Ce protocole rationalise la production de vecteurs rétroviraux et la transduction des lymphocytes T murins, facilitant ainsi la génération efficace de cellules CAR-T chez la souris.
Article de méthode
Ce protocole rationalise la production de vecteurs rétroviraux et la transduction des lymphocytes T murins, facilitant ainsi la génération efficace de cellules CAR-T chez la souris.
Les thérapies cellulaires modifiées utilisant des cellules T à récepteur antigénique chimérique (CAR)-T ont atteint une efficacité remarquable chez les personnes atteintes d’hémopathies malignes et sont actuellement en cours de développement pour le traitement de diverses tumeurs solides. Jusqu’à présent, l’évaluation préliminaire de nouveaux produits cellulaires CAR-T a principalement eu lieu dans des modèles tumoraux de xénogreffe utilisant des souris immunodéficientes. Cette approche est choisie pour faciliter la prise de greffe réussie de cellules CAR-T humaines dans le cadre expérimental. Cependant, les modèles murins syngéniques, dans lesquels les tumeurs et les cellules CAR-T sont dérivées de la même souche de souris, permettent d’évaluer les nouvelles technologies CAR dans le contexte d’un système immunitaire fonctionnel et d’un microenvironnement tumoral complet (TME). Le protocole décrit ici vise à rationaliser le processus de génération de cellules CAR-T chez la souris en présentant des méthodes standardisées pour la transduction rétrovirale et la culture ex vivo de cellules T. Les méthodes décrites dans ce protocole peuvent être appliquées à d’autres constructions de CAR au-delà de celles utilisées dans cette étude pour permettre l’évaluation de routine de nouvelles technologies de CAR dans les systèmes immunocompétents.
Les thérapies adoptives à base de lymphocytes T exprimant des récepteurs antigéniques chimériques (CAR) ont révolutionné le domaine de l’immunothérapie du cancer en exploitant la puissance du système immunitaire adaptatif pour cibler et éliminer spécifiquement les cellules cancéreuses antigéniques positives1. Bien que le succès des thérapies cellulaires CAR-T ciblant les tumeurs malignes à cellules B ait été validé cliniquement, les études précliniques réalisées sur des modèles animaux restent vitales pour le développement de nouvelles thérapies CAR-T ciblant les tumeurs solides. Cependant, une efficacité clinique limitée a été démontrée jusqu’à présent dans les indications de tumeurs solides, et il devient de plus en plus évident que les modèles précliniques individuels ne prédisent pas avec précision la pharmacodynamie et l’efficacité clinique d’un médicament vivant 2,3. Par conséquent, les chercheurs ont commencé à élargir l’étude préclinique des produits cellulaires CAR-T pour inclure des évaluations parallèles dans des modèles xénogreffiques et syngéniques de cancers humains et murins, respectivement.
Contrairement aux modèles de xénogreffe, où les tumeurs humaines et les lymphocytes T sont greffés dans des souris immunodéficientes, les modèles syngéniques permettent d’examiner les réponses des cellules CAR-T dans le contexte d’un système immunitaire fonctionnel. Plus précisément, les souris immunocompétentes porteuses de tumeurs syngéniques fournissent un système permettant d’étudier l’interaction entre les lymphocytes T transférés par adoption et les milieux spécifiques au contexte, y compris les macrophages associés aux tumeurs (TAM) et les lymphocytes T régulateurs (Tregs) connus pour supprimer la fonction des lymphocytes T dans le microenvironnement tumoral (ETM4,5,6). De plus, les modèles syngéniques offrent une plate-forme supplémentaire pour évaluer la toxicité sur cible, hors tumeur, et l’interaction des cellules CAR-T avec les facteurs de l’hôte qui peuvent conduire à des toxicités supplémentaires, y compris le syndrome de libération de cytokines7.
