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Research Article
Dimitrios Dimitrakopoulos1, Chrisitna Dimitriou1, Freyja McClenahan2, Robin J. M. Franklin2,3, Ilias Kazanis1
1Laboratory of Developmental Biology, Department of Biology,University of Patras, 2Wellcome Trust-MRC Cambridge Stem Cell Institute,University of Cambridge, 3Altos Labs,Cambridge Institute of Science
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Une méthode d’isolement de cellules souches neurales et de cellules progénitrices d’oligodendrocytes à partir du cerveau de rats vivants est présentée ici en détail expérimental. Il permet de multiples prélèvements de ces cellules chez les mêmes animaux sans compromettre leur bien-être.
Les cellules souches neurales (CSN) spécifiques aux tissus restent actives dans le cerveau postnatal des mammifères. Ils résident dans des niches spécialisées, où ils génèrent de nouveaux neurones et des cellules gliales. L’une de ces niches est la zone sous-épendymaire (ZES, également appelée zone ventriculaire-sous-ventriculaire), qui est située à travers les parois latérales des ventricules latéraux, adjacentes à la couche de cellules épendymaires. Les cellules progénitrices oligodendrocytaires (OPC) sont abondamment réparties dans tout le système nerveux central, constituant un pool de cellules progénitrices prolifératives capables de générer des oligodendrocytes.
Les NSC et les OPC présentent tous deux un potentiel d’auto-renouvellement et des cycles de quiescence/activation. En raison de leur emplacement, l’isolement et l’investigation expérimentale de ces cellules sont effectués post-mortem. Nous décrivons ici en détail la « traite cérébrale », une méthode d’isolement des NSC et des OPCs, entre autres cellules, à partir d’animaux vivants. Il s’agit d’un protocole en deux étapes conçu pour être utilisé chez les rongeurs et testé chez les rats. Tout d’abord, les cellules sont « libérées » du tissu par injection intra-intra-ventriculaire stéréotaxique (i.c.v.) d’un « cocktail de libération ». Les principaux composants sont la neuraminidase, qui cible les cellules épendymaires et induit la dénudation de la paroi ventriculaire, un anticorps bloquant l’intégrine-β1, et le facteur de croissance des fibroblastes-2. Lors d’une deuxième étape de « prélèvement », des biopsies liquides du liquide céphalorachidien sont réalisées à partir de la citerne magna, chez des rats anesthésiés sans avoir besoin d’une incision.
Les résultats présentés ici montrent que les cellules isolées conservent leur profil endogène et que les CSN de la ZES préservent leur quiescence. La dénudation de la couche épendymaire est limitée au niveau anatomique de l’injection et le protocole (libération et prélèvement) est bien toléré par les animaux. Cette nouvelle approche ouvre la voie à la réalisation d’études longitudinales de la neurogenèse endogène et de la gliogenèse chez les animaux de laboratoire.
Les cellules souches tissulaires spécifiques sont des cellules partiellement engagées qui peuvent donner naissance à toutes les populations cellulaires qui constituent les tissus respectifs. En plus d’être multipotentes, ce sont des cellules auto-renouvelables et cruciales pour le maintien de l’homéostasie et de la capacité de régénération des tissus1. Certaines cellules souches tissulaires restent actives et fortement prolifératives, comme les cellules souches intestinales ou hématopoïétiques. D’autres, comme les cellules souches cérébrales, restent en grande partie au repos ou dormantes2. Dans le cerveau adulte, les cellules souches neurales (CSN) peuvent être trouvées dans des zones spécialisées, souvent appelées niches. Deux de ces zones bien décrites existent dans la zone sous-épendymaire (ZES) des ventricules latéraux et dans le gyrus denté de l’hippocampe. La niche des ZES génère le plus grand nombre de cellules, principalement des neuroblastes qui migrent vers les bulbes olfactifs et contribuent à la population locale d’interneurones ; en revanche, les oligodendroblastes générés migrent vers le corps calleux (CC)3 adjacent. Les cellules progénitrices oligodendrocytaires (OPC) sont des cellules mitotiquement actives, largement distribuées dans tout le système nerveux central, qui : i) sont engagées dans la lignée oligodendrogliale, ii) peuvent migrer vers des sites de démyélinisation et iii) peuvent se différencier en oligodendrocytes myélinisants. Les OPC présentent également un potentiel d’auto-renouvellement et de quiescence4.
