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Research Article
Mabel Taracena1,2, Catherine Hunt1, Pamela Pennington3, Deborah Andrew4,5, Marcelo Jacobs-Lorena5,6, Ellen Dotson1, Michael Wells5,7,8
1Division of Parasitic Diseases and Malaria, Entomology Branch,Centers for Disease Control and Prevention, 2Department of Entomology,Cornell University, 3Centro de Estudios en Biotecnologia,Universidad del Valle de Guatemala, 4Department of Cell Biology,Johns Hopkins School of Medicine, 5Johns Hopkins Malaria Research Institute,Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, 6Department of Molecular Microbiology and Immunology,Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health and Malaria Research Institute, 7Department of Cell Biology,Johns Hopkins School of Medicine, 8Biomedical Sciences Department,Idaho College of Osteopathic Medicine
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
L’administration orale d’ARNd produit par des bactéries, une méthode d’administration de l’interférence ARN (ARNi) couramment utilisée chez Caenorhabditis elegans, a été appliquée avec succès ici aux moustiques adultes. Notre méthode permet des études robustes de génétique inverse et des études de vecteurs bloquant la transmission sans l’utilisation de l’injection.
L’interférence ARN est un outil très utilisé pour l’analyse génétique inverse depuis deux décennies. Chez les moustiques adultes, l’administration d’ARN double brin (ARNds) a été réalisée principalement par injection, ce qui nécessite beaucoup de temps et ne convient pas aux applications sur le terrain. Pour surmonter ces limitations, nous présentons ici une méthode plus efficace pour l’activation robuste de l’ARNi par administration orale d’ARNds à Anopheles gambiae adulte. De longs ARNd ont été produits dans la souche HT115 (DE3) d’Escherichia coli , et une suspension concentrée de bactéries contenant de l’ARNd tuées thermiquement dans du saccharose à 10% a été offerte sur des boules de coton ad-libitum aux moustiques adultes. Les boules de coton ont été remplacées tous les 2 jours pendant toute la durée du traitement. L’utilisation de cette méthode pour cibler le doubleex (un gène impliqué dans la différenciation sexuelle) ou la tête de fourche (qui code pour un facteur de transcription des glandes salivaires) a entraîné une réduction de l’expression du gène cible et / ou du signal d’immunofluorescence des protéines, mesurée par PCR quantitative en temps réel (qRT-PCR) ou microscopie confocale à fluorescence, respectivement. Des défauts dans la morphologie des glandes salivaires ont également été observés. Cette méthode très flexible, conviviale, peu coûteuse et rapide d’administration de l’ARNds pourrait être largement applicable aux gènes cibles importants pour la physiologie des insectes vecteurs et au-delà.
De nombreuses maladies sont transmises par les moustiques, ce qui fait de l’étude de la physiologie et de la génétique des moustiques une entreprise importante. L’utilisation de l’ARNi dans ces organismes a été importante au cours des 20 dernières années et a permis la caractérisation fonctionnelle de nombreux gènes de moustiques 1,2,3,4,5. La technique la plus couramment utilisée pour l’administration d’ARNd a été la microinjection, qui présente l’inconvénient de blesser les moustiques et nécessite beaucoup de temps et d’efforts. Des méthodes d’administration orale d’ARNi ont été testées, mais principalement au stade larvaire des moustiques 6,7,8,9. L’administration orale d’ARNds chez les moustiques adultes n’a pas été pleinement explorée et pourrait être un outil utile pour l’étude de la biologie des vecteurs et de la lutte antivectorielle.