Malgré ces avantages, le nombre d’études sur les cellules CAR-T syngéniques reste limité. Notamment, les modèles syngéniques nécessitent l’ingénierie autologue de cellules CAR-T de la même souche de souris et présentent donc un défi supplémentaire en raison de l’absence de méthodologie pour une transduction efficace des cellules T murines et une expansion ex vivo 2,8. Ce protocole décrit les méthodes permettant d’obtenir une expression stable de CAR grâce à la production de vecteurs rétroviraux et à l’optimisation de la transduction des lymphocytes T. Un schéma de l’ensemble du processus est présenté à la figure 1. L’utilisation de cette approche démontre l’efficacité de la transduction rétrovirale des cellules CAR-T murines et l’obtention d’une expression élevée de CAR sans avoir besoin d’une concentration virale par ultracentrifugation. Des stratégies visant à modifier la spécificité antigénique de la construction CAR sont discutées en plus de la co-expression de transgènes supplémentaires.
Toutes les procédures animales ont été effectuées avec l’approbation de l’Institutional Animal Care and Use Committee (Université Columbia, protocoles AC-AABQ5551 et AC-AAAZ4470) en utilisant des souris femelles BALB/c ou CF57BL/6 âgées de 6 à 8 semaines pesant entre 20 et 25 g. Les animaux ont été obtenus auprès d’une source commerciale (voir le tableau des matériaux). Ce protocole est structuré autour des « jours post-activation » des lymphocytes T murins, et la production virale commence au jour -2. Le rétrovirus peut être stocké à -80 °C après la production initiale, et pour une utilisation future de ce protocole, on peut commencer par l’étape 2, l’isolement et l’activation des lymphocytes T au jour 0.
1. Production de vecteurs rétroviraux
NOTA : Les produits viraux ont été rendus défectueux en raison de la séparation des gènes d’emballage en deux plasmides distincts (voir le tableau des matériaux), ce qui réduit considérablement la probabilité d’événements de recombinaison et de production accidentelle de virus compétents pour la réplication.
2. Isolement des lymphocytes T murins
3. Transduction des lymphocytes T murins
Le protocole décrit ici vise à standardiser le processus de transduction des lymphocytes T murins pour la génération de cellules CAR-T de souris. La figure 1 fournit une description détaillée des étapes à suivre. Le processus commence par la production de vecteurs rétroviraux par co-transfection de composants viraux dans des cellules Phoenix Eco. La figure 2 fournit une image de la densité optimale des cellules Phoenix Eco le jour de la transfection. Les lymphocytes T isolés sont ensuite activés 24 h après la transfection, ou « Jour 0 » de ce protocole, en préparation de la transduction le Jour 1. Après transduction, les cellules CAR-T sont cultivées en présence d’IL-7 et d’IL-15 humaines recombinantes afin d’obtenir une expansion de pli suffisante tout en préservant les populations mémoires de cellules souches.
L’utilisation du kit d’isolement des lymphocytes T murins recommandé (voir le tableau des matériaux) avec ce protocole permet d’obtenir des puretés des lymphocytes T de <98 % avant la transduction, telles que déterminées par cytométrie en flux (Figure 3A). De plus, des taux d’expression reproductibles de CAR de 65 % à 75 % peuvent être obtenus en utilisant ce protocole et le vecteur rétroviral pMSCV modifié pour exprimer la construction CAR à partir d’un promoteur PGK (Figure 3B,C). La détermination du titre rétroviral révèle des titres allant jusqu’à ~2 x 107 TU/mL et une expression de CAR de 74 % avec 1/3du surnageant viral récolté après co-transfection du pMSCV avec le pCL-Eco (Figure supplémentaire 1).
Enfin, la culture ex vivo avec 10 ng/mL d’IL-7 et d’IL-15 conduit à une expansion d’environ 15 fois, ce qui donne ~150 x 10 cellulesT 6 au jour 10 après l’activation à partir d’une seule rate (Figure 3D). La culture avec l’IL-7 et l’IL-15 conduit à des fréquences comparables des lymphocytes T CD8+ et CD4+ (Figure 3E) et à des populations mémoire de cellules souches préservées déterminées par l’expression de CD62L+CD44- après 10 jours de culture ex vivo (Figure 3F).

