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Article de méthode

Mesure des changements dynamiques du pH glycosomal chez Trypanosoma brucei vivant

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DOI :

10.3791/66279

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19 janvier 2024

* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Nous décrivons une méthode pour étudier comment le pH répond aux signaux environnementaux dans les glycosomes de la forme sanguine des trypanosomes africains. Cette approche implique une sonde de protéine héréditaire sensible au pH en combinaison avec la cytométrie en flux pour mesurer la dynamique du pH, à la fois en tant que test temporel et dans un format de criblage à haut débit.

Résumé

Le métabolisme du glucose est essentiel pour le trypanosome africain, Trypanosoma brucei, en tant que processus métabolique essentiel et régulateur du développement du parasite. On sait peu de choses sur les réponses cellulaires générées lorsque les niveaux de glucose environnementaux changent. Dans les parasites de la circulation sanguine et de la forme procyclique (stade d’insecte), les glycosomes abritent la majeure partie de la glycolyse. Ces organites sont rapidement acidifiés en réponse à la privation de glucose, ce qui entraîne probablement la régulation allostérique des enzymes glycolytiques telles que l’hexokinase. Dans les travaux précédents, la localisation de la sonde chimique utilisée pour effectuer les mesures de pH était difficile, ce qui limitait son utilité dans d’autres applications.

Cet article décrit le développement et l’utilisation de parasites qui expriment pHluorin2 localisée glycosomiquement, un biocapteur de pH protéique héréditaire. pHluorin2 est une variante ratiométrique de la pHluorin qui présente une diminution de l’excitation dépendante du pH (acide) à 395 nm tout en produisant simultanément une augmentation de l’excitation à 475 nm. Les parasites transgéniques ont été générés en clonant le cadre de lecture ouvert de pHluorin2 dans le vecteur d’expression du trypanosome pLEW100v5, permettant l’expression inductible de protéines à l’une ou l’autre étape du cycle de vie. L’immunofluorescence a été utilisée pour confirmer la localisation glycosomale du biocapteur pHluorin2, en comparant la localisation du biocapteur à la protéine résidente glycosomale aldolase. La réactivité de la sonde a été calibrée à différents niveaux de pH en incubant des cellules dans une série de tampons dont le pH variait de 4 à 8, une approche que nous avons déjà utilisée pour étalonner une sonde de pH à base de fluorescéine. Nous avons ensuite mesuré la fluorescence de pHluorin2 à 405 nm et 488 nm en utilisant la cytométrie en flux pour déterminer le pH glycosomal. Nous avons validé les performances des parasites transgéniques vivants exprimant pHluorin2, en surveillant le pH dans le temps en réponse à la privation de glucose, un déclencheur connu de l’acidification glycosomale chez les parasites PF. Cet outil a une gamme d’applications potentielles, y compris potentiellement utilisé dans le criblage de médicaments à haut débit. Au-delà du pH glycosomal, la sonde pourrait être adaptée à d’autres organites ou utilisée dans d’autres trypanosomatidés pour comprendre la dynamique du pH dans le cadre de cellules vivantes.

Introduction

Les kinétoplastides parasites, comme la plupart des organismes vivants, dépendent du glucose comme composant fondamental du métabolisme central du carbone. Ce groupe comprend des organismes médicalement importants, tels que le trypanosome africain, Trypanosoma brucei ; le trypanosome américain, T. cruzi ; et les parasites du genre Leishmania. Le métabolisme du glucose est essentiel à la croissance du parasite dans les stades du cycle de vie pathogène. Par exemple, lorsqu’il est privé de glucose, la forme sanguine (BSF) du trypanosome africain meurt rapidement. Notamment, la glycolyse est la seule source d’ATP à ce stade de l’infection

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Protocole

L’utilisation de trypanosomes 90-13 BSF de T. brucei brucei , une lignée parasitaire monomorphe, nécessite une prise en compte de l’innocuité, car ils sont considérés comme des organismes du groupe de risque 2 qui doivent être manipulés dans des installations de niveau de biosécurité 2.

