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Research Article
Marina Cunquero1, Maria Marsal1, Gustavo Castro-Olvera1, Steven T. Walston2, F. Taygun Duvan2, José Gabriel Macias-Montero3, Carles Puigdengoles3, Mokhtar Chmeissani3, Jose A. Garrido2,4, Pablo Loza-Alvarez1
1Institut de Ciències Fotòniques (ICFO),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Catalan Institute of Nanoscience and Nanotechnology (ICN2), CSIC and BIST,Campus UAB, 3Institut de Física d'Altes Energies (IFAE),The Barcelona Institute of Science and Technology, Campus UAB, 4Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA)
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Les prothèses rétiniennes ont la capacité de générer des perceptions visuelles. Pour faire progresser le développement de nouvelles prothèses, des méthodes ex vivo sont nécessaires pour tester les dispositifs avant l’implantation. Cet article fournit un protocole complet pour étudier l’activité du calcium dans la couche de cellules ganglionnaires de la rétine lorsqu’elle est soumise à une stimulation électrique.
Les dystrophies rétiniennes sont l’une des principales causes de cécité dans le monde. Des efforts considérables sont en cours pour développer des prothèses rétiniennes avancées capables de contourner les cellules photoréceptrices sensibles à la lumière altérées dans la rétine dégénérée, dans le but de restaurer partiellement la vision en induisant des perceptions visuelles. Une piste de recherche courante concerne la conception et la production de dispositifs implantables avec une structure physique flexible, abritant un grand nombre d’électrodes. Cela permet de générer efficacement et précisément des perceptions visuelles. Cependant, à chaque avancée technologique, il est nécessaire de disposer d’une méthode ex vivo fiable et gérable pour vérifier la fonctionnalité de l’appareil avant de passer à des expériences in vivo , où des facteurs autres que les performances de l’appareil entrent en jeu. Cet article présente un protocole complet pour étudier l’activité calcique dans la couche de cellules ganglionnaires de la rétine (GCL) suite à une stimulation électrique. Plus précisément, les étapes suivantes sont décrites : (1) marquage fluorescent de la rétine de rat à l’aide d’indicateurs calciques génétiquement codés, (2) capture du signal de fluorescence à l’aide d’un microscope à fluorescence inversée tout en appliquant des modèles distincts de stimulation électrique, et (3) extraction et analyse des traces de calcium des cellules individuelles dans le GCL. En suivant cette procédure, les chercheurs peuvent tester efficacement de nouveaux protocoles de stimulation avant de mener des expériences in vivo .
La rétine contient des photorécepteurs, qui sont des cellules responsables de la détection de la lumière. Ils captent les photons et les convertissent en influx nerveux. Ces impulsions sont ensuite traitées dans la rétine et transmises au cortex visuel, ce qui entraîne la formation d’une image visuelle1. La rétinite pigmentaire (RP) et la dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA) sont des maladies dégénératives caractérisées par la perte progressive des photorécepteurs. Ces rétinopathies sont parmi les principales causes de cécité dans le monde1, affectant des millions de personnes et ayant des conséquences médicales, personnelles et socio-économiques importantes pour les patients, les systèmes de santé et la société dans son ensemble. De plus, avec le vieillissement de la population, on prévoit que les cas de DMLA augmenteront de 15 % d’ici 20502.
Actuellement, de nombreux efforts de recherche sont en cours pour restaurer la vision chez les patients atteints de ces affections3. Une approche prometteuse est l’utilisation de prothèses rétiniennes, qui ont démontré leur efficacité dans la restauration partielle de la vision 4,5. Ces appareils captent la lumière de la scène visuelle et la convertissent en impulsions électriques. Ces impulsions sont délivrées par des électrodes au sein d’un réseau de microélectrodes (MEA) implanté dans l’œil, stimulant les neurones survivants et contournant la fonction des photorécepteurs perdus. Les cellules ganglionnaires de la rétine activées (CGR) transmettent la sortie au cerveau, où elle est interprétée comme une perception visuelle. Cependant, les principales limites des implants actuels résident dans la résolution de l’interface électrode-tissu6 et la stimulation non sélective de différents types de cellules. Par conséquent, pour optimiser la conception de nouveaux dispositifs implantables pour une restauration plus efficace de la vision, il est crucial de comprendre comment des paradigmes de stimulation peuvent être développés pour activer sélectivement les cellules à proximité des électrodes.
