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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Le changement climatique a un impact sur les écosystèmes des récifs coralliens à l’échelle mondiale. Les coraux provenant de systèmes d’aquaculture ex situ peuvent aider à soutenir les efforts de restauration et de recherche. Ici, les techniques d’alimentation et de culture des coraux qui peuvent être utilisées pour favoriser le maintien à long terme des coraux scléractiniaires couveurs ex situ sont décrites.
Le changement climatique affecte la survie, la croissance et le recrutement des coraux à l’échelle mondiale, avec des changements à grande échelle dans l’abondance et la composition des communautés attendus dans les écosystèmes récifaux au cours des prochaines décennies. La reconnaissance de cette dégradation des récifs a suscité une série de nouvelles interventions actives basées sur la recherche et la restauration. L’aquaculture ex situ peut jouer un rôle de soutien grâce à la mise en place de protocoles robustes de culture corallienne (par exemple, pour améliorer la santé et la reproduction dans le cadre d’expériences à long terme) et par la fourniture d’un approvisionnement constant en géniteurs (par exemple, pour une utilisation dans des projets de restauration). Ici, des techniques simples pour l’alimentation et la culture ex situ de coraux scléractiniaires couveurs sont décrites en utilisant le corail commun et bien étudié, Pocillopora acuta, comme exemple. Pour démontrer cette approche, les colonies de coraux ont été exposées à différentes températures (24 °C contre 28 °C) et à différents traitements d’alimentation (nourris ou non nourris) et le rendement et le moment de la reproduction, ainsi que la faisabilité de nourrir les coraux avec des nauplius d’Artemia aux deux températures, ont été comparés. Le taux de reproduction a montré de fortes variations entre les colonies, avec des tendances différentes observées entre les traitements à la température ; à 24 °C, les colonies nourries ont produit plus de larves que les colonies non nourries, mais l’inverse a été observé dans les colonies cultivées à 28 °C. Toutes les colonies se sont reproduites avant la pleine lune, et les différences dans le moment de la reproduction n’ont été observées qu’entre les colonies non nourries dans le traitement à 28 °C et les colonies nourries dans le traitement à 24 °C (jour lunaire moyen de reproduction ± écart-type : 6,5 ± 2,5 et 11,1 ± 2,6, respectivement). Les colonies de coraux se nourrissaient efficacement de nauplius d’Artemia aux deux températures de traitement. Les techniques d’alimentation et d’élevage proposées sont axées sur la réduction du stress corallien et la promotion de la longévité de la reproduction d’une manière rentable et personnalisable, avec une applicabilité polyvalente dans les systèmes d’aquaculture à flux continu et à recirculation.
De nombreux écosystèmes de récifs coralliens dans le monde sont en train de disparaître et de se dégrader en raison du stress dû aux températures élevées entraîné par le changement climatique 1,2. Le blanchissement des coraux (c’est-à-dire la rupture de la symbiose corail-algue3) était considéré comme relativement rare au cours des4 dernières années, mais il se produit maintenant plus fréquemment5, et on s’attend à ce qu’un blanchissement annuel se produise dans de nombreuses régions d’ici le milieu ou la fin du siècle 6,7. Ce raccourcissement de la période intermédiaire entre les épisodes de blanchissement peut limiter la capacité de résilience des récifs8. Les impacts directs du stress à haute température sur les colonies coralliennes (par exemple, lésions tissulaires9 ; épuisement de l’énergie10) sont intrinsèquement liés aux impacts indirects à l’échelle du récif, dont une réduction de la capacité de reproduction et de recrutement est particulièrement préoccupante11. Cela a stimulé une série de recherches appliquées explorant, par exemple, l’amélioration active in situ du recrutement (par exemple, l’ensemencement des récifs12), les nouvelles technologies pour la mise à l’échelle de la restauration des coraux13 et la simulation des signaux de reproduction pour induire la reproduction dans les systèmes ex situ 14. En complément de ces interventions actives, la reconnaissance récente des avantages de l’alimentation hétérotrophe chez les coraux soumis à un stress à haute température15 et l’exploration du rôle que l’apport alimentaire peut jouer dans la reproduction16.