Le paludisme est transmis par les moustiques anophèles lorsqu’un moustique femelle infecté prend un repas de sang d’un hôte non infecté et injecte de la salive contenant des parasites du paludisme10. Pour finalement être transmis dans la salive d’un moustique, le parasite doit surmonter de nombreux obstacles, notamment échapper au système immunitaire des moustiques, traverser la barrière de l’intestin moyen et envahir les glandes salivaires11. L’architecture des glandes salivaires (SG) des moustiques est la clé de l’invasion parasitaire et cette architecture est contrôlée à la fois par des facteurs de transcription clés exprimés par les glandes salivaires ainsi que par des déterminants du dimorphisme sexuel. Plusieurs facteurs de transcription hautement conservés sont nécessaires pour la spécification cellulaire et le maintien homéostatique des glandes salivaires et pour la production et la sécrétion de protéines salivaires qui fonctionnent dans l’alimentation sanguine 12,13,14. La tête de fourche (Fkh) est un facteur de transcription de l’hélice ailée qui fonctionne comme un régulateur majeur de la structure et de la fonction SG de l’insecte (basé sur des études chez les mouches des fruits et la teigne du ver à soie)15,16,17,18,19,20. Dans les SG de drosophiles, Fkh fonctionne avec Sage, un facteur de transcription hélicoïque-boucle-hélice (bHLH) spécifique à SG, pour favoriser la survie sg et la production de salive19. Un co-régulateur important et positif de la production de salive chez la drosophile est CrebA, un facteur de transcription par fermeture éclair de leucine bien étudié qui régule à la hausse l’expression des gènes de la voie sécrétoire 21,22,23. Il existe également un fort degré de différenciation morphologique dans les glandes salivaires féminines qui joue probablement un rôle clé, non seulement dans l’alimentation sanguine, mais aussi dans la capacité des parasites à envahir ce tissu24.
De nombreux gènes impliqués dans la détermination de la survie, de la structure, de la physiologie et du dimorphisme sexuel des glandes salivaires ont des profils d’expression spatio-temporelle complexes 25,26,27, et les méthodes traditionnelles d’administration de l’ARNd pour induire l’ARNi ne sont pas toujours efficaces pour cibler ces types de gènes dans ce tissu ou dans d’autres. Cependant, l’administration orale d’ARNds au stade larvaire Aedes aegypti et de moustiques An. gambiae a été utilisée avec succès pour faire taire la forme spécifique à la femelle du gène dsx 9,28. Des études antérieures utilisant l’ARNds dans les glandes salivaires des moustiques ont révélé que, bien que de grandes quantités d’ARNds aient été nécessaires, l’effet de silencieux était relativement durable (au moins 13 jours)29. Ici, la capacité de la souche HT115 (DE3) d’E. coli tuée par la chaleur exprimant un ARNd spécifique à la séquence pour dsx, fkh ou CrebA à induire le silence de ces gènes par ARNi chez les moustiques femelles adultes a été testée. L’administration orale d’ARNd a induit l’élimination des gènes chez An. gambiae, avec des réductions claires des niveaux d’ARNm et avec des phénotypes compatibles avec la perte de fonction de ces gènes. Ainsi, cette approche fonctionnera probablement pour détruire la fonction d’une variété de gènes des glandes salivaires.
1. Clonage de l’ARNds en vecteur d’expression d’E. coli
2. Préparation de bactéries tuées par la chaleur exprimant l’ARNds
3. Nourrir les moustiques avec des bactéries tuées par la chaleur exprimant l’ARNds
4. Les niveaux d’expression des gènes cibles du test
5. Évaluation phénotypique : alimentation sanguine réussie
6. Évaluation phénotypique : morphologie des glandes salivaires et régulation négative des protéines pertinentes
Pour commencer, les données d’expression des microréseaux de VectorBase ont été utilisées pour analyser des cibles potentielles à travers les stades de développement 36,37 afin de déterminer le statut d’expression de tous les gènes pertinents pour la présente étude (tableau 1). Comme prévu, tous les gènes cibles que nous avons choisis ont montré une expression chez les SG adultes. Les niveaux d’aapp et de sauge étaient particulièrement élevés (tableau 1). Il convient également de noter les niveaux élevés d’expression de f-Agdsx chez les SG9 de sexe féminin adulte.