L’imagerie calcique est une technique largement utilisée pour étudier l’activité neuronale, offrant plusieurs avantages par rapport aux méthodes non optiques 7,8. Tout d’abord, il fournit une résolution cellulaire et subcellulaire. Deuxièmement, les marqueurs calciques peuvent cibler des types de cellules spécifiques. Troisièmement, il permet un suivi à long terme, et quatrièmement, il permet d’observer des populations cellulaires entières tout en distinguant les cellules actives et inactives. Cette méthode fournit des preuves indirectes de l’activité cellulaire avec une résolution temporelle de l’ordre de quelques centaines de millisecondes. Les indicateurs de calcium fluorescents codés génétiquement, tels que les capteurs GCaMP, subissent un changement conformationnel lors de la liaison au calcium, ce qui entraîne une augmentation de la fluorescence9. Les vecteurs viraux adéno-associés (AAV) recombinants sont un moyen efficace de transduire les cellules rétiniennes avec GCaMP10.
Ce protocole présente une méthode efficace qui utilise l’imagerie calcique pour tester les protocoles de stimulation des implants rétiniens. Plus précisément, nous nous concentrons sur les tissus rétiniens de rat ex vivo et fournissons des instructions détaillées, étape par étape, de l’acquisition de l’échantillon à l’analyse des données. En proposant ce guide complet, les chercheurs de divers horizons peuvent se lancer dans l’expérimentation de la stimulation électrique en toute confiance.
Toutes les procédures animales ont été menées conformément aux directives standard en matière d’éthique animale (directive 86/609/UE des Communautés européennes) et approuvées par les comités locaux d’éthique animale. Des rats Long Evans âgés de 8 semaines ont été utilisés pour la présente étude. Les animaux ont été obtenus auprès d’une source commerciale (voir le tableau des matériaux).
1. Préparation du support et montage à plat
2. Marquage GCL et montage à plat de la rétine de rat
REMARQUE : Cette méthode de marquage ne différencie pas les CGR des cellules amacrines déplacées. Si un marquage sélectif des CGR est souhaité, envisager d’utiliser des AAV avec des promoteurs spécifiques des CGR11 et/ou un marquage rétrograde à travers le nerf optique12. Pour faire la distinction entre les classes de CGR ON et OFFCENTRÉS, classer les CGR en fonction de leur réponse à la lumière13,14 et utiliser des versions plus récentes d’indicateurs calciques génétiquement codés qui offrent une sensibilité accrue et la capacité de mesurer des potentiels d’action unique15.
3. Imagerie calcique ex vivo par stimulation électrique
NOTE : Dans ce travail, une MEA de preuve de concept a été utilisée pour l’expérimentation ex vivo . Les MEA personnalisés ont été fabriqués avec des électrodes poreuses à base de graphène de 25 μm de diamètre sur du verre borosilicaté de 500 μm d’épaisseur avec des traces de Ti/Au, puis isolées avec du nitrure de silicium et de la résine photosensible SU-812. Cependant, les méthodes d’imagerie calcique sont valables quel que soit le matériau de l’électrode utilisé pour la stimulation.
4. Analyse des données
Le protocole décrit dans cette étude est basé sur les études d’imagerie par fluorescence et de stimulation électrique menées par Weitz et al.12. Le protocole se compose de trois parties principales : (1) le marquage fluorescent du GCL et le montage à plat de la rétine sur le MEA (Figure 1 à gauche), (2) la visualisation de l’activité calcique dans le GCL pendant la stimulation électrique (Figure 1 au milieu) et (3) l’extraction, le traitement et l’interprétation des données d’imagerie (Figure 1 à droite).
Tout d’abord, comme le montre la figure 1 à gauche, des rats Long Evans reçoivent une injection intravitrée d’AAV2-CAG-GCaMP5G avant la séance d’imagerie. L’expression virale optimale de ce vecteur se produit 2 à 3 semaines après l’injection12,18. Après l’anesthésie complète de l’animal, un trou pilote est pratiqué à l’aide d’une aiguille de 30 G, puis 5 μL d’AAV2-CAG-GCaMP5G sont lentement injectés dans le vitré à l’aide d’une aiguille émoussée de 36 G attachée à une seringue de précision pour éviter le reflux. Au cours de l’expression virale, un système d’imagerie rétinienne in vivo est utilisé pour évaluer l’état de la rétine après la chirurgie, les images OCT fournissant une visualisation détaillée des couches rétiniennes. Une fois l’expression des gènes atteinte, la rétine est soigneusement extraite de l’œilleton à l’aide d’un stéréomicroscope et d’outils de dissection de haute précision. À partir de ce moment, le tissu est manipulé dans un milieu oxygéné pour préserver l’échantillon. La rétine excisée, avec le GCL vers le haut, est ensuite montée sur une plate-forme conçue pour un montage à plat afin d’assurer la stabilité et d’empêcher l’échantillon de flotter. L’échantillon est monté sur la surface MEA avec le GCL face aux électrodes.