L’alimentation hétérotrophe est connue pour influencer les performances des coraux17 et a été spécifiquement liée à l’augmentation de la croissance des coraux18,19, ainsi qu’à la résistance thermique et à la résilience20,21. Pourtant, les avantages de l’hétérotrophie ne sont pas omniprésents chez les espèces de coraux22 et peuvent différer en fonction du type d’aliment consommé 23, ainsi que du niveau d’exposition à la lumière24. Dans le contexte de la reproduction des coraux, l’alimentation hétérotrophe a montré des résultats variables, avec des observations d’une capacité de reproduction supérieure à25 et inférieureà 26 après une alimentation hétérotrophe. L’influence de l’alimentation hétérotrophe sur la reproduction des coraux à travers un spectre de températures est rarement évaluée, mais chez le corail tempéré Cladocora caespitosa, l’hétérotrophie s’est avérée plus importante pour la reproduction dans des conditions de température plus basses27. Une meilleure compréhension du rôle de la température et de l’alimentation sur le rendement reproducteur est probablement nécessaire pour déterminer si des récifs spécifiques (par exemple, les récifs associés à une grande disponibilité de nourriture28) possèdent une plus grande capacité de recrutement dans le cadre du changement climatique.
À l’instar de la production reproductive, l’effet de la température et de l’alimentation sur le moment de la reproduction chez les coraux reste relativement peu étudié, bien que la synchronisation de la reproduction avec les conditions abiotiques/biotiques soit un facteur important pour le succès du recrutement dans un océan qui se réchauffe29. Il a été démontré que des températures plus chaudes entraînent une reproduction plus précoce dans les études de conditionnement thermique des coraux menées en laboratoire30, et cela a également été observé dans les coraux collectés sur les récifs naturels au cours des saisons31. Pourtant, il est intéressant de noter que la tendance inverse a récemment été observée chez les coraux nourris cultivés au cours d’une année dans un système d’écoulement ex situ (c’est-à-dire que la reproduction s’est produite plus tôt dans le cycle lunaire à des températures hivernales plus fraîches et plus tard dans le cycle lunaire à des températures estivales plus chaudes)32. Ce résultat contrasté suggère que le moment de la reproduction peut s’écarter des schémas typiques dans des conditions associées à des ressources énergétiques abondantes.
Des expériences contrôlées à long terme sous différents scénarios de température pourraient contribuer à une meilleure compréhension de l’influence de l’hétérotrophie sur la reproduction chez les coraux scléractiniaires. Cependant, le maintien de colonies de coraux reproducteurs dans des conditions ex situ pendant plusieurs cycles de reproduction peut être difficile (mais voir les recherches précédentes32,33). Des techniques simples et efficaces pour l’alimentation active (source de nourriture : Artemia nauplii) et la culture à long terme d’un corail couvant (Pocillopora acuta) dans un système d’aquaculture à écoulement continu sont décrites ; Cependant, il convient de noter que toutes les techniques décrites peuvent également être utilisées dans les systèmes d’aquaculture en recirculation. Pour démontrer ces techniques, une comparaison préliminaire du taux de reproduction et du moment de la reproduction des colonies de coraux maintenues à 24 °C et 28 °C sous traitement « nourri » et « non nourri » a été effectuée. Ces températures ont été choisies pour se rapprocher des températures de l’eau de mer en hiver et en été, respectivement, dans le sud de Taïwan30,34 ; Une température plus élevée n’a pas été choisie parce que la promotion de la culture ex situ à long terme, plutôt que de tester la réponse des coraux au stress thermique, était l’un des principaux objectifs de cette expérience. De plus, la densité des nauplius d’Artemia avant et après les séances d’alimentation a été quantifiée pour comparer la faisabilité d’une alimentation hétérotrophe aux deux traitements à température.