Jusqu’à présent, l’isolement et l’étude des NSC et des OPC nécessitaient une dissociation post-mortem des tissus cérébraux et moelle épinière disséqués. Pour contourner cette limitation expérimentale, nous avons mis au point une méthode qui permet, pour la première fois, d’isoler les NSC et OPC cérébraux d’animaux vivants. Nous appelons cette méthode « traite », car elle permet de collecter plusieurs cellules car leurs réserves ne sont pas épuisées. Le protocole a été développé chez le rat, en raison de la grande taille de son cerveau, ciblant principalement la ZES, ou CC, et comprend deux étapes principales. Tout d’abord, les NSC ou OPC sont « éliminés » du tissu par injection intraveineuse d’un « cocktail de libération » contenant de la neuraminidase, une toxine qui induit la dénudation de la paroi ventriculaire, un anticorps bloquant l’intégrine-β1 et le facteur de croissance des fibroblastes 2 (FGF2). Le cocktail est injecté par stéréotaxie bilatéralement dans les ventricules latéraux. Si l’utilisation prévue est l’isolement des NSC, les zones rostrales des ventricules latéraux sont ciblées. Si l’objectif est d’isoler plus purement les OPC, le cocktail est injecté par voie caudale dans la zone des fimbria de l’hippocampe. Lors d’une deuxième étape de « prélèvement », des biopsies liquides de liquide céphalorachidien (LCR) sont effectuées à partir de la citerne magna de rats anesthésiés, sans qu’il soit nécessaire d’incision. La biopsie liquide est mélangée avec un milieu de culture NSC et peut être conservée à 4 °C jusqu’au dressage.
Les procédures d’élevage, d’entretien et d’expérimentation des animaux ont été menées conformément à la loi britannique de 1986 sur les animaux (procédures scientifiques), autorisée par le ministère de l’Intérieur, et au décret présidentiel 56/2013 de la République hellénique, examinées par les organismes de bien-être animal et d’éthique des universités de Cambridge et de Patras, ainsi qu’approuvées et examinées par le comité préfectoral local de protection et d’utilisation des animaux (numéro de protocole : 5675/39/18-01-2021). Des rats Sprague-Dawley, Wistar et Long-Evans mâles et femelles, âgés de 2 à 4 mois et pesant entre 150 g et 250 g, ont été utilisés. Le protocole est résumé graphiquement à la figure 1.
1. Libérer la préparation du cocktail
REMARQUE : Préparez frais le jour de l’intervention et conservez-le sur glace. Les quantités sont données par 2 μL à injecter dans chaque ventricule latéral. Préparer 1 μL supplémentaire par injection prévue.
2. Injection de cocktail de libération
REMARQUE : L’ensemble du processus peut être effectué en 20 minutes. Prenez soin d’effectuer la chirurgie dans des conditions aseptiques. Nettoyez toutes les surfaces avec un antiseptique (p. ex., peroxyde d’hydrogène à 3 % ou 6 %). Utilisez des outils, des gants, des blouses et des champs autoclavés ou facilement stériles.
3. Biopsie liquide du liquide céphalorachidien (LCR)
REMARQUE : L’ensemble du processus peut être effectué en 10 minutes. La biopsie liquide décrite ici est réalisée 3 jours après l’injection du cocktail libératoire mais peut être réalisée exactement de la même manière chaque fois que nécessaire. Prenez soin d’effectuer la chirurgie dans des conditions aseptiques. Nettoyez toutes les surfaces avec un antiseptique (par exemple, du peroxyde d’hydrogène à 3 % ou 6 %). Utilisez des outils, des gants, des blouses et des champs autoclavés ou facilement stériles.