Figure 1 : Vue d’ensemble du protocole. Panneau supérieur : une vue d’ensemble schématique de la chronologie du protocole. Panneau inférieur : Instructions étape par étape pour la production de vecteurs rétroviraux et la transduction des lymphocytes T de souris. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Densité cellulaire optimale pour la transfection. Image microscopique à fond clair des cellules Phoenix Eco à la densité optimale avant transfection avec pMSCV et pCL-Eco. Capturé à l’aide d’un objectif 10x. Barre d’échelle = 200 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Production de cellules CAR-T murines et culture ex vivo. (A) Diagramme de cytométrie en flux montrant la fréquence des cellules BALB/c CD3+ après l’isolement des lymphocytes T murins. (B) Représentation schématique du vecteur rétroviral pMSCV utilisé pour l’expression de la GFP-CAR dans les lymphocytes T murins. (C) Histogrammes de cytométrie en flux démontrant l’expression de surface de CAR sur les lymphocytes T de souris après incubation avec de la sfGFP purifiée. UT, non transduit. (D) Expansion du pli des cellules CAR-T au jour 10 après l’activation et culture avec de l’IL-17 et de l’IL-15 humaines recombinantes. Environ 8 x 106 lymphocytes T murins ont été activés avant la transduction et ont atteint environ 1,28 x 108 au jour 10 après l’activation. (E) Diagramme de cytométrie en flux montrant la fréquence des cellules CAR-T CD8+ et CD4+ au jour 10 après l’activation. (F) Diagramme de cytométrie en flux démontrant la fréquence des populations mémoires de lymphocytes T CD8+ déterminée par l’expression de surface de CD62L et CD44. La mémoire des cellules souches (TSCM) est caractérisée par CD62L+CD44-, la mémoire centrale (MTC) par CD62L+CD44+ et la mémoire effectrice (MET) par CD62L-CD44+. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Tableau 1 : Formulation des milieux de culture cellulaire. Les détails de la formulation des milieux de culture cellulaire utilisés dans le protocole. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce tableau.
Figure supplémentaire 1 : Expression de surface du CAR et titres rétroviraux. (A) Histogrammes de cytométrie en flux montrant l’expression de surface de CAR sur les lymphocytes T BALB/c après incubation avec sfGFP purifié. Le rétrovirus a été généré par transfection de cellules Phoenix Eco avec pMSCV_PGK_mGFP28z en combinaison avec pCL-Eco et pMD2.G (I), pCL-Eco (II) ou seul (III). Les lymphocytes T ont été transduits avec un rétrovirus dilué comme indiqué. (B) Titres rétroviraux déterminés par l’expression de surface CAR des lymphocytes T transduits. Les unités de transduction (TU)/mL ont été calculées à l’aide de la formule : (N∙F∙D)/V, où N est le nombre de cellules transduites (1 x 105), F est la fréquence des cellules CAR+ , D est le facteur de dilution et V est le volume de transduction en mL (0,2 mL). Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Fichier supplémentaire 1 : séquence vectorielle d’expression pMSCV. La séquence du CAR GFP28z et les séquences flanquantes (en italique) dans le vecteur d’expression pMSCV, avec les sites enzymatiques NotI et BamHI surlignés en bleu. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Ce protocole décrit les étapes et les réactifs nécessaires à la transduction rétrovirale des lymphocytes T murins afin de générer des lymphocytes CAR-T pour des études in vivo . L’optimisation des conditions de transduction rétrovirale permet d’obtenir une expression robuste de la CAR sans avoir besoin d’une concentration virale par ultracentrifugation ou réactifs supplémentaires. Cependant, il existe de multiples modifications qui peuvent être appliquées à cette méthodologie.
