Ici, nous présentons un protocole démontrant l’amplification de l’ARN à flux latéral et évaluons l’efficacité pour détecter rapidement Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis et Ureaplasmaurealyticum.
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Article de méthode
Ici, nous présentons un protocole démontrant l’amplification de l’ARN à flux latéral et évaluons l’efficacité pour détecter rapidement Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis et Ureaplasmaurealyticum.
Neisseria gonorrhoeae (NG), Chlamydia trachomatis (CT) et Ureaplasma urealyticum (UU) sont des agents pathogènes courants associés aux maladies sexuellement transmissibles (MST). NG est l’agent causal de la gonorrhée, qui peut entraîner divers troubles du système génito-urinaire, notamment l’épididymite, la prostatite, la cervicite et l’infertilité. La tomodensitométrie est un micro-organisme responsable de l’urétrite non gonococcique et de la maladie inflammatoire pelvienne. L’UU est associée à l’urétrite non gonococcique, à la cervicite, à la prostatite et à l’infertilité. Les technologies moléculaires actuelles pour l’analyse de NG, CT et UU sont souvent complexes et prennent beaucoup de temps. Les tests moléculaires rapides pour ces agents pathogènes peuvent faciliter le diagnostic précoce des MST. Le test d’amplification d’ARN à flux latéral (RGT) est une méthode qui ne nécessite pas d’extraction d’acide nucléique. Dans ce processus, les échantillons sont lysés pour libérer des fragments d’acide nucléique, qui sont ensuite amplifiés par transcription inverse et transcription. Le produit d’ARN amplifié est reconnu et capturé par des sondes spécifiques, formant un complexe ARN-sonde de détection sonde-sonde d’or qui peut être immobilisé sur une membrane de nitrocellulose par flux latéral pour produire des bandes visibles. L’ensemble de la procédure prend moins de 1 h. Le but de cette étude était d’évaluer l’efficacité de la RGT pour la détection rapide de la NG, de la TDM et de l’UU. Au total, 1 416 échantillons ont été inclus. La cohérence de NG, CT et UU lorsqu’elles sont analysées par RGT par rapport à la méthode de sondage par fluorescence par réaction en chaîne par polymérase (PCR) était de 99,03 % (307/310), 99,38 % (159/160) et 99,02 % (303/306), respectivement. La cohérence de NG, CT et UU lorsqu’analysée par RGT par rapport au séquençage génique était de 99,17 % (238/240), 98,95 % (188/190) et 98,30 % (173/176), respectivement. Comparativement à la méthode de culture d’isolement des agents pathogènes, les taux de détection pour les tests NG, CT et UU étaient de 100,00 % (9/9, 17/17, 8/8). La sensibilité et la spécificité élevées, la facilité d’utilisation et les délais réduits rendent ce test idéal pour la détection rapide et précise de NG, CT et UU.
Les infections sexuellement transmissibles (IST) représentent d’importants défis de santé publique à l’échelle mondiale, entraînant de graves morbidités et mortalité génitales et reproductives1. Neisseria gonorrhoeae (NG) est l’agent causal de la gonorrhée, avec environ 87 millions de nouveaux cas signalés chaque année dans le monde2. Cet agent pathogène induit principalement une inflammation en envahissant l’épithélium cylindrique du tractus urogénital3. Chlamydia trachomatis (CT), un autre micro-organisme, est responsable de l’urétrite non gonococcique et des infections pelviennes, représentant environ 130 millions de nouveaux cas chaque année4. Ureaplasma urealyticum (UU), la cellule auto-réplicative la plus simple et la plus petite, envahit facilement les tissus cervicaux endommagés et est associée à l’urétrite non gonococcique, à la cervicite, à la prostatite et à l’infertilité5. Toutes ces infections sont souvent asymptomatiques chez les femmes et les hommes, mais elles peuvent entraîner de graves complications si elles ne sont pas traitées rapidement. Les infections maternelles peuvent entraîner de graves issues défavorables de la grossesse, notamment la mortinaissance, la fausse couche, l’accouchement prématuré et l’infection fœtale directe6. Par conséquent, le développement d’une méthode rapide, sensible, spécifique et conviviale pour la détection des agents pathogènes est d’une importance capitale.