4. Traitement des tissus pour l’immunofluorescence
5. Traitement des cellules isolées pour l’immunofluorescence
6. Microscopie et analyse d’images
Libération et collecte des NSC
Les CSN de la ZES ne sont séparées du LCR que par la monocouche de cellules épendymaires, bien qu’elles restent en contact direct avec le contenu ventriculaire par l’intermédiaire d’apophyses monociliées intercalées 8,9. La neuraminidase agit spécifiquement sur les cellules épendymaires via le clivage des résidus d’acide sialique et peut induire une dénudation de la paroi ventriculaire. Cela conduit à un regroupement des neuroblastes à la surface du ventricule10,11. De plus, un flux de neuroblastes a été observé dans le LCR après l’injection i.c.v. d’un anticorps bloquant l’intégrine-β1, probablement dû au relâchement des jonctions cellulaires inter-épendymaires12. Ces observations ont conduit à la mise au point d’un protocole qui permet d’isoler les cellules souches et progénitrices du cerveau par compromis contrôlé de l’intégrité des parois du ventricule latéral. Dans un premier temps, la libération du parenchyme et l’écoulement ultérieur de NSC ou d’OPC à l’intérieur du LCR sont induits par injection intraveineuse du cocktail de libération. Le cocktail est injecté par stéréotaxie à raison de 1 μL/min, bilatéralement (2 μL par injection) dans les ventricules latéraux (coordonnées ciblant les CSN des ZES : AP = 0,3 mm, L = ± 1,2 mm, D = 3,5 mm ; coordonnées ciblant les OPC CC : AP = 1,5 mm, L = ± 2 mm, D = 3,5 mm). La deuxième étape (« prélèvement ») consiste à réaliser des biopsies liquides du LCR à partir de la citerne magna. Les rats doivent être anesthésiés et la biopsie peut être effectuée avec des seringues de 1 ml. L’utilisation de l’appareil stéréotaxique permet de prélever presque 100 μL de LCR, sans avoir besoin d’incisions. La biopsie liquide est ajoutée au milieu de culture glacé et est maintenue à 4 °C jusqu’à ce que le placage dure pendant <3 h (le milieu de culture NSC contient le milieu Eagle modifié de Dulbecco [DMEM], le supplément B27 [2 %], le supplément N2 [1 %], le FGF2 [20 ng/mL] et le facteur de croissance épidermique [EGF ; 20 ng/mL]).
Bilan histologique de la zone périventriculaire après l’injection du cocktail libératoire
Une première cohorte d’expériences a révélé que lors de l’injection de plus de 3 μL de liquide, les ventricules pouvaient être endommagés en raison d’une lésion mécanique non spécifique (Figure 2B,C). L’injection lente de 2 μL de cocktail de libération a conduit à l’émergence d’amas de neuroblastes immunopositifs Dcx à la surface ventriculaire. Ces grappes sont restées visibles même 8 mois après l’injection (Figure 2D). La méthode étant destinée à des études longitudinales, visant un suivi à long terme des animaux, les lésions tissulaires causées par le cocktail de libération ont été évaluées. L’immunomarquage a été effectué sur des coupes cérébrales de cryostat de 14 μm d’épaisseur pour les marqueurs cellulaires épendymaires, tels que S100β et β-caténine13, et l’intégrité globale de la couche épendymaire a été évaluée. Les sites de dénudation de la couche épendymaire n’étaient présents qu’à proximité du niveau rostrocaudal des injections, avec une diminution progressive des perturbations de la couche épendymaire détectée dans les zones plus postérieures et plus antérieures de la ZES (Figure 2E, F) et devenant absentes après une distance de ±2 mm du site d’injection. Les résultats mentionnés ci-dessus montrent que la dénudation partielle de la couche épendymaire provoquée par l’injection i.c.v. du cocktail de libération est focale, restreinte à proximité du site d’injection, et laisse intact le reste de la couche épendymaire périventriculaire.