Ensuite, le MEA est monté sur sa carte d’interface sur un microscope fluorescent inversé (Figure 1 au milieu). L’échantillon rétinien est perfusé avec un milieu oxygéné à 33 °C à l’aide d’un système de perfusion. L’échantillon peut être conservé dans cette configuration pendant plusieurs heures. Le schéma de stimulation souhaité est programmé et les images sont acquises à un rythme de 10 images par seconde. Il est recommandé de nommer les films en fonction des paramètres de stimulation électrique appliqués. L’acquisition d’images doit commencer avant le début de la stimulation afin d’obtenir des images de base sans stimulation, ce qui servira de contrôle négatif.
Enfin, comme l’illustre la figure 1 à droite, les données sont extraites des images en accéléré en segmentant les somas cellulaires. Les effets de photoblanchiment sont corrigés en ajustant les données, et les cellules réactives sont identifiées. Les cellules réactives sont définies comme celles dont les pics de fluorescence pendant la stimulation dépassent leur ligne de base de 2,5 fois. Si une cellule répond à trois des cinq rafales de stimulation, elle est considérée comme réceptive à ce train spécifique de stimulation.

Figure 1 : Vue d’ensemble de l’étude. Illustration schématique du protocole de marquage par fluorescence (à gauche) du GCL de la rétine et du montage de l’échantillon, (au milieu) de la préparation des enregistrements ex vivo avec stimulation électrique fournie par un MEA, et (à droite) de l’analyse des données d’imagerie calcique pour classer les cellules réactives. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Rétine injectée intravitréenne
L’incidence des complications associées aux injections intravitréennes est très faible. Cependant, certaines complications peuvent découler de la chirurgie elle-même, quel que soit le composant injecté. Ces complications comprennent la formation de cataractes, l’hémorragie du vitré, l’élévation de la pression intraoculaire et l’endophtalmie23. Pour déterminer si ces complications sont causées par la chirurgie, l’animal doit subir une évaluation avant l’intervention à l’aide d’une funduscopie et d’une OCT. Trois jours après l’injection, les animaux doivent être suivis. Sur la figure 2A-D, la rétine d’un animal sain ayant reçu l’injection est représentée. Après deux semaines d’injection, les CGR commencent à exprimer une fluorescence, qui peut être visualisée à l’aide d’une fluorescence (Figure 2B,C). Les images OCT fournissent une visualisation détaillée de la disposition et de l’épaisseur des couches rétiniennes (Figure 2D), offrant une résolution plus élevée par rapport au fond d’œil, en particulier lors de l’évaluation du décollement de la rétine. Une fois que la rétine est montée à plat et imagée à l’aide d’un microscope à fluorescence inversée, il devient possible de distinguer les cellules et les faisceaux axonaux. Contrairement à d’autres indicateurs calciques, l’indicateur GCaMP est limité au cytoplasme7 et la fluorescence est exclue du noyau (Figure 2E).

Figure 2 : Images représentatives de la rétine injectée intravitréenne. (A) fundoscopie, (B) fond d’œil à fluorescence, (C) zoom avant du fond d’œil à fluorescence, (D) image OCT et (E) image d’épifluorescence de la rétine excisée montée sur un MEA personnalisé avec des électrodes à base de graphène sur du verre borosilicaté de 500 μm d’épaisseur. En (E), les lignes noires correspondent aux traces Ti/Au. Barres d’échelle : 115 μm (D) et 100 μm (E). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Électrodes et contact GCL
Afin d’évoquer efficacement les réponses neuronales, il est crucial de s’assurer que la rétine montée à plat est en contact étroit avec la surface de l’AME. Un moyen simple de le vérifier est de vérifier visuellement si les cellules et les électrodes sont situées dans le même plan focal (Figure 3A). Si les cellules ne sont pas dans le même plan focal que les électrodes (Figure 3B), cela indique que le contact n’est pas optimal, ce qui se traduira par une stimulation moins efficace.