Des segments spécifiques de chaque gène ont été évalués pour être utilisés comme ARNds à l’aide de l’application Web E-ARNi pour la conception de réactifs ARNi30. Les régions d’environ 400 pb contenant des séquences uniques à chaque gène cible ont ensuite été clonées (Figure 1A), transformées en souches bactériennes appropriées et utilisées pour préparer des suspensions de bactéries tuées par la chaleur, qui ont été induites pour produire de l’ARNd. Les moustiques adultes ont été nourris pendant 8 jours avec les boules de coton imbibées de saccharose contenant les suspensions bactériennes d’ARNds pour f-Agdsx, fkh ou fourmi (le contrôle négatif non lié).
Pour l’analyse de l’alimentation à l’ARNi des moustiques femelles, il a d’abord été déterminé si l’alimentation en aRNds f-Agdsx ou fkh induisait un silençage génique. Une réduction de 98,8 % (±2,1) des niveaux de transcription fkh a été observée dans le groupe nourri avec de l’ARNm fkh (Figure 1B), ce qui indique que l’ARNds a très efficacement réduit l’abondance des transcriptions fkh dans les SG. Étonnamment, les niveaux d’ARNm fkh ont été réduits de 82,0 % (±18,9) chez les moustiques traités avec de l’ARNds pour f-Agdsx, qui présentaient une réduction de 89,86 % (±4,48 ) de f-Agdsx , suggérant que fkh pourrait être une cible de F-Dsx dans la glande salivaire. Parallèlement à la réduction significative des niveaux d’expression de fkh, les moustiques fkh-knockdown ont montré une augmentation significative du nombre de tentatives de sondage nécessaires pour nourrir le sang. Ces moustiques ont présenté, en moyenne, cinq fois plus de tentatives d’alimentation que le groupe témoin ou les moustiques nourris à l’ARNd f-Agdsx pour être complètement engorgés de sang (Figure 1C). Cela a conduit à se demander si les traitements de l’ARNi fkh knockdown ont provoqué des changements dans la localisation et / ou la distribution des principaux régulateurs transcriptionnels (SG TF Sage et CrebA) (Figure 2), des protéines sécrétées (AAPP et mucine) (Figure 3) et de la machinerie sécrétoire [Nile Red (lipides) et Rab11 (vésicules sécrétoires)] (Figure 4). Il est important de noter que des différences substantielles dans l’intensité de la coloration ont été observées entre différentes régions du lobe, lobes et SG individuels.
Comme prévu, les niveaux de coloration à la sauge et à la CrebA ont été nettement réduits dans tous les lobes SG suivant l’ARNi fkh (figure 2B) par rapport à l’ARNi témoin des fourmis (figure 2A). Les réductions des valeurs d’intensité maximale les plus élevées (lignes pointillées rouges et étiquettes numériques) et des valeurs d’intensité maximale les plus basses (lignes pointillées bleues et étiquettes numériques) dans les profils de balayage linéaire ont suggéré des réductions dans les zones de signal élevé et faible dans le tissu (figures 2A, B). Ces données suggèrent que An. gambiae fkh RNAi est efficace et que fkh régule la production et/ou la stabilité des SG TF Sage et CrebA chez An. gambiae, analogue à leur relation génétique dans Drosophila SGs 19,38,39.
Lors de l’examen des protéines composant la salive très abondantes, les niveaux de protéine antiplaquettaire anophèle (AAPP)40,41 ont été réduits dans les trois lobes SG après l’ARNi fkh, par rapport au traitement ARNi témoin (Figure 3A, B; vert). D’autre part, aucun changement dans les niveaux de mucine n’a été observé (Figure 3A, B; violet). Ces données suggèrent que Fkh contribue différemment à l’expression de différents gènes de protéines salivaires.