Plus précisément, 24 colonies de P. acuta (extension linéaire totale moyenne ±écart-type : 21,3 cm ± 2,8 cm) ont été obtenues à partir de bassins à écoulement continu dans les installations de recherche du Musée national de biologie marine et d’aquarium, dans le sud de Taïwan. Pocillopora acuta est une espèce de corail commune qui possède à la fois une stratégie de reproduction à la volée et une stratégie de reproduction généralement couveuse35,36. Les colonies parentes de ces coraux ont été collectées à l’origine dans le récif Outlet (21,931°E, 120,745°N) environ 2 ans plus tôt pour une autre expérience32. Par conséquent, les colonies de coraux utilisées dans la présente expérience ont été élevées toute leur vie dans des conditions de culture ex situ ; Plus précisément, les colonies ont été exposées à la température ambiante et à un cycle lumière/obscurité de 12 h : 12 h à 250 μmol quanta m−2·s−1 et ont été nourries avec des nauplius d’Artemia deux fois par semaine. Nous reconnaissons que cette culture ex situ à long terme pourrait avoir affecté la façon dont les colonies ont réagi aux conditions de traitement dans cette expérience. Nous voudrions donc souligner que l’objectif principal ici est d’illustrer comment les techniques décrites peuvent être utilisées efficacement pour la culture de coraux ex situ en démontrant un exemple appliqué dans lequel les effets de la température et de l’alimentation sur la reproduction des coraux ont été évalués.
Les colonies de coraux ont été réparties uniformément dans six réservoirs de culture à écoulement continu (longueur intérieure du réservoir x largeur x hauteur : 175 cm x 62 cm x 72 cm ; régime d’éclairage du réservoir : 12 h : cycle lumière :obscurité à 250 μmol quanta m−2·s−1) (Figure 1A). La température dans trois des réservoirs a été réglée à 28 °C et la température dans les trois autres réservoirs a été réglée à 24 °C ; chaque réservoir avait un enregistreur qui enregistrait la température toutes les 10 minutes (voir le tableau des matériaux). La température était contrôlée indépendamment dans chaque réservoir à l’aide de refroidisseurs et de réchauffeurs, et la circulation de l’eau était maintenue à l’aide de moteurs à débit (voir le tableau des matériaux). La moitié des colonies de chaque réservoir (n = 2 colonies/bassin) ont été nourries avec des nauplius d’Artemia deux fois par semaine, tandis que les autres colonies n’ont pas été nourries. Chaque séance d’alimentation a duré 4 h et s’est déroulée dans deux réservoirs d’alimentation indépendants à température spécifique. Pendant l’alimentation, toutes les colonies ont été déplacées dans les bassins d’alimentation, y compris les colonies non nourries, afin de normaliser l’effet de stress potentiel du déplacement des colonies entre les bassins. Les colonies dans les traitements d’alimentation et de non-alimentation ont été placées dans leur propre compartiment à l’aide d’un cadre grillagé à l’intérieur des réservoirs d’alimentation à température spécifique afin que seules les colonies à l’état d’alimentation reçoivent de la nourriture. Le rendement et le moment de la reproduction des coraux ont été évalués quotidiennement à 09h00 pour chaque colonie en comptant le nombre de larves qui avaient été relâchées dans les conteneurs de collecte des larves pendant la nuit.
1. Colonies coralliennes suspenduesdans des bassins d’aquaculture ex situ
2. Alimentation des coraux
3. Quantification de la densité des nauplius d’Artemia avant et après l’alimentation
4. Collecte de larves de corail
Les protocoles décrits ont permis (1) de comparer le rendement reproducteur et le moment de la reproduction de colonies de coraux individuelles entre des traitements d’alimentation et de température distincts et (2) d’évaluer la faisabilité de l’alimentation des nauplius d’Artemia à différentes températures. Nous donnons ici un bref aperçu des résultats, mais il convient de faire preuve de prudence en ce qui concerne l’interprétation large des effets rapportés de la température et de l’alimentation sur la reproduction des coraux en raison de la nature à court terme de cette expérience (c’est-à-dire un seul cycle de reproduction) et de l’utilisation de colonies de coraux acclimatées à des conditions ex situ .