Figure 3 : Électrodes et contact GCL. (A) Cellules et électrode (astérisque) dans le même plan focal. (B) Les cellules et les électrodes ne sont pas dans le même plan focal, ce qui indique un contact sous-optimal pour la stimulation électrique dans cette zone. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Imagerie calcique ex vivo par stimulation électrique fournie par un MEA
Les données obtenues par imagerie calcique consistent en des images en accéléré qui surveillent l’activité neuronale de centaines de cellules en réponse à une stimulation électrique. Les stimuli supraseuils provoquent un afflux de calcium dans les somas cellulaires, ce qui entraîne un changement soudain de l’intensité de la fluorescence (vidéo 1). Ce protocole permet de déterminer si une électrode, un MEA et/ou un algorithme de stimulation suscite la réponse souhaitée dans le tissu neural. La taille et le pas des électrodes sur le MEA, ainsi que la proportion de tissu étudié, détermineront le grossissement objectif approprié à choisir. En règle générale, pour les études de stimulation à électrode unique avec des diamètres allant de 5 μm à 100 μm, un grossissement d’objectif de 20 à 25x convient (Figure 4A), fournissant un champ de vision d’environ 600 μm x 600 μm. Pour les expériences impliquant une stimulation avec plusieurs électrodes, un grossissement de l’objectif de 4 à 10x peut être nécessaire pour évaluer une zone plus large d’environ 2 mm x 2 mm. Les cellules réactives peuvent être facilement identifiées en générant une projection d’image par écart-type de la vidéo en accéléré (Figure 4B et Vidéo 1).

Figure 4 : Imagerie calcique du GCL avec stimulation électrique fournie par une électrode de 25 μm de diamètre. (A) Projection maximale d’un film time-lapse de 60 s et (B) projection de l’écart-type représentant clairement les cellules qui répondent aux stimuli électriques d’une électrode poreuse à base de graphène de 25 μm de diamètre. L’électrode de stimulation est indiquée par un astérisque. Barre d’échelle : 50 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Analyse de la dynamique du calcium au cours du temps lors d’une stimulation contrôlée
Pour chaque soma cellulaire identifié, les valeurs moyennes d’intensité ont été extraites au fil du temps. La figure 5A montre les traces de calcium corrigées par photoblanchiment des cellules réceptives. Dans cet exemple, cinq rafales de trains d’impulsions biphasiques (cathodique d’abord, 40 cycles, durée de 1 ms, amplitude de 2 μA) ont été délivrées toutes les 10 s (indiquées par des lignes noires) au cours d’une acquisition d’image de 60 s. Dans le cadre d’une expérience donnée, les cinq mêmes trains d’impulsions sont appliqués pour tester la cohérence de la réponse. Les images capturées pendant les périodes non stimulantes (surlignées en rouge) sont utilisées pour effectuer un ajustement linéaire, en corrigeant l’effet de photoblanchiment.
Une fois que les cellules répondantes sont identifiées et que leurs coordonnées (x,y) sont connues par rapport à l’électrode de stimulation, on peut examiner la relation entre le courant nécessaire pour activer les cellules et la distance de l’électrode de stimulation (Figure 5B). Comme on pouvait s’y attendre, les cellules situées plus près de l’électrode de stimulation ont besoin de valeurs de courant plus faibles pour susciter une réponse.

Figure 5 : Représentation des réponses évoquées électriquement. (A) Traces calciques de somas cellulaires sur 5 rafales de trains d’impulsions (biphasique, cathodique d’abord, 40 cycles, durée de 1 ms, amplitude de 2 μA) toutes les 10 s (lignes noires) au cours d’une acquisition d’image de 60 s. Les périodes non stimulantes (images surlignées en rouge) et stimulantes (images surlignées en jaune) sont affichées. Les traces dépassant de 2,5 fois le signal de base (racine carrée moyenne des périodes non stimulantes) sont considérées comme des réponses évoquées. Les cellules qui répondent dans trois des cinq périodes de stimulation sont classées comme des cellules répondantes. (B) Carte de distribution de l’activité calcique montrant l’électrode de stimulation (cercle encadré en noir) et les cellules (cercle en gris). Le code couleur représente l’amplitude d’impulsion minimale nécessaire pour provoquer une réponse cellulaire. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Vidéo 1 : Imagerie calcique du GCL avec stimulation électrique fournie par une électrode de 25 μm de diamètre. La vidéo montre les différences d’intensité de fluorescence dues à la stimulation électrique d’une électrode poreuse à base de graphène de 25 μm de diamètre. Le côté gauche montre le film original et le côté droit montre la projection de l’écart-type où les cellules répondantes peuvent être facilement identifiées. Barre d’échelle : 50 μm. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo.
Les auteurs n’ont aucune divulgation à ajouter au manuscrit.
