Culture de cellules PC12
La lignée cellulaire PC12 a été multipliée dans un milieu de croissance du Roswell Park Memorial Institute 1640 (RPMI-1640) contenant 10 % de sérum fœtal bovin (FBS) et 1 % de pénicilline/streptomycine, avec un entretien de routine dans des conditions de culture standard (37 °C, 5 % de CO2 sous atmosphère humidifiée). Pour les procédures expérimentales, les cellules adhérentes ont été plaquées sur des récipients de culture et laissées proliférer jusqu’à obtenir des monocouches presque confluentes (couverture de surface d’environ 90 %). La dissociation cellulaire a été réalisée par un traitement enzymatique utilisant une solution de trypsine-EDTA à 0,25 %, suivi de trois cycles de sous-culture successifs pour assurer la stabilité de la population. Les cellules traitées ont ensuite été allouées à des applications expérimentales en aval et à des évaluations analytiques.
Tests de viabilité cellulaire
La viabilité cellulaire a été évaluée afin d’évaluer la cytotoxicité de l’hémine et de la locostatine sur les cellules PC12, en suivant les instructions fournies par le fabricant du kit de test. Les cellules PC12 ont été uniformément ensemencées dans des plaques de 96 puits et cultivées avec de l’hémine ou de la locostatine pendant 24 h. Après le lavage avec une solution saline tamponnée au phosphate (PBS), les cellules ont été incubées dans un milieu RPMI-1640 contenant une solution saline de tétrazolium à 10 % pendant 90 min à 37 °C. Les valeurs de densité optique (DO) ont ensuite été mesurées à 450 nm à l’aide d’un lecteur de microplaques.
Réaction en chaîne quantitative par polymérase par transcription inverse (RT-qPCR)
L’ARN total a été extrait des cellules PC12 à l’aide du réactif d’extraction d’ARN. Tout d’abord, l’échantillon a été homogénéisé dans le réactif d’extraction, assurant une lyse complète. Du chloroforme a été ajouté au mélange, secoué vigoureusement et centrifugé pour séparer les phases (12 000 × g, 15 min, 4 °C). La phase aqueuse contenant l’ARN a été collectée, et l’ARN a été précipité par ajout d’isopropanol (phase aqueuse : iPrOH = 1:1) et incubation à température ambiante. La centrifugation a été effectuée pour granuler l’ARN (12 000 × g, 10 min, 4 °C), 1 mL d’éthanol à 70 % a été ajouté pour éliminer les impuretés, et enfin, la pastille d’ARN a été dissoute dans de l’eau exempte de RNase pour être stockée à -80 °C. Des matrices d’ADN complémentaire (ADNc) ont été générées par transcription inverse avec le RT Master Mix. Les modèles résultants ont ensuite été dilués à un rapport de 1:5 et soumis à une PCR quantitative en temps réel sur un instrument de PCR en temps réel. Chaque échantillon a été amplifié en trois exemplaires, et la quantité relative de produit de PCR a été moyennée. Les amorces utilisées sont énumérées dans le tableau 1, la β-actine servant de gène d’entretien. La concentration relative d’ARNm a été déterminée à l’aide de la formule E = 2−ΔΔCt, et la valeur du cycle à seuil critique (CT) a été enregistrée pour chaque réaction.
Essais d’espèces réactives de l’oxygène (ROS) intracellulaires et d’hydroperoxyde lipidique (LPO)
Les niveaux de ROS et de LPO ont été mesurés par cytométrie en flux. Les cellules PC12 ont été traitées avec de l’hémine (80 μM), de la locostatine (5 μM) et du ML385 (5 μM) pendant 24 h et lavées 3 fois avec du PBS dans de la vaisselle. Les cellules ont ensuite été incubées à 37 °C avec 5 % de CO2 pendant 40 min en présence de diacétate de 2',7'-dichlorodihydrofluorescéine (DCFH-DA), une sonde ROS, et de BODIPY 581/591 C11, une sonde LPO. Après des lavages PBS pour éliminer les sondes en excès, l’intensité de la fluorescence a été mesurée par cytométrie en flux. Une stratégie de contrôle cohérente a été appliquée à tous les échantillons : d’abord, les cellules ont été contrôlées sur FSC-A par rapport à SSC-A pour exclure les débris, puis les cellules individuelles ont été sélectionnées par FSC-A par rapport à FSC-H. Des cellules non colorées et des cellules traitées avec de l’hémine seule ont été utilisées comme témoins négatifs et positifs pour établir la compensation de fluorescence et les portes. Les données ont été analysées à l’aide du logiciel lié.