La détection rapide et précise des agents pathogènes est essentielle pour un diagnostic et une gestion efficaces des maladies. Les méthodes de culture traditionnelles, qui nécessitent l’isolement, la culture et l’identification des agents pathogènes, présentent des inconvénients importants, notamment qu’elles prennent du temps et qu’elles sont peu sensibles. Bien que le séquençage des gènes présente un taux de précision élevé, il nécessite un environnement et un équipement complexes, ce qui le rend coûteux et chronophage. Les technologies moléculaires conventionnelles pour l’analyse de NG, CT et UU ont été largement acceptées ; Cependant, ces méthodes sont souvent compliquées et prennent du temps, nécessitant des instruments sophistiqués, des techniciens formés et des délais de traitement prolongés. Par conséquent, il est urgent de disposer d’une méthode de diagnostic moléculaire simple et fiable pour remédier aux limites des approches conventionnelles. Le test d’amplification d’ARN à flux latéral (RGT) offre une alternative rapide, sensible et spécifique sans avoir besoin de procédures complexes 7,8. Dans cette méthode, les échantillons sont directement lysés pour libérer des fragments d’acide nucléique sans extraction d’acide nucléique, et ces fragments sont amplifiés par transcription inverse et transcription. Le produit d’ARN amplifié est ensuite reconnu et capturé par des sondes spécifiques, formant un complexe ARN-sonde de détection-sonde d’or, qui peut être immobilisé sur une membrane de nitrocellulose par flux latéral pour créer des bandes visibles9. L’ensemble du processus prend moins de 1 h, ce qui le rend parfaitement adapté aux tests de laboratoire d’urgence.
Dans cette étude, nous avons recruté 1 416 échantillons pour évaluer l’utilisation de RGT pour la détection de NG, CT et UU. Les échantillons ont été analysés à l’aide de méthodes de culture RGT, PCR, de séquençage de gènes et d’isolement d’agents pathogènes. Les résultats ont indiqué que la méthode RGT était précise et cohérente avec les méthodes de diagnostic conventionnelles. En conclusion, la sensibilité et la spécificité élevées, la facilité d’utilisation et les délais réduits rendent ce test idéal pour la détection rapide et précise de NG, CT et UU, suggérant son application prometteuse dans le diagnostic médical préliminaire des maladies sexuellement transmissibles.
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Cette étude a été menée conformément aux directives éthiques et à l’approbation accordée par le Conseil d’examen institutionnel du Premier Hôpital populaire de Foshan, dans la province du Guangdong, en Chine (Document d’examen éthique n°. LR (2025) 136). Au total, 1 416 échantillons d’écouvillonnage génital (716 de femmes, 700 de garçons) ont été prélevés de manière prospective chez des personnes cliniquement suspectées d’être atteintes de MST qui n’avaient pas reçu d’antibiothérapie au cours des 14 jours précédents (tableau supplémentaire 1). Pour chaque participant, des écouvillons appariés ont été obtenus simultanément et analysés en parallèle : l’un par la méthode de test (RGT) et l’autre par la méthode de référence (sonde de fluorescence PCR, séquençage de gènes et culture d’isolement d’agents pathogènes, respectivement). L’accord inter-méthodes a été quantifié à l’aide du coefficient Kappa de Cohen (κ), l’interprétation étant guidée par les critères de Landis et Koch.
REMARQUE : Le protocole de dosage pour la TDM et l’UU suit des étapes procédurales identiques à celles décrites pour le NG, avec des modifications limitées aux réactifs spécifiques de l’agent pathogène. Les formulations détaillées des réactifs sont fournies à l’étape 2.1 (tableau supplémentaire 2, tableau supplémentaire 3 et tableau supplémentaire 4).
