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Ventilation Images
Si les procédures de préparation des animaux et de ventilation sont correctement mises en œuvre, l’imagerie radiale 3D peut capturer avec succès les modèles de ventilation lorsque l’acquisition des données est effectuée à l’inspiration ou à l’expiration (Figure 7). Bien que ces images soient recueillies sur de nombreuses respirations, la méthode décrite ici est similaire à la méthode d’imagerie d’une seule respiration utilisée chez l’homme. En effet, toutes les lignes de l’espace k sont collectées à un moment précis du cycle respiratoire (par exemple, toutes à la fin de l’inspiration), créant ainsi une image représentative d’une seule inspiration. Sur ces images, les principales voies respiratoires (trachée et bronches) sont clairement visibles, aucun artefact d’image évident n’est présent et le parenchyme pulmonaire semble complètement gonflé avec un SNR élevé (~15 ou plus, selon la polarisation initiale). Bien que contre-intuitives, les images acquises à l’inspiration (Figure 7A, SNR = 15) affichent un SNR inférieur à celui acquis à l’expiration (Figure 7B, SNR = 27). Cela est lié à la pression d’entraînement modeste et au débit lent utilisés lors de la ventilation de cette souris. Pour des images d’inspiration, le gaz HP n’avait pas encore complètement pénétré dans le parenchyme des poumons, ce qui a entraîné la concentration du 129Xe (et donc du signal) dans les voies respiratoires plus grandes. Cet effet est visuellement exacerbé par la mise à l’échelle de l’espace k lors de la reconstruction de l’image, car le signal des voies aériennes élevées domine la plage dynamique des données. Néanmoins, l’analyse devrait être simple si le parenchyme est segmenté de telle sorte que les grandes voies respiratoires sont omises.

Figure 7 : Images représentatives de la ventilation radiale en 3D chez une souris adulte C57BL/6J acquises à l’aide de méthodes précédemment publiées39. Bien que les deux images aient un rapport signal/bruit relativement élevé, les images à l’inspiration (A) ont un rapport signal/bruit plus faible que les images à l’expiration (B), en grande partie parce que le gaz 129Xe n’avait pas encore eu le temps de pénétrer dans les poumons. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Il est important de faire la distinction entre la ventilation pathologiquement obstruée et les autres causes de faible SNR. Dans la figure 7A, on ne s’attend pas à ce qu’il y ait obstruction de la ventilation (c.-à-d. une faible VDP) parce que l’animal était une souris sauvage en bonne santé. Si la ventilation était obstruée, les défauts apparaîtraient généralement comme des régions où le signal 129Xe est faible ou inexistant. Les causes non pathologiques d’un signal faible comprennent généralement :
(i) Faible polarisation 129Xe : Cela provoque un faible SNR dans le parenchyme pulmonaire et les voies respiratoires sans artefacts d’accompagnement. Une faible polarisation peut généralement être attribuée à un mauvais suivi des procédures de polarisation, à une dépolarisation pendant le transport ou à une teneur excessive en gaz O2 dans la tubulure de distribution HP 129Xe (par exemple, à partir d’un ventilateur mal calibré).
(ii) Canule d’intubation insérée trop profondément : Si elle est insérée trop profondément dans la trachée, la canule peut dévier vers le bas de la bronche gauche ou droite. S’il est logé suffisamment serré, le volume courant de l’ensemble du poumon peut être confiné à quelques lobes et voies respiratoires, tandis que le reste du poumon n’en reçoit aucun. Si cela se produisait, les lobes hypergonflés pourraient être blessés et il pourrait être nécessaire d’euthanasier l’animal. Alternativement, l’extrémité de la canule peut entrer en contact direct avec les tissus. Dans ce cas, 129Xe sera principalement confiné à l’intérieur de la canule, ce qui entraînera un signal brillant provenant d’un tube visiblement droit et un signal minimal à l’intérieur du parenchyme. Dans ce cas, la position de la canule doit être corrigée rapidement et l’animal doit être surveillé pour détecter des signes de détresse (par exemple, un mouvement thoracique anormal, absent ou asynchrone par rapport au ventilateur).
