Un abonnement JoVE est requis pour visualiser ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre période d'essai gratuite.

Article de méthode

Études thermochimiques des complexes ternaires Ni(II) et Zn(II) à l’aide de la mobilité ionique et de la spectrométrie de masse

2.1K vues

DOI :

10.3791/63722

8 juin 2022

Dans cet article

Résumé

Cet article décrit un protocole expérimental utilisant la spectrométrie de masse de mobilité des ions électrospray, des calculs quantiques semi-empiriques et la dissociation induite par collision de seuil résolu en énergie pour mesurer la thermochimie relative de la dissociation de complexes métalliques ternaires apparentés.

Résumé

Cet article décrit un protocole expérimental utilisant la spectrométrie de masse de mobilité par électronébulisation ionique (ES-IM-MS) et la dissociation induite par collision à seuil résolu en énergie (TCID) pour mesurer la thermochimie de la dissociation des complexes ternaires [amb+M(II)+NTA]- chargés négativement en deux canaux de produits : [amb+M(II)] + NTA ou [NTA+M(II)]-  + amb, où M = Zn ou Ni et NTA est l’acide nitrilotriacétique. Les complexes contiennent l’un des heptapeptides alternatifs de liaison aux métaux (amb) avec les structures primaires acétyl-His 1-Cys 2-Gly 3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7 ou acétyl-Asp 1-Cys 2-Gly3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7, où les acides aminés Aa 1,2,6,7 Les positions sont les sites potentiels de liaison des métaux. Les états stationnaires optimisés pour la géométrie des complexes ternaires et de leurs produits ont été sélectionnés à partir de calculs de chimie quantique (actuellement le hamiltonien semi-empirique PM6) en comparant leurs énergies électroniques et leurs sections efficaces de collision (CCS) à celles mesurées par ES-IM-MS. À partir des calculs de fréquence PM6, les paramètres moléculaires du complexe ternaire et de ses produits modélisent les intensités dépendantes de l’énergie des deux canaux de produits en utilisant une méthode TCID compétitive pour déterminer les énergies seuils des réactions qui se rapportent aux enthalpies 0 K de dissociation (ΔH0). Les corrections thermiques et d’entropie de la mécanique statistique utilisant les fréquences de rotation et de vibration PM6 fournissent les 298 K enthalpies de dissociation (ΔH298). Ces méthodes décrivent une routine EI-IM-MS qui peut déterminer la thermochimie et les constantes d’équilibre pour une gamme de complexes d’ions métalliques ternaires.

Introduction

Cette étude décrit une nouvelle technique utilisant un spectromètre de masse à mobilité ionique disponible dans le commerce qui permet de déterminer la thermochimie relative pour la dissociation d’un complexe métallique ternaire de liaison métallique alternative (amb) [amb + M (II) + NTA], où M = Zn ou Ni et NTA = acide nitrilotriacétique (Figure 1). Ces réactions modélisent la dissociation de la protéine recombinante marquée par amb attachée au métal immobilisé par le NTA au cours de la chromatographie d’affinité pour les métaux immobilisés (IMAC)1,2. A titre d’exemple, cette mét....

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Protocole

Remarque : La figure 1 montre une vue d’ensemble du protocole.

1. Préparation des réactifs

  1. Achetez des peptides amb lyophilisés (pureté >98%) et conservez-les dans un congélateur à -80 °C.
  2. Achetez > nitrate de zinc(II) de pureté 99 % et nickel(II) nitrate hexahydraté.
    MISE EN GARDE : L’hexahydrate de nitrate de nickel(II) présente un danger pour l’environnement et la santé.
  3. Achetez l’acide nitrilotriacétique, les polymères poly-DL-alanine, l’acétate d’ammonium ultrapur/oligo-métaux, l’hydroxyde d’ammonium, l’acide acétique glacial et l’acétonitrile de qualité C....

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Résultats

La dissociation compétitive induite par collision des complexes ternaires [amb+M(II)+NTA]- de A et H en [amb+M(II)]- + NTA ou [NTA+M(II)]- + amb, est représentée à la figure 3. L’amb est représenté par A ou H et le M = Zn ou Ni. Le complexe ternaire [A+Zn(II)+NTA]- (Figure 3A) présente des seuils apparents d’environ 0,7 eV d’énergie de collision (CE) p.......

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Discussion

Étapes critiques
Analyses ES-IM-MS de dissociation induite par collision (TCID). Le TCID a utilisé la cellule d’onde T de transfert en présence d’argon comme cellule de collision. Avant la dissociation, les ions précurseurs sont thermalisés par des collisions de faible énergie avec l’azote gazeux lorsqu’ils traversent la cellule de mobilité ionique (IM). Il en résulte un TCID résolu en énergie plus reproductible que celui obtenu en utilisant le piège comme cellule de collision

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.

Remerciements

Ce matériel est basé sur des travaux soutenus par la National Science Foundation dans le cadre du 1764436 programme NSF REU (CHE-1659852), du soutien aux instruments de la NSF (MRI-0821247), du projet NSF Scholarship for Success (PASS) de la NSF (1643567), de la Welch Foundation (T-0014) et des ressources informatiques du ministère de l’Énergie (TX-W-20090427-0004-50) et de L3 Communications. Les auteurs remercient Kent M. Ervin (Université du Nevada - Reno) et Peter B. Armentrout (Université de l’Utah) d’avoir partagé le programme CRUNCH et pour les conseils sur l’ajustement de PBA. Les auteurs remercient le groupe de Michael T. Bower à l’Université de Californie à S....

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Acétonitrile de qualité HPLCFisher Scientific (www.Fishersci.com)A998SK-4
Peptides alternatifs de liaison métallique (amb)PepmicCo (www.pepmic.com)ont été synthétisés par ordre Acétate d’ammonium
(ultrapur)VWR97061-014
Hydroxyde d’ammonium (qualité oligo-métallique)Fisher Scientific (www.Fishersci.com)A512-P500
Driftscope 2.1 logicielWaters (www.waters.com)programme d’analyse logicielle
Gaussienne 09Logiciel de modélisation de structure électroniquegaussienne
GaussViewgaussiennepour visualiser les calculs
Acide acétique glacial (grade Optima)Fisher Scientific (www.Fishersci.com)A465-250
Méthode Lennard-Jones (LJ) à l’échelle ioniqueGroupe de SigmaMichael T. Bowers de l’Université de Californie à Santa Barbara
MassLynx 4.1Waters (www.waters.com)programme d’analyse logicielle
Tubes de microcentrifugationVWR87003-2941,7 mL, en polypropylène
Tubes de microcentrifugationVWR87003-2982,0 mL, polypropylène
Ni(II) nitrate hexahydraté (pureté de 99 %)Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)A15540
Poly-DL-alanineSigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)P9003-25MG
Waters Synapt G1 HDMSWaters (www.waters.com)  ; quadripôle - mobilité ionique- spectromètre de masse à temps de vol
Zn(II) nitrate hexahydraté (pureté 99 %+)Alfa Aesar (www.alfa.com)12313
Les peptides conçus par Interface graphique

Références

  1. Kim, Y. -M., Chen, P. Ligand binding energy in [(bipy)Rh(PCH)]+ by collision-induced dissociation threshold measurements. International Journal of Mass Spectrometry. 202 (1-3), 1-3 (2000).
  2. Plattner, D.

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Réimpressions et autorisations

Mots-clés

Complexes m talliques ternairesdissociation induite par collision au seuilanalyse thermochimiquecomplexe d acide nitrilotriac tiquecomplexes de nickelcomplexes de zinccalculs de chimie quantiqueliaison m tal peptidesection efficace de collision