1. Prélèvement d’échantillons
2. Préparation
3. Lyser les cellules pour extraire l’ARN
4. Amplification isotherme de l’ARN
5. Dosage à flux latéral
6. Analyse des résultats
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Cohérence des méthodes de sonde de fluorescence RGT et PCR
Au total, 310 échantillons ont été analysés pour le NG, soit 161 femelles et 149 mâles. Le taux de coïncidence positive était de 98,78 % (IC à 95 % : 93,39 %-99,97 %), tandis que le taux de coïncidence négative était de 99,12 % (IC à 95 % : 96,87 %-99,89 %). Le taux de coïncidence global était de 99,03 % (IC à 95 % : 97,20 %-99,80 %). La valeur de cohérence de Kappa était de 0,975 (IC à 95 % : 0,947-1,...
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Dans cette étude, la RGT a été utilisée pour détecter les agents pathogènes des IST, y compris le NG, le CT et l’UU. Lorsqu’il a été réalisé dans le cadre de protocoles opérationnels rigoureux, le test RGT a démontré une forte concordance avec les méthodes de diagnostic établies telles que la sonde de fluorescence PCR, le séquençage de gènes et les techniques de culture d’isolement des agents pathogènes. La sensibilité et la spécificité du test RGT étaient comparables ou supérieures à ce...
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Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
Nous remercions Wuhan Zhongzhi Bio-technologies Inc. pour les réactifs et les conseils techniques offerts pour cette étude.
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Hypochlorite de sodium à 10 % (p/v) | Préparation en laboratoire. | Préparation en laboratoire. | Solution d’eau de Javel diluée pour la décontamination et l’inactivation des agents pathogènes sur l’équipement ou les surfaces. |
| Éthanol à 75 % (v/v) | Ante Food Co., Ltd (Anhui, Chine) | http://www.antegroup.com/product_detail_cn/id/81.html | Solution aqueuse d’éthanol utilisée pour la désinfection des surfaces |
| Pipette à volume réglable (0,5 &ndash ; 10 &mu ; L) | DLAB Scientific Co., Ltd. | 7010101004 | Micropipette monocanal pour une manipulation précise de volumes à l’échelle du microlitre. |
| Pipette à volume réglable (100&ndash ; 1000 &mu ; L) | DLAB Scientific Co., Ltd. | 7010101014 | Pipette monocanal calibrée pour la manipulation de liquides de grand volume. |
| Pipette à volume réglable (10&ndash ; 100 &mu ; L) | DLAB Scientific Co., Ltd. | 7010101008 | Pipette monocanal optimisée pour les volumes intermédiaires, couramment utilisée dans les protocoles de biologie moléculaire. |
| Pipette à volume réglable (20 po ; 200 &mu ; L) | DLAB Scientific Co., Ltd. | 7010101009 | Pipette monocanal pour les transferts de volumes moyens, adaptée à l’aliquotage précis des réactifs. |
| Enceinte de biosécurité (HF Safe-1200) | HealForce Bio-Meditech Holdings Limited (Hong Kong, Chine) | HF Safe-1200 | Une enceinte de biosécurité de classe II assurant la protection du personnel, des échantillons et de l’environnement lors de la manipulation de micro-organismes pathogènes ou de cultures cellulaires. |
| Centrifuge Tubes | Haozhi Medical Devices Co., Ltd. (Guangzhou, Chine) | Dépôt de dispositif médical Guangzhou Yuexiu n° 20210414 | Pour l’extraction d’acides nucléiques, la granulation de cellules et d’autres procédures de laboratoire. |
| Chamydia trachomatis (CT) Dosage des acides nucléiques (amplification de l’ARN-Dosage du flux latéral) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC.(Wuhan, Chine) | A.10.309-STD-RG-002 | Pour la détection qualitative de l’ARN des acides nucléiques de Chamydia trachomatis dans les échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Incubateur CO2 | Thermo Fisher Scientific(Asheville, USA) LLC | SN : | Utilisé pour la culture cellulaire, fournissant un environnement stable avec une température contrôlée (37° ; C), l’humidité et la concentration de CO2 (généralement 5 %) pour assurer une croissance cellulaire optimale. |