Profil marqueur et comportement in vitro des cellules collectées
Par la suite, le comportement in vitro et le profil marqueur des cellules isolées via le protocole de traite ont été évalués. Le rendement cellulaire moyen de chaque biopsie liquide est d’environ 300 ± 45 cellules (par biopsie de 100 μL)7. Les biopsies de traite ont donné lieu à des cultures de NSC avec un potentiel de passage moyen de 3,17 ± 0,45. Les cellules isolées de rats ayant reçu une solution saline ont pu être traitées en moyenne 1,92 ± 0,76 fois ; en revanche, ceux isolés par traite ont même atteint neuf passages (p = 0,038, test t) (Figure 3A)7. La capacité moyenne de passage des cultures de neurosphères post-mortem standard dérivées de ZES est supérieure à 12 passages entre nos mains. Parce que le potentiel d’expansion in vivo des CSN des ZES, tel que révélé par les expériences de cartographie du destin cellulaire in vivo 14, s’est avéré limité, la traite produit des cellules ayant un comportement in vitro significativement différent de celui des cellules en culture standard, bien que beaucoup plus proche du comportement des CSN endogènes. Les cellules collectées ont été plaquées sur des puits recouverts de poly-D-lysine, où ils se sont développés à la fois sous forme de monocouches adhérentes et plus rarement sous forme de neurosphères (Figure 3B). Les cellules fraîchement isolées (prélevées 3 jours après l’injection et fixées 24 h après la mise en place) qui étaient immunopositives pour le marqueur astroglial GFAP étaient également immunopositives pour ID3, un marqueur de quiescence, et avaient les caractéristiques de la morphologie bipolaire NSC (Figure 3C). De plus, comme indiqué précédemment7, une comparaison immunocytochimique plus détaillée des cellules dérivées de la biopsie et des cellules dérivées post-mortem des mêmes animaux, 3 jours après l’injection (à la recherche d’astrocytes GFAP+, de neuroblastes Dcx+, de progéniteurs d’oligodendrocytes PDGFRa+ et de cellules SOX2+ de la lignée neurale) a montré que le profil des cellules collectées était similaire à celui des cellules SEZ endogènes (Figure 3D). Notamment, lorsque des cellules issues de la biopsie et des tissus ont été comparées dans différentes conditions (par exemple, injection d’un cocktail de libération avec et sans FGF2), il a été constaté que le facteur de croissance entraînait une augmentation concomitante et significative de la présence de cellules SOX2+, ainsi qu’une diminution significative de la présence de neuroblastes Dcx+ dans les deux échantillons (Figure 3D). Ces données ont confirmé que tout changement apparaissant dans le profil des populations endogènes de CSN se reflète dans les échantillons de cellules générées par la traite.

Figure 1 : Résumé graphique de la traite. Une section coronale d’un hémisphère cérébral avec les principaux points de repère anatomiques (le ventricule latéral, le corps calleux sus-jacent et la commissure antérieure en dessous [voies de la substance blanche en gris], et la zone sous-épendymaire aux parois latérales [en bleu]). Le cocktail de libération est injecté dans le ventricule latéral, ce qui compromet l’intégrité du tissu et la libération de cellules souches neurales cérébrales postnatales dans le liquide céphalo-rachidien, à partir duquel elles peuvent être prélevées via des biopsies liquides. Abréviations : ZES = zone sous-épendymaire ; VG = ventricule latéral ; LCR = liquide céphalo-rachidien ; pbNSCs = cellules souches neurales cérébrales postnatales ; β1-int = intégrine bêta1. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Évaluation histologique des effets des injections intraveineuses. (A-D) Images à faible grossissement de la moitié dorsale du ventricule latéral après immunomarquage pour Dcx (en rouge, pour marquer les neuroblastes). (A) La simple insertion d’une seringue Hamilton ne perturbe pas la cyto-architecture de la ZES, tandis que l’injection de 10 mL (débit de perfusion de 1 mL/min) entraîne de graves lésions de la paroi ventriculaire quel que soit son contenu. (B) solution saline et (C) cocktail libératoire. (D) L’injection de 2 μL du cocktail de libération entraîne une atteinte contrôlée de la paroi ventriculaire, observée même à 8 mois après l’intervention. Les détails à fort grossissement de la paroi de la ZES à 7 et 14 jours après l’injection sont indiqués en (E) et (F), respectivement. Il y a une structure désorganisée, avec les neuroblastes Dcx+ (en vert) reposant à la surface de la paroi et les autres cellules de la niche (Sox2+, en blanc) reposant plus profondément. Le tissu périventriculaire est endommagé au niveau rostrocaudal de l’injection au moment de 2 mois (en G), tandis que le tissu est intact au niveau plus caudal (en H) chez le même animal. La paroi ventriculaire est évaluée par immunomarquage pour les marqueurs épendymaires S100β et β-caténine. Le détail de l’architecture typique du mur est montré en (I). La coloration nucléaire est réalisée à l’aide de DAPI (en bleu). Barres d’échelle = 300 μm (A-C, V, H, encarts), 150 μm (D), 30 μm (E, F) et 50 μm (I). Cette figure est modifiée à partir de McClenahan et al.13. Abréviations : ZES = zone sous-épendymaire ; I.C.V = intra-ventriculaire ; Dcx = doublecortine ; DAPI = 4',6-diamidino-2-phénylindole. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Évaluation des cellules isolées par traite. (A) Graphique montrant le nombre maximal de passages obtenus par échantillon de biopsie liquide chez des animaux ayant reçu une injection de solution saline (barres grises, total de 12 échantillons), ou après la traite (barres noires, total de 29 échantillons, cocktail de libération avec neuraminidase et anticorps bloquant l’intégrine-β1). (B) Image de microscopie confocale représentative de cellules primaires obtenues par traite, 3 jours après l’injection, immunocolorées contre GFAP et ID3. (C,D) Images en fond clair de cellules isolées 3 jours après l’injection, plaquées sur des puits recouverts de poly-D-lysine et laissées se développer dans un milieu de prolifération NSC pendant 7 jours. (E) Graphique montrant le profil de type cellulaire des cellules isolées par traite de la ZES et de la population endogène de CSN ZES provenant des mêmes animaux de laboratoire. Les fractions SOX2+ et Dcx+ ont été significativement augmentées et diminuées, respectivement, après la co-injection de FGF2. (Analyse ANOVA à un facteur par marqueur, suivie d’une analyse post-hoc ; n = 4 à 6 animaux par groupe expérimental.) Barres d’échelle = 100 μm (C,D) et 10 μm (B). Cette figure est modifiée à partir de McClenahan et al.13. Abréviations : ZES = zone sous-épendymaire ; DPI = jours après l’injection ; NSC = cellules souches neurales ; Dcx = doublecortine ; GFAP = protéine acide fibrillaire gliale. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont pas d’intérêts financiers concurrents ou d’autres conflits d’intérêts à déclarer.
Une méthode d’isolement de cellules souches neurales et de cellules progénitrices d’oligodendrocytes à partir du cerveau de rats vivants est présentée ici en détail expérimental. Il permet de multiples prélèvements de ces cellules chez les mêmes animaux sans compromettre leur bien-être.
Ce travail a été soutenu par une subvention d’Action Medical Research (UK) (GN2291) à R.J.M.F. et I.K. Les travaux de recherche ont également été partiellement financés (coûts des animaux et soutien à D.D.) par la Fondation hellénique pour la recherche et l’innovation (H.F.R.I.) dans le cadre du « Premier appel à projets de recherche H.F.R.I. pour soutenir les membres du corps professoral et les chercheurs et l’obtention d’une subvention d’équipement de recherche à coût élevé » (numéro de projet : 3395).
