaires.
Les procédures utilisant des homogénats tissulaires pour mesurer l’oxydation des acides gras détruisent l’architecture cellulaire régulant et soutenant ce processus, conduisant à une collecte de données qui ne reflètent pas avec précision le métabolisme in vivo. Alors que les techniques utilisant des hépatocytes primaires plaqués préservent ce système, la culture de cellules isolées pendant de longues périodes entraîne une perte du profil d’expression génique in vivo qui était présent dans les cellules lorsqu’elles vivaient encore chez l’animal 8,9. Le protocole suivant décrit une méthode pour isoler les hépatocytes primaires et tester leur capacité à β-oxydation des acides gras immédiatement après l’isolement et en suspension, en utilisant l’acide [1-14C]palmitique. Le dosage est basé sur la mesure de la radioactivité associée aux métabolites solubles dans l’acide (ASM) ou à des produits, comme l’acétyl-CoA, produits par la β-oxydation de l’acide [1-14C]palmitique10,11.
Toutes les procédures expérimentales sur des souris (C57BL/6J, mâles, âgés de 9 à 11 semaines) ont été approuvées par les comités institutionnels de soins et d’utilisation des animaux (IACUC) de l’Université de Virginie-Occidentale.
1. Isolement des hépatocytes

Figure 1 : Appareil de perfusion et foie perfusé. (A) Pompe péristaltique avec ligne de sortie reliée à l’aiguille utilisée pour canuler et perfuser le foie. (B) Une canulation réussie est indiquée par un blanchiment immédiat et homogène du foie. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
2. Dosage de β-oxydation des acides gras
REMARQUE: Le test est effectué en trois exemplaires et chaque mélange réactionnel contient 750 000 cellules, 1,35 mg / mL d’albumine sérique bovine (BSA), 100 μM d’acide palmitique et 0,4 μCi [1-14C]palmitique dans un volume final de 2 mL.
ATTENTION : Les composés radioactifs sont dangereux. Acheter, manipuler, stocker et éliminer les matières radioactives conformément aux réglementations institutionnelles, étatiques et fédérales.
| Tampons/composants multimédias | Quantité | Concentration finale | Instructions |
| Solution C | |||
| Kcl | 1,79 g | 480 mM | Ajouter de l’eau à 50 mL. Conserver à 4 °C |
| MgSO4 heptahydraté | 1,48 g | 120 mM | |
| KH2PO4 | 0,81 g | 119 mM | |
| Tampon Krebs-Henseleit (KHB), sans calcium | |||
| NaCl | 7,0 g | 120 mM | Ajouter de l’eau à 900 mL, ajuster le pH à 7,4 et porter le volume final à 1 L. Conserver à 4 °C |
| NaHCO3 | 2,0 g | 24 mM | |
| 1 M HEPES pH 7,45 | 5 mL | 5 mM | |
| Glucose | 1 ou 2 g | 5,6 ou 11 mM | |
| Solution C | 10 mL | ||
| Tampon 1 | |||
| KHB | 500 mL | Mélanger les composants et filtrer stériliser. Conserver à 4 °C | |
| 50 mM EGTA | 1,0 mL | 0,1 mM | |
| Tampon 2 | |||
| KHB | 500 mL | Mélanger les composants et filtrer stériliser. Conserver à 4 °C | |
| 1 M CaCl2 dihydraté | 686 μL | 1,4 mM | |
| Solution de gentamicine | |||
| Sulfate de gentamicine | 0,5 g | 50 mg/mL | Ajouter l’eau à 10 mL et filtrer stériliser. Aliquote et conserver à -20 °C |
| Solution de collagénase | |||
| Mélange de collagénase I et II | 10 mg | 7 mg/mL | Dissoudre tout le contenu du flacon dans 1,43 mL d’eau. Aliquote et conserver à -20 °C |
| M199 | |||
| M199 | 1 pochette | Ajouter de l’eau à 900 mL et ajuster le pH à 7,2-7,4. Porter le volume final à 1 L et filtrer stériliser. Conserver à 4 °C | |
| NaHCO3 | 2,2 g | 26 mM | |
| 1 M HEPES (grade de culture cellulaire) | 25 mL | 25 mM | |
| Glucose supplémentaire (uniquement pour les souris nourries) | 1 g | 11 mM | |
| Solution BSA | |||
| BSA sans acides gras | 400 mg | 20 % (p/v) | Dissoudre dans 2 mL d’eau. Aliquote et conserver à -20 °C |
| Solution d’acide palmitique non radioactif | |||
| Acide palmitique | 103 mg | 200 mM | Dissoudre dans 2 mL d’éthanol, conserver à -20 °C |
| 1 M Acide perchlorique | |||
| 70% d’acide perchlorique | 3,5 mL | 2 . | Diluer à 40 mL avec de l’eau. Conserver à température ambiante |
Tableau 1 : Tampons, milieux et autres solutions nécessaires à l’isolement des hépatocytes et au dosage de la β-oxydation des acides gras
| Numéro de réaction | Inhibiteurs de ± M199 | Suspension hépatocytaire (μL) | Mélange de substrat (μL) | ||||
| Volume (μL) | Etomoxir | ||||||
| 1 | 750 | - | Préchauffer à 37 °C | 750 | Pré-incuber à 37 °C pendant 15 min | 500 | Incuber à 37 °C pendant 15 min |
| 2 | |||||||
| 3 | |||||||
| 4 | + | ||||||
| 5 | |||||||
| 6 | |||||||
| 7 | + | Arrêt immédiat | |||||
| 8 | |||||||
| 9 | |||||||
Tableau 2 : Exemple de configuration expérimentale pour une suspension hépatocytaire dosée en triple exemplaire en présence et en l’absence d’étomoxir.
