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En raison de sa relative simplicité et de sa facilité d’utilisation, la transfection transitoire de lignées cellulaires de mammifères avec des acides nucléiques est devenue un pilier de la recherche biomédicale. Bien que la plupart des lignées cellulaires largement utilisées aient des protocoles robustes pour la transfection en culture bidimensionnelle adhérente, ces protocoles ne se traduisent souvent pas bien pour les lignées moins étudiées ou celles dont la morphologie est atypique et difficile à transfecter. En utilisant des cellules souches pluripotentes de souris cultivées dans un milieu 2i/LIF, un modèle de culture largement utilisé pour la médecine régénérative, cette méthode décrit un protocole de transfection inverse optimisé et rapide capable d’atteindre une plus grande efficacité de transfection. En s’appuyant sur ce protocole, une poly-transfection à trois plasmides est effectuée, tirant parti de l’efficacité supérieure à la normale dans l’administration des plasmides pour étudier une gamme élargie de stœchiométrie plasmidique. Ce protocole de poly-transfection inverse permet une méthode expérimentale en un seul pot, permettant aux utilisateurs d’optimiser les rapports plasmidiques dans un seul puits, plutôt que sur plusieurs co-transfections. En facilitant l’exploration rapide de l’effet de la stœchiométrie de l’ADN sur la fonction globale des circuits génétiques délivrés, ce protocole minimise le temps et le coût de la transfection de cellules souches embryonnaires.