Bien que ce protocole décrive l’exemple de génération d’un CAR spécifique à la GFP, ces méthodes peuvent être adaptées pour générer des cellules CAR-T de souris ciblant n’importe quel antigène extracellulaire d’intérêt. Le vecteur rétroviral pMSCV_PGK utilisé dans cette étude permet la libération efficace de la séquence de nanocorps spécifique à la GFP par digestion enzymatique avec NotI et BamHI et peut être remplacé par un domaine de reconnaissance de l’antigène défini par l’utilisateur tel qu’un scFv, un nanocorps ou un domaine de liaison au ligand (Fichier supplémentaire 1). Pour faciliter l’évaluation de l’expression alternative de CAR, il est recommandé de concevoir des CAR avec un marqueur d’épitope N-terminal, tel que des marqueurs Myc (EQKLISEEDL) ou Flag (DYKDDDDK), qui peuvent être détectés à l’aide d’anticorps conjugués fluorescents12. De plus, la présente étude démontre la production d’un seul transgène ; cependant, l’incorporation de peptides auto-clivants (séquences 2A) ou de sites d’entrée internes des ribosomes (IRES) permettrait la coproduction de plusieurs transgènes, y compris des technologies supplémentaires pour améliorer la fonction des lymphocytes T in vivo 8,13,14.
Bien que ce protocole ait été élaboré pour éliminer le besoin d’équipement spécialisé en omettant l’ultracentrifugation (24 000 x g, 2 h, 4 °C), il convient de noter que la concentration du surnageant viral peut permettre d’obtenir des titres viraux plus élevés et de réduire le volume de virus nécessaire pour atteindre une expression élevée de CAR8. Ce protocole rationalise en outre la production de vecteurs rétroviraux en obtenant des titres viraux élevés reproductibles (~2 x 107 TU/mL) et une expression stable du CAR sans qu’il soit nécessaire de déterminer le titre viral avant utilisation. Cependant, en plus de faciliter la normalisation, la détermination du titre viral avant la transduction des lymphocytes T peut également augmenter la viabilité des lymphocytes T en réduisant la toxicité potentielle causée par des concentrations virales inutilement élevées10,15.
Une supplémentation en IL-7 et IL-15 est recommandée pour favoriser l’expansion des lymphocytes T et préserver les populations mémoires des lymphocytes T ; cependant, l’IL-2 humaine recombinante peut être utilisée comme alternative pour réduire le nombre de réactifs nécessaires à la culture ex vivo 16,17,18,19. Néanmoins, les méthodes de génération de cellules CAR-T décrites ici restent limitées par l’expansion relativement faible des cellules T murines. Cependant, les mesures visant à améliorer la viabilité des lymphocytes T discutées ci-dessus pourraient être encore améliorées en incluant des suppléments supplémentaires et du 2-ME dans le milieu de culture mTCM tout au long du processus de transduction20. Bien que ces modifications puissent améliorer l’expansion des lymphocytes T de 15 fois à 20 fois20, elles peuvent entraîner une efficacité de transduction plus faible et une expression réduite du CAR.
En fin de compte, la production de cellules CAR-T murines permet le développement de modèles syngéniques pour évaluer la fonction des cellules CAR-T au sein d’un système immunitaire intact, ce qui facilite une évaluation contextuelle de leur puissance, de leur durabilité et de leur sécurité. Alors que les modèles chez les souris immunodéficientes permettent d’importantes études précliniques d’un produit de lymphocyte T humain ciblant un antigène tumoral humain. La combinaison de ces systèmes modèles complémentaires sera indispensable pour comprendre la complexité de la biologie cellulaire CAR-T, optimiser de nouvelles conceptions CAR et, en fin de compte, traduire les résultats précliniques en thérapies cliniques efficaces.
Aucun conflit d’intérêts n’a été déclaré.
Nous remercions L. Brockmann pour la relecture critique du manuscrit. Ce travail a été soutenu par NIH 1R01EB030352 et UL1 TR001873.
