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Les neutrophiles sont des cellules très dynamiques et réactives qui ont une courte durée de vie et ne peuvent pas encore être cryoconservées19, ce qui rend difficile l’étude de leur biologie. Par conséquent, il est essentiel de suivre des étapes minutieuses pour obtenir des neutrophiles viables, enrichis et au repos11,20. Cette étude a utilisé une technique d’isolement basée sur la densité qui met l’accent sur une manipulation douce et minimale, ainsi que sur l’utilisation de basses températures jusqu’à l’étape d’activation. De plus, le traitement sanguin doit avoir lieu dans les 30 minutes suivant la ponction veineuse et être conservé à température ambiante. Le présent travail présente une option pour diminuer le stress de manipulation et le temps d’expérimentation. Pour simplifier davantage le processus, nous avons introduit une nouvelle étape (en option) dans le protocole, qui consiste à retirer les globules rouges par remise en suspension et aspiration douces de la couche de globules rouges après une seule procédure d’hémolyse. Cette étape réduit le stress de manipulation et le temps d’expérimentation, car elle élimine la majorité des globules rouges avec une seule étape d’hémolyse hypotonique. Cependant, il convient de noter que les compétences de l’opérateur influent grandement sur l’efficacité de cette étape et qu’elles n’éliminent pas toujours entièrement les globules rouges. De plus, l’aspiration des globules rouges peut entraîner une perte de neutrophiles, mais cela n’affecte pas le rendement, car un plus grand nombre de neutrophiles ont été initialement récupérés du gradient lors de la collecte plus près de la couche de globules rouges. Par conséquent, l’aspiration des globules rouges est recommandée si les tests ne nécessitent pas la plus grande pureté possible, ou si l’opérateur a toujours obtenu de bons résultats. Pour les tests de dépistage présentés ici, une petite quantité de globules rouges contaminants (<3 %) n’interférerait pas avec les résultats.
Pour s’assurer que toutes les procédures sont effectuées en temps voulu, y compris la préparation des réactifs, un flux de travail est présenté (Figure 2) qui détaille la chronologie et la répartition des tâches entre deux chercheurs. Une fois tous les tests fonctionnels terminés, les cellules restantes peuvent être préparées pour d’autres investigations moléculaires, telles que des études omiques par lyse cellulaire avec un tampon de lyse et un stockage appropriés.
Production de ROS
L’éclatement respiratoire est une caractéristique de l’amorçage et de l’activation des neutrophiles18,21, et l’évaluation de la production de ROS est une méthode couramment utilisée pour estimer l’état d’activation des neutrophiles. Cette étude a évalué la production de ROS à l’aide de deux approches : la microscopie optique et la spectrophotométrie.
Le test NBT est une approche bien connue pour évaluer l’éclatement respiratoire chez les neutrophiles22,23. Deux méthodes couramment utilisées sont les tests basés sur la microscopie optique (ou test sur lames) et les tests basés sur la spectrophotométrie 24,25,26. Bien que la microscopie optique permette de visualiser les détails au niveau de la cellule, elle est sujette à des biais de l’utilisateur. Par conséquent, le test de lame NBT sert de complément qualitatif au test spectrophotométrique concernant les caractéristiques phénotypiques, telles que les modèles de formation de formazan, l’intensité et l’agrégation cellulaire.
Les étapes critiques pour les tests de lame NBT et les tests spectrophotométriques sont la NBT et la solubilisation complète du formazan. Contrairement aux recommandations du fabricant, le NBT ne se dissout pas bien dans l’eau. Cependant, l’homogénéisation du NBT dans le DMSO pendant au moins 15 minutes, puis l’ajout d’eau/HBSS et le vortex pendant 2 min permettent une solubilisation complète. De plus, pour analyser l’absorbance du formazan, deux étapes critiques doivent être réalisées : (1) la libération des cristaux de formazan des cellules par lyse PMN et (2) la solubilisation complète des cristaux de formazan. Les deux étapes ont été réalisées en traitant la pastille cellulaire avec 10 % de SDS, comme cela a été récemment suggéré27, suivie d’une sonication et d’une analyse d’absorbance du surnageant à 570 nm.
De plus, les résultats de la NBT des groupes témoins négatifs et positifs constituent la première étape du dépistage à évaluer. Cette étape doit montrer une différence remarquable, car l’évaluation de la production de ROS par formazan indique si le processus d’isolement pourrait avoir été responsable de changements indésirables dans l’état de repos des cellules, soit par stimulation, soit par inhibition.