Extraction de protéines et western blot
Extraction totale des protéines
Le surnageant des cellules PC12 traitées a été mis au rebut, suivi de trois lavages avec du PBS glacé. Les cellules ont été récoltées à l’aide de trypsine et centrifugées à 200 × g pendant 5 min. Après avoir éliminé le surnageant, la pastille cellulaire a été homogénéisée dans un tampon de lyse à froid contenant 10 % d’inhibiteur de protéase et 10 % d’inhibiteur de phosphatase. Après une incubation de 30 minutes sur glace, le lysat a été centrifugé à 12 000 × g pendant 15 min à 4 °C. Le surnageant clair a été mélangé avec un tampon de charge (4:1) et chauffé à 95 °C pendant 5 min pour dénaturer les protéines. Les échantillons de protéines ont été conservés à -80 °C en vue d’une utilisation ultérieure.
Analyse par transfert Western
Les protéines ont été séparées par SDS-PAGE à l’aide d’un gel d’empilement et d’un gel de résolution, les échantillons étant chargés dans des puits. L’électrophorèse a été réalisée à 80 V pour le gel d’empilement et à 120 V pour le gel de résolution. Les protéines ont été transférées sur une membrane de fluorure de polyvinylidène (PVDF) (pré-activée dans du méthanol pendant 1 min) à l’aide d’un système de transfert à courant constant de 300 mA pendant 1 à 2 h. La membrane a été bloquée avec du lait écrémé à 5 % dans du TBST pendant 2 h à température ambiante pour éviter une liaison non spécifique. Après trois lavages avec du TBST (10 min chacun), la membrane a été incubée pendant la nuit à 4 °C avec les anticorps primaires suivants dilués dans du TBST : anti-ACSL4 de lapin (1:1 000), anti-GPX4 de lapin (1:1 000), anti-HO-1 de lapin (1:2 000), anti-NRF2 de lapin (1:1 000), anti-RKIP de lapin (1:1 500) et anti-β-actine de souris (1:5 000). La membrane a été lavée pendant 3 x 10 min avec du TBST et incubée avec des anticorps secondaires conjugués à la HRP pendant 2 h à température ambiante : IgG anti-souris de chèvre marquées HRP (1:1 000), IgG anti-lapin de chèvre marquées HRP (1:1 000). Après des lavages TBST supplémentaires pendant 3 x 5 minutes, les signaux protéiques ont été visualisés à l’aide d’un kit ECL Western Blot et quantifiés à l’aide du logiciel ImageJ.
Coloration par immunofluorescence
Les cellules ont été ensemencées sur des lamelles pré-placées dans des plaques de culture et laissées adhérer. Après des traitements expérimentaux, le surnageant a été éliminé et les cellules ont été lavées 3 fois avec du PBS. Les cellules ont été fixées avec du paraformaldéhyde à 4 % (PFA) pendant 15 min à température ambiante, suivies de trois lavages PBS. Par la suite, les cellules ont été perméabilisées avec 0,1 % de Triton X-100 pendant 10 minutes à température ambiante et lavées 3 fois avec du PBS. La liaison non spécifique a été bloquée par l’incubation avec 3 % d’albumine sérique bovine (BSA) pendant 30 min à température ambiante. Les anticorps primaires ont été appliqués pendant la nuit à 4 °C : anti-HO-1 chez le lapin (1:500), anti-NRF2 chez le lapin (1:500). Après trois lavages PBS le lendemain, les cellules ont été incubées avec des anticorps secondaires fluorescents dans l’obscurité pendant 1 h à température ambiante : Alexa Fluor 488-marked Goat Anti-Rabbit IgG (1:500). Après les lavages finaux, les échantillons ont été montés avec un milieu de montage contenant du 4',6-diamidino-2'-phénylindole (DAPI) pour la contre-coloration nucléaire. Les images ont été capturées à l’aide d’un microscope confocal à balayage laser.
Analyse statistique
Les données de mesure ont été exprimées en moyenne ± en écart-type (écart-type). Des données quantitatives représentant les résultats de trois tests répétés indépendants ont été prélevées pour analyse. Pour les comparaisons entre deux groupes, un test t a été appliqué, tandis qu’une analyse de variance à un facteur (ANOVA) a été utilisée pour les comparaisons entre plusieurs groupes, suivie du test post hoc de Tukey pour les comparaisons multiples. Une valeur p < 0,05 a été considérée comme statistiquement significative.