| Plaque de culture ; | Corning Incorporated (Corning, États-Unis) | 50 mm & aigu ; 9 mm | Pour la culture cellulaire adhérente et l’expansion. |
| Kit de détection de l’acide nucléique à Chamydia trachomatis (CT) (PCR-Fluorescence Probing) | Fosun Diagnostics (Shanghai, China) Co., Ltd | China Medical Device Registration Certificate No. 20143402234 | Pour la détection qualitative de l’acide nucléique de Chamydia trachomatis dans les échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Kit de détection de l’acide nucléique à Neisseria gonorrhoeae (NG) (PCR-Fluorescence Probing) | Fosun Diagnostics (Shanghai, China) Co., Ltd | China Medical Device Registration Certificate No. 20173401080 | Pour la détection qualitative de l’acide nucléique de Neisseria gonorrhoeae dans les échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Kit de détection de l’acide nucléique à Ureaplasma Urealyticum (UU) (PCR-Fluorescence Probing) | Fosun Diagnostics (Shanghai, China) Co., Ltd | China Medical Device Registration Certificate No. 20173400536 | Pour la détection qualitative de l’acide nucléique d’Ureaplasma Urealyticum dans les échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Milieu DMEM | Thermo Fisher Scientific Inc. (Waltham, États-Unis 11965092 | Pour la culture de Chlamydia trachomatis. | |
| Pointes de pipette filtrante (10 &mu ; L) | Guangzhou Surbiopure Biotechnology Co., Ltd (Guangzhou, Chine) | TF-10-BXL | Pour un pipetage précis dans les expériences. |
| Pointes de pipette à filtre (200 &mu ; L) | Guangzhou Surbiopure Biotechnology Co., Ltd (Guangzhou, Chine) | TF-200-BXL | Pour un pipetage précis dans les expériences. |
| Écouvillon génital | Haozhi Medical Devices Co., Ltd. (Guangzhou, Chine) | Hz112 | Écouvillons stériles à bout de coton pour le prélèvement d’échantillons cliniques sur les surfaces de la muqueuse génitale. |
| Sérum fœtal bovin Gibco (FBS) | Thermo Fisher Scientific Inc. (Waltham, États-Unis) | 10270106 | Pour la culture de Chlamydia trachomatis. |
| Lames de verre | Haozhi Medical Devices Co., Ltd. (Guangzhou, Chine) | Dépôt de dispositif médical Guangzhou Yuexiu n° 20210414 | Lames de verre standard avec traitement anti-décoloration pour la préparation de frottis cellulaires ou de coupes de tissus, compatibles avec les protocoles de coloration de Gram. |
| Kit de synthèse d’ADNc Goldenstar RT6 Ver2 | Beijing Tsingke Biotech Co., Ltd (Pékin, Chine) | TSK302S | Pour la synthèse du premier brin d’ADNc dans la première étape de la RT-PCR en deux étapes. Il contient tous les réactifs nécessaires à la synthèse de l’ADNc à partir de l’ARN. |
| Baso | Diagnostics, Inc. (Zhuhai, Chine) | BA4012 | Un kit de coloration contenant du violet cristallin, de l’iode, un décolorant et de la safranine pour différencier Neisseria Gonorrhoeae. ; |
| IBM SPSS Statistics (V25.0) | International Business Machines Corporation (New York, USA) | Version 25.0 | Pour l’analyse des données. |
| Stérilisateur infrarouge | Huaxixinrui (Qingdao) Analytical Instruments Co., Ltd. | MJ-200W | Pour la décontamination instantanée des boucles d’inoculation ou des pinces, minimisant ainsi la contamination croisée dans les enceintes de biosécurité. |
| Boucle d’inoculation | BKMAM Biotechnology Co., Ltd. (Hunan, Chine) | 110306002 | Pour le transfert d’échantillons microbiens, le stries ou l’inoculation. |
| Microscope inversé (IX-51) | Olympus Corporation (Tokyo, Japon) | Code d’actif du laboratoire : ; 71807101 | Pour l’observation des cellules adhérentes ou de la dynamique des cellules vivantes dans les boîtes de culture. |
