Les virus pseudotypés (PV) sont des outils moléculaires utilisés en microbiologie pour étudier les interactions hôte-virus et pathogène-pathogène 1,2,3,4. Les PV sont constitués d’une partie interne, le noyau viral qui protège le génome viral, et d’une partie externe, les glycoprotéines d’enveloppe à la surface du virus qui définissent le tropisme5. Un pseudovirus est incompétent en matière de réplication dans la cellule cible car il ne contient pas toute l’information génétique nécessaire pour générer de nouvelles particules virales. Cette combinaison de caractéristiques particulières fait des PV une alternative sûre à un virus de type sauvage. Les virus de type sauvage, en revanche, sont hautement pathogènes et ne peuvent pas être utilisés dans les laboratoires BSL 2 pour l’analyse6.
L’infectiosité des PV peut être surveillée par un gène rapporteur, généralement codant pour une protéine fluorescente (GFP, RFP, YFP) ou une enzyme qui produit des produits chimiluminescents (luciférase). Celui-ci est contenu dans l’un des plasmides utilisés pour la production de PV et incorporé dans le génome du pseudovirus7.
Il existe actuellement plusieurs types de cœurs photovoltaïques, notamment des particules dérivées de lentiviraux basées sur le génome du VIH-1. Le grand avantage des PV à base de VIH-1 par rapport aux autres plateformes est leur processus d’intégration intrinsèque dans le génome de la cellule cible8. Bien que le VIH-1 soit un virus très contagieux et qu’il soit l’agent causal du sida, ces vecteurs lentiviraux peuvent être utilisés en toute sécurité en raison des nombreuses étapes d’optimisation au fil des ans. Des conditions de sécurité optimales ont été obtenues avec l’introduction de vecteurs lentiviraux de 2e génération, dans lesquels les gènes viraux ont été appauvris sans influencer les capacités de transduction9. Les 3eet 4egénérations ont contribué à accroître la sécurité de la manipulation des vecteurs lentiviraux avec la division du génome viral en plasmides distincts10,11. Les dernières générations de PV sont généralement utilisées pour produire des vecteurs lentiviraux pour la thérapie génique.
Les PV peuvent être utilisés pour étudier les interactions entre les virus et les cellules hôtes, tant pendant les phases de production que d’infection. Les PV sont particulièrement utilisés dans les essais de neutralisation des pseudovirus (PVNA). Les PVNA sont largement validés pour évaluer le potentiel de neutralisation du sérum ou du plasma en ciblant la glycoprotéine virale sur l’enveloppe du PV12,13. L’activité de neutralisation, exprimée par la concentration inhibitrice 50 (CI50), est définie comme la dilution du sérum/plasma qui bloque 50 % de l’entrée des particules virales14. Dans ce protocole, nous avons décrit la mise en place d’un PVNA pour tester l’activité des anticorps contre le syndrome respiratoire aigu sévère - Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) dans des sérums prélevés avant et après avoir reçu une dose de rappel du vaccin.