Dans cette méthode, des simulations spécifiques au sujet sont effectuées pour prédire et évaluer les effets thermiques et mécaniques possibles résultant de l’application de TUS au cerveau. Les ensembles de données entre les participants doivent rester séparés et soigneusement documentés, car l’utilisation d’un scan ou d’un fichier de données incorrect entraînera des simulations inexactes. Lorsque de nombreux numérisages de participants sont collectés et que la planification est effectuée ensemble, il est important d’assurer un étiquetage correct des images et des dossiers et de procéder avec prudence lors du tri et de l’enregistrement des fichiers.
Pour effectuer des simulations avec précision, le crâne doit être correctement modélisé afin d’obtenir une compréhension spécifique du sujet des propriétés acoustiques et géométriques. BabelBrain nécessite donc la réalisation d’un scanner ou d’un scanner ZTE ; si ni l’un ni l’autre n’est disponible, BabelBrain peut utiliser un masque simplifié de l’os du crâne obtenu avec l’outil de charme. La tomodensitométrie fournit les informations les plus précises sur les caractéristiques du crâne pour prédire comment l’échographie se propagera dans le cerveau une fois qu’elle entrera en contact avec le crâne. Ceci est réalisé en utilisant des informations voxélisées de l’os du crâne, bien que l’estimation du volume osseux soit encore difficile à prédire en raison de sa nature hétérogène51. Cependant, plus récemment, des séquences IRM TE ultra-courtes, telles que le balayage ZTE, ont été utilisées pour déterminer les propriétés acoustiques du crâne et effectuer des simulations TUS. La résolution et le contraste des pixels osseux ne sont pas aussi élevés dans une image ZTE qu’ils ne le sont dans la tomodensitométrie. cependant, par rapport aux masques simplifiés dérivés de l’IRM T1-w et T2-w, les images ZTE fournissent toujours une meilleure estimation de l’échauffement, les simulations TUS52 ayant des prédictions similaires à celles faites avec les tomodensitogrammes53. L’utilisation des balayages ZTE dans les simulations élimine toute exposition inutile aux rayonnements et le temps supplémentaire nécessaire pour obtenir des images de tomodensitométrie à rayons X, car les séquences ZTE peuvent être ajoutées à la session d’IRM d’origine. Cependant, les protocoles ZTE ne sont pas un produit standard sur la plupart des scanners IRM, et des recherches supplémentaires sont nécessaires pour améliorer le post-traitement basé sur ZTE pour une utilisation dans la modélisation TUS. Si ni les images CT ni ZTE ne sont disponibles, l’outil de charme utilisé avec BabelBrain crée un masque simplifié à partir d’images T1 et T2 pour prédire les caractéristiques du crâne. Une comparaison des simulations effectuées avec un masque CT par rapport à un masque simplifié a révélé des différences minimes dans l’orientation (1,00 mm ± 1,3 mm) et le repositionnement mécanique (direction x 0,2 mm ± 0,4 mm ; direction y 0,1 mm ± 0,5 mm) nécessaires pour atteindre la cible, mais une distribution d’intensité légèrement différente (distance de mise au point 6 % ± 8 % ; largeur de mise au point 2,7 % ± 2 % ; volume de mise au point 10,4 % ± 16 % ; pression de crête -0,5 % ± 15 % pour le masque simplifié par rapport à la tomodensitométrie)36. Cela révèle que le scanner fournit des simulations plus précises ; cependant, s’il n’est pas possible d’utiliser un scanner ou un balayage ZTE, le masque simplifié est adéquat pour effectuer des simulations pour l’expérimentation TUS chez l’homme.
Les méthodes de cartographie des propriétés acoustiques restent un domaine de recherche nécessaire, car la prédiction de la vitesse du son et de l’atténuation à partir d’images CT et MR nécessite encore une meilleure compréhension et un flux de travail rationalisé. Par conséquent, il reste une mise en garde concernant l’écart potentiel des effets thermiques ou mécaniques par rapport à ce qui est prédit dans la simulation. La modélisation des effets acoustiques dans BabelBrain est réalisée à l’aide d’une bibliothèque open source BabelViscoFDTD54,55, qui permet de modéliser à la fois la transmission linéaire en compression et en ondes de cisaillement. Ce modèle a été validé par rapport à plusieurs autres modèles pour la position, la taille et l’amplitude de la focale, différant de moins de 10 % en pression focale et de moins de 1 mm en positionnement focal56. Les simulations acoustiques sont donc en accord avec d’autres modèles de simulation. Les prédictions thermiques sont plus difficiles et n’ont pas été validées expérimentalement car la thermométrie par résonance magnétique ne peut pas être effectuée dans le crâne, et les changements de température devraient être très faibles, ce qui crée une source d’incertitude. La modélisation thermique utilisée dans BabelBrain est cohérente entre les articles, résolvant l’équation de transfert de biochaleur (BHTE) pour simuler le chauffage du crâne en modélisant la diffusion thermique, les effets de la perfusion et la puissance acoustique36,51. Les estimations de l’élévation thermique à partir de modèles d’atténuation et d’absorption sont utilisées pour prédire les effets dans le crâne avec TUS sur la base d’autres publications57, ce qui constitue la meilleure alternative à ce jour pour simuler l’échauffement du crâne. Comme on le voit dans les méthodes décrites, l’utilisateur spécifie la durée de l’échographie, le temps d’arrêt après l’échographie, le cycle de service et l’intensité moyenne de l’impulsion spatiale souhaitée dans les conditions cérébrales, dont les paramètres de sécurité sont calculés en fonction de la sélection des paramètres. L’utilisateur doit donc inspecter tous les paramètres à utiliser pour s’assurer qu’ils sont conformes aux exigences de sécurité. Divers systèmes de neuronavigation utilisés pour positionner le transducteur sur la région d’intérêt ont également été observés avec une erreur d’identification de la cible d’environ 3 mm 38,58,59. Cependant, en fonction de la fréquence utilisée et de la taille de la cible, le point focal peut encore être suffisamment grand pour couvrir la cible, même avec une erreur de 3 mm. Bien que cela puisse être une limitation, il offre tout de même un plus grand avantage par rapport aux autres systèmes de navigation en raison du caractère invasif des méthodes de localisation stéréotaxique.
BabelBrain rationalise les étapes de planification nécessaires à la réalisation des expériences TUS chez l’homme, car il est efficace, facile à utiliser et est le seul outil de planification accessible en open source à ce jour. Cela permet une transparence dans les méthodes expérimentales dans la littérature publiée, car les scripts utilisés sont librement accessibles. La méthode décrite complète les étapes de préparation des données et de traitement des images, éliminant ainsi le besoin de scripts personnalisés ou de toute collaboration externe pour exécuter des simulations. Il élimine donc un obstacle majeur pour les expérimentateurs, leur permettant d’effectuer directement la planification et les simulations et permettant à davantage de laboratoires de mener à bien les expériences TUS. En plus de la planification prospective des expériences, cette méthode a également des applications potentielles dans la planification de la thérapie FUS médiée par la cavitation36, comme l’ouverture de la barrière hémato-encéphalique59. Dans l’ensemble, cette méthode fournit une approche efficace et rationalisée pour la planification et la mise en œuvre de l’expérimentation TUS chez l’homme et le développement de TUS pour une utilisation en milieu clinique.