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Article de méthode

Application de l’analyse cytométrique en flux pour mesurer plusieurs paramètres mitochondriaux dans des organoïdes cérébraux 3D

1.6K vues

DOI :

10.3791/65621

4 août 2023

Dans cet article

Résumé

Ce protocole fait état d’une méthode unique d’utilisation d’un cytomètre en continu et de plusieurs anticorps pour l’évaluation simultanée de plusieurs paramètres fonctionnels mitochondriaux, y compris les modifications du volume mitochondrial, les quantités de sous-unités complexes de la chaîne respiratoire mitochondriale (MRC) et la réplication de l’ADN mitochondrial (ADNmt).

Résumé

Le dysfonctionnement mitochondrial est un contributeur primaire ou secondaire commun à de nombreux types de neurodégénérescence, et des modifications de la masse mitochondriale, des complexes de la chaîne respiratoire mitochondriale (MRC) et du nombre de copies de l’ADN mitochondrial (ADNmt) figurent souvent dans ces processus. Les organoïdes du cerveau humain dérivés de cellules souches pluripotentes induites humaines (iPSC) récapitulent l’arrangement cytoarchitectural tridimensionnel (3D) du cerveau et offrent la possibilité d’étudier les mécanismes de la maladie et de cribler de nouvelles thérapies dans un système humain complexe. Ici, nous rapportons une approche unique basée sur la cytométrie en flux pour mesurer plusieurs paramètres mitochondriaux dans les organoïdes corticaux dérivés d’iPSC. Ce rapport détaille un protocole pour générer des organoïdes cérébraux corticaux à partir d’iPSC, la dissociation unicellulaire des organoïdes générés, la fixation, la coloration et l’analyse cytométrique en flux ultérieure pour évaluer plusieurs paramètres mitochondriaux. La double coloration avec des anticorps contre la sous-unité du complexe MRC NADH : la sous-unité B10 (NDUFB10) de l’ubiquinone oxydoréductase ou le facteur de transcription mitochondrial A (TFAM) associée au canal sélectif des anions 1 dépendant de la tension (VDAC 1) permet d’évaluer la quantité de ces protéines par mitochondrie. Étant donné que la quantité de TFAM correspond à la quantité d’ADNmt, elle fournit une estimation indirecte du nombre de copies d’ADNmt par contenu mitochondrial. L’ensemble de cette procédure peut être complété en l’espace de 2 à 3 heures. De manière cruciale, il permet la quantification simultanée de plusieurs paramètres mitochondriaux, y compris les niveaux totaux et spécifiques relatifs à la masse mitochondriale.

Introduction

Les mitochondries sont des organites cellulaires essentiels et le principal site de production de l’adénosine triphosphate (ATP). En plus de fournir de l’énergie aux cellules, les mitochondries participent également à de multiples processus cellulaires, notamment la transmission de l’information cellulaire, la différenciation cellulaire et l’apoptose, et ont la capacité de réguler la croissance cellulaire et le cycle cellulaire. Des modifications de la fonction mitochondriale ont été identifiées dans diverses maladies neurodégénératives, notamment la maladie de Parkinson (MP)1,2

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Protocole

1. Différenciation des iPSC en organoïdes corticaux

  1. Préparation de plaques revêtues de matrice
    1. Décongelez le flacon de la matrice de membrane basale disponible dans le commerce sur de la glace pendant la nuit. Diluer à 1:100 dans du froid Advanced Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium/Ham’s F12 DMEM/F12 (concentration finale de 1 %). Faites des aliquotes et conservez-les à -20 °C (voir tableau des matériaux).
    2. Décongeler la solution matricielle membranaire à 4 °C (la garder froide) et enduire le nombre requis de puits (1 mL pour un puits dans une plaque à 6 puits). Incuber....

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Résultats

La figure 1 fournit une représentation schématique du processus de différenciation et des stratégies utilisées pour l’analyse cytométrique en flux. Des iPSC humaines ont été cultivées dans des plaques non adhérentes à 96 puits pour former des EB, puis transférées sur des plaques non adhérentes à 6 puits pour obtenir des organoïdes corticaux complètement développés. La composition cellulaire des organoïdes a été validée par microscopie confocale après immunomarquage avec des marqueurs neurona.......

