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Étapes critiques
L’un des pièges les plus courants lors de l’acquisition est une mise à l’échelle inadéquate du signal, qui entraîne une perte d’informations lors de la conversion DICOM en raison d’une précision réduite de la représentation des données numériques. Par conséquent, cela peut entraîner des problèmes lors de la phase de post-traitement. Un autre piège encore plus critique est l’acquisition de plusieurs tranches de manière entrelacée. Ainsi, la résolution temporelle effective des coupes individuelles est considérablement réduite. De plus, en fonction de la distance des tranches, cela peut avoir un impact sur le contraste de perfusion et la quantification, car l’afflux repose sur des spins frais sans historique de magnétisation. Une attention particulière est requise lors de la configuration du protocole, en particulier en ce qui concerne l’intensité du gradient, l’écho asymétrique, la bande passante et l’imagerie parallèle. Des écarts par rapport aux paramètres suggérés, même pour un seul de ces paramètres, peuvent entraîner une résolution TE et temporelle inadéquate.
Le post-traitement se compose de plusieurs étapes, qui doivent être suivies dans l’ordre décrit. Par exemple, un enregistrement après un filtrage passe-bas n’est pas significatif. Par conséquent, l’échec d’une étape entraîne une panne lors des étapes suivantes. D’où l’importance de l’étape d’inscription. Comme il n’existe pas d’algorithme de recalage unique, les paramètres doivent être définis empiriquement en fonction de l’implémentation respective. Sans réglage fin de ces paramètres, un faux enregistrement empêchera la génération de tout résultat significatif. La segmentation est une autre étape potentiellement chronophage et critique lors du post-traitement. Des segmentations erronées peuvent conduire à des calculs de paramètres complètement erronés (par exemple, en incluant des régions non pulmonaires) dans le rapport final. De telles erreurs de segmentation sont plus susceptibles de se produire avec des algorithmes d’apprentissage profond, qui sont habitués à certaines apparences d’image et sont appliqués à des images d’un autre fournisseur/machine avec une apparence légèrement différente. Un contrôle visuel de la qualité de la précision de la segmentation, avec une éventuelle correction manuelle, est donc obligatoire.
Dépannage
La procédure de dépannage typique consiste à suivre toutes les étapes une par une et à vérifier la plausibilité des résultats intermédiaires. La procédure pour les étapes principales est la suivante : Vérifiez que les images sont acquises en respiration libre avec la séquence et les paramètres corrects. Ensuite, vérifiez que la plage dynamique des signaux est appropriée (~50 UA dans le parenchyme pulmonaire). Si des données brutes sont encore disponibles, répétez la reconstruction des images avec un facteur d’échelle approprié en évitant d’avoir à acquérir de nouvelles données. Vérifiez que l’enregistrement a été effectué sans artefacts majeurs ni mouvement restant. Ensuite, vérifiez si les petits retours sur investissement présentent une série chronologique avec les modulations attendues liées à la ventilation et à la perfusion. Vérifiez ensuite si les filtres appliqués modifient les images de la manière attendue (par exemple, pas de modulations à haute fréquence dans les données filtrées passe-bas). Vérifiez si les cycles respiratoires et cardiaques synthétisés sont physiologiques et ne montrent pas de sauts soudains. Vérifiez la précision de la segmentation. Notez qu’une recherche à un niveau de résolution plus fin peut être nécessaire dès que l’étape principale, au cours de laquelle le problème survient, a été identifiée.
Limitations
Bien que le protocole présenté soit connu pour produire des résultats reproductibles et sensibles, le nombre d’étapes et de paramètres impliqués lors de l’acquisition et du post-traitement permet une optimisation presque infinie et sont entrelacés. Par conséquent, une approche ascendante doit être suivie en abordant d’abord les optimisations du protocole de séquence (par exemple, en ce qui concerne le SNR et le rapport contraste/bruit fonctionnel). Pour les optimisations de post-traitement suivantes, une vérité terrain prédéfinie sous la forme d’un modèle pulmonaire numérique peut être utile40. Tel que présenté, ce modèle imite une acquisition en respiration libre et comprend plusieurs classes pour simuler des défauts de ventilation/perfusion. En incluant une déformation connue due au mouvement, les algorithmes de repérage peuvent également être testés directement. Malgré ces avantages, chaque modèle est intrinsèquement limité par la précision de la cartographie de la réalité complexe à un modèle fini et simplifié.