Enfin, deux marqueurs de sécrétion ont été observés (figures 4A,B) : Rab11 (vésicules associées aux endosomes de recyclage apical)42 et Nile Red (lipides). Une réduction de la fluorescence Rab11 a été observée dans les lobes latéraux distaux (DL) après un traitement par ARNi fkh (Figure 4A v vs 4B v; vert). Cependant, une augmentation du signal Rab11 dans les lobes médial (M) et latéral proximal (PL) (Figure 4A vii, ix vs 4B vii, ix; vert) s’est également produite. Aucune différence perceptible n’a été observée dans le signal rouge du Nil (figures 4A, B; violet) après l’ARNi fkh par rapport au traitement ARNi témoin. Ces données suggèrent que la réduction du fkh peut modifier certaines actions sécrétoires de la machinerie d’une manière complexe qui diffère entre les lobes SG.
| Jeu de données: | Goltsev | Neira Oviedo | Neira Oviedo | Boulanger | Boulanger | Boulanger | Boulanger | ||
| symbole de gène | fonction | AGAP ID | embryon (25 heures) | Larves L3 | L3 SG | femelle adulte corps (3 jours) |
mâle adulte corps (3 jours) |
femelle adulte SG (3 jours) |
mâle adulte SG (3 jours) |
| L’AAPP | protéine de salive | AGAP009974 | 3.92 | 4.38 | 4.33 | 3.81 | 2.46 | 11.92 | 2.69 |
| CrebA | Facteur txn | AGAP001464 | 6.28 | 5.22 | 5.92 | 2.99 | 2.96 | 3.27 | 3.13 |
| " | Facteur txn | AGAP011038 | 4.50 | 4.46 | 5.23 | 2.96 | 2.86 | 3.05 | 2.88 |
| Dsx | Facteur txn | AGAP004050 | 4.91 | 5.39 | 5.55 | 3.72 | 4.00 | 4.57 | 4.01 |
| fkh | Facteur txn | AGAP001671 | 5.18 | 4.67 | 5.25 | 2.99 | 3.09 | 3.21 | 3.05 |
| MUC2 | protéine de salive | AGAP012020 | 4.59 | 5.53 | 5.63 | 2.96 | 3.07 | 3.08 | 3.26 |
| Rab11 | trafic vésiculeux | AGAP004559 | 10.21 | 7.47 | 8.60 | 4.90 | 3.79 | 3.38 | 2.96 |
| sauge | Facteur txn | AGAP013335 | 5.32 | 5.96 | 8.89 | 3.40 | 3.33 | 7.37 | 7.23 |
Tableau 1 : Profils moyens d’expression de microréseaux log2 pour An. gambie gènes d’intérêt. Les noms de gènes, la catégorie fonctionnelle, les identificateurs Vectorbase (AGAP) et les données moyennes d’expression de microréseau log2 recueillies à partir de Vectorbase sont présentées. Ces données indiquent que nos gènes d’intérêt (impliqués dans la biologie et la sécrétion des cellules des glandes salivaires (SG)) sont exprimés et enrichis au stade larvaire 3 (L3) et chez les SG adultes, par rapport aux individus entiers.