(iii) Canule d’intubation placée trop peu profonde : Lorsqu’un bolus de gaz est délivré trop peu profondément dans l’oropharynx, la résistance à ce bolus s’écoulant dans les poumons peut être plus forte que la résistance à ce bolus s’écoulant autour de l’extérieur de la canule et hors de la bouche. Cela peut entraîner une faible inflation pulmonaire. Le SNR trachéal peut être élevé, tandis que le SNR parenchymateux sera faible. Des artefacts de mouvement peuvent être présents en raison du gaz qui s’écoule dans la trachée pendant l’acquisition des données. Le caractère de l’artefact variera en fonction du type de séquence (GRE, radiale, etc.).
(iv) Moment d’acquisition incorrect : Si les impulsions RF et l’acquisition de données se sont produites pendant des périodes d’écoulement de gaz inspiratoire ou expiratoire, des artefacts de mouvement sévères seront généralement présents - en particulier lors de l’utilisation de séquences cartésiennes - et le SNR parenchymateux sera faible.
(v) Respiration spontanée : Si l’animal n’est pas suffisamment sédaté lors de l’acquisition des données, le mouvement respiratoire spontané sera superposé de manière asynchrone au modèle de ventilation mécanique. Cela se traduira par une distribution variable de 129Xe d’un souffle à l’autre, des artefacts de mouvement modérés à sévères et un mauvais rapport signal/bruit parenchymateux. Il est essentiel de suivre attentivement la dose de sédatif et le moment de la dose.
(vi) Mort d’animaux : Dans de rares cas, les souris peuvent mourir (par exemple, en raison d’une position incorrecte de la canule, d’une administration insuffisante d’O2 , d’une surdose de sédatif ou d’une pathologie expérimentale grave). Si cela se produit, le tissu pulmonaire se raidit rapidement et le parenchyme pulmonaire se gonfle mal. La trachée supérieure peut rester brillante, mais le parenchyme pulmonaire sera très faible en signal.
Spectroscopie d’échange de gaz
Chez les sujets humains, les paramètres dérivés de la spectroscopie (par exemple, l’intensité du signal, la largeur spectrale, le décalage chimique et la phase) offrent des informations sur la dynamique cardiopulmonaire et l’état pathologique52,53. Contrairement aux humains86, aux chiens100 et aux rats20 101, les spectres pulmonaires entiers de souris obtenus lorsque l’aimantation 129Xe est confinée au parenchyme pulmonaire présentent une résonance de phase dissoute unique, large et correspondant à 129Xe dissous dans le tissu de la membrane capillaire, le plasma sanguin et les globules rouges54 (Figure 8A, 197 ppm). Lorsqu’il est transporté par le flux sanguin vers des tissus plus distaux, 129Xe produit des fréquences de résonance distinctes à partir de divers tissus, notamment le tissu adipeux54, le muscle, la matière grise et la substance blanche102,103. Cependant, en raison de temps de transit relativement longs (plusieurs secondes) et d’une solubilité modestede 104 (solubilité d’Ostwald = 0,1 - 0,3), ces signaux sont généralement faibles et ne sont observés que lors d’expériences dédiées et minutieuses. L’exception est le 129Xe dissous dans les tissus adipeux (Figure 8A, 189 ppm). À partir de ces tissus, un signal 129Xe peut apparaître en quelques secondes (par exemple, au cours des premières respirations lors de la configuration de l’animal). De plus, l’intensité du signal peut être élevée, car la solubilité d’Ostwald de 129Xe est près de 20 fois plus élevée dans les tissus adipeux que dans le plasma sanguin (c’est-à-dire 1,7 contre 0,094, respectivement, à 37 °C104). Les temps de relaxation longitudinaux devraient également être relativement longs (in vivo, T1 est de ~20 s dans les lipides105 contre 3-8 s dans le sang106). En conséquence, le signal 129Xe du tissu adipeux peut être relativement élevé par rapport à d’autres tissus.
En raison de la dynamique du signal différente, les expériences de spectroscopie 129Xe peuvent être adaptées pour interroger le tissu adipeux (par exemple, pour cibler la thermométrie107 du tissu adipeux brun) ou l’absorption de gaz dans les poumons en sélectionnant les paramètres d’acquisition corrects. Lorsque les spectres de 129Xe des poumons sont acquis avec les paramètres décrits dans le tableau 4 (c.-à-d. TR = 50 ms et un angle de retournement de 90° centré sur le pic de phase dissoute), les pics de phase gazeuse et de phase dissoute sont observés (figures 8A, B). Notamment, le volume de gaz dans le poumon de la souris est 2 à 3 fois plus élevé que le volume tissulaire, et la solubilité du 129Xe dans ce tissu n’est que de ~10 4,108,109,110,111. Malgré cela, l’amplitude du signal dissous dépasse celle de la phase gazeuse d’environ 2 fois car l’excitation de la phase gazeuse est éloignée de la résonance (~15 kHz à 7 T ; Figure 8B, SNR = 102 contre 43, respectivement). Par conséquent, le réservoir d’aimantation 20 à 30 fois plus grand dans la phase gazeuse peut être approximé comme un réservoir stable (c’est-à-dire non épuisé) pour le signal de la phase de dissolution pendant les parties statiques du cycle respiratoire.
Avec un nouveau souffle d’aimantation toutes les ~600 ms et un TR de 50 ms, l’intensité du signal de la phase gazeuse et de la phase dissoute 129Xe oscille. Pour le signal de gaz, cela est attribuable à la variation du volume total de gaz (c’est-à-dire élevé à l’inspiration et faible à l’expiration). La situation est plus complexe pour le signal dissous car l’aimantation du gaz source, T2* et le volume sanguin capillaire peuvent fluctuer avec l’état d’inflation. Par conséquent, le rapport d’amplitude du signal dissous/gaz oscille également par rapport au cycle respiratoire (Figure 8C, rapport moyen dissous/gaz = 1,9 ± 0,39).

Figure 8 : Spectroscopie dynamique représentative chez une souris C57BL/6J adulte. (A) Un spectre d’impulsion unique montre un signal provenant de 129Xe en phase gazeuse, dissous dans le tissu adipeux (189 ppm) et dissous dans la membrane capillaire et les tissus sanguins (197 ppm). (B) Spectroscopie dynamique montrant l’intensité du signal variant dans le temps du 129Xe dissous et gazeux (temps de répétition = 50 ms). Pour faciliter la visualisation, seuls cinq spectres sont affichés. Les lignes diagonales sur l’axe temporel représentent les sauts d’échelle. (C) Le rapport entre l’amplitude du signal dissous et celui du gaz sur un intervalle de 2 s (correspondant à la rupture de l’échelle rouge dans le panneau B montre une nette variation avec le cycle respiratoire (0,6 s par respiration). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Voici une liste de facteurs qui pourraient compromettre les résultats de la spectroscopie d’échange gazeux 129Xe. Dans chaque cas, le résultat probable est un faible SNR, ce qui peut rendre l’ajustement spectral et les mesures résultantes (par exemple, le rapport d’amplitude du signal dissous/gazeux, le décalage chimique, la largeur spectrale et la phase) inexacts.
(i) Mauvaise fréquence de fonctionnement : En raison du volume de gaz nettement plus élevé et de la faible solubilité tissulaire, les impulsions RF centrées sur la fréquence de la phase gazeuse ne produiront aucun signal de phase dissoute. Les impulsions RF doivent être centrées à la fréquence de la phase dissoute ou à proximité.
(ii) Largeur de bande trop large : La largeur de bande d’excitation doit être suffisamment large pour qu’une partie de la phase gazeuse 129Xe soit excitée afin de mesurer le rapport entre l’amplitude du signal dissous et l’amplitude du signal gazeux. Mais si la bande passante est trop large, l’impulsion d’excitation détruira l’aimantation en phase gazeuse avant de se dissoudre dans le tissu. Cela peut être considéré comme un signal de gaz très élevé et un signal de phase dissoute faible ou nul, bien que l’impulsion soit centrée sur la fréquence de la phase dissoute.
(iii) TR non optimisé : Pour interroger la dynamique du signal sur une respiration, le théorème d’échantillonnage de Nyquist-Shannon exige que le signal soit échantillonné à un minimum de deux fois sa fréquence (ici, 100 respirations par minute ont été échantillonnées toutes les 50 ms, soit ~12x par respiration). Selon les conditions expérimentales, il est possible d’interroger davantage la dynamique du signal cardiopulmonaire à une fréquence d’échantillonnage plus rapide. Les résultats de ces expériences dépendraient de nombreux facteurs, notamment la bande passante d’excitation, la fréquence respiratoire et la fréquence cardiaque. Le temps d’échange du xénon (c’est-à-dire le temps nécessaire au xénon pour se dissoudre dans les tissus ; ~56 ms54) et le temps de transit pulmonaire (c’est-à-dire le temps nécessaire au sang pour circuler du ventricule droit au ventricule gauche ; ~830 ms pour une fréquence cardiaque de ~436 battements/min112) doivent également être pris en compte. Un échantillonnage trop fréquent entraînera la destruction précoce de l’aimantation et un signal faible, mais il réduira également l’influence du flux sanguin. Un échantillonnage moins fréquent permettra à l’aimantation de se dissoudre davantage et d’accumuler plus de signal, mais elle deviendra plus dépendante du flux sanguin et moins localisée dans les régions d’échange gazeux dans les alvéoles.
Images pondérées en diffusion
Les images pondérées en diffusion, utilisées pour quantifier la taille de l’espace aérien alvéolaire, ont été rigoureusement validées dans des modèles de petits animaux par des méthodes d’histomorphométrie traditionnelles 98,113,114. Ici, nous avons limité la discussion à l’imagerie 2D, sélective en tranches, afin de minimiser le temps de balayage et l’utilisation de gaz tout en respectant les protocoles98 précédemment validés. Un minimum de 2 images de valeur b est suffisant pour calculer l’ADC, et 4 images de valeur b ou plus sont nécessaires pour les calculs de morphométrie avancés (tels que l’interception linéaire moyenne). L’acquisition de plusieurs images de valeur b offre un avantage significatif en améliorant la précision des calculs. Contrairement à l’imagerie humaine pendant une seule apnée, l’imagerie préclinique sur plusieurs respirations fournit un signal continuellement réapprovisionné. Pour cette raison, il est possible d’acquérir de nombreuses images à valeur b SNR élevée, limitées uniquement par le volume de gaz HP disponible et la durée de la sédation animale. Ici, nous avons acquis 7 images de valeur b, chacune avec un SNR >15, en utilisant 400 mL de gaz 129Xe sur 18 min de temps de balayage (Figure 9). Le signal de chaque image décroît avec l’augmentation de l’intensité du gradient de diffusion (valeur b). Cette décroissance du signal est proportionnelle à l’ADC du 129Xe dans le poumon. Les grandes voies respiratoires peuvent être distinguées du tissu acineux en comparant les images b0 et b6. Dans les régions anatomiquement susceptibles de contenir des voies respiratoires, les pixels apparaîtront très brillants dans l’image b0 mais apparaîtront sombres dans l’image b6 (flèches rouges, Figure 9). Ces pixels doivent être exclus de l’analyse du parenchyme pulmonaire.

Figure 9 : Images représentatives pondérées en fonction de la diffusion chez une souris C57BL/6J adulte. Les grandes voies respiratoires (flèches rouges), à travers lesquelles 129Xe se diffuse librement tout en étant dilué avec de l’oxygène, présentent une atténuation accrue du signal par rapport au parenchyme pulmonaire. Il en résulte des voies respiratoires lumineuses dans l’image b0 et des voies respiratoires à faible signal dans l’image b6. Les souris et les rats ont des valeurs ADC tout aussi petites par rapport aux humains, mais les valeurs dépendront de facteurs biologiques et expérimentaux tels que l’âge, le volume courant, la pression et les paramètres de diffusion. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
L’ADC de cette souris saine, adulte et de type sauvage suit le résultat attendu basé sur la littérature, son âge, son SNR, ses paramètres d’acquisition, etc. Les facteurs qui peuvent avoir une incidence néfaste sur la précision et l’exactitude des résultats de l’ADC sont les suivants :
(i) Faible SNR : Il est important de noter qu’un faible SNR dans les images biaise le calcul de l’ADC vers des valeurs inférieuresde 99,115. Pour cette raison, nous excluons les voxels avec SVNR0 < 2,5 fois le bruit de l’image97.
(ii) Segmentation incorrecte : Une mauvaise segmentation (par exemple, l’utilisation du seuillage du signal sans inspection visuelle pour le contrôle de la qualité) peut fausser les résultats. Si les images contiennent des artefacts (comme ceux causés par le mouvement), elles peuvent dépasser le seuil et être classées à tort comme parenchyme. De plus, il est particulièrement important d’exclure les pixels situés à proximité de grandes voies respiratoires, car les effets de volume partiel peuvent biaiser leur ADC vers des valeurs plus élevées.
(iii) Ventilateur mal calibré : En général, la dilution de 129Xe avec des gaz plus légers (par exemple, O2 ou N2) peut déplacer l’ADC vers des valeurs plus élevées, de sorte qu’une ventilation avec des mélanges de gaz connus est nécessaire pour les comparaisons quantitatives. En cas de ventilation avec un mélange 129Xe/O2 , une augmentation de la concentration d’oxygène avant l’administration augmentera la relaxation de T1 et réduira l’aimantation de 129Xe dans le tube de distribution de gaz, diminuant ainsi le SNR.
(iv) Désenclavement pulmonaire : Chez les animaux anesthésiés et ventilés mécaniquement, un collapsus alvéolaire (atélectasie) peut survenir au fil du temps. Lorsque cela se produit lors d’une ventilation à volume constant, le même volume courant est nécessairement redistribué vers les alvéoles qui restent recrutées. Au fur et à mesure qu’une atélectasie modérée à sévère se développe, le reste du poumon peut devenir hypergonflé, causant des lésions et une augmentation de l’ADC dans ces régions. Des manœuvres de recrutement régulières et la PEP préviennent le collapsus alvéolaire, évitent la diminution de la compliance pulmonaire et minimisent le risque de lésions pulmonaires qui peuvent fausser les résultats de l’ADC.
v) Mauvais ajustement des données : La méthode d’estimation de l’ADC doit être prise en considération. L’ajustement log-linéaire est le plus efficace en termes de calcul, mais introduit un biais dans les images à faible SNR. Par conséquent, il est préférable de l’appliquer aux images à rapport signal/bruit élevé (>20). La méthode linéaire pondérée réduit ce biais et convient aux images avec un SNR > 15. L’estimation bayésienne peut produire des estimations de l’ADC avec une faible incertitude, même avec un SNR <10, mais elle est coûteuse en calcul99.
(vi) Temps de diffusion sous-optimal : Le temps de diffusion optimal est influencé par l’intensité maximale du gradient de l’appareil d’IRM et le rayon des voies respiratoires acineuses chez la souris (rayon ~100 μm49), qui est environ trois fois plus petit que celui de l’homme. Pour garantir des conditions optimales, le temps de diffusion est réglé de manière à atteindre une longueur de diffusion supérieure au rayon alvéolaire moyen mais inférieure à la longueur moyenne des canaux alvéolaires. Le temps de diffusion optimal pour l’intensité maximale du gradient spécifique au site peut être déterminé à l’aide des méthodes décrites par Sukstanskii et Yablonskiy49. L’utilisation d’un temps de diffusion sous-optimal peut entraîner des diminutions non linéaires de 129Xe ADC, ce qui complique l’interprétation des résultats.
(vii) Valeurs b sous-optimales : Il y a un compromis entre l’optimisation du SNR et la maximisation du rapport contraste/bruit (CNR) généré sur les images à valeur b. Si le CNR est sacrifié par l’utilisation de seules valeurs b faibles (c’est-à-dire une décroissance du signal diffusif comme si l’on acquérait seulement les 3 premières images de valeur b de la figure 9), alors l’estimation de l’ADC sera imprécise en raison d’un mauvais ajustement. Si la pondération de diffusion est trop forte, le SNR résultant sera insuffisant et l’ADC sera biaisé vers des valeurs inférieures.