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Discussion

Un protocole est présenté pour générer des organoïdes cérébraux corticaux à partir d’iPSC humaines et pour effectuer l’analyse cytométrique en flux des paramètres mitochondriaux dans des cellules uniques isolées de ces organoïdes. La composition cellulaire des organoïdes a été vérifiée par microscopie confocale avec coloration immunohistochimique pour les marqueurs des cellules neuronales et gliales. Il a été démontré que la stratégie de co-coloration basée sur la cytométrie en flux avec.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Nous exprimons notre sincère gratitude à Gareth John Sullivan de l’Institut des sciences médicales fondamentales de l’Université d’Oslo, en Norvège, pour nous avoir généreusement fourni la lignée cellulaire AG05836 (RRID :CVCL_2B58). Nous remercions chaleureusement le Centre d’imagerie moléculaire, Plateforme de cytométrie en flux de l’Université de Bergen en Norvège. Ce travail a été soutenu par les financements suivants : K.L a été partiellement soutenu par l’Université de Bergen Meltzers Høyskolefonds (numéro de projet : 103517133) et Gerda Meyer Nyquist Guldbrandson og Gerdt Meyer Nyquists legat (numéro de projet : 103816102). L.A....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Anticorps utilisant en cytométrie
anti-DUFB10 Alexa Fluor 405NOVUS biologiquesNBP2-72915AF405
anti-VDAC1 Alexa Fluor 647Santa cruz technologysc-390996
anti-TFAM Alexa Fluor 488Abcamab198308
L/D fixable near-IR deadcell stain kit Life technologiesL10119
Anticorps utilisant dans la coloration par
anti-Tuj1Abcamab78078
anti-SOX2  ;Abcamab97959
farine anti-Alexa 488Thermo Fisher ScientificA28175
farine anti-Alexa 594Thermo Fisher ScientificA-21442
Commercial cells
AG05836 (RRID :CVCL_2B58)Fourni par Gareth John Sullivan de l’Institut des sciences médicales fondamentales de l' Université d’Oslo, Norvège
Essential 8 Medium (milieu de culture iPSC)
Essential 8 Basal Medium  ;Thermo Fisher ScientificA1516901
Essential 8 Supplément (50x) 2 % (v/v)Thermo Fisher ScientificA1517101
Stocker à 4 ° ; C et réchauffez-vous à RT avant utilisation.
Instruments
Heracell 150i Incubateurs CO2Fisher Scientific, États-Unis
Agitateurs orbitaux - SSM1, SSL1Stuart Equipment, UK
CCD Microscope Camera Leica DFC3000 GLeica Microsystems, Allemagne
Water Bath Jb Academy Basic Jba5 JBA5 Grant InstrumentsGrant Instruments, États-Unis
Système d’aspiration de fluides Contrôle BVCVacuubrand, Allemagne
Leica TCS SP8 STED Microscope confocalLeica Microsystems, Allemagne
50 mL Falcon tubeSigma-AldrichCLS430828
BD LSR FortessaBD Biosciences, États-Unis
Flowjo Sampler AnalysisPipette FlowJo LLC, USA
10 mLSigma-AldrichSIAL1100
1, 10, 100, 1000 mLSigma-Aldrich
40 & micro ; m Cell starinerSigma-AldrichCLS431750
plaque 96 puits à fixation ultra-faibleS-BIOMS-9096UZ
Compteur de cellules automatisé Countess IIThermo Fisher Scientific
Neural differentiation medium  ; (NDM+)
DMEM/F12Life technologies11330032
Neurobasal mediumLife technologies2110349
Glutamax supplement 1 % (v/v)Life technologies35050
N2 supplement 0.5 % (v/v)Life technologies17502-048
B27 supplement 1 % (v/v)Life technologies17504-044
&beta ;-Mercaptoethanol 50 µ ; MSigma-aldrichM3148
BDNF 20 ng/mLPeprotech450-02
Acide ascorbique 200 µ ; MSigma-Aldrich  ;A92902
Magasin à 4° ; C jusqu’à 2 semaines
Milieu de différenciation neurale moins viatmin A (NDM-)
DMEM/F12Life technologies11330032
NeurobasalMedium Life technologies2110349
(v/v)Life technologies35050
N2 supplément 0,5 % (v/ v)Life technologies17502-048
B27 supplément W/O vit. A 1 % (v/v)Life technologies12587010
&beta ;-Mercaptoethanol 50 µ ; MSigma-aldrichM3148
Magasin à 4° ; C jusqu’à 8 jours
Neural Induction Medium (NIM)
DMEM/F12Life technologies11330032
Knockout serum replacement 15 % (v/v)Life technologies10828028
Glutamax supplement 1 % (v/v)Life technologies35050
&beta ;- Mercaptoéthanol 100 & micro ; MSigma-AldrichM3148
LDN-193189 100 nMStemgent/Reprocell04-0074
SB431542 10 & micro ; MTocris1614
XAV939 2 & micro ; MSigma-AldrichX3004
Boutique à 4° ; C jusqu’à 10 jours
Milieu de neutralisation
IMDMLife technologies21980032
FBS 10 %Sigma-Aldrich12103C
Autres réactifs
DPBS (sans Ca2+/Mg2+)Thermo Fisher Scientific14190250
Albumine sérique bovineEuropa BioproductsEQBAH62-1000
AccutaseLife technologiesA11105-01
GeltrexLife technologiesA1413302
EDTALife technologies15575038
Advanced DMEM / F12Life technologies12634010
Tissu neural kit de dissociationMiltenyi biotec130-092-628
Y-27632 dichlorhydrate Inhibiteur de rocheBiotechne Tocris1254
Fluoromount-G&trade ; Support de montageSouthernBiotech0100-20
PFAThermo Fisher Scientific28908
en fluximmunofluorescence Glutamax supplément 1 %

Références

  1. Bindoff, L. A., Birch-Machin, M., Cartlidge, N. E., Parker, W. D. Jr, Turnbull, D. M. Mitochondrial function in Parkinson's disease. The Lancet. 2 (8653), 49(1989).
  2. Gonzalez-Rodriguez, P., et al. Disruption of mitochondrial complex I induces progressive parkinsonism. Nature. 59....

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Réimpressions et autorisations

Mots-clés

Cytom trie en fluxorgano des d riv s d iPSCdysfonctionnement mitochondrialdissociation cellulaire uniquemasse mitochondrialecomplexes MRCmarquage TFAMnombre de copies d ADNmt
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