Les prothèses rétiniennes ont la capacité de générer des perceptions visuelles. Pour faire progresser le développement de nouvelles prothèses, des méthodes ex vivo sont nécessaires pour tester les dispositifs avant l’implantation. Cet article fournit un protocole complet pour étudier l’activité du calcium dans la couche de cellules ganglionnaires de la rétine lorsqu’elle est soumise à une stimulation électrique.
Nous remercions Merche Rivas, Angel Sandoval, Jesús Planagumà, Jordi Cortés, Sandra Ortonobés Lara et Alina Hirschmann (ICFO-Institut de Ciències Fotòniques) pour leur soutien technique, Anna Duarri (VHIR, Institut de recherche Vall d’Hebron) du groupe de recherche en ophtalmologie pour leur soutien avec les injections intravitréennes et l’imagerie rétinienne in vivo .
Les organismes de financement qui ont soutenu ce travail sont : Fundació CELLEX ; Fundació Mir-Puig ; Programme Ministerio de Economía y Competitividad - Severo Ochoa pour les centres d’excellence en R&D (CEX2019-000910-S, [MCIN/AEI/10.13039/501100011033]) ; Generalitat de Catalunya à travers le programme CERCA ; Laserlab-Europe (EU-H2020 GA n° 871124) ; Fondation La Caixa (LCF/HR19/52160003) ; et Fondo Social Europeo (PRE2020-095721, M.C.).
| 20x NA 0.75 S Objectif à air fluor | Nikon | CFI Super Fluor 20X-3.5 | |
| cm Plat de culture cellulaire | Nunc | 12-565-90-30 | |
| Aiguille G | VWR | 613-5373-36 | |
| G Aiguille émoussée | World Precision Instruments | NF36BL-2-6 | |
| cm Plat de culture cellulaire | Nunc | 12-565-94-AAV2-CAG-GCaMP5G||
|   ; | Vector Biolabs | - | - |
| Ames' Medium | Sigma Aldrich | A1420-Blade | |
| Swann-morton | 0308-Caméra | ||
| Hamamatsu | ORCA Flash v4.0-Carbogen | ||
| Air liquide | - | - | |
| Curved-forceps  ; | - | - | - |
| Ciseaux à ressort fins | FST | 91501-09-FITC | |
| cube de filtre | Nikon | Série | Standard-Lampe |
| fluorescente | Nikon  ; | C-HGFI-Stéréomicroscope | |
| fluorescent  ; | Nikon | SMZ25-HBSS | |
| Capricorn | HBSS-1A-ImageJ | ||
| /FIDJI  ; | NIH | v1.50i-Système | |
| d’imagerie rétinienne in vivo | Phoenix Research Laboratories | Micron | III-Microscope |
| à fluorescence inversée | Nikon | Eclipse | Ti-Isofluorane |
| Arrane Baxter Laboratories | - | - | |
| Long-Evans rat | Janvier | - | - |
| MATLAB (Version R2021b)  ; | Mathworks | - | - |
| Filtres à médias | Merckmillipore | ||
| SCGPS02RE-Methocel 2 % | Omni Vision | - | - |
| Réseau de microélectrodes (MEA) | - | NaHCO | |
| 3 | Thermofisher | 42427-Pénicilline | |
| /Streptomycine 100x | Thermofisher | 15140122 | - |
| phényléphrine | alcon cusí ; Laboratoires | 653437.3 | 100 mg/mL |
| Pipette en plastique | VWR | 612-1793-Membrane | |
| poreuse | Merckmillipore | #JVWP01300-Seringue de | |
| précision | World Precision Instruments | 10 µ ; l | Nanofil-Prescaina|
| Llorens-Chlorhydrate | d’oxybuprocaïne | (2 mg/mL), anesthésique local | |
| Masque nasal de rat | Xenotec | XRK-RA-Petite | |
| pince incurvée  ; | Bbraun | AESCBD311R-Ciseaux-à-ressorts | |
|   ; | FST | 15040-11-Stéréomicroscope | |
| Zeiss | Stemi 2000-Pince | ||
| droite  ; | FST | 11252-20-Suture | |
| filament | Vitrex Medical | 4328 | Nilon monofilament, 7/0, DS12 |
| Tobradex | Alcon Cusí ; | Laboratoires-Tobramycine (3 mg/mL) et dexaméthasone (1 mg/mL) | |
| Tropicamide | Alcon Cusí ; Laboratoires | 653486 | Laveuse 10 mg/mL |
| Thorlabs | W8S038 | - |