La stéatose hépatique non alcoolique (NAFLD) est un problème majeur de santé publique avec une prévalence de 25 à 30 %1. Il a été rapporté que la prévalence de la NAFLD est élevée chez les patients atteints de diabète2. Cependant, l’importance de la NAFLD chez les patients non diabétiques n’est pas encore claire. Des études ont suggéré que la NAFLD joue un rôle indépendant dans la pathogenèse de l’athérosclérose 3,4. De plus, une méta-analyse a montré que la NAFLD est étroitement associée à la calcification de l’artère coronaire, à la dysfonction endothéliale et à l’athérosclérose, et est apparue comme un facteur de risque cardiovasculaire indépendant5. Le lien entre la NAFLD et les maladies cardiovasculaires nécessite encore des recherches plus approfondies.
L’infarctus du myocarde (infarctus du myocarde) est une maladie catastrophique qui menace la santé et impose un fardeau économique important aux patients et à leurs familles dans le monde entier6. L’infarctus du myocarde est également une cause majeure de décès chez les patients atteints de NAFLD. Une étude clinique publiée dans le British Medical Journal a montré que le risque d’infarctus du myocarde chez les patients atteints de NAFLD est 1,17 fois plus élevé que chez les patients non atteints de NAFLD 7,8. Certaines études ont identifié des voies moléculaires, notamment l’inflammation, le stress oxydatif et le métabolisme des lipides, qui contribuent à l’IM 9,10,11 lié à la NAFLD. Cependant, les mécanismes sous-jacents qui lient la NAFLD et l’IM restent flous. Il est crucial d’identifier de nouveaux biomarqueurs liés au pronostic de la NAFLD et de l’IM.
La prévalence croissante de la NAFLD, qui touche un large segment de la population, souligne un problème de santé publique important, en particulier compte tenu de son association avec le diabète. Cependant, l’impact de la NAFLD sur les patients non diabétiques reste mal compris. La NAFLD a été impliquée dans la pathogenèse de l’athérosclérose et est reconnue comme un facteur de risque cardiovasculaire indépendant, étant étroitement liée à la calcification de l’artère coronaire, à la dysfonction endothéliale et à l’athérosclérose. Malgré ces associations, les mécanismes précis qui font le lien entre la NAFLD et les maladies cardiovasculaires telles que l’infarctus du myocarde (IM) nécessitent une élucidation plus approfondie. L’IM est l’une des principales causes de mortalité dans le monde et impose un fardeau économique important. Le risque d’infarctus du myocarde chez les patients atteints de NAFLD est nettement plus élevé que chez ceux qui n’en ont pas, ce qui souligne la nécessité d’une compréhension plus approfondie des voies moléculaires reliant ces conditions. Bien que l’inflammation, le stress oxydatif et le métabolisme des lipides aient été suggérés comme facteurs contributifs, les mécanismes exacts restent incertains. Il est urgent d’identifier de nouveaux biomarqueurs qui peuvent fournir des informations sur le pronostic et la prise en charge de l’IM lié à la NAFLD.
Par conséquent, dans cette étude, des ensembles de données de microréseaux d’ARN pour la NAFLD et l’IM ont été téléchargés à partir du National Center for Biotechnology Information-Gene Expression Omnibus (NCBI-GEO, voir Table of Materials) afin d’identifier et d’analyser l’interaction des gènes exprimés de manière différentielle (DEG) entre la NAFLD et l’IM. Analyse d’enrichissement, construction de diagrammes de réseau d’interaction protéine-protéine (IPP), élimination de caractéristiques récursives par machine de vecteurs de support (SVM-RFE), et les algorithmes LASO (Least Absolute Shrinkage and Selection operator) ont été utilisés pour identifier les gènes pivots 12,13,14,15,16,17,18,19. Une analyse d’immuno-infiltration a été réalisée pour examiner les cellules immunitaires chez les patients atteints de NAFLD et d’IM. En fin de compte, ces méthodes ont été intégrées pour élucider la relation entre la NAFLD et l’IM. La figure 1 illustre la séquence de conception suivie dans cette étude. En combinant la bioinformatique, l’apprentissage automatique et l’analyse d’immuno-infiltration, cette étude vise à contribuer au développement d’une nouvelle plateforme d’aide à la décision médicale.
Les principales contributions de cet article sont les suivantes : (1) Identification des gènes co-exprimés : L’étude met en évidence la relation entre la NAFLD et l’IM en identifiant les gènes co-exprimés, offrant une compréhension plus approfondie des liens moléculaires entre ces deux conditions. (2) Application de la bio-informatique et de l’apprentissage automatique : À l’aide de techniques de bio-informatique et d’apprentissage automatique, y compris l’élimination des caractéristiques récursives par machine du vecteur de support (SVM-RFE)17 et l’opérateur de sélection et de rétrécissement absolu minimal (LASSO)19, l’étude identifie THBS1 comme un gène exprimé de manière différentielle. THBS1 démontre une performance élevée pour distinguer les patients atteints de NAFLD et d’IM des témoins sains. (3) Analyse d’immuno-infiltration : L’étude effectue une analyse d’immuno-infiltration, révélant des niveaux significativement plus faibles de lymphocytes T CD8+ et des niveaux plus élevés de neutrophiles chez les patients atteints de NAFLD et d’IM. (4) Analyse de corrélation : La recherche démontre que THBS1 est positivement corrélé avec plusieurs facteurs immunitaires, y compris le CCR (récepteur des chimiokines), le CMH de classe I (complexe majeur d’histocompatibilité de classe I), les neutrophiles, para-inflammation et les cellules Tfh (T auxiliaires folliculaires). Il est négativement corrélé avec les lymphocytes T CD8+, l’activité cytolytique et les lymphocytes infiltrant la tumeur (TIL).