Figure 1 : f-Agdsx et fkh knockdown chez An. gambiae adulte réduit les niveaux d’ARNm fkh dans les SG et affecte la capacité féminine à se nourrir dans le sang. (A) Image représentative de la conception du plasmide utilisée pour la production d’ARNds dans cette méthodologie. La deuxième séquence promotrice T7 est ajoutée au plasmide en l’incluant dans l’amorce 3' utilisée pour amplifier l’insert à cloner dans le plasmide pGEMT. Le plasmide est ensuite transformé en bactéries E. coli HT115 (DE3) et une solution d’alimentation est constituée d’une suspension de bactéries tuées par la chaleur induite dans de l’eau sucrée à 10%. (B) Les animaux nourris avec une solution d’alimentation à ARNds pour f-Agdsx ou fkh ont montré des niveaux significativement plus faibles de transcriptions de fkh (ANOVA unidirectionnelle avec comparaisons multiples; n = 15). Cependant, seul le groupe nourri avec de l’ARNd (C) fkh a montré une différence significative dans le nombre de tentatives de morsure nécessaires pour acquérir un repas de sang. Les moustiques de ce groupe avaient besoin, en moyenne, de cinq fois plus de tentatives d’enquête pour obtenir un repas sanguin réussi que ce dont avaient besoin le groupe témoin ou les groupes nourris au dsx-dsRNA (ANOVA unidirectionnelle avec plusieurs comparaisons; n = 15). Les barres d’erreur indiquent l’erreur type de la moyenne (MEB). Chaque expérience a été menée dans trois répliques biologiques distinctes. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : L’abattage du fkh dans les glandes salivaires adultes d’An. gambiae réduit les niveaux de facteur de transcription SG. On voit des images représentatives du jour 13 des AG de la femelle adulte An. gambiae après 8 jours (jours 5-13) d’exposition orale à (A) un contrôle dsRNA non apparenté (fourmi) ou (B) dsRNA ciblant la tête de fourche SG TF (fkh, AGAP001671) dans 10% de saccharose coloré avec les colorants DAPI (ADN; rouge), agglutinine de germe de blé marquée (WGA, chitine / O-GlcNAcylation; bleu), antisérum contre les SG TF Sage (vert) et CrebA (violet). Les longueurs de barres d’échelle indiquées sont des microns. Les SG (i) sont soulignés par des tirets blancs. Les lignes jaunes dans les images de lobes zoomés (des régions entourées de cases jaunes et étiquetées « encart ») indiquent où les balayages linéaires de l’intensité du signal ont été effectués. Les intensités des canaux verts et violets correspondant aux balayages de ligne pour chaque lobe zoomé sont tracées (toujours de gauche à droite dans le SG) dans les graphiques sous les images; Axe X = distance (en pixels) et axe Y = unité grise (intensité en pixels). La plage dynamique de l’intensité des pixels est délimitée par des lignes pointillées rouges (maximum) et bleues (minimum) et les valeurs correspondantes sont affichées sur chaque graphique. MIP = projection 3D d’intensité maximale sur toute la profondeur SG. DL: lobe latéral distal; M : lobe médial ; PL: lobe latéral proximal; SD: canal salivaire. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : L’élimination du fkh dans les glandes salivaires adultes d’An. gambiae réduit les niveaux de protéines sécrétées par SG. Sont montrées des images représentatives du jour 13 des AG de la femelle adulte An. gambiae après 8 jours (jours 5-13) d’exposition orale à (A) un contrôle dsRNA non apparenté (fourmi), ou (B) dsRNA ciblant la tête de fourche SG TF (fkh, AGAP001671) dans 10% de saccharose coloré avec les colorants DAPI (ADN; rouge), agglutinine de germe de blé marquée (WGA, chitine / O-GlcNAcylation; bleu), et les protéines salivaires AAPP (vert) et Mucine (MUC2, violet). Les longueurs de barres d’échelle indiquées sont des microns. Les SG (i) sont soulignés par des tirets blancs. Les lignes jaunes dans les images de lobes zoomés (des régions entourées de boîtes jaunes) indiquent où les balayages linéaires de l’intensité du signal ont été effectués. Les intensités des canaux verts et violets correspondant aux balayages de ligne pour chaque lobe sont tracées (toujours de gauche à droite dans le SG) dans les graphiques sous les images; Axe X = distance (en pixels) et axe Y = unité grise (intensité en pixels). La plage dynamique de l’intensité des pixels est délimitée par des lignes pointillées rouges (maximum) et bleues (minimum) et les valeurs correspondantes sont affichées sur chaque graphique. MIP = projection 3D d’intensité maximale sur toute la profondeur SG. DL: lobe latéral distal; M : lobe médial ; PL: lobe latéral proximal; SD: canal salivaire. Les étiquettes italiques « DL » (Bi) indiquent deux régions visibles du même lobe DL. