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Article de méthode

Isolement de gouttelettes lipidiques de plastoglobule à partir de tissus foliaires végétaux et de cyanobactéries

3.6K vues

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DOI :

10.3791/64515

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6 octobre 2022

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Dans cet article

Résumé

Un protocole rapide et efficace est présenté pour l’isolement des gouttelettes lipidiques plastoglobules associées à divers organismes photosynthétiques. La préparation réussie de plastoglobules isolés est une première étape cruciale qui précède les investigations moléculaires détaillées telles que les analyses protéomiques et lipidomiques.

Résumé

Les gouttelettes lipidiques de Plastoglobule sont un sous-compartiment dynamique des chloroplastes et des cyanobactéries des plantes. Présents partout parmi les espèces photosynthétiques, on pense qu’ils jouent un rôle central dans l’adaptation et le remodelage de la membrane thylakoïde dans des conditions environnementales en évolution rapide. La capacité d’isoler des plastoglobules de haute pureté a grandement facilité leur étude grâce à des méthodologies protéomiques, lipidomiques et autres. Avec des plastoglobules de grande pureté et de rendement, il est possible d’étudier leur composition lipidique et protéique, leur activité enzymatique et leur topologie protéique, entre autres caractéristiques moléculaires possibles. Cet article présente un protocole rapide et efficace pour l’isolement des plastoglobules à partir de chloroplastes de tissus foliaires végétaux et présente des variations méthodologiques pour l’isolement des plastoglobules et des structures de gouttelettes lipidiques apparentées à partir de feuilles de maïs, du tissu foliaire desséché de la plante de résurrection, Eragrostis nindensis, et de la cyanobactérie, Synechocystis . sp. PCC 6803. L’isolement repose sur la faible densité de ces particules riches en lipides, ce qui facilite leur purification par flottation de densité saccharose. Cette méthodologie s’avérera utile dans l’étude des plastoglobules de diverses espèces.

Introduction

La compréhension actuelle de la composition et de la fonction des plastoglobules a émergé grâce à des études protéomiques et lipidomiques détaillées 1,2,3,4,5. De telles études ont été grandement facilitées par une méthode d’isolement rapide et efficace qui repose sur leur très faible densité pour une séparation efficace à l’aide de gradients de saccharose. Les méthodes initiales d’isolement des plastoglobules ont été réalisées à partir d’espèces telles que le hêtre (Fagus sylvatica), le genêt à ba....

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Protocole

1. Isolement brut de plastoglobules

  1. Extraction brute de plastoglobule à partir de tissus foliaires de maïs non stressés
    1. Acquérir six plants de maïs sains âgés d’environ 3 semaines et presque au stade de croissance V5, pesant environ 120 g.
    2. Coupez toutes les feuilles à la base de la tige, plongez-les rapidement dans un bain de glace et transportez-les dans la chambre froide.
    3. En travaillant sous une lampe de sécurité verte, retirez les feuilles de maïs du bain de glace et coupez-les en morceaux plus petits (environ 5 cm x 5 cm) à l’aide de ciseaux.
    4. Broyer délicatement mais soigneusement la moitié du tiss....

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Résultats

À la fin de l’étape 1 du protocole, on devrait être en mesure de voir facilement une quantité considérable de plastoglobules/gouttelettes lipidiques flottant sur (ou à proximité) de la couche supérieure du coussin de saccharose (figure 1B-C). D’autres fractions pourraient également être collectées à ce stade. Par exemple, les thylakoïdes seront granulés et pourront être remis en suspension avec un milieu R 0,2 pour des analyses ultérieures. Après centrifugat.......

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Discussion

Pour minimiser les changements physiologiques / biochimiques du matériau et protéger certains pigments prényl-lipidiques photo- et thermo-labiles qui sont un composant riche des plastoglobules, il est essentiel d’effectuer l’isolement à 4 ° C et à l’abri de la lumière. Comme indiqué ci-dessus, les étapes initiales sont effectuées en chambre froide sous une lampe de sécurité à l’aide d’une ampoule à émission verte. Les étapes suivantes effectuées en laboratoire sont sous des lumières tamisées et utilisent de la glace ou u.......

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Déclarations de divulgation

Aucun conflit d’intérêts à déclarer.

Remerciements

La recherche dans le groupe de laboratoire Lundquist est soutenue par des subventions de la NSF (MCB-2034631) et de l’USDA (MICL08607) à P.K.L. Les auteurs remercient la Dre Carrie Hiser (MSU) pour son soutien dans le développement de la méthode d’isolement des plastoglobules cyanobactériens.

....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
AEBSFMilipore SigmaP7626
Antipain.2HClBachemH-1765.0050BA
AprotinineMilipore SigmaA6106
AscorbateBDHBDH9242
BestatinSigma AldrichB8385
Bêta-Glycérophosphate. 2Na5H2OEMD Millipore35675
Sérum bovinAlbumine proliante biologique68700
ChymostatineSigma AldrichC7268
Eragrostis nindensisN/AN/A
E-64Milipore SigmaE3132
Cellule de pression française (modèle FA-079)SLM/AmincoN/A
HEPESSigma AldrichH3375
LeupeptinSigma AldrichL2884
Chlorure de magnésiumSigma AldrichM8266
Incubateur à secousses MultitronInfors HTN/A
Phospho-ramidon.2 NaSigma AldrichR7385
Hydroxyde de potassiumFisher ChemicalsM16050
Réduit CysteineMP Biochemicals101444
Fluorure de sodiumSigma AldrichS7920
Ortho-vanadate de sodiumSigma Aldrich450243
 ; 10H2OSigma Aldrich3850
SorbitolSigma AldrichS3889
SaccharoseSigma AldrichS9378
Sylvania 15 W Ampoule fluorescente à tube Gro-Lux, 18"WalmartN/A
Synechocystis sp. PCC 6803N/A N/A
Optima MAX-TL UltracentrifugeuseBeckman CoulterA95761
Mélangeur Waring (1,2 L)VWR58977-227Mélangeur professionnel
Zea maysN/AN/A
Pyrophosphate de sodium ·

Références

  1. Lundquist, P. K., Shivaiah, K. K., Espinoza-Corral, R. Lipid droplets throughout the evolutionary tree. Progress in Lipid Research. 78, 101029(2020).
  2. Lundquist, P. K., et al. The functional network of the Ara....

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Réimpressions et autorisations

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