1. Culture et transfection de trypanosomes

  1. Culture de trypanosomes T . brucei brucei 90-13 BSF en milieu HMI-9 complété par 10 % de FBS inactivé par la chaleur et 10 % de Nu-Serum à 37 °C dans 5 % de CO210.
    REMARQUE : Pour garder la culture en bonne santé, maintenez la densité....

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Résultats

Localisation de pHLuorin2-PTS1 dans les glycosomes chez BSF T. brucei
Pour évaluer la localisation subcellulaire de la pHluorin2-PTS1, les parasites ont été soumis à des tests d’immunofluorescence. Signal du transgène colocalisé avec des antisérums élevés contre une protéine résidente des glycosomes, l’aldolase (TbAldolase) (Figure 2A). Le coefficient de corrélation moyen de Pearson de colocalisation entre l’anti-TbAldolase et la pHluorin2-PTS1 était de 0,895, ce.......

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Discussion

La perception environnementale et les mécanismes de réponse du trypanosome africain sont mal compris. Les changements dans la disponibilité des nutriments sont connus pour déclencher diverses réponses chez le parasite, y compris l’acidification des glycosomes. Ici, nous avons décrit une méthode pour étudier la réponse du pH glycosomal aux perturbations environnementales dans les cellules vivantes à l’aide d’un capteur de protéines héréditaires, pHluorin2, et de la cytométrie en flux.

Il y a pl.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.

Remerciements

pHluorin2-PTS1 a été cloné en pLEW100v5 par Twist Bioscience qui a fourni la construction dans un vecteur de clonage à haute copie ; pLEW100v5 était un cadeau du Dr George Cross. L’antisérum contre T. brucei aldolase est disponible sur demande auprès du Dr Meredith T. Morris, de l’Université de Clemson. Les travaux des laboratoires JCM et KAC ont été partiellement soutenus par un prix des National Institutes of Health (R01AI156382). Le SSP a été soutenu par le NIH 3R01AI156382.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Fioles de culture tissulaire de 50 mL (non traitées, stériles)VWR10861-572
75 cm2 Fiole de culture tissulaire (non traitée, stérile)Corning431464U
80 µ ; L plaque à fond plat 384 puitsBrandTech  ;781620
Cellule T humaine Amaxa Nucléofector  ; KitLonzaVPA-1002
Attune NxT Flow Cytometerinvitrogen by Thermo Fisher ScientificA24858Logiciel FlowJo
BRANDplates 96-Well, plaque à fond platMillipore SigmaBR781662
Coloc 2 plugin d’ImageJhttps://imagej.net/plugins/coloc-2
CytKick Max Auto Samplerinvitrogen by Thermo Fisher ScientificA42973
Cytomètre en flux CytoFLEXBeckman-Coulter
Microscopie électronique Sciences 16 % Paraformaldéhyde Solution aqueuse, grade EM, 10 mL AmpouleFisher Scientific50-980-487
GraphPad Prismlogiciel statistique
Nigericin (sel de sodium)Cayman Chemical11437
Nucleofector 2bLonzaProduit abandonné OP2
Liquid HandleropentronsOP2
poly-L-lysine, 0,1 % (p/v) dans H2OSigma Life ScienceCAS :25988-63-0Robot de pipetage pour le dosage HTS
Thiazole Red (TO-PRO-3)biotium#40087Nous avons usiné un support de plaque acrylique personnalisé afin que cette marque de plaque puisse être détectée et utilisée sur notre CytKick Max Auto Échantillonneur
valinomycineCayman Chemical10009152Robot de pipetage pour le dosage HTS
  ;   ;  ;   ;  ;   ;Pour l’étalonnage du pH
  ;   ;  ;   ;  ;   ;Pour l’étalonnage du pH

Références

  1. Coley, A. F., Dodson, H. C., Morris, M. T., Morris, J. C. Glycolysis in the African trypanosome: Targeting enzymes and their subcellular compartments for therapeutic development. Molecular Biology International. 2011, 123702(2011).
  2. Mcconville, M. J., Saunders, E. C., Kloehn, J., Dagley, M. J.

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Réimpressions et autorisations

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