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : L’abattage du fkh dans les glandes salivaires adultes d’An. gambiae réduit les marqueurs de sécrétion de SG. On voit des images représentatives du jour 13 des SG an. gambiae femelles adultes après 8 jours (jours 5-13) d’exposition orale à (A) un contrôle dsRNA non apparenté (fourmi), ou (B) dsRNA ciblant la tête de fourche SG TF (fkh, AGAP001671) dans 10% de saccharose coloré avec les colorants DAPI (ADN; rouge), agglutinine de germe de blé marqué (WGA, chitine / O-GlcNAcylation; bleu), Rouge du Nil (lipides; violet) et antisérums contre le marqueur de vésicule endosome de recyclage Rab11 (vert). Les longueurs de barres d’échelle indiquées sont des microns. Les SG (i) sont soulignés par des tirets blancs. Les lignes jaunes dans les images de lobes zoomés (des régions entourées de boîtes jaunes) indiquent où les balayages linéaires de l’intensité du signal ont été effectués. Les intensités des canaux verts et violets correspondant aux balayages linéaires pour chaque lobe sont tracées (toujours de gauche à droite dans le SG) dans les graphiques sous les images; Axe X = distance (en pixels) et axe Y = unité grise (intensité en pixels). La plage dynamique de l’intensité des pixels est délimitée par des lignes pointillées rouges (maximum) et bleues (minimum) et les valeurs correspondantes sont affichées sur chaque graphique. MIP = projection 3D d’intensité maximale sur toute la profondeur SG. DL: lobe latéral distal; M : lobe médial ; PL: lobe latéral proximal; SD: canal salivaire. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Dossier supplémentaire 1. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Les auteurs signalent qu’ils n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
L’administration orale d’ARNd produit par des bactéries, une méthode d’administration de l’interférence ARN (ARNi) couramment utilisée chez Caenorhabditis elegans, a été appliquée avec succès ici aux moustiques adultes. Notre méthode permet des études robustes de génétique inverse et des études de vecteurs bloquant la transmission sans l’utilisation de l’injection.
Les auteurs tiennent à remercier le personnel et les scientifiques de la Direction de l’entomologie et de la Division des maladies parasitaires et du paludisme du CDC, ainsi que Brian Trigg et Michelle Chiu pour leur aide à la préparation des bactéries à JHU et / ou des discussions utiles sur ce travail. Nous remercions l’insectaire JHMRI et le directeur Chris Kizito pour l’accès et l’élevage des moustiques An. gambiae . Nous remercions Wei Huang (JHSPH) pour son aide dans l’obtention des plasmides PJet GFP et pPB47 GFP pour une utilisation dans cette étude. Le financement de ce travail a été fourni par: NIH R21AI153588 (à DJA), une bourse postdoctorale du Johns Hopkins Malaria Research Institute (à MW); et par une subvention de la Good Ventures Foundation et de l’Open Philanthropy Project à la CDC Foundation intitulée Support cryopreservation and suppression of female development in mosquitoes to help research for malaria, Open Philanthropy Project, 2017. Nous apprécions profondément l’aide du personnel du JHU Microscope Facility et le soutien de subvention applicable des NIH pour le microscope utilisé (NIH Grant #: S10OD016374). Les résultats et conclusions de ce manuscrit sont ceux des auteurs et ne représentent pas nécessairement les points de vue du CDC. L’utilisation de noms commerciaux est uniquement à des fins d’identification et n’implique pas l’approbation des Centers for Disease Control and Prevention, du Public Health Service ou du département américain de la Santé et des Services sociaux.