| Système automatisé de spectrométrie de masse microbienne MALDI Biotyper | Bruker Daltonics GmbH & Co. KG (Brême, Allemagne) | Numéro d’enregistrement national d’importation de dispositifs médicaux n° 20182222017 | Un système basé sur la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l’identification microbienne rapide via le profilage des protéines, permettant l’identification des espèces de bactéries et de champignons dans les laboratoires de microbiologie clinique. |
| Lignées cellulaires McCoy | Conservées en laboratoire. | Conservé en laboratoire. | Pour la culture de Chlamydia trachomatis. |
| Incubateur thermostatique à microplaques Leopard70-4 (capacité de 4 plaques) | Leaptec Scientific Instruments (Beijing) Co., Ltd. | Leopard70-4 | Un incubateur de microplaques pouvant accueillir jusqu’à 4 microplaques standard, avec une plage de température ambiante à 70° ; C, ; utilisé pour les étapes d’incubation. |
| Microscope (OLYMPUS CX43) | Olympus Corporation (Tokyo, Japon) | https://lifescience.evidentscientific.com.cn/zh/microscopes/upright/cx43-33/ | Pour l’observation clinique d’échantillons (par exemple, morphologie cellulaire, échantillons colorés). |
| Mini bain métallique MiniG-R100 | Leaptec Scientific Instruments (Beijing) Co., Ltd. | MiniG-R100 | Pour la régulation rapide de la température pendant l’expérience, comme le chauffage, l’incubation ou la fin des réactions dans des échantillons de petit volume. |
| Neisseria gonorrhoeae (NG) Dosage des acides nucléiques (amplification de l’ARN-Dosage à flux latéral) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC.(Wuhan, Chine) | A.10.309-STD-RG-001 | Pour la détection qualitative de l’ARN des acides nucléiques de Neisseria gonorrhoeae dans des échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Réactif d’extraction d’acide nucléique | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC. (Wuhan, Chine) | A.10.105-SC-001 | Pour l’extraction, l’enrichissement et la purification des acides nucléiques. |
| Milieu de transport d’échantillons | QIAGEN N.V. (Venlo, Pays-Bas) | 5128-1220 | Ce milieu est spécialement formulé pour la collecte, la conservation et le transport d’échantillons cliniques, assurant ainsi la viabilité de Chlamydia trachomatis ; et ; Neisseria gonorrhoeae ; pour les tests de diagnostic ultérieurs. |
| Centrifugeuse thermostatique | Beckman Coulter, Inc. (Brea, USA) | SN : MRZ21L037 | Pour la granulation d’acides cellulaires, microbiens ou nucléiques. |
| TM moyen | Shanghai Yihua Medical Science & Technology Co., Ltd (Shanghai, Chine) | dépôt de dispositif médical Pu n° 20140081 | TM de Shanghai peut être utilisé pour l’isolement, la culture et l’identification de Neisseria gonorrhoeae à partir d’échantillons cliniques afin d’aider au diagnostic de la gonorrhée. |
| Trypsine-EDTA (0,25 %) | Thermo Fisher Scientific Inc. (Waltham, États-Unis) | 25200072 | Pour la dissociation en douceur des cellules adhérentes pendant les procédures de sous-culture ou expérimentales. |
| Ureaplasma urealyticum (UU) Dosage des acides nucléiques (amplification de l’ARN-Dosage à flux latéral) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC.(Wuhan, Chine) | A.10.309-STD-RG-003 | Pour la détection qualitative de l’ARN de l’acide nucléique d’Ureaplasma Urealyticum dans des échantillons d’écouvillons des voies génitales et urinaires. |
| Ureaplasma urealyticum et Mycoplasma hominis Kit de culture, d’identification et de sensibilité aux médicaments | Hebei Zhongaisheng Biotechnology Co., Ltd. (Hebei, Chine) | Enregistrement de dispositif médical Hebei n° 20152400168 | Pour l’isolement sélectif, la culture, l’identification et la détermination de la sensibilité aux médicaments d’Ureaplasma urealyticum et de Mycoplasma hominis. |
| Mélangeur vortex | Xinkang Medical Instrument Co. Ltd (Jiangsu, Chine) | XK80-A | Dispositif de laboratoire pour l’homogénéisation d’échantillons de liquide par agitation rapide. |
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