D’autres méthodes, telles que la réduction du cytochrome c28 ou l’analyse par cytométrie en flux29, sont souvent utilisées pour la détection des ROS ; Cependant, si l’on considère une approche de criblage, leur application nécessite un temps d’expérimentation plus long, l’utilisation de marqueurs spécifiques et des instruments coûteux. La chimiluminescence du luminol/isoluminol est une méthode rapide et rentable pour détecter les ROS tout en permettant la différenciation des ROS intra- et extracellulaires. Cependant, un luminomètre est nécessaire pour cette méthode30,31. Bien que le coût de l’instrument puisse être contourné par l’utilisation d’une installation, il serait toujours impropre à une analyse de dépistage effectuée simultanément avec d’autres tests.
Phagocytose
L’incubation PMN/levure fournit une vue d’ensemble de la capacité et de l’efficacité de la phagocytose des neutrophiles en comptant le nombre de neutrophiles effectuant la phagocytose et le nombre de levures englouties par neutrophile. Cependant, comme la particule de levure elle-même est un signal d’activation, la comparaison du groupe témoin avec le PMN prétraité constitue un système de double stimulation, qui peut ne pas présenter de changements significatifs, comme le montre le PMN CTRL par rapport au PMN traité au fMLP (Figure 4). Néanmoins, ce test est utile pour indiquer si un modulateur potentiel aurait un impact sur la phagocytose. Un nouveau peptide antimicrobien a été testé à l’aide de ce test, et les résultats indiquent une réponse potentielle intéressante à cette combinaison de stimuli, qui a récemment été discutée comme nécessaire pour une activation efficace32.
L’étape critique de ce test est la coloration, car l’analyse devient peu fiable si la lame est conservée sur le panoptique n° 3 (hématoxyline) pendant ≥3 s. En effet, les cellules de levure et les lobes nucléaires des neutrophiles ne peuvent pas être distingués l’un de l’autre. De plus, cette approche permet l’analyse morphologique des neutrophiles après exposition à des modulateurs. La cytométrie en flux est une autre technique efficace pour analyser la phagocytose33, bien qu’elle présente des limites en raison de la difficulté à faire la distinction entre les particules liées à la membrane et les particules englouties et d’autres facteurs liés à l’ensemble de criblage proposé, comme nous l’avons vu dans la rubrique précédente. La même limitation est observée dans la méthode décrite ici, bien qu’elle doive être considérée comme un dépistage initial pour guider les études de suivi.
Migration en temps réel
Le protocole de criblage en temps réel a été optimisé pour évaluer la capacité de migration des PMN. Bien qu’une étude antérieure ait suggéré qu’un revêtement de la face inférieure de la plaque RTCA était nécessaire pour que le test de migration montre une différence entre le contrôle négatif et le traitement à l’IL-815, cette étude a montré des valeurs d’intervalle de confiance (IC) élevées pour les cellules traitées au fMLP sans ajout d’agents d’enrobage. Les résultats ont présenté une reproductibilité élevée avec une migration significative à partir de 12 minutes. De plus, l’analyse de l’ajustement des courbes des données de migration obtenues peut révéler des paramètres, tels que l’indice de cellule maximal ainsi que la pente d’augmentation et de diminution, qui sont utiles pour comprendre la dynamique de la migration, et peuvent dépendre de la concentration ou différer entre les conditions. Le meilleur ajustement pour les courbes de migration des neutrophiles (Figure 5) a été la fonction de Gompertz ajustée34, montrant que fMLP augmente l’indice cellulaire maximal et la pente accrue.
Une attention particulière est nécessaire pour éviter les bulles dans le système RTCA car elles peuvent bloquer les cellules passant à travers les électrodes, compromettant ainsi l’expérience. Un facteur limitant est le coût élevé des plaques. Bien que des techniques moins chères analysent la migration cellulaire, elles manquent d’une bonne reproductibilité ou sont difficiles et prennent du temps, comme la chambre de Boyden35. Par conséquent, RTCA est une analyse de migration fiable compatible avec les autres tests de dépistage présentés ici.