| 1 Kb Plus Échelle d’ADN | Thermo Fisher Scientific | 10787018 | |
| 2x Extrait de levure Tryptone (2xYT) Medium | BD Difco | DF0440-17 | |
| AAPP | n/a | n/a | Antisera. Dilution 1:50 (lapin) ; don de Fabrizio Lombardo |
| AccuStart II PCR Supermix | Quantabio | 95137-100 | |
| Agarose | Millipore Sigma | A9539 | |
| Ampicilline | Millipore Sigma | A5354 | |
| Anopheles gambiae G3 | BioDefense and Emerging Infections (BEI) Centre de Ressources sur les réactifs de référence et de recherche sur le paludisme (MR4) | MRA-112 | |
| BugDorm | BioQuip | 1452 | |
| Centrifuge 5810R | Eppendorf | P022628181 | |
| CrebA | DSHB | CrebA Rbt-PC | Antisera. dilution 1:50 (lapin) ; généré par le régime Andrew Lab |
| Damiens | BioServ | ||
| DAPI | Life Technologies | n/a | 4&prime ;,6-diamidino-2-phénylindole ; dilution 1:200. |
| Sang de mouton défibriné | HemoStat | DSB050 | |
| Escherichia coli HT115 (DE3) | |||
| Bromure d’éthidium | Millipore Sigma | E7637 | |
| Kit de transcription inverse d’ADNc haute capacité | Thermo Fisher Scientific | 4368814 | |
| Isopropyl &beta ;-D-1-thiogalactopyranoside Millipore | Sigma | I5502 | |
| JM109 Cellules compétentes | Promega | L2005 | |
| Luria Broth Media | Thermo Fisher Scientific | 10855001 | |
| Mucin 2 | Proteintech | Muc2 ; 27 675-1-AP | Antisérum. Dilution 1:100 (souris). |
| Nanodrop 2000 | Thermo Fisher Scientific | ||
| Nile Red | Sigma | n/a | Colorant lipidique ; dilution 1:50. |
| Owl EasyCast B2 Mini Gel Électrophorèse horizontale | Thermo Fisher | Scientific Model B2 | |
| pGEMT easy | Promega | A3600 | |
| Power SYBR-green PCR master MIX | Applied Biosystems | 4367659 | |
| PureLink PCR kit de purification | Thermo Fisher Scientific | K31001 | |
| QuantaStudio 6 | Applied Biosystems | ||
| QuantStudio6 Système de PCR en temps réel | Applied Biosystems | ||
| Rab11 | n/a | n/a | Antisera. Dilution 1:100 (lapin) ; générée par Andrew Lab |
| Rh-WGA | Vector Labs | n/a | Agglutinine de germe de blé conjuguée à la rhodamine (chitine, colorant O-GlcNAcylation) ; dilution 1:40 |
| Sage | n/a | n/a | Antisera. dilution 1:50 (rat) ; générée par Andrew Lab |
| T4 ADN ligase | Promega | M1801 | |
| Tétracycline | Millipore Sigma | 87128 | |
| Trizol | Thermo Fisher Scientific | 15596018 | |
| Microscope confocal à fluorescence Zeiss LSM700 Zeiss | |||
| ANTIBODIES | |||
| Chicken anti-Rat IgG (H+L), Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A21472 | |
| Chèvre anti-souris IgG (H+L), Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A28181 | |
| IgG (H+L) Chèvre anti-lapin, Alexa Fluor 488 Thermo | Fisher Scientific | A27034 | |
| Lapin anti-chèvre IgG (H+L), Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A27012 | |
| ACT-2f : TACAACTCGATCATGAAGTGCGA | CDC Biotechnology Core Facility | Branch n/a | amorce qRT-PCR |
| ACT-3r : CCCGGGTACATGGTGGTACCGC CGGA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | amorce qRT-PCR |
| FKH_RNAi_F : GCCGACTTATGCTTAGCCCA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR |
| primer FKH_RNAi_R : TAGCCGTCAATTCCTCCTGC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
| newDSX-f : AGAGGGCGGGGGGAAATTCTAGT | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
| newDSX-r : GGGCTTGTGGCAGTACGAATA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
| S7qf1 : AGAACCAGCAGACCACCATC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | amorce qRT-PCR |
| S7qr1 : GCTGCAAACTTCGGCTATTC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | amorce qRT-PCR |