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Les modifications du TMV dans les cellules excitables in vitro déclenchées par des impulsions électriques peuvent être surveillées optiquement avec ce protocole, et les signaux de fluorescence peuvent être analysés pour extraire leurs paramètres pertinents.
Le dispositif expérimental est illustré à la figure 1A. La figure 1B illustre un signal typique d’impulsion électrique de 100 μs utilisé dans les expériences. Les cellules des chambres qui sont placées sous le microscope ressemblent généralement aux cellules de la figure 1C (image en fond clair) et de la figure 1D (image en fluorescence). Nous réalisons une expérience où toutes les 2 minutes, une impulsion électrique avec une tension croissante est appliquée aux mêmes cellules. Notez que le temps d’interimpulsion de 2 minutes peut ne pas être suffisamment long pour permettre une refermeture complète et une récupération des membranes cellulaires, en particulier lors de l’utilisation d’impulsions de la plus grande amplitude, qui sont associées à une électroporation proéminente. Ainsi, on peut s’attendre à certains effets cumulatifs des impulsions. Pour éviter ces effets cumulatifs, le retard entre les impulsions peut être prolongé, mais au prix d’une réduction du nombre d’amplitudes d’impulsion testées et d’éviter de garder les cellules sur le microscope trop longtemps.
Après avoir capturé des images de fluorescence dans le cadre d’expériences, analysez-les avec l’application MATLAB personnalisée. Tout d’abord, déterminez les seuils de pixels (Figure 2A) ; En ajustant le seuil bas, on obtient une image claire des membranes autour des cellules (en violet), et en ajustant le seuil haut, on supprime le signal de débris (vert). L’application détermine ensuite l’intensité de fluorescence moyenne de tous les pixels de seuil pour chaque impulsion consécutive délivrée afin d’obtenir un signal dépendant du temps de la variation relative de la fluorescence F/F0. Ce signal est corrigé pour le photoblanchiment par colorant en soustrayant la pente de la diminution linéaire de F déterminée à partir de l’enregistrement time-lapse de contrôle dans lequel aucune impulsion n’a été appliquée (Figure 2B). Après avoir corrigé le signal, les paramètres des réponses sont extraits sous la forme d’un tableau intégré à l’application et d’un graphique du signal de fluorescence corrigé (Figure 2C). Dans de rares cas, l’algorithme ne détecte pas un pic évident ou détecte les signaux de bruit parasites comme des faux positifs. Dans ces cas, l’utilisateur a la possibilité de sélectionner manuellement le point correspondant dans le signal de fluorescence en tant que pic ou de supprimer le faux pic détecté (Figure 2D-suppression d’un petit pic détecté de manière anormale avant l’application de l’impulsion électrique).
En utilisant l’application MATLAB, nous pouvons obtenir des images des réponses TMV aux impulsions électriques dans les cellules S-HEK excitables (Figure 3A) et NS-HEK non excitables (Figure 3B). Les paramètres de réponse suivants sont extraits (Tableau 1) : nombre de pics (NoPeaks), temps moyen de crête à crête (lorsque plus d’un pic est détecté, MPPT), réponse maximale (MR), temps jusqu’au premier pic (TtFP) et temps entre le pic et 25 %, 50 %, 75 % et 90 % de récupération (T25, T50, T75, T90, respectivement). Ces paramètres permettent d’évaluer les réponses à différentes impulsions électriques (par exemple, déterminer le nombre de pics déclenchés par des impulsions électriques de différents E, figure 3C) et l’interaction entre l’excitation et l’électroporation.

Figure 1 : La configuration, la forme d’onde et les cellules S-HEK. (A) L’image de la chambre sur la platine du microscope. (B) Exemple de la forme d’onde d’une impulsion utilisée dans l’étude (tension (U) dans le temps). (C, D) L’image des cellules S-HEK ((C) : fond clair, (D) : fluorescence), barre d’échelle : 100 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Application d’analyse de données. (A) L’image de l’interface d’application - seuillage. (B) Le graphique du signal brut et corrigé de changement de fluorescence. (C) L’image de l’interface de l’application - les données extraites. (D) Correction manuelle de la détection de crête (suppression d’un petit pic qui avait été détecté de manière anormale avant l’application de l’impulsion électrique, marqué d’une flèche rouge). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Résultats représentatifs. (A, B) Déclenchement de modifications de la TMV dans (A) le S-HEK excitable et (B) le NS-HEK non excitable avec des impulsions électriques de 100 μs d’amplitudes différentes, résultats d’expériences représentatives. Par souci de clarté, seules les réponses aux impulsions sélectionnées dans la séquence d’impulsions appliquée sont affichées. (C) Les paramètres des réponses TMV déclenchées par les impulsions de 100 μs de différentes amplitudes : l’exemple montre le nombre de pics. Les résultats sont exprimés en moyenne ± ET, nombre d’expériences : N = 13. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
| Index | Force E (V/cm) | Pas de pics (-) | MPPT (Mme) | MONSIEUR (-) | TtFP (Mme) | T25 (Mme) | T50 (Mme) | T75 (Mme) | T90 (Mme) |
| 1 | 0 | | | | | | | | |
| 2 | 126 | 9 | 224 | 0.104 | 360 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 3 | 150 | 6 | 354 | 0.097 | 108 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 4 | 176 | 2 | 144 | 0.089 | 36 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 5 | 200 | 1 | | 0.075 | 0 | 108 | 144 | 180 | 252 |
| 6 | 250 | 2 | 396 | 0.064 | 0 | 108 | 216 | 432 | 2052 |
| 7 | 300 | 1 | | 0.059 | 0 | 180 | 1188 | 2448 | |
| 8 | 350 | 1 | | 0.053 | 0 | 1008 | 2340 | | |
| 9 | 400 | 1 | | 0.047 | 0 | 1512 | | | |
Tableau 1 : Paramètres des réponses TMV déclenchées par les impulsions de 100 μs de différentes amplitudes.