Filets
Enfin, un test prometteur, facile et peu coûteux pour une évaluation préliminaire de la formation de TNE a été mis au point à l’aide de la microscopie optique. Il a été dérivé de l’observation de lames de phagocytose, dans lesquelles PMA, un stimulus spécifique induisant des TNE testé pour son effet sur la capacité de phagocytose, a également induit une formation de structure en forme de toile par rapport aux groupes CTRL et fMLP. Ce travail a émis l’hypothèse que ces structures pourraient indiquer la libération de TNE. Une telle hypothèse a été testée en traitant les échantillons avec de la DNase I après activation, où aucune structure filamenteuse n’a été trouvée dans les neutrophiles activés par PMA. L’hypothèse selon laquelle de telles structures sont susceptibles d’être des TNE est basée sur le fait que la PMA est citée comme un inducteur bien connu de la formation de TNE36,37, la découverte de structures similaires par microscopie à fluorescence à l’aide de marqueurs spécifiques pour les TNE38,39 et la dégradation des TNE catalysée par la DNase I40,41. Il est important de souligner qu’il ne s’agit pas d’une méthode de confirmation de la formation de TNE, mais simplement d’un dépistage préliminaire qui suggère la présence de TNE. Bien que ce test ait des limites, car les TNE peuvent être confondues avec des artefacts de coloration, il sert un objectif pertinent en suggérant la formation de TNE dans un dépistage rapide et peu coûteux qui peut être effectué avec d’autres tests fonctionnels. Une fois qu’elles ont été détectées comme potentiellement pertinentes pour l’étude dépistée, les TNE peuvent être évaluées plus en détail par microscopie confocale ou électronique42, comme nous le verrons plus loin.
Dans notre laboratoire, de nouveaux peptides antimicrobiens, également susceptibles d’avoir des activités immunomodulatrices, sont fréquemment évalués par cet ensemble de tests de criblage afin de mieux guider l’analyse ultérieure des effets de certains peptides sur les neutrophiles humains, car certains présentent des propriétés intéressantes de ROS43, de phagocytose, de migration et/ou de modulation des NET.
En conclusion, le NeutroFun Screen offre un outil précieux pour identifier les modulateurs potentiels de l’activité des neutrophiles de densité normale à partir d’un grand nombre de composés non testés. Cependant, il est important de noter que cette méthode ne sert que de dépistage préliminaire. Après ce premier examen, des méthodologies plus coûteuses, plus avancées et plus longues peuvent être dirigées vers des fonctions ou des voies spécifiques suggérées par ces premiers résultats pour la validation des données. Pour la production de ROS, la phagocytose et la formation de NET, il existe d’autres méthodes pour valider les données et obtenir d’autres résultats quantitatifs. La visualisation et la quantification des TNE peuvent être effectuées par analyse par microscopie d’immunofluorescence, qui détermine la présence et le chevauchement de l’ADN extracellulaire et des protéines granulaires, telles que la myéloperoxydase et l’élastase neutrophile, comme décrit en détail récemment42. Les ROS jouent différents rôles cruciaux dans de nombreux processus biologiques, et leur étude est donc très répandue et diversifiée. Parmi les méthodologies les plus établies, on trouve celles qui utilisent des anticorps, telles que le test immuno-enzymatique (ELISA) et l’immunotransfert de luminescence, ou la détection par fluorescence, comme la cytométrie en flux de cellules sous différents marquages - par DCFDA, la spectroscopie EPR et les mesures d’activité enzymatique44. De même, une évaluation robuste de la phagocytose est également effectuée de plusieurs manières ; Les méthodes alternatives comprennent la cytométrie en flux seule45,46 ou combinée à la microscopie à fluorescence47. La migration cellulaire en temps réel décrite est un test robuste et suffisant qui ne nécessite pas de validation supplémentaire et présente des paramètres que d’autres méthodologies ne peuvent pas envisager. D’autres combinaisons de ces méthodes pourraient mieux convenir à des scénarios spécifiques, mais en résumé, cela représente une combinaison rapide et abordable qui englobe de nombreuses activités neutrophiles.
En résumé, cette étude vise à fournir un ensemble de tests composés de méthodologies simples, rapides et peu coûteuses pour évaluer les réponses multiples des neutrophiles à de nouvelles molécules et conditions afin de mieux orienter les efforts vers des méthodologies avancées. En tant que limites majeures, les résultats des tests ROS, NET et de phagocytose doivent être considérés comme préliminaires et nécessitent une validation plus approfondie par des tests plus spécifiques et plus élaborés, et ceux qui reposent sur une numération cellulaire par microscopie non automatisée sont sujets à des biais inconscients.