La perfusion hépatique décrite ici donne généralement 30 à 40 millions de cellules/foie avec une viabilité moyenne de 80 %, telle qu’estimée par l’exclusion du bleu de trypan (Figure 2). La concentration typique de glucose dans le tampon Krebs-Henseleit (KHB), qui est utilisé pour préparer les tampons de perfusion 1 et 2, est de 11 mM. Lors de la mesure de la β-oxydation des acides gras dans des hépatocytes isolés de souris à jeun, la concentration de glucose dans le KHB peut être abaissée pour mieux représenter l’état à jeun. Comme le montre la figure 2, l’abaissement de la concentration de glucose à 5,6 mM n’a aucun effet négatif sur le rendement ou la viabilité des hépatocytes.
Le tableau 2 montre une configuration expérimentale typique pour une suspension d’hépatocytes dosée en triple exemplaire en présence et en l’absence d’étomoxir, un puissant inhibiteur de la CPT1 et donc de l’oxydation mitochondriale des acides gras10,13. En présence de cet inhibiteur ou d’autres inhibiteurs de l’oxydation des acides gras mitochondriaux, tout produit résiduel marqué 14C généré par l’oxydation de l’acide palmitique [1-14C] peut être attribué au premier cycle de β-oxydation dans les peroxysomes. Ainsi, la contribution de l’oxydation des acides gras mitochondriaux à l’oxydation totale des acides gras β peut être calculée comme la différence entre l’oxydation totale (-étomoxir) et peroxysomale (+ étomoxir) 7,14,15 (Figure 3).
Pour les hépatocytes, plus de 95% de la radioactivité associée aux produits de la β-oxydation de l’acide [1-14C]palmitique se trouve dans l’ASM, et le reste est libéré sous forme de 14C-CO210. Les comptes par minute (CPM) associés à la radioactivité de fond varient avec le lot d’acide [1-14C]palmitique. Cependant, ils sont encore significativement inférieurs au CPM obtenu dans les échantillons autorisés à incuber avec le mélange de substrat pendant 15 min (Figure 3A). Comme prévu, les hépatocytes isolés de souris à jeun montrent une forte augmentation des taux de β-oxydation des acides gras mitochondriaux et peroxysomaux, ce qui correspond à l’activation connue de ces voies 16,17,18,19.

Figure 2 : Viabilité et rendement des hépatocytes isolés à l’aide de la procédure décrite ici. Les hépatocytes ont été isolés chez des souris mâles nourries ad libitum ou à jeun pendant la nuit pendant 16 à 18 heures, avec un accès libre à l’eau. (A) Viabilité des hépatocytes et (B) rendement par foie. Les données sont rapportées comme la moyenne (barres) des mesures sur des préparations individuelles d’hépatocytes (cercles) ± SEM. Les hépatocytes isolés de souris nourries et à jeun ont été comparés à l’aide d’un test t de Student à deux queues non apparié. * p < 0,05. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Capacité d’oxydation β des acides gras dans les hépatocytes isolés de souris mâles nourries et à jeun et dosés en suspension. Les hépatocytes fraîchement isolés ont été pré-incubés avec de l’étomoxir (45 μM, +Eto) ou du DMSO (véhicule, -Eto) avant l’ajout du mélange de substrat. (A) CPM total introduit dans chaque essai et récupéré dans la fraction ASM des réactions mises en place pour estimer la radioactivité de fond, la radioactivité totale (-Eto), le peroxysomique (+Eto) et l’β-oxydation des acides gras mitochondriaux. Ces données sont présentées avant toute correction (pour le fond, le nombre de cellules ou les niveaux de protéines) ou tout autre calcul. (B) Données en (A) corrigées pour le fond, le volume total du test, normalisé à 1 million de cellules viables et exprimé comme la vitesse à laquelle l’acide palmitique est oxydé dans les hépatocytes isolés de souris nourries et à jeun. (C) Protéines totales correspondant aux quelque 750 000 hépatocytes/dosage utilisés. (D) Données en (A) corrigées comme en (B) mais normalisées en mg de protéines. Les données sont rapportées comme la moyenne (barres) des mesures sur des préparations individuelles d’hépatocytes (cercles) ± SEM. Les hépatocytes isolés de souris nourries et à jeun ont été comparés à l’aide d’un test t de Student à deux queues non apparié. * p < 0,05; ** p < 0,01. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
La β-oxydation des acides gras est une voie métabolique essentielle responsable de la génération d’énergie dans de nombreux types de cellules, y compris les hépatocytes. Ici, nous décrivons une méthode pour mesurer l’oxydation β des acides gras dans des hépatocytes primaires fraîchement isolés en utilisant de l’acide palmitique marqué 14C.