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| 0,45 &mu ; m filters | MilliporeSigma | SLHVR33RS | |
| seringue de 1 mL ; | Fisher Scientific ; | 14-955-450 | |
| Tubes de microcentrifugation de 1,5 mL | Fisher Scientific ; | 05-408-135 | |
| Seringue de 10 mL | BD | 14-823-16E | |
| 100 &mu ; m passoire | Corning | 07-201-432 | |
| 15 cm Boîtes de culture cellulaire traitées TC | ThermoFisher Scientific ; | ||
| tubes coniques de 15 mL | Faucon | 14-959-70C | |
| 40 &mu ; crépine M ; | Corning | 07-201-430 | |
| Tubes coniques de 50 mL | Faucon | 14-959-49A | |
| 70 &mu ; m passoire | Corning | 07-201-431 | |
| Attune NxT Cytomètre en flux ; | ThermoFisher Scientific ; | ||
| BALB/C, 6-8 semaines ; | Jackson Laboratory | 651 | |
| B-Mercaptoéthanol ; | Gibco | 21985023 | |
| Albumine sérique bovine | GOLDBIO | A-420-500 | |
| DMEM Medium | Gibco | 11965092 | |
| Dulbecco’s Saline tamponnée au phosphate (PBS), sans calcium ni magnésium. | Gibco | 14-190-250 | |
| DynaMag-2 Aimant ; | Invitrogen | 12-321-D | |
| EasySep Aimant ; | Stemcell Technologies | 18000 | |
| EasySep Kit d’isolement des lymphocytes T de souris | Stemcell Technologies | 19851 | |
| Tampon FACS ; | BD | BDB554657 | |
| Sérum fœtal bovin (FBS) ; | Corning | MT35011CV | |
| GlutaMAX | Gibco | 35-050-061 | |
| G-REX6 | Wilson Wolf | 80240M ; | |
| Solution tampon HEPES ; | Gibco | 15-630-080 | |
| IL-15 humaine recombinante ; | Miltenyi Biotec | 130-095-765 | |
| IL-2 recombinante humaine | Miltenyi Biotec | 130-097-748 | |
| IL-7 recombinante humaine | Miltenyi Biotec | 130-095-363 | |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L3000008 | |
| MEM Solution d’acides aminés non essentiels ; | Gibco | 11140-050 | |
| Souris Anti-CD3 BV421 | Biolegend | 100228 | |
| Souris Anti-CD3/CD28 Dynabeads | Gibco | 11-453-D | |
| Souris Anti-CD4 BV605 | BD | 563151 | |
| Souris Anti-CD44 APC ; | Souris Biolegend | 103011 | |
| Anti-CD62L PE-Cy7 | Tonbo | SKU 60-0621-U025 | |
| Souris Anti-CD8 APC-Cy7 | Tonbo | SKU 25-0081-U025 | |
| Nikon Ti2 avec appareil photo Prime 95B ; | Plaques Nikon | ||
| non traitées à 24 puits ; | CytoOne | CC7672-7524 | |
| Opti-MEM | Gibco | 31-985-062 | |
| pCL-Eco | Addgene | #12371 | |
| Pénicilline/Streptomycine Solution | Gibco | 15-070-063 | |
| Phoenix Eco cells | ATCC | CRL-3214 | |
| pMDG.2 | Addgene | #12259 | |
| pMSCV_PGK_GFP28z | N/A | Produit par R.LV. | |
| SfGFP N | /A | purifié Produit par R.LV. | |
| RetroNectin ('réactif de transduction') | Takara Bio | T100B | |
| RPMI 1640 | Gibco | 21875 | |
| Pipette sérologique 10 mL | Fisher Scientific ; | 13-678-11F | |
| Pipette sérologique 25 mL | Fisher Scientific ; | 13-678-11 | |
| Pipette sérologique 5 mL | Fisher Scientific ; | 13-678-11D | |
| Pyruvate de sodium | Gibco | 11-360-070 | |
| TC 24 plaques de puits | Corning | 08-772-1 | |
| Trypan bleu ; | Gibco | 15-250-061 |