| Release cocktail | |||
| &beta ; Anticorps bloquant l’intégrine | 1 BD Biosciences | #555002 | purifié NA/LE Hamster Anti-Rat CD29 Clone Ha2/5, 1 mg/mL. Tout abntibody avec une activité bloquante doit être approprié. |
| Les neuraminidases de Clostridium perfringens (Clostridium welchii) | Sigma-Aldrich | #N2876 | Lesneuraminidases d’autres sources (par exemple, de Vibrio cholerae) n’ont pas été testées. |
| FGF humain recombinant (154 a.a.) | Peprotech | #100-18B | conservé en tant que 1 &mu ; g/&mu ; L stock, dilué dans de l’eau stérile à -20 ° ; C |
| 10 & micro ; L Seringue | Hamilton | #80330 | Modèle 701 RN, petite aiguille amovible, calibre 26s, 2 po, point de style 2 |
| BD Micro-fine 1 mL seringues à insuline | BD biosciences | 04085-00 | 29 G x 12,7 mm |
| BÉTADINE COUPÉE. SOL 10 % FLx30ML | LAVIPHARM-CASTALIA | UGS : | |
| Bupaq | RICHTERPHARMA | 1021854AF | 10 mL (buprénophine 0,3 mg/mL) |
| Numérique Nouvelle norme Stéréotaxique, Stoelting pour rats et souris | 51500D | ||
| Système de surveillance homéothermique | Harvard Appareil | 55-7020 | |
| ISOFLURINE 1 000 mg/g inhalation de vapeur, liquide | Vetpharma Santé animale | 32509/4031 | |
| Ketamidor | RICHTER PHARMA | UGS : | 9004114002531Kétamine 100 mg/mL |
| Suture en nylon, Ethilon | Ethicon | D9635 | Transparent, taille 5-0 |
| Tondeuses chirurgicales sans fil rechargeables | Item | :51472 | |
| Lames de scalpel, stériles | Swann Morton | AW050 | |
| Scopettes Jr. Écouvillons de 8 pouces | Birchwood Laboratories | 34-7021-12P | |
| Foret stéréotaxique à grande vitesse | Foredom | 1474w/o1464 | |
| Stoelting' s Stereotaxic Instrument | Kit Stoelting | Article : 52189 | |
| Xylan 2 % | Chanelle Pharmaceuticals | 13764/03/19-5-2004 | Xylazine, 25 mL |
| Manipulation des tissus et des cellules et immunomarquages | |||
| 96-well plates appropriées pour la microscopie | Greiner | #655866 | Screen star microplate |
| B27 supplement | ThermoFisher Scientific | A1486701 | |
| Albumine sérique bovine (BSA) | Merck | P06-1391100 | Fraction V, choc thermique |
| Citrate | Merck | 71497 | Citrate de sodium monobasique |
| Cryostat | Leica | CM1510S | |
| DAPI | Merck, Calbiochem | 28718-90-3 | Coloration nucléaire, dilution : 1/1 000 |
| DMEM | ThermoFisher Scientific | 11995065 | Oeil anti-chèvre à haute teneur en glucose, pyruvate |
| Biotium | 20016 ou 20106 ou 20048 | Dilution : 1/1 000 | |
| âne anti-souris | Biotium | 20014 ou 20105 ou 20046 | Dilution : 1/1 000 |
| âne anti-lapin | Biotium | 20015 ou 20098 ou 20047 | Dilution : 1/1 000 |
| EGF | Peprotech | 315-09 | |
| FGF-2 (ou bFGF) | Peprotech | 100-18B | |
| chèvre anti-GFAP | Abcam | ab53554 | Dilution : 1/500 |
| chèvre anti-SOX2 | Santa Cruz Biotecnology | sc-17320 | Dilution : 1/200 |
| souris anti-ID3 | Santa Cruz Biotecnology | sc-56712 | Dilution : 1/200 |
| souris anti-S100&beta ; | Sigma | S2532 | Dilution : 1/200 |
| Mowiol | Merck, Calbiochem | 475904 | Milieu de montage |
| Supplément N2 ThermoFisher | Scientific | 17502048 | |
| Parafolmadehyde | Merck | 158127 | |
| Poly-D-Lysine | Merck, Millipore | A-003-E | Solution, 1,0 mg/mL |
| anti-Doublecortin (DCX) | Abcam | ab18723 | Dilution : 1/500 |
| lapin anti-PDGFR&alpha ; | Abcam | ab51875 | Dilution : 1/200 |
| lapin anti-&beta ;- caténine | Abcam | ab16051 | Dilution : 1/500 |
| Triton X-100 | Merck | X100 | |
| Microscopie et analyse d’images | |||
| Microscope confocal | Leica | SP6 et SP8 | |
| Analyse d’images | NIH, USA | ImageJ | |
| Analyse d’images | Leica | LasX |