L’analyse empirique a montré que les seuils présentés dans ce protocole donnaient des résultats raisonnables chez des volontaires en bonne santé et dans différentes cohortes de patients. Néanmoins, comme nous l’avons déjà mentionné, il est probable qu’un ajustement soit nécessaire en fonction de la séquence, de l’intensité du champ et de la cohorte.
Une limitation générale de PREFUL est le post-traitement étendu, qui n’est pas encore facilement disponible en tant que produit médical, bien que les premières versions en cours de développement de Siemens Healthineers et BioVisioneers soient disponibles à des fins scientifiques dans un cadre de collaboration scientifique/commerciale. Les calculs impliquent généralement un traitement parallèle, ce qui pose des exigences particulièrement élevées en matière de processeur et de RAM et peut nécessiter des postes de travail modernes ou des solutions de serveur pour traiter efficacement de grandes quantités de données. De plus, les étapes de post-traitement chronophages empêchent actuellement une présentation instantanée des résultats, ce qui serait souhaitable pour le flux de travail clinique.
Comparaison avec d’autres méthodes
Il existe une multitude d’approches similaires comme PREFUL, y compris le prédécesseur de la décomposition de Fourier et ses autres dérivés tels que la décomposition au crayon matriciel41 et l’approche légèrement différente Self-gated Non-Contrast-enhanced Functional Lung IRM (senceful mri)42. Alors que la décomposition de Fourier et des méthodes similaires fonctionnent dans le domaine fréquentiel, PREFUL utilise un filtrage de Fourier moins strict et un calcul ultérieur des amplitudes dans le domaine temporel. Par conséquent, il n’est pas nécessaire de sélectionner des pics spécifiques correspondant à la ventilation/perfusion. Cela peut entraîner une moindre sensibilité à la variabilité de la respiration, ce qui est connu chez les sujets humains.
Alors que PREFUL effectue le tri des images, SENCEFUL utilise le tri des lignes de l’espace k, ce qui permet une plus grande flexibilité. Néanmoins, SENCEFUL nécessite des séquences avec des capacités d’auto-gating, tandis que PREFUL peut être réalisé avec une séquence d’écho à gradient gâché conventionnelle. De même, la bSSFP couramment utilisée dans les approches basées sur la décomposition de Fourier est connue pour un meilleur SNR et un meilleur contraste de flux sanguin, mais nécessite généralement plus d’optimisation pour l’acquisition pulmonaire, en particulier à 3T43. Néanmoins, à part cela, il n’y a aucune raison de ne pas combiner PREFUL avec l’acquisition de bSSFP44.
Toutes ces approches basées sur le signal supposent que certaines influences de signaux indésirables, notamment T1, T2/T2*, la diffusion, le mouvement à travers le plan et les voxels non irréguliers orthogonalement, sont négligeables. Alors que la validation avancée de PREFUL suggère indirectement que de telles influences ne sont effectivement pas critiques, Triphan et al. ont montré qu’il existe une dépendance vis-à-vis de la T1 et de l’ET efficaces, ce qui s’explique par la pondération différente des composants sanguins et parenchymateux en fonction de l’ET45. Dans cette optique, l’avantage initial de la bSSFP pour visualiser le sang en raison du contraste T2/T1 pourrait poser un défi supplémentaire pour établir une quantification précise par rapport à la mécanique de contraste plus simple d’un SPGRE. Néanmoins, d’autres études portant directement sur l’influence de diverses variables MR, par exemple, comme celles réalisées par Glandorf et al. pour les produits de contraste46,47, sont souhaitables car elles peuvent quantifier directement l’effet sur PREFUL.
Importance
En tant que méthode à respiration libre et sans produit de contraste, PREFUL partage de nombreux avantages avec les méthodes connexes mentionnées précédemment : 1) Pas d’application de rayonnements ionisants et d’agents de contraste, 2) Pas besoin de matériel ou de personnel supplémentaire, 3) Acquisition, qui ne dépend que de l’observance minimale du patient. Ces avantages font de PREFUL un outil de surveillance pratique, en particulier pour les groupes vulnérables tels que les enfants atteints de maladies pulmonaires chroniques. Bien que le SNR soit faible avec la séquence SPGRE, la disponibilité et l’absence de besoin de programmation ou de partage de séquences supplémentaires favorisent davantage la diffusion de cette approche.
Comme nous l’avons vu dans la section d’introduction, le nombre d’études montrant de bons résultats de validation, de reproductibilité, de sensibilité et de capacités de surveillance montre que l’importance de cette technique et des paramètres dynamiques correspondants est sur une trajectoire croissante et sera soutenue par une large diffusion.