Ce travail a été soutenu par la subvention R35GM119528 des National Institutes of Health à Roberta Leonardi.
| Sel sodique (R)-(+)-étomoxir | Tocris Bioscience | 4539/10 | |
| [1-14C]-Acide palmitique, 50&ndash ; 60 mCi/mmol, 0,5 mCi/mL | Produits chimiques radiomarqués américains | ARC 0172A | |
| 1 M HEPES, stérile | Corning | 25060CI | |
| 10 µ ; L capillaires/pistons jetables pour pipette à déplacement positif | Mettler Toledo | 17008604 | |
| 1000 & micro ; L, 200 et micro ; L, et 10 & micro ; Pipettes et pointes | en L | ||
| Pipettes | sérologiques de 5 mL, 10 mL et 25 mL | ||
| Tubes à centrifuger stériles de 50 mL | CellTreat | 229421 | |
| 70 % d’acide perchlorique | Fisher Scientific | A2296-1LB | |
| BSA, sans acides gras | Fisher Scientific | BP9704100 | |
| CaCl2 dihydraté | MilliporeSigma | 223506 | |
| D-(+)-glucose | MilliporeSigma | G7021 | |
| EGTA | Gold Biotechnology | E-217 | |
| Ethanol | Pharmco | 111000200CSPP | |
| Système de filtration, 0.22 &mu ; m Filtre PES, 500 mL, CellTreat | stérile 229707 | ||
| Sulfate de gentamicine | Gold Biotechnology | G-400-25 | |
| HDPE, 6,5 mL flacons à scintillation | Fisher Scientific | 03-342-3 | |
| Hémocytomètre | |||
| Aiguilles hypodermiques 22 G, 1,5 po | BD Biosciences | 305156 | |
| Isoflurane | VetOne | 502017 | |
| KCl | Fisher Scientific | BP366-1 | |
| KH2PO4 | MilliporeSigma | P5655 | |
| Liberase TM Research Grade | MilliporeSigma | 5401119001 | Mélange défini de collagénase I et II purifiée avec une concentration moyenne de thermolysine |
| M199 | moyenne MilliporeSigma | M5017 | |
| MgSO4 heptahydrate | MilliporeSigma | M1880 | |
| Microcentrifugeuse | Fisher Scientific | accuSpin Micro 17 | |
| Ciseaux de microdissection | Roboz Surgical Instrument Co | RS-5980 | |
| NaCl | Chem-Impex International | 30070 | |
| NaHCO3 | Acros Organics | 424270010 | |
| Acide palmitique | MilliporeSigma | P0500 | |
| Pénicilline/streptomycine (100x) | Gibco | 15140122 | |
| Saline tamponnée au phosphate (PBS) | Cytiva Life Sciences | SH30256.01 | |
| Pipette à déplacement positif MR-10, 10 µ ; L | Mettler Toledo | 17008575 | |
| Centrifugeuse réfrigérée avec inserts pour tubes coniques de 50 mL | Eppendorf | 5810 R | |
| Tubes à essai de culture en polypropylène à fond rond, 14 mL | Fisher Scientific | 14-956-9A | |
| Compteur à scintillation | Perkin Elmer | TriCarb 4810 TR | |
| ScintiVerse BD cocktail | Fisher Scientific | SX18-4 | |
| Bain-marie à secousses, capacité de 30 L | New Brunswick Scientific |   ; Modèle G76 | |
| Crépines à cellules stériles, 100 & micro ; m | Fisher Scientific | 22363549 | |
| Pince à pansement pour le pouce | Roboz Surgical Instrument Co | RS-8120 | |
| Trypan Blue | Corning | 25900CI | |
| Pompe péristaltique à débit variable | Fisher Scientific | 138762 | |
| Bains-marie, 2&ndash ; Capacité de | 2,5 L |