Chaque colonie s’est reproduite au cours de notre période de suivi (septembre lunaire 2022), et le taux de reproduction mensuel total a montré une forte variation entre les colonies. Le nombre total de larves relâchées par les colonies variait de 6 à 319, à l’exception d’une colonie (dans le traitement non nourri à 24 °C) qui a produit 528 larves ; Les données de toutes les colonies sont présentées à la figure 2, mais la colonie aberrante à forte production n’a pas été incluse dans l’analyse des données. Le rendement reproductif a été affecté par la température (modèle linéaire généralisé à effets mixtes ; z = 5,35, p < 0,001) et l’alimentation (z = 3,01, p < 0,003), avec une interaction significative entre la température et les traitements d’alimentation (z = 12,22 , p < 0,001). Les colonies cultivées à 28 °C ont libéré plus de larves lorsqu’elles n’étaient pas nourries (moyenne ±écart-type ; 151 ± 82) que lorsqu’elles étaient nourries (131 ± 133) (modèle linéaire généralisé à effets mixtes, contraste post-hoc ; z = 3,01, p = 0,014), mais la tendance inverse a été observée dans les colonies cultivées à 24 °C, les colonies nourries (80 ± 78) produisant plus de larves que les colonies non nourries (12 ± 6) (z = 11,91, p < 0,001).
Dans toutes les colonies, la reproduction a eu lieu avant la pleine lune (jour lunaire 15) (figure 3). Le jour lunaire moyen (DLM) de libération larvaire (pondéré par le taux de reproduction) variait du jour lunaire 6,5 au jour lunaire 11,1, avec une différence significative entre les traitements détectés uniquement entre les colonies « non nourries à 28 °C », qui se reproduisaient plus tôt dans le cycle lunaire, et les colonies « nourries à 24 °C », qui se reproduisaient plus tard dans le cycle lunaire (modèle linéaire à effets mixtes, contraste post hoc, t = 4,10, p = 0,006).
Au cours du mois précédant le suivi formel de la reproduction (août lunaire 2022), la densité des nauplius d’Artemia a été évaluée avant et après les séances d’alimentation ; cela a été répété à trois moments : au début de la culture du corail pour cette expérience (T0) et 2 semaines et 4 semaines après le début de la culture du corail dans les conditions de traitement (Figure 4). L’évaluation initiale à T0 n’a montré aucune différence entre la densité des nauplius d’Artemia avant et après l’alimentation dans les deux traitements thermiques. Après 2 semaines et 4 semaines de culture, la densité des nauplius d’Artemia était plus faible après l’alimentation dans les deux traitements à température (semaine 2 : ANOVA bidirectionnelle, F 1 104 = 128,45, p < 0,001 ; semaine 4 : ANOVA bidirectionnelle, F 1 104 = 294,71, p < 0,001). Il n’y avait pas de différence dans la densité avant l’alimentation entre les traitements à température (p > 0,05) ou la densité après l’alimentation entre les traitements à température (p > 0,05) à aucun des trois points de temps évalués.
Toutes les analyses ont été effectuées en R à l’aide des packages lme437, lmerTest 38, emmeans39, car 40 et Hmisc41. Les données et le script R utilisés pour les analyses sont accessibles au public sur GitHub (https://github.com/CJ-McRae/Lam-et-al_JoVE-submission).

Figure 1 : Schéma du plan expérimental et des matériaux représentatifs pour l’alimentation et la culture ex situ d’un corail scléractinien couvant. (A) Des colonies de Pocillopora acuta ont été élevées dans des bassins d’aquaculture à écoulement continu à 24 °C ou 28 °C dans des conditions d’alimentation et de non-alimentation ; Les cercles noirs représentent les colonies. (B) Les colonies ont été suspendues avec des lignes de pêche afin de réduire le stress lié à la manipulation et de favoriser un mouvement efficace entre les bassins d’élevage et d’alimentation. (C) Pendant les séances d’alimentation, toutes les colonies ont été déplacées dans un cadre grillagé à l’intérieur de bassins d’alimentation à température spécifique. Les colonies nourries étaient placées dans un compartiment du cadre et les colonies non nourries étaient placées dans l’autre compartiment du cadre ; Seules les colonies nourries recevaient de la nourriture. (D) Des nauplius d’Artemia enrichis ont été administrés aux colonies dans le traitement nourri deux fois par semaine. (E) Les colonies ont été placées dans des conteneurs de collecte de larves pendant la nuit pour quantifier le taux de reproduction quotidien au cours d’un cycle lunaire. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Rendement reproducteur des colonies de Pocillopora acuta à différentes températures (24 °C contre 28 °C) et traitements d’alimentation (nourris ou non nourris). Les lettres sont représentatives des différences significatives dans le rendement reproductif entre les traitements. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Période de reproduction des colonies de Pocillopora acuta à différentes températures (24 °C contre 28 °C) et traitements d’alimentation (nourris ou non nourris). La ligne pointillée verticale indique le jour lunaire moyen (DLM) de reproduction pour chaque traitement. Les tonalités de couleur à l’intérieur de chaque barre des parcelles spécifiques au traitement (A-D) indiquent la contribution des colonies individuelles à la reproduction totale quotidienne. Les lettres sont représentatives des différences significatives dans le moment de la reproduction entre les traitements. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Densité des nauplius d’Artemia avant et après les séances d’alimentation des coraux dans les traitements à 24 °C et 28 °C. La densité avant l’alimentation des coraux a été calculée avant l’alimentation des coraux, et la densité après l’alimentation a été calculée après la fin d’une session d’alimentation des coraux de 4 heures. La densité des nauplius d’Artemia a été évaluée au début de la culture corallienne (T0) puis après 2 semaines et 4 semaines dans des conditions de traitement dans un système d’aquaculture à flux continu. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont pas d’intérêts financiers concurrents ou d’autres conflits d’intérêts.
Le changement climatique a un impact sur les écosystèmes des récifs coralliens à l’échelle mondiale. Les coraux provenant de systèmes d’aquaculture ex situ peuvent aider à soutenir les efforts de restauration et de recherche. Ici, les techniques d’alimentation et de culture des coraux qui peuvent être utilisées pour favoriser le maintien à long terme des coraux scléractiniaires couveurs ex situ sont décrites.
Cette recherche a été financée par le ministère de la Science et de la Technologie (Taïwan), numéros de subvention MOST 111-2611-M-291-005 et MOST 111-2811-M-291-001.
| Kystes d’artémie  ; | Supreme plus | NA | Source de nourriture  ; |
| Refroidisseur | Resun | CL650 | Pour refroidir la température de l’eau si nécessaire |
| Conductimètre portable | WTW | Cond 3110 | Pour mesurer la salinité |
| Régimes d’enrichissement | Omega | NA | Utilisé dans la culture d’artémias |
| Ligne de pêche | Super | Nylon monofilament | Pour accrocher les colonies de coraux |
| Moteurs de débit | Maxspect | GP03 | Pour créer débit d’eau |
| Chauffage 350 W | ISTA | NA | Appareils de chauffage utilisés dans les réservoirs |
| HOBO Enregistreur de température suspendu | Ordinateur d’arrivée | UA-002-08 | Pour enregistrer la température de l’eau |
| Lumières LED | Mean Well | FTS : HLG-185H-36B | NA |
| Compteur portable de lumière | LI-COR | LI-250A | Appareil utilisé avec un capteur de lumière pour mesurer l’intensité lumineuse en PAR |
| Capteur de lumière | LI-COR | LI-193SA | NA |
| Filet à plancton 100 & micro ; m maille | Omega | NA | Pour collecter les larves et les artémias  ; |
| Pompe primaire 6000 L/H | Mr. Aqua | BP6000 | Pour puiser l’eau des réservoirs dans le refroidisseur |
| Courantomètre à hélice | KENEK | GR20 | Dispositif utilisé avec un détecteur à hélice pour mesurer le débit |
| Détecteur à hélice | KENEK | GR3T-2-20N | |
| NA Stéréomicroscope | Zeiss | Stemi 2000-C  ; | Pour compter le nombre d’artémies  ; |
| Régulateur de température 1000 W | Rep Park | O-RP-SDP-1 | Pour régler et maintenir la température de l’eau |