L’architecture cellulaire de l’intestin pose un défi unique pour maintenir son intégrité structurelle lorsque le tissu intestinal est préservé pour l’immunomarquage. L’intestin grêle est composé de structures allongées en forme de doigts appelées villosités1. Ces villosités se déforment souvent au cours des processus d’encastrement. Il est crucial de s’assurer que les chercheurs disposent de techniques pour intégrer correctement les intestins afin d’obtenir des coupes efficaces, permettant de visualiser toutes les régions de l’intestin, ainsi que les couches qui composent l’intestin (c’est-à-dire la musculeuse propria, la muqueuse et la séreuse), est crucial pour une analyse expérimentale robuste2. Une fixation inadéquate, une fixation excessive et une manipulation inappropriée des tissus compromettront l’intégrité des tissus, entraînant des dommages accidentels à l’épithélium intestinal 3,4. Endommager l’épithélium intestinal au cours de ces étapes peut diminuer considérablement la qualité des analyses ultérieures, comme l’immunofluorescence, indépendamment de l’efficacité des protocoles d’immunohistochimie et des anticorps utilisés.
L’immunomarquage, comme la bonne fixation des tissus, est une partie importante de la recherche biomédicale. Lorsqu’elle est bien faite, l’immunocoloration peut mettre en lumière des aspects jusque-là inconnus de la structure et de la fonction cellulaires. La coloration par immunofluorescence des sections de paraffine peut être difficile en raison des modifications physicochimiques résultant du processus de fixation et d’enrobage de la paraffine5. La fixation et l’intégration de la paraffine entraînent un masquage de l’antigène qui peut interférer avec la détection par immunofluorescence des épitopes d’intérêt6. Une fixation retardée peut induire une dégradation protéolytique, ce qui entraîne une coloration affaiblie ou absente des épitopes critiques7. De plus, les anticorps sont souvent imprécis avec des niveaux élevés de bruit de fond. Les protocoles d’immunomarquage qui favorisent une liaison cohérente et spécifique des anticorps et un rapport signal/bruit élevé peuvent fournir des informations précieuses aux chercheurs.
Ici, nous fournissons un protocole complet conçu pour obtenir des images d’immunofluorescence de haute qualité grâce à la fixation des tissus intestinaux, à la préparation du rouleau suisse8 et à l’immunomarquage. Mettant l’accent sur les lignes directrices visant à préserver l’intégrité de l’intestin, le protocole vise à fournir aux chercheurs une méthodologie robuste pour améliorer la qualité et la fiabilité des études d’imagerie par immunofluorescence. Nous avons également cherché à utiliser des ressources rentables, notamment du papier filtre et une récupération d’antigène maison, des solutions de blocage et des diluants d’anticorps pour rendre le protocole plus accessible aux laboratoires qui peuvent disposer de fonds limités. Comme pour tous les protocoles expérimentaux, les chercheurs doivent optimiser le protocole actuel en fonction de leur approche expérimentale